RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000465902.1

USP19-210, Transcript of ubiquitin specific peptidase 19, human

TSL 3

Gene USP19, Length 617 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
USP19-210	ENST00000465902	PPP1R16A	Q96I34	528 aa		18.04	■□□□□ 0.48
USP19-210	ENST00000465902	EXOC2	Q96KP1	924 aa		18.04	■□□□□ 0.48
USP19-210	ENST00000465902	ZNF670	Q9BS34	389 aa		18.04	■□□□□ 0.48
USP19-210	ENST00000465902	MAK16	Q9BXY0	300 aa	Known RBP	18.04	■□□□□ 0.48
USP19-210	ENST00000465902	PILRB	Q9UKJ0	227 aa		18.04	■□□□□ 0.48
USP19-210	ENST00000465902	ALG6	Q9Y672	507 aa		18.04	■□□□□ 0.48
USP19-210	ENST00000465902	DUSP10	Q9Y6W6	482 aa		18.04	■□□□□ 0.48
USP19-210	ENST00000465902	PATE3	B3GLJ2	98 aa		18.03	■□□□□ 0.48
USP19-210	ENST00000465902	POP4	O95707	220 aa	Known RBP	18.03	■□□□□ 0.48
USP19-210	ENST00000465902	GNS	P15586	552 aa		18.03	■□□□□ 0.48
USP19-210	ENST00000465902	RAD51	Q06609	339 aa		18.03	■□□□□ 0.48
USP19-210	ENST00000465902	IL10RB	Q08334	325 aa		18.03	■□□□□ 0.48
USP19-210	ENST00000465902	CCDC15	Q0P6D6	951 aa		18.03	■□□□□ 0.48
USP19-210	ENST00000465902	CYTH1	Q15438	398 aa		18.03	■□□□□ 0.48
USP19-210	ENST00000465902	MYLK3	Q32MK0	819 aa		18.03	■□□□□ 0.48
USP19-210	ENST00000465902	PLA2G2C	Q5R387	149 aa		18.03	■□□□□ 0.48
USP19-210	ENST00000465902	PLPP6	Q8IY26	295 aa		18.03	■□□□□ 0.48
USP19-210	ENST00000465902	TXLNB	Q8N3L3	684 aa		18.03	■□□□□ 0.48
USP19-210	ENST00000465902	ATPAF2	Q8N5M1	289 aa		18.03	■□□□□ 0.48
USP19-210	ENST00000465902	OR2T34	Q8NGX1	318 aa		18.03	■□□□□ 0.48
USP19-210	ENST00000465902	PCDH19	Q8TAB3	1148 aa		18.03	■□□□□ 0.48
USP19-210	ENST00000465902	TRAF3IP1	Q8TDR0	691 aa	Predicted RBP	18.03	■□□□□ 0.48
USP19-210	ENST00000465902	RNF25	Q96BH1	459 aa	Predicted RBP	18.03	■□□□□ 0.48
USP19-210	ENST00000465902	CINP	Q9BW66	212 aa	Predicted RBP	18.03	■□□□□ 0.48
USP19-210	ENST00000465902	PCED1A	Q9H1Q7	454 aa		18.03	■□□□□ 0.48
USP19-210	ENST00000465902	PDF	Q9HBH1	243 aa		18.03	■□□□□ 0.48
USP19-210	ENST00000465902	DDX56	Q9NY93	547 aa	Known RBP	18.03	■□□□□ 0.48
USP19-210	ENST00000465902	EVL	Q9UI08	416 aa	Predicted RBP	18.03	■□□□□ 0.48
USP19-210	ENST00000465902	EIF2B4	Q9UI10	523 aa	Known RBP	18.03	■□□□□ 0.48
USP19-210	ENST00000465902	CDV3	Q9UKY7	258 aa	Known RBP	18.03	■□□□□ 0.48
USP19-210	ENST00000465902	WASF2	Q9Y6W5	498 aa		18.03	■□□□□ 0.48
USP19-210	ENST00000465902	RNF103	O00237	685 aa		18.02	■□□□□ 0.48
USP19-210	ENST00000465902	ADPRH	P54922	357 aa		18.02	■□□□□ 0.48
USP19-210	ENST00000465902	KIF5A	Q12840	1032 aa		18.02	■□□□□ 0.48
USP19-210	ENST00000465902	DUOXA1	Q1HG43	343 aa		18.02	■□□□□ 0.48
USP19-210	ENST00000465902	TRIM61	Q5EBN2	209 aa		18.02	■□□□□ 0.48
USP19-210	ENST00000465902	LRRC38	Q5VT99	294 aa		18.02	■□□□□ 0.48
USP19-210	ENST00000465902	KIAA0895L	Q68EN5	471 aa		18.02	■□□□□ 0.48
USP19-210	ENST00000465902	NCBP2-AS2	Q69YL0	99 aa		18.02	■□□□□ 0.48
USP19-210	ENST00000465902	TPCN2	Q8NHX9	752 aa		18.02	■□□□□ 0.48
USP19-210	ENST00000465902	NSMCE1	Q8WV22	266 aa		18.02	■□□□□ 0.48
USP19-210	ENST00000465902	ARRDC3	Q96B67	414 aa		18.02	■□□□□ 0.48
USP19-210	ENST00000465902	BIRC7	Q96CA5	298 aa		18.02	■□□□□ 0.48
USP19-210	ENST00000465902	NUSAP1	Q9BXS6	441 aa	Known RBP	18.02	■□□□□ 0.48
USP19-210	ENST00000465902	LACRT	Q9GZZ8	138 aa		18.02	■□□□□ 0.48
USP19-210	ENST00000465902	SALL4	Q9UJQ4	1053 aa		18.02	■□□□□ 0.48
USP19-210	ENST00000465902	ZBTB32	Q9Y2Y4	487 aa	Predicted RBP	18.02	■□□□□ 0.48
USP19-210	ENST00000465902	TRPM6	Q9BX84	2022 aa		18.01	■□□□□ 0.47
USP19-210	ENST00000465902	SLC7A4	O43246	635 aa		18.01	■□□□□ 0.47
USP19-210	ENST00000465902	MFSD11	O43934	449 aa		18.01	■□□□□ 0.47
USP19-210	ENST00000465902	MAP3K6	O95382	1288 aa		18.01	■□□□□ 0.47
USP19-210	ENST00000465902	UGT2B4	P06133	528 aa		18.01	■□□□□ 0.47
USP19-210	ENST00000465902	AGBL4	Q5VU57	503 aa		18.01	■□□□□ 0.47
USP19-210	ENST00000465902	C11orf63	Q6NUN7	778 aa		18.01	■□□□□ 0.47
USP19-210	ENST00000465902	FBXL19	Q6PCT2	694 aa		18.01	■□□□□ 0.47
USP19-210	ENST00000465902	ERN2	Q76MJ5	926 aa	Known RBP	18.01	■□□□□ 0.47
USP19-210	ENST00000465902	RABEPK	Q7Z6M1	372 aa		18.01	■□□□□ 0.47
USP19-210	ENST00000465902	RFX6	Q8HWS3	928 aa		18.01	■□□□□ 0.47
USP19-210	ENST00000465902	ZCCHC9	Q8N567	271 aa	Known RBP	18.01	■□□□□ 0.47
USP19-210	ENST00000465902	PAF1	Q8N7H5	531 aa		18.01	■□□□□ 0.47
USP19-210	ENST00000465902	TSEN2	Q8NCE0	465 aa	Known RBP	18.01	■□□□□ 0.47
USP19-210	ENST00000465902	CEP76	Q8TAP6	659 aa		18.01	■□□□□ 0.47
USP19-210	ENST00000465902	NETO1	Q8TDF5	533 aa		18.01	■□□□□ 0.47
USP19-210	ENST00000465902	RNF157	Q96PX1	679 aa		18.01	■□□□□ 0.47
USP19-210	ENST00000465902	RTKN	Q9BST9	563 aa		18.01	■□□□□ 0.47
USP19-210	ENST00000465902	LHX3	Q9UBR4	397 aa		18.01	■□□□□ 0.47
USP19-210	ENST00000465902	SUSD2	Q9UGT4	822 aa		18.01	■□□□□ 0.47
USP19-210	ENST00000465902	SBDS	Q9Y3A5	250 aa	Known RBP eCLIP	18.01	■□□□□ 0.47
USP19-210	ENST00000465902	KNL1	Q8NG31	2342 aa		18	■□□□□ 0.47
USP19-210	ENST00000465902	LOC105378220	A0A1B0GUY1	285 aa	Predicted RBP	18	■□□□□ 0.47
USP19-210	ENST00000465902	MACROD2	A1Z1Q3	448 aa		18	■□□□□ 0.47
USP19-210	ENST00000465902	INSIG1	O15503	277 aa		18	■□□□□ 0.47
USP19-210	ENST00000465902	PSTPIP1	O43586	416 aa		18	■□□□□ 0.47
USP19-210	ENST00000465902	ITGB7	P26010	798 aa		18	■□□□□ 0.47
USP19-210	ENST00000465902	HOXD12	P35452	270 aa		18	■□□□□ 0.47
USP19-210	ENST00000465902	IRX4	P78413	519 aa		18	■□□□□ 0.47
USP19-210	ENST00000465902	ZNF235	Q14590	738 aa		18	■□□□□ 0.47
USP19-210	ENST00000465902	RFTN1	Q14699	578 aa	Predicted RBP	18	■□□□□ 0.47
USP19-210	ENST00000465902	LBR	Q14739	615 aa	Known RBP	18	■□□□□ 0.47
USP19-210	ENST00000465902	PAFAH1B3	Q15102	231 aa	Known RBP	18	■□□□□ 0.47
USP19-210	ENST00000465902	PIP5KL1	Q5T9C9	394 aa		18	■□□□□ 0.47
USP19-210	ENST00000465902	TMCO4	Q5TGY1	634 aa		18	■□□□□ 0.47
USP19-210	ENST00000465902	GDPD4	Q6W3E5	623 aa		18	■□□□□ 0.47
USP19-210	ENST00000465902	PQLC3	Q8N755	202 aa		18	■□□□□ 0.47
USP19-210	ENST00000465902	KIAA1524	Q8TCG1	905 aa		18	■□□□□ 0.47
USP19-210	ENST00000465902	DNASE2B	Q8WZ79	361 aa		18	■□□□□ 0.47
USP19-210	ENST00000465902	FAF2	Q96CS3	445 aa		18	■□□□□ 0.47
USP19-210	ENST00000465902	LRIG1	Q96JA1	1093 aa		18	■□□□□ 0.47
USP19-210	ENST00000465902	CALR3	Q96L12	384 aa	Known RBP	18	■□□□□ 0.47
USP19-210	ENST00000465902	KLHL32	Q96NJ5	620 aa		18	■□□□□ 0.47
USP19-210	ENST00000465902	OSBPL1A	Q9BXW6	950 aa		18	■□□□□ 0.47
USP19-210	ENST00000465902	SEPT3	Q9UH03	358 aa		18	■□□□□ 0.47
USP19-210	ENST00000465902	HEY1	Q9Y5J3	304 aa		18	■□□□□ 0.47
USP19-210	ENST00000465902	PLXNA2	O75051	1894 aa		18	■□□□□ 0.47
USP19-210	ENST00000465902	CACNA1E	Q15878	2313 aa		17.99	■□□□□ 0.47
USP19-210	ENST00000465902	BTNL10	A8MVZ5	291 aa		17.99	■□□□□ 0.47
USP19-210	ENST00000465902	APOL1	O14791	398 aa		17.99	■□□□□ 0.47
USP19-210	ENST00000465902	BCAT2	O15382	392 aa	Predicted RBP	17.99	■□□□□ 0.47
USP19-210	ENST00000465902	PJA2	O43164	708 aa		17.99	■□□□□ 0.47
USP19-210	ENST00000465902	PLRG1	O43660	514 aa	Known RBP	17.99	■□□□□ 0.47

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.4 ms