RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000475060.1

CTPS1-207, Transcript of CTP synthase 1, humanhuman

TSL 5

Gene CTPS1, Length 813 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTPS1-207ENST00000475060 SATB1Q01826 763 aa6.6□□□□□ -1.35
CTPS1-207ENST00000475060 POU4F1Q01851 419 aa6.6□□□□□ -1.35
CTPS1-207ENST00000475060 NSUN2Q08J23 767 aaKnown RBP eCLIP6.6□□□□□ -1.35
CTPS1-207ENST00000475060 ASPHQ12797 758 aa6.6□□□□□ -1.35
CTPS1-207ENST00000475060 PRKAA1Q13131 559 aa6.6□□□□□ -1.35
CTPS1-207ENST00000475060 SLC12A1Q13621 1099 aa6.6□□□□□ -1.35
CTPS1-207ENST00000475060 GRM3Q14832 879 aa6.6□□□□□ -1.35
CTPS1-207ENST00000475060 HERC3Q15034 1050 aa6.6□□□□□ -1.35
CTPS1-207ENST00000475060 TRMT5Q32P41 509 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
CTPS1-207ENST00000475060 SLC39A12Q504Y0 691 aa6.6□□□□□ -1.35
CTPS1-207ENST00000475060 LIPMQ5VYY2 423 aa6.6□□□□□ -1.35
CTPS1-207ENST00000475060 SLC8B1Q6J4K2 584 aa6.6□□□□□ -1.35
CTPS1-207ENST00000475060 PGM2L1Q6PCE3 622 aa6.6□□□□□ -1.35
CTPS1-207ENST00000475060 ARHGAP36Q6ZRI8 547 aa6.6□□□□□ -1.35
CTPS1-207ENST00000475060 LRRC8DQ7L1W4 858 aa6.6□□□□□ -1.35
CTPS1-207ENST00000475060 OTOP3Q7RTS5 596 aa6.6□□□□□ -1.35
CTPS1-207ENST00000475060 NET1Q7Z628 596 aaPredicted RBP6.6□□□□□ -1.35
CTPS1-207ENST00000475060 CMC1Q7Z7K0 106 aa6.6□□□□□ -1.35
CTPS1-207ENST00000475060 C14orf80Q86SX3 495 aa6.6□□□□□ -1.35
CTPS1-207ENST00000475060 TTC7BQ86TV6 843 aa6.6□□□□□ -1.35
CTPS1-207ENST00000475060 ALYREFQ86V81 257 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
CTPS1-207ENST00000475060 LONP2Q86WA8 852 aa6.6□□□□□ -1.35
CTPS1-207ENST00000475060 C10orf107Q8IVU9 208 aa6.6□□□□□ -1.35
CTPS1-207ENST00000475060 FAM126BQ8IXS8 530 aa6.6□□□□□ -1.35
CTPS1-207ENST00000475060 GPR65Q8IYL9 337 aa6.6□□□□□ -1.35
CTPS1-207ENST00000475060 PLD6Q8N2A8 252 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
CTPS1-207ENST00000475060 CPSF7Q8N684 471 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
CTPS1-207ENST00000475060 TEX9Q8N6V9 391 aa6.6□□□□□ -1.35
CTPS1-207ENST00000475060 SLAIN1Q8ND83 568 aa6.6□□□□□ -1.35
CTPS1-207ENST00000475060 PDZD8Q8NEN9 1154 aa6.6□□□□□ -1.35
CTPS1-207ENST00000475060 GPR150Q8NGU9 434 aa6.6□□□□□ -1.35
CTPS1-207ENST00000475060 CALML6Q8TD86 181 aa6.6□□□□□ -1.35
CTPS1-207ENST00000475060 PPP4R1Q8TF05 950 aa6.6□□□□□ -1.35
CTPS1-207ENST00000475060 SREK1Q8WXA9 508 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
CTPS1-207ENST00000475060 PRR11Q96HE9 360 aaPredicted RBP6.6□□□□□ -1.35
CTPS1-207ENST00000475060 CELF6Q96J87 481 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
CTPS1-207ENST00000475060 FEM1CQ96JP0 617 aa6.6□□□□□ -1.35
CTPS1-207ENST00000475060 CASD1Q96PB1 797 aa6.6□□□□□ -1.35
CTPS1-207ENST00000475060 AGAP2Q99490 1192 aa6.6□□□□□ -1.35
CTPS1-207ENST00000475060 CCDC28BQ9BUN5 200 aa6.6□□□□□ -1.35
CTPS1-207ENST00000475060 CDH19Q9H159 772 aa6.6□□□□□ -1.35
CTPS1-207ENST00000475060 MFSD1Q9H3U5 465 aa6.6□□□□□ -1.35
CTPS1-207ENST00000475060 CWH43Q9H720 699 aa6.6□□□□□ -1.35
CTPS1-207ENST00000475060 NMRAL1Q9HBL8 299 aa6.6□□□□□ -1.35
CTPS1-207ENST00000475060 GPAMQ9HCL2 828 aa6.6□□□□□ -1.35
CTPS1-207ENST00000475060 ALG13Q9NP73 1137 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
CTPS1-207ENST00000475060 TLR8Q9NR97 1041 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
CTPS1-207ENST00000475060 C20orf96Q9NUD7 363 aaPredicted RBP6.6□□□□□ -1.35
CTPS1-207ENST00000475060 NDFIP2Q9NV92 336 aa6.6□□□□□ -1.35
CTPS1-207ENST00000475060 RBM22Q9NW64 420 aaKnown RBP eCLIP6.6□□□□□ -1.35
CTPS1-207ENST00000475060 VTI1BQ9UEU0 232 aa6.6□□□□□ -1.35
CTPS1-207ENST00000475060 SFMBT1Q9UHJ3 866 aa6.6□□□□□ -1.35
CTPS1-207ENST00000475060 STOML2Q9UJZ1 356 aa6.6□□□□□ -1.35
CTPS1-207ENST00000475060 VPS28Q9UK41 221 aa6.6□□□□□ -1.35
CTPS1-207ENST00000475060 DNAJC16Q9Y2G8 782 aa6.6□□□□□ -1.35
CTPS1-207ENST00000475060 INPP5FQ9Y2H2 1132 aa6.6□□□□□ -1.35
CTPS1-207ENST00000475060 RAP2CQ9Y3L5 183 aa6.6□□□□□ -1.35
CTPS1-207ENST00000475060 GBF1Q92538 1859 aa6.6□□□□□ -1.35
CTPS1-207ENST00000475060 PPAN-P2RY11A0A0B4J1V8 794 aaPredicted RBP6.59□□□□□ -1.35
CTPS1-207ENST00000475060 CARNS1A5YM72 827 aa6.59□□□□□ -1.35
CTPS1-207ENST00000475060 PALM2-AKAP2B1ALY0 433 aaPredicted RBP6.59□□□□□ -1.35
CTPS1-207ENST00000475060 F8W810 466 aa6.59□□□□□ -1.35
CTPS1-207ENST00000475060 SPECC1L-ADORA2AF8WAN1 911 aa6.59□□□□□ -1.35
CTPS1-207ENST00000475060 ENPP3O14638 875 aa6.59□□□□□ -1.35
CTPS1-207ENST00000475060 GYG2O15488 501 aa6.59□□□□□ -1.35
CTPS1-207ENST00000475060 MSI1O43347 362 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.35
CTPS1-207ENST00000475060 ATP9BO43861 1147 aa6.59□□□□□ -1.35
CTPS1-207ENST00000475060 CCNT2O60583 730 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.35
CTPS1-207ENST00000475060 PRAMEF11O60813 436 aa6.59□□□□□ -1.35
CTPS1-207ENST00000475060 NBNO60934 754 aa6.59□□□□□ -1.35
CTPS1-207ENST00000475060 ANP32DO95626 131 aa6.59□□□□□ -1.35
CTPS1-207ENST00000475060 LATS1O95835 1130 aa6.59□□□□□ -1.35
CTPS1-207ENST00000475060 MT-CYBP00156 380 aaPredicted RBP6.59□□□□□ -1.35
CTPS1-207ENST00000475060 AHSGP02765 367 aa6.59□□□□□ -1.35
CTPS1-207ENST00000475060 FGF1P05230 155 aa6.59□□□□□ -1.35
CTPS1-207ENST00000475060 ATXN1LP0C7T5 689 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.35
CTPS1-207ENST00000475060 NEFHP12036 1026 aa6.59□□□□□ -1.35
CTPS1-207ENST00000475060 ELNP15502 786 aa6.59□□□□□ -1.35
CTPS1-207ENST00000475060 HLA-DPA1P20036 260 aa6.59□□□□□ -1.35
CTPS1-207ENST00000475060 OGNP20774 298 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.35
CTPS1-207ENST00000475060 YY1P25490 414 aa6.59□□□□□ -1.35
CTPS1-207ENST00000475060 CD151P48509 253 aa6.59□□□□□ -1.35
CTPS1-207ENST00000475060 IDH3AP50213 366 aa6.59□□□□□ -1.35
CTPS1-207ENST00000475060 WNT3AP56704 352 aa6.59□□□□□ -1.35
CTPS1-207ENST00000475060 ACTR3P61158 418 aa6.59□□□□□ -1.35
CTPS1-207ENST00000475060 NAA20P61599 178 aa6.59□□□□□ -1.35
CTPS1-207ENST00000475060 USP46P62068 366 aa6.59□□□□□ -1.35
CTPS1-207ENST00000475060 IRX1P78414 480 aaPredicted RBP6.59□□□□□ -1.35
CTPS1-207ENST00000475060 NFKB2Q00653 900 aa6.59□□□□□ -1.35
CTPS1-207ENST00000475060 ZBTB16Q05516 673 aa6.59□□□□□ -1.35
CTPS1-207ENST00000475060 SF3A3Q12874 501 aaKnown RBP eCLIP6.59□□□□□ -1.35
CTPS1-207ENST00000475060 BFSP2Q13515 415 aa6.59□□□□□ -1.35
CTPS1-207ENST00000475060 OLIG2Q13516 323 aa6.59□□□□□ -1.35
CTPS1-207ENST00000475060 SERINC3Q13530 473 aa6.59□□□□□ -1.35
CTPS1-207ENST00000475060 ITGA9Q13797 1035 aa6.59□□□□□ -1.35
CTPS1-207ENST00000475060 RCN2Q14257 317 aa6.59□□□□□ -1.35
CTPS1-207ENST00000475060 RFTN1Q14699 578 aaPredicted RBP6.59□□□□□ -1.35
CTPS1-207ENST00000475060 PAN2Q504Q3 1202 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.35
CTPS1-207ENST00000475060 PPM1JQ5JR12 505 aa6.59□□□□□ -1.35
CTPS1-207ENST00000475060 FAM182AQ5T1J6 154 aa6.59□□□□□ -1.35
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