RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000484841.5

ACTB-212, Transcript of actin beta, humanhuman

TSL 5

Gene ACTB, Length 1,032 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Lamellipodium, Mitochondria, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTB-212ENST00000484841 MYLKQ15746 1914 aa20.5■□□□□ 0.87
ACTB-212ENST00000484841 GOLGA4Q13439 2230 aaKnown RBP20.5■□□□□ 0.87
ACTB-212ENST00000484841 SIGLEC16A6NMB1 481 aa20.49■□□□□ 0.87
ACTB-212ENST00000484841 RNF103O00237 685 aa20.49■□□□□ 0.87
ACTB-212ENST00000484841 BUB1O43683 1085 aa20.49■□□□□ 0.87
ACTB-212ENST00000484841 KDELR3O43731 214 aa20.49■□□□□ 0.87
ACTB-212ENST00000484841 GSRP00390 522 aa20.49■□□□□ 0.87
ACTB-212ENST00000484841 EPHB2P29323 1055 aa20.49■□□□□ 0.87
ACTB-212ENST00000484841 HDAC4P56524 1084 aa20.49■□□□□ 0.87
ACTB-212ENST00000484841 GSCP56915 257 aaPredicted RBP20.49■□□□□ 0.87
ACTB-212ENST00000484841 HNRNPKP61978 463 aaKnown RBP eCLIP20.49■□□□□ 0.872e-7■□□□□ 8.8
ACTB-212ENST00000484841 PROX2Q3B8N5 592 aa20.49■□□□□ 0.87
ACTB-212ENST00000484841 ZNF805Q5CZA5 627 aa20.49■□□□□ 0.87
ACTB-212ENST00000484841 MANEALQ5VSG8 457 aa20.49■□□□□ 0.87
ACTB-212ENST00000484841 DCUN1D2Q6PH85 259 aa20.49■□□□□ 0.87
ACTB-212ENST00000484841 WDR59Q6PJI9 974 aa20.49■□□□□ 0.87
ACTB-212ENST00000484841 GCNT7Q6ZNI0 430 aa20.49■□□□□ 0.87
ACTB-212ENST00000484841 PARS2Q7L3T8 475 aaKnown RBP20.49■□□□□ 0.87
ACTB-212ENST00000484841 ABI3BPQ7Z7G0 1075 aa20.49■□□□□ 0.87
ACTB-212ENST00000484841 NLRP14Q86W24 1093 aa20.49■□□□□ 0.87
ACTB-212ENST00000484841 OR6K2Q8NGY2 324 aa20.49■□□□□ 0.87
ACTB-212ENST00000484841 OR4C6Q8NH72 309 aa20.49■□□□□ 0.87
ACTB-212ENST00000484841 CENPIQ92674 756 aaPredicted RBP20.49■□□□□ 0.87
ACTB-212ENST00000484841 PCDHB18PQ96TA0 734 aa20.49■□□□□ 0.87
ACTB-212ENST00000484841 AGPAT1Q99943 283 aa20.49■□□□□ 0.87
ACTB-212ENST00000484841 CATSPERBQ9H7T0 1116 aa20.49■□□□□ 0.87
ACTB-212ENST00000484841 NDFIP2Q9NV92 336 aa20.49■□□□□ 0.87
ACTB-212ENST00000484841 CLCA2Q9UQC9 943 aa20.49■□□□□ 0.87
ACTB-212ENST00000484841 CHD5Q8TDI0 1954 aa20.48■□□□□ 0.87
ACTB-212ENST00000484841 FAM72CH0Y354 149 aa20.48■□□□□ 0.87
ACTB-212ENST00000484841 TRIM38O00635 465 aa20.48■□□□□ 0.87
ACTB-212ENST00000484841 CREB3O43889 395 aa20.48■□□□□ 0.87
ACTB-212ENST00000484841 PIAS2O75928 621 aa20.48■□□□□ 0.87
ACTB-212ENST00000484841 RABIFP47224 123 aa20.48■□□□□ 0.87
ACTB-212ENST00000484841 CLDN6P56747 220 aa20.48■□□□□ 0.87
ACTB-212ENST00000484841 FAM72AQ5TYM5 149 aa20.48■□□□□ 0.87
ACTB-212ENST00000484841 FAM72DQ6L9T8 149 aa20.48■□□□□ 0.87
ACTB-212ENST00000484841 KYAT3Q6YP21 454 aaKnown RBP20.48■□□□□ 0.87
ACTB-212ENST00000484841 LEKR1Q6ZMV7 388 aa20.48■□□□□ 0.87
ACTB-212ENST00000484841 PDZD3Q86UT5 571 aa20.48■□□□□ 0.87
ACTB-212ENST00000484841 FAM72BQ86X60 149 aa20.48■□□□□ 0.87
ACTB-212ENST00000484841 SLC25A45Q8N413 288 aa20.48■□□□□ 0.87
ACTB-212ENST00000484841 CASKIN2Q8WXE0 1202 aa20.48■□□□□ 0.87
ACTB-212ENST00000484841 GDAP1L1Q96MZ0 367 aa20.48■□□□□ 0.87
ACTB-212ENST00000484841 EPAS1Q99814 870 aa20.48■□□□□ 0.87
ACTB-212ENST00000484841 DUSP23Q9BVJ7 150 aa20.48■□□□□ 0.87
ACTB-212ENST00000484841 NRSN2Q9GZP1 204 aa20.48■□□□□ 0.87
ACTB-212ENST00000484841 C16orf96A6NNT2 1141 aa20.47■□□□□ 0.87
ACTB-212ENST00000484841 CD160O95971 181 aa20.47■□□□□ 0.87
ACTB-212ENST00000484841 IGSF6O95976 241 aa20.47■□□□□ 0.87
ACTB-212ENST00000484841 UGT2B4P06133 528 aa20.47■□□□□ 0.87
ACTB-212ENST00000484841 FERP16591 822 aa20.47■□□□□ 0.87
ACTB-212ENST00000484841 GKP32189 559 aa20.47■□□□□ 0.87
ACTB-212ENST00000484841 DUSP3P51452 185 aaPredicted RBP20.47■□□□□ 0.87
ACTB-212ENST00000484841 AIF1P55008 147 aa20.47■□□□□ 0.87
ACTB-212ENST00000484841 SEMG2Q02383 582 aa20.47■□□□□ 0.87
ACTB-212ENST00000484841 C1QBPQ07021 282 aaKnown RBP20.47■□□□□ 0.87
ACTB-212ENST00000484841 PTP4A2Q12974 167 aa20.47■□□□□ 0.87
ACTB-212ENST00000484841 MYLK3Q32MK0 819 aa20.47■□□□□ 0.87
ACTB-212ENST00000484841 ARTNQ5T4W7 220 aa20.47■□□□□ 0.87
ACTB-212ENST00000484841 PPP1R2P3Q6NXS1 205 aa20.47■□□□□ 0.87
ACTB-212ENST00000484841 LRRC69Q6ZNQ3 347 aa20.47■□□□□ 0.87
ACTB-212ENST00000484841 TMC6Q7Z403 805 aa20.47■□□□□ 0.87
ACTB-212ENST00000484841 TTC7BQ86TV6 843 aa20.47■□□□□ 0.87
ACTB-212ENST00000484841 RTL3Q8N8U3 475 aaKnown RBP20.47■□□□□ 0.87
ACTB-212ENST00000484841 KLHL32Q96NJ5 620 aa20.47■□□□□ 0.87
ACTB-212ENST00000484841 NAT10Q9H0A0 1025 aaKnown RBP20.47■□□□□ 0.87
ACTB-212ENST00000484841 UCKL1Q9NWZ5 548 aa20.47■□□□□ 0.87
ACTB-212ENST00000484841 DONSONQ9NYP3 566 aa20.47■□□□□ 0.87
ACTB-212ENST00000484841 NLGN3Q9NZ94 848 aa20.47■□□□□ 0.87
ACTB-212ENST00000484841 IGLON5A6NGN9 336 aa20.46■□□□□ 0.87
ACTB-212ENST00000484841 CCP110O43303 1012 aa20.46■□□□□ 0.87
ACTB-212ENST00000484841 TNFAIP3P21580 790 aa20.46■□□□□ 0.87
ACTB-212ENST00000484841 XPAP23025 273 aaPredicted RBP20.46■□□□□ 0.87
ACTB-212ENST00000484841 ZNF143P52747 638 aaPredicted RBP20.46■□□□□ 0.87
ACTB-212ENST00000484841 YBEYP58557 167 aaPredicted RBP20.46■□□□□ 0.87
ACTB-212ENST00000484841 ZNF542PQ5EBM4 170 aa20.46■□□□□ 0.87
ACTB-212ENST00000484841 GDPD4Q6W3E5 623 aa20.46■□□□□ 0.87
ACTB-212ENST00000484841 PARGQ86W56 976 aa20.46■□□□□ 0.87
ACTB-212ENST00000484841 SLC22A18ASQ8N1D0 253 aa20.46■□□□□ 0.87
ACTB-212ENST00000484841 BMFQ96LC9 184 aa20.46■□□□□ 0.87
ACTB-212ENST00000484841 MCEEQ96PE7 176 aa20.46■□□□□ 0.87
ACTB-212ENST00000484841 ERGIC2Q96RQ1 377 aa20.46■□□□□ 0.87
ACTB-212ENST00000484841 NCAPGQ9BPX3 1015 aa20.46■□□□□ 0.87
ACTB-212ENST00000484841 C1QTNF7Q9BXJ2 289 aa20.46■□□□□ 0.87
ACTB-212ENST00000484841 ABCG4Q9H172 646 aa20.46■□□□□ 0.87
ACTB-212ENST00000484841 CFAP47Q6ZTR5 3102 aa20.46■□□□□ 0.87
ACTB-212ENST00000484841 POM121BA6NF01 834 aa20.45■□□□□ 0.86
ACTB-212ENST00000484841 RRP8O43159 456 aaKnown RBP20.45■□□□□ 0.86
ACTB-212ENST00000484841 MBD3O95983 291 aa20.45■□□□□ 0.86
ACTB-212ENST00000484841 THOP1P52888 689 aa20.45■□□□□ 0.86
ACTB-212ENST00000484841 RHOAP61586 193 aa20.45■□□□□ 0.86
ACTB-212ENST00000484841 INSM1Q01101 510 aaPredicted RBP20.45■□□□□ 0.86
ACTB-212ENST00000484841 PDE1CQ14123 709 aaPredicted RBP20.45■□□□□ 0.86
ACTB-212ENST00000484841 PTK2BQ14289 1009 aa20.45■□□□□ 0.86
ACTB-212ENST00000484841 INO80DQ53TQ3 878 aaPredicted RBP20.45■□□□□ 0.86
ACTB-212ENST00000484841 ATXN7L2Q5T6C5 722 aaPredicted RBP20.45■□□□□ 0.86
ACTB-212ENST00000484841 MON1BQ7L1V2 547 aa20.45■□□□□ 0.86
ACTB-212ENST00000484841 CACTIN-AS1Q8N1I8 211 aa20.45■□□□□ 0.86
ACTB-212ENST00000484841 DENND6BQ8NEG7 585 aa20.45■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.1 ms