RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000465576.1

CLRN1-AS1-201, CLRN1 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene CLRN1-AS1, Length 2,045 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 SESN2P58004 480 aaPredicted RBP6.51□□□□□ -1.37
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CLRN1-AS1-201ENST00000465576 CDK16Q00536 496 aa6.51□□□□□ -1.37
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 FCHO2Q0JRZ9 810 aa6.51□□□□□ -1.37
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 SLC12A1Q13621 1099 aa6.51□□□□□ -1.37
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 RFTN1Q14699 578 aaPredicted RBP6.51□□□□□ -1.37
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CLRN1-AS1-201ENST00000465576 MTSS1LQ765P7 747 aa6.51□□□□□ -1.37
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CLRN1-AS1-201ENST00000465576 NOD2Q9HC29 1040 aa6.5□□□□□ -1.37
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CLRN1-AS1-201ENST00000465576 HPS4Q9NQG7 708 aa6.5□□□□□ -1.37
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CLRN1-AS1-201ENST00000465576 CHMP2BQ9UQN3 213 aa6.5□□□□□ -1.37
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 MAD1L1Q9Y6D9 718 aa6.5□□□□□ -1.37
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CLRN1-AS1-201ENST00000465576 COL6A3P12111 3177 aa6.5□□□□□ -1.37
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 PSMD3O43242 534 aa6.5□□□□□ -1.37
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 RIPK2O43353 540 aa6.5□□□□□ -1.37
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 ECI2O75521 394 aa6.5□□□□□ -1.37
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 TTC4O95801 387 aa6.5□□□□□ -1.37
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 AGTP01019 485 aa6.5□□□□□ -1.37
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 MMP2P08253 660 aa6.5□□□□□ -1.37
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 SERPINF2P08697 491 aa6.5□□□□□ -1.37
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 TPH1P17752 444 aa6.5□□□□□ -1.37
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 ELK3P41970 407 aa6.5□□□□□ -1.37
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 SLC6A11P48066 632 aa6.5□□□□□ -1.37
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 PLK1P53350 603 aa6.5□□□□□ -1.37
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