RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000487547.1

USP34-216, Transcript of ubiquitin specific peptidase 34, humanhuman

TSL 3

Gene USP34, Length 612 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP34-216ENST00000487547 FAM90A22PA8MWA6 464 aa6.33□□□□□ -1.4
USP34-216ENST00000487547 FAM90A12PA8MX19 464 aa6.33□□□□□ -1.4
USP34-216ENST00000487547 FAM90A23PA8MXZ1 464 aa6.33□□□□□ -1.4
USP34-216ENST00000487547 GLUD1P00367 558 aa6.33□□□□□ -1.4
USP34-216ENST00000487547 ADAP00813 363 aa6.33□□□□□ -1.4
USP34-216ENST00000487547 NAGAP17050 411 aa6.33□□□□□ -1.4
USP34-216ENST00000487547 PSMC2P35998 433 aaKnown RBP6.33□□□□□ -1.4
USP34-216ENST00000487547 PTPN9P43378 593 aa6.33□□□□□ -1.4
USP34-216ENST00000487547 GLUD2P49448 558 aa6.33□□□□□ -1.4
USP34-216ENST00000487547 ARSFP54793 590 aa6.33□□□□□ -1.4
USP34-216ENST00000487547 NANOS2P60321 138 aaKnown RBP6.33□□□□□ -1.4
USP34-216ENST00000487547 VAMP2P63027 116 aa6.33□□□□□ -1.4
USP34-216ENST00000487547 Q0VFX4 171 aa6.33□□□□□ -1.4
USP34-216ENST00000487547 TRAF1Q13077 416 aa6.33□□□□□ -1.4
USP34-216ENST00000487547 ERV3-1Q14264 604 aa6.33□□□□□ -1.4
USP34-216ENST00000487547 SLC4A8Q2Y0W8 1093 aa6.33□□□□□ -1.4
USP34-216ENST00000487547 EDRF1Q3B7T1 1238 aa6.33□□□□□ -1.4
USP34-216ENST00000487547 ATG9BQ674R7 924 aa6.33□□□□□ -1.4
USP34-216ENST00000487547 NAPEPLDQ6IQ20 393 aa6.33□□□□□ -1.4
USP34-216ENST00000487547 LRRC8DQ7L1W4 858 aa6.33□□□□□ -1.4
USP34-216ENST00000487547 LRRTM4Q86VH4 590 aa6.33□□□□□ -1.4
USP34-216ENST00000487547 CPXM2Q8N436 756 aa6.33□□□□□ -1.4
USP34-216ENST00000487547 MCPH1Q8NEM0 835 aa6.33□□□□□ -1.4
USP34-216ENST00000487547 MYRIPQ8NFW9 859 aa6.33□□□□□ -1.4
USP34-216ENST00000487547 TNIP2Q8NFZ5 429 aa6.33□□□□□ -1.4
USP34-216ENST00000487547 RFWD2Q8NHY2 731 aa6.33□□□□□ -1.4
USP34-216ENST00000487547 RNF183Q96D59 192 aa6.33□□□□□ -1.4
USP34-216ENST00000487547 UBXN10Q96LJ8 280 aa6.33□□□□□ -1.4
USP34-216ENST00000487547 LUZP4Q9P127 313 aa6.33□□□□□ -1.4
USP34-216ENST00000487547 A0A1B0GVT2 93 aa6.32□□□□□ -1.4
USP34-216ENST00000487547 INAFM1C9JVW0 142 aa6.32□□□□□ -1.4
USP34-216ENST00000487547 I6L893 689 aaPredicted RBP6.32□□□□□ -1.4
USP34-216ENST00000487547 CLDN7O95471 211 aa6.32□□□□□ -1.4
USP34-216ENST00000487547 IFIT1P09914 478 aaKnown RBP6.32□□□□□ -1.4
USP34-216ENST00000487547 PGM1P36871 562 aa6.32□□□□□ -1.4
USP34-216ENST00000487547 YWHAZP63104 245 aaKnown RBP6.32□□□□□ -1.4
USP34-216ENST00000487547 CRYZQ08257 329 aaKnown RBP6.32□□□□□ -1.4
USP34-216ENST00000487547 ST3GAL1Q11201 340 aa6.32□□□□□ -1.4
USP34-216ENST00000487547 ME3Q16798 604 aa6.32□□□□□ -1.4
USP34-216ENST00000487547 PLEKHO1Q53GL0 409 aaPredicted RBP6.32□□□□□ -1.4
USP34-216ENST00000487547 LCE1AQ5T7P2 110 aa6.32□□□□□ -1.4
USP34-216ENST00000487547 Q6ZSV7 163 aa6.32□□□□□ -1.4
USP34-216ENST00000487547 ADGRG6Q86SQ4 1221 aa6.32□□□□□ -1.4
USP34-216ENST00000487547 ELP5Q8TE02 316 aa6.32□□□□□ -1.4
USP34-216ENST00000487547 USP13Q92995 863 aaPredicted RBP6.32□□□□□ -1.4
USP34-216ENST00000487547 MIB2Q96AX9 1013 aa6.32□□□□□ -1.4
USP34-216ENST00000487547 PHF21BQ96EK2 531 aa6.32□□□□□ -1.4
USP34-216ENST00000487547 MEIS3Q99687 375 aa6.32□□□□□ -1.4
USP34-216ENST00000487547 HNRNPUL1Q9BUJ2 856 aaKnown RBP eCLIP6.32□□□□□ -1.4
USP34-216ENST00000487547 SEZ6LQ9BYH1 1024 aa6.32□□□□□ -1.4
USP34-216ENST00000487547 EPHX3Q9H6B9 360 aa6.32□□□□□ -1.4
USP34-216ENST00000487547 WDR6Q9NNW5 1121 aaKnown RBP6.32□□□□□ -1.4
USP34-216ENST00000487547 SPATS2LQ9NUQ6 558 aaKnown RBP6.32□□□□□ -1.4
USP34-216ENST00000487547 CNOT7Q9UIV1 285 aaKnown RBP6.32□□□□□ -1.4
USP34-216ENST00000487547 CHL1O00533 1208 aa6.31□□□□□ -1.4
USP34-216ENST00000487547 LDB2O43679 373 aa6.31□□□□□ -1.4
USP34-216ENST00000487547 ITM2AO43736 263 aa6.31□□□□□ -1.4
USP34-216ENST00000487547 SOX30O94993 753 aa6.31□□□□□ -1.4
USP34-216ENST00000487547 NGFRP08138 427 aa6.31□□□□□ -1.4
USP34-216ENST00000487547 CKMT1AP12532 417 aa6.31□□□□□ -1.4
USP34-216ENST00000487547 MYF6P23409 242 aa6.31□□□□□ -1.4
USP34-216ENST00000487547 LIFRP42702 1097 aa6.31□□□□□ -1.4
USP34-216ENST00000487547 NUDT6P53370 316 aa6.31□□□□□ -1.4
USP34-216ENST00000487547 SLC18A2Q05940 514 aa6.31□□□□□ -1.4
USP34-216ENST00000487547 TDRD12Q587J7 1177 aaKnown RBP6.31□□□□□ -1.4
USP34-216ENST00000487547 RETSATQ6NUM9 610 aa6.31□□□□□ -1.4
USP34-216ENST00000487547 TRILQ7L0X0 811 aa6.31□□□□□ -1.4
USP34-216ENST00000487547 CHD1LQ86WJ1 897 aa6.31□□□□□ -1.4
USP34-216ENST00000487547 LSM14AQ8ND56 463 aaKnown RBP6.31□□□□□ -1.4
USP34-216ENST00000487547 RASSF8Q8NHQ8 419 aa6.31□□□□□ -1.4
USP34-216ENST00000487547 APOLD1Q96LR9 279 aa6.31□□□□□ -1.4
USP34-216ENST00000487547 LHPPQ9H008 270 aa6.31□□□□□ -1.4
USP34-216ENST00000487547 CDT1Q9H211 546 aa6.31□□□□□ -1.4
USP34-216ENST00000487547 MROH8Q9H579 483 aa6.31□□□□□ -1.4
USP34-216ENST00000487547 PCDHGB5Q9Y5G0 923 aa6.31□□□□□ -1.4
USP34-216ENST00000487547 CCDC196A0A1B0GTZ2 297 aa6.3□□□□□ -1.4
USP34-216ENST00000487547 KRTAP29-1A8MX34 341 aaPredicted RBP6.3□□□□□ -1.4
USP34-216ENST00000487547 PER2O15055 1255 aa6.3□□□□□ -1.4
USP34-216ENST00000487547 CEP104O60308 925 aa6.3□□□□□ -1.4
USP34-216ENST00000487547 PRSS2P07478 247 aa6.3□□□□□ -1.4
USP34-216ENST00000487547 HOXB6P17509 224 aaKnown RBP6.3□□□□□ -1.4
USP34-216ENST00000487547 CTPS1P17812 591 aa6.3□□□□□ -1.4
USP34-216ENST00000487547 RFX5P48382 616 aaPredicted RBP6.3□□□□□ -1.4
USP34-216ENST00000487547 ABATP80404 500 aa6.3□□□□□ -1.4
USP34-216ENST00000487547 ADORA2A-AS1P86434 159 aa6.3□□□□□ -1.4
USP34-216ENST00000487547 ZXDBP98169 803 aa6.3□□□□□ -1.4
USP34-216ENST00000487547 LTBQ06643 244 aa6.3□□□□□ -1.4
USP34-216ENST00000487547 FBXO43Q4G163 708 aa6.3□□□□□ -1.4
USP34-216ENST00000487547 C8orf82Q6P1X6 216 aaPredicted RBP6.3□□□□□ -1.4
USP34-216ENST00000487547 NEK10Q6ZWH5 1172 aa6.3□□□□□ -1.4
USP34-216ENST00000487547 CPOQ8IVL8 374 aa6.3□□□□□ -1.4
USP34-216ENST00000487547 DENND6AQ8IWF6 608 aa6.3□□□□□ -1.4
USP34-216ENST00000487547 ADHFE1Q8IWW8 467 aa6.3□□□□□ -1.4
USP34-216ENST00000487547 ZNF479Q96JC4 524 aa6.3□□□□□ -1.4
USP34-216ENST00000487547 MAELQ96JY0 434 aaKnown RBP6.3□□□□□ -1.4
USP34-216ENST00000487547 CLSTN3Q9BQT9 956 aa6.3□□□□□ -1.4
USP34-216ENST00000487547 MVB12BQ9H7P6 319 aa6.3□□□□□ -1.4
USP34-216ENST00000487547 TMEM160Q9NX00 188 aa6.3□□□□□ -1.4
USP34-216ENST00000487547 EBAG9O00559 213 aa6.29□□□□□ -1.4
USP34-216ENST00000487547 ZNF8P17098 575 aaPredicted RBP6.29□□□□□ -1.4
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.9 ms