RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000487620.1

ZNF3-215, Transcript of zinc finger protein 3, humanhuman

TSL 2

Gene ZNF3, Length 2,660 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF3-215ENST00000487620 PPWD1Q96BP3 646 aaKnown RBP9.9□□□□□ -0.82
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ZNF3-215ENST00000487620 SLC29A1Q99808 456 aa9.89□□□□□ -0.83
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