RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000483859.6

SENP6-208, Transcript of SUMO specific peptidase 6, humanhuman

TSL 3

Gene SENP6, Length 1,013 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Exosome, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SENP6-208ENST00000483859 HIST2H2BDQ6DRA6 164 aa3.49□□□□□ -1.85
SENP6-208ENST00000483859 TMEM71Q6P5X7 295 aa3.49□□□□□ -1.85
SENP6-208ENST00000483859 AAGABQ6PD74 315 aa3.49□□□□□ -1.85
SENP6-208ENST00000483859 UBE2Q1Q7Z7E8 422 aa3.49□□□□□ -1.85
SENP6-208ENST00000483859 SUGP2Q8IX01 1082 aaKnown RBP eCLIP3.49□□□□□ -1.85
SENP6-208ENST00000483859 GHDCQ8N2G8 530 aa3.49□□□□□ -1.85
SENP6-208ENST00000483859 TSPYL6Q8N831 410 aa3.49□□□□□ -1.85
SENP6-208ENST00000483859 KDM1BQ8NB78 822 aa3.49□□□□□ -1.85
SENP6-208ENST00000483859 OR4N2Q8NGD1 307 aa3.49□□□□□ -1.85
SENP6-208ENST00000483859 BCAS4Q8TDM0 211 aa3.49□□□□□ -1.85
SENP6-208ENST00000483859 HDAC7Q8WUI4 952 aa3.49□□□□□ -1.85
SENP6-208ENST00000483859 COQ8BQ96D53 544 aa3.49□□□□□ -1.85
SENP6-208ENST00000483859 PERPQ96FX8 193 aa3.49□□□□□ -1.85
SENP6-208ENST00000483859 CD180Q99467 661 aa3.49□□□□□ -1.85
SENP6-208ENST00000483859 ACTR5Q9H9F9 607 aaPredicted RBP3.49□□□□□ -1.85
SENP6-208ENST00000483859 WDR6Q9NNW5 1121 aaKnown RBP3.49□□□□□ -1.85
SENP6-208ENST00000483859 BEX4Q9NWD9 120 aaPredicted RBP3.49□□□□□ -1.85
SENP6-208ENST00000483859 AASSQ9UDR5 926 aa3.49□□□□□ -1.85
SENP6-208ENST00000483859 CLDN16Q9Y5I7 305 aa3.49□□□□□ -1.85
SENP6-208ENST00000483859 MST1RQ04912 1400 aa3.49□□□□□ -1.85
SENP6-208ENST00000483859 A0A1W2PPH5 198 aa3.48□□□□□ -1.85
SENP6-208ENST00000483859 A0A1W2PQM1 296 aa3.48□□□□□ -1.85
SENP6-208ENST00000483859 DPPA5A6NC42 116 aa3.48□□□□□ -1.85
SENP6-208ENST00000483859 PRSS44E7EML9 344 aa3.48□□□□□ -1.85
SENP6-208ENST00000483859 RTN3O95197 1032 aaPredicted RBP3.48□□□□□ -1.85
SENP6-208ENST00000483859 CLDN7O95471 211 aa3.48□□□□□ -1.85
SENP6-208ENST00000483859 HLA-DQA2P01906 255 aa3.48□□□□□ -1.85
SENP6-208ENST00000483859 UNGP13051 313 aaPredicted RBP3.48□□□□□ -1.85
SENP6-208ENST00000483859 PRF1P14222 555 aa3.48□□□□□ -1.85
SENP6-208ENST00000483859 CAPN3P20807 821 aa3.48□□□□□ -1.85
SENP6-208ENST00000483859 MAPK4P31152 587 aa3.48□□□□□ -1.85
SENP6-208ENST00000483859 KRT9P35527 623 aa3.48□□□□□ -1.85
SENP6-208ENST00000483859 DPP6P42658 865 aa3.48□□□□□ -1.85
SENP6-208ENST00000483859 RXRGP48443 463 aa3.48□□□□□ -1.85
SENP6-208ENST00000483859 CXCR3P49682 368 aa3.48□□□□□ -1.85
SENP6-208ENST00000483859 CCR9P51686 369 aa3.48□□□□□ -1.85
SENP6-208ENST00000483859 ARSFP54793 590 aa3.48□□□□□ -1.85
SENP6-208ENST00000483859 GAD2Q05329 585 aa3.48□□□□□ -1.85
SENP6-208ENST00000483859 LMOD3Q0VAK6 560 aa3.48□□□□□ -1.85
SENP6-208ENST00000483859 TBCEQ15813 527 aaPredicted RBP3.48□□□□□ -1.85
SENP6-208ENST00000483859 C10orf25Q5T742 122 aa3.48□□□□□ -1.85
SENP6-208ENST00000483859 TMEM81Q6P7N7 255 aa3.48□□□□□ -1.85
SENP6-208ENST00000483859 DEF8Q6ZN54 512 aa3.48□□□□□ -1.85
SENP6-208ENST00000483859 RSRC2Q7L4I2 434 aaKnown RBP3.48□□□□□ -1.85
SENP6-208ENST00000483859 TMPRSS12Q86WS5 348 aa3.48□□□□□ -1.85
SENP6-208ENST00000483859 CPXM2Q8N436 756 aa3.48□□□□□ -1.85
SENP6-208ENST00000483859 SLC25A41Q8N5S1 370 aa3.48□□□□□ -1.85
SENP6-208ENST00000483859 ANKRD52Q8NB46 1076 aa3.48□□□□□ -1.85
SENP6-208ENST00000483859 DNAAF1Q8NEP3 725 aa3.48□□□□□ -1.85
SENP6-208ENST00000483859 PPHLN1Q8NEY8 458 aaKnown RBP3.48□□□□□ -1.85
SENP6-208ENST00000483859 RASSF8Q8NHQ8 419 aa3.48□□□□□ -1.85
SENP6-208ENST00000483859 GDPD5Q8WTR4 605 aa3.48□□□□□ -1.85
SENP6-208ENST00000483859 UCMAQ8WVF2 138 aa3.48□□□□□ -1.85
SENP6-208ENST00000483859 SKA1Q96BD8 255 aa3.48□□□□□ -1.85
SENP6-208ENST00000483859 KIF1BPQ96EK5 621 aa3.48□□□□□ -1.85
SENP6-208ENST00000483859 KLHL15Q96M94 604 aa3.48□□□□□ -1.85
SENP6-208ENST00000483859 NR1H4Q96RI1 486 aaPredicted RBP3.48□□□□□ -1.85
SENP6-208ENST00000483859 TRMOQ9BU70 441 aa3.48□□□□□ -1.85
SENP6-208ENST00000483859 IFT27Q9BW83 186 aa3.48□□□□□ -1.85
SENP6-208ENST00000483859 JMJD4Q9H9V9 463 aa3.48□□□□□ -1.85
SENP6-208ENST00000483859 BRF2Q9HAW0 419 aa3.48□□□□□ -1.85
SENP6-208ENST00000483859 SNTG1Q9NSN8 517 aa3.48□□□□□ -1.85
SENP6-208ENST00000483859 ZBTB40Q9NUA8 1239 aa3.48□□□□□ -1.85
SENP6-208ENST00000483859 C20orf141Q9NUB4 165 aa3.48□□□□□ -1.85
SENP6-208ENST00000483859 GRHL1Q9NZI5 618 aa3.48□□□□□ -1.85
SENP6-208ENST00000483859 SARDHQ9UL12 918 aa3.48□□□□□ -1.85
SENP6-208ENST00000483859 DHDHQ9UQ10 334 aa3.48□□□□□ -1.85
SENP6-208ENST00000483859 KDM3AQ9Y4C1 1321 aa3.47□□□□□ -1.85
SENP6-208ENST00000483859 TEX13CA0A0J9YWL9 993 aa3.47□□□□□ -1.85
SENP6-208ENST00000483859 TMEM272A0A1B0GTI8 110 aa3.47□□□□□ -1.85
SENP6-208ENST00000483859 C17orf113A0A1B0GUU1 675 aa3.47□□□□□ -1.85
SENP6-208ENST00000483859 NPIPB15A6NHN6 443 aaPredicted RBP3.47□□□□□ -1.85
SENP6-208ENST00000483859 FAM157AC9JC47 383 aa3.47□□□□□ -1.85
SENP6-208ENST00000483859 TMCC1O94876 653 aa3.47□□□□□ -1.85
SENP6-208ENST00000483859 SEC31AO94979 1220 aaKnown RBP3.47□□□□□ -1.85
SENP6-208ENST00000483859 NDUFB8O95169 186 aa3.47□□□□□ -1.85
SENP6-208ENST00000483859 SKIV2L2P42285 1042 aaKnown RBP3.47□□□□□ -1.85
SENP6-208ENST00000483859 PAFAH1B1P43034 410 aa3.47□□□□□ -1.85
SENP6-208ENST00000483859 RFX5P48382 616 aaPredicted RBP3.47□□□□□ -1.85
SENP6-208ENST00000483859 CLDN2P57739 230 aa3.47□□□□□ -1.85
SENP6-208ENST00000483859 CAMK1Q14012 370 aa3.47□□□□□ -1.85
SENP6-208ENST00000483859 KRT32Q14532 448 aa3.47□□□□□ -1.85
SENP6-208ENST00000483859 RALBP1Q15311 655 aa3.47□□□□□ -1.85
SENP6-208ENST00000483859 RBMS2Q15434 407 aaKnown RBP3.47□□□□□ -1.85
SENP6-208ENST00000483859 ALG10Q5BKT4 473 aa3.47□□□□□ -1.85
SENP6-208ENST00000483859 ALG10BQ5I7T1 473 aa3.47□□□□□ -1.85
SENP6-208ENST00000483859 TTC39AQ5SRH9 613 aa3.47□□□□□ -1.85
SENP6-208ENST00000483859 CCDC30Q5VVM6 783 aa3.47□□□□□ -1.85
SENP6-208ENST00000483859 ISM2Q6H9L7 571 aa3.47□□□□□ -1.85
SENP6-208ENST00000483859 LRRC8EQ6NSJ5 796 aa3.47□□□□□ -1.85
SENP6-208ENST00000483859 SHC4Q6S5L8 630 aa3.47□□□□□ -1.85
SENP6-208ENST00000483859 FAM160B2Q86V87 743 aa3.47□□□□□ -1.85
SENP6-208ENST00000483859 ANKRD13BQ86YJ7 626 aa3.47□□□□□ -1.85
SENP6-208ENST00000483859 CADM3Q8N126 398 aa3.47□□□□□ -1.85
SENP6-208ENST00000483859 PRSS3P2Q8NHM4 247 aa3.47□□□□□ -1.85
SENP6-208ENST00000483859 TDRD7Q8NHU6 1098 aaKnown RBP3.47□□□□□ -1.85
SENP6-208ENST00000483859 METTL6Q8TCB7 284 aa3.47□□□□□ -1.85
SENP6-208ENST00000483859 RFFLQ8WZ73 363 aa3.47□□□□□ -1.85
SENP6-208ENST00000483859 INPP5DQ92835 1189 aa3.47□□□□□ -1.85
SENP6-208ENST00000483859 SH3KBP1Q96B97 665 aa3.47□□□□□ -1.85
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 57.9 ms