RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000459758.5

TTLL3-222, Transcript of tubulin tyrosine ligase like 3, human

TSL 4

Gene TTLL3, Length 555 nt, Biotype retained intron.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TTLL3-222	ENST00000459758	HLA-DQB2	P05538	268 aa		11.65	□□□□□ -0.54
TTLL3-222	ENST00000459758	HAPLN1	P10915	354 aa	Predicted RBP	11.65	□□□□□ -0.54
TTLL3-222	ENST00000459758	KCNA4	P22459	653 aa		11.65	□□□□□ -0.54
TTLL3-222	ENST00000459758	NMBR	P28336	390 aa		11.65	□□□□□ -0.54
TTLL3-222	ENST00000459758	SLC11A2	P49281	568 aa		11.65	□□□□□ -0.54
TTLL3-222	ENST00000459758	COPA	P53621	1224 aa		11.65	□□□□□ -0.54
TTLL3-222	ENST00000459758	WNT3A	P56704	352 aa		11.65	□□□□□ -0.54
TTLL3-222	ENST00000459758	DNAJB13	P59910	316 aa		11.65	□□□□□ -0.54
TTLL3-222	ENST00000459758	GALNT1	Q10472	559 aa	Predicted RBP	11.65	□□□□□ -0.54
TTLL3-222	ENST00000459758	MSLN	Q13421	630 aa	Predicted RBP	11.65	□□□□□ -0.54
TTLL3-222	ENST00000459758	ITGA9	Q13797	1035 aa		11.65	□□□□□ -0.54
TTLL3-222	ENST00000459758	RCN2	Q14257	317 aa		11.65	□□□□□ -0.54
TTLL3-222	ENST00000459758	POLD3	Q15054	466 aa	Predicted RBP	11.65	□□□□□ -0.54
TTLL3-222	ENST00000459758	MS4A13	Q5J8X5	152 aa		11.65	□□□□□ -0.54
TTLL3-222	ENST00000459758	C10orf120	Q5SQS8	335 aa		11.65	□□□□□ -0.54
TTLL3-222	ENST00000459758	SEL1L3	Q68CR1	1132 aa		11.65	□□□□□ -0.54
TTLL3-222	ENST00000459758	AAGAB	Q6PD74	315 aa		11.65	□□□□□ -0.54
TTLL3-222	ENST00000459758	APLF	Q8IW19	511 aa	Predicted RBP	11.65	□□□□□ -0.54
TTLL3-222	ENST00000459758	SCUBE1	Q8IWY4	988 aa		11.65	□□□□□ -0.54
TTLL3-222	ENST00000459758	LRRC43	Q8N309	656 aa		11.65	□□□□□ -0.54
TTLL3-222	ENST00000459758	PLD4	Q96BZ4	506 aa		11.65	□□□□□ -0.54
TTLL3-222	ENST00000459758	IFT43	Q96FT9	208 aa		11.65	□□□□□ -0.54
TTLL3-222	ENST00000459758	FEM1C	Q96JP0	617 aa		11.65	□□□□□ -0.54
TTLL3-222	ENST00000459758	SCYL1	Q96KG9	808 aa		11.65	□□□□□ -0.54
TTLL3-222	ENST00000459758	CNDP1	Q96KN2	507 aa		11.65	□□□□□ -0.54
TTLL3-222	ENST00000459758	TMEM209	Q96SK2	561 aa		11.65	□□□□□ -0.54
TTLL3-222	ENST00000459758	SERPINI1	Q99574	410 aa		11.65	□□□□□ -0.54
TTLL3-222	ENST00000459758	TRMO	Q9BU70	441 aa		11.65	□□□□□ -0.54
TTLL3-222	ENST00000459758	CADM1	Q9BY67	442 aa	Known RBP	11.65	□□□□□ -0.54
TTLL3-222	ENST00000459758	MAGEH1	Q9H213	219 aa		11.65	□□□□□ -0.54
TTLL3-222	ENST00000459758	YY1AP1	Q9H869	796 aa		11.65	□□□□□ -0.54
TTLL3-222	ENST00000459758	POPDC3	Q9HBV1	291 aa		11.65	□□□□□ -0.54
TTLL3-222	ENST00000459758	GPAM	Q9HCL2	828 aa		11.65	□□□□□ -0.54
TTLL3-222	ENST00000459758	TREX1	Q9NSU2	369 aa		11.65	□□□□□ -0.54
TTLL3-222	ENST00000459758	TAS2R1	Q9NYW7	299 aa		11.65	□□□□□ -0.54
TTLL3-222	ENST00000459758	ZNF212	Q9UDV6	495 aa		11.65	□□□□□ -0.54
TTLL3-222	ENST00000459758	MAFF	Q9ULX9	164 aa		11.65	□□□□□ -0.54
TTLL3-222	ENST00000459758	LIN7A	O14910	233 aa	Predicted RBP	11.64	□□□□□ -0.55
TTLL3-222	ENST00000459758	HDAC3	O15379	428 aa		11.64	□□□□□ -0.55
TTLL3-222	ENST00000459758	VAPB	O95292	243 aa		11.64	□□□□□ -0.55
TTLL3-222	ENST00000459758	ENO1	P06733	434 aa	Known RBP	11.64	□□□□□ -0.55
TTLL3-222	ENST00000459758	KIT	P10721	976 aa		11.64	□□□□□ -0.55
TTLL3-222	ENST00000459758	THRA	P10827	490 aa		11.64	□□□□□ -0.55
TTLL3-222	ENST00000459758	ELN	P15502	786 aa		11.64	□□□□□ -0.55
TTLL3-222	ENST00000459758	IBSP	P21815	317 aa	Predicted RBP	11.64	□□□□□ -0.55
TTLL3-222	ENST00000459758	CSRP3	P50461	194 aa		11.64	□□□□□ -0.55
TTLL3-222	ENST00000459758	RPL14	P50914	215 aa	Known RBP	11.64	□□□□□ -0.55
TTLL3-222	ENST00000459758	AP2B1	P63010	937 aa		11.64	□□□□□ -0.55
TTLL3-222	ENST00000459758	PRAME	P78395	509 aa		11.64	□□□□□ -0.55
TTLL3-222	ENST00000459758	SATB1	Q01826	763 aa		11.64	□□□□□ -0.55
TTLL3-222	ENST00000459758	ITK	Q08881	620 aa		11.64	□□□□□ -0.55
TTLL3-222	ENST00000459758	EFEMP1	Q12805	493 aa		11.64	□□□□□ -0.55
TTLL3-222	ENST00000459758	ZNF235	Q14590	738 aa		11.64	□□□□□ -0.55
TTLL3-222	ENST00000459758	GRM3	Q14832	879 aa		11.64	□□□□□ -0.55
TTLL3-222	ENST00000459758	POU6F1	Q14863	301 aa		11.64	□□□□□ -0.55
TTLL3-222	ENST00000459758	E2F5	Q15329	346 aa		11.64	□□□□□ -0.55
TTLL3-222	ENST00000459758	MAPRE2	Q15555	327 aa		11.64	□□□□□ -0.55
TTLL3-222	ENST00000459758	C5orf22	Q49AR2	442 aa		11.64	□□□□□ -0.55
TTLL3-222	ENST00000459758	TSTD2	Q5T7W7	516 aa		11.64	□□□□□ -0.55
TTLL3-222	ENST00000459758	LRRC8E	Q6NSJ5	796 aa		11.64	□□□□□ -0.55
TTLL3-222	ENST00000459758	FAM45BP	Q6NSW5	357 aa		11.64	□□□□□ -0.55
TTLL3-222	ENST00000459758	MRNIP	Q6NTE8	343 aa		11.64	□□□□□ -0.55
TTLL3-222	ENST00000459758	NEPRO	Q6NW34	567 aa		11.64	□□□□□ -0.55
TTLL3-222	ENST00000459758	C16orf46	Q6P387	395 aa		11.64	□□□□□ -0.55
TTLL3-222	ENST00000459758	OTOP3	Q7RTS5	596 aa		11.64	□□□□□ -0.55
TTLL3-222	ENST00000459758	ZNF354C	Q86Y25	554 aa		11.64	□□□□□ -0.55
TTLL3-222	ENST00000459758	ZNF280B	Q86YH2	543 aa		11.64	□□□□□ -0.55
TTLL3-222	ENST00000459758	UNC5B	Q8IZJ1	945 aa		11.64	□□□□□ -0.55
TTLL3-222	ENST00000459758	FAM45A	Q8TCE6	357 aa		11.64	□□□□□ -0.55
TTLL3-222	ENST00000459758	USP33	Q8TEY7	942 aa		11.64	□□□□□ -0.55
TTLL3-222	ENST00000459758	STYX	Q8WUJ0	223 aa		11.64	□□□□□ -0.55
TTLL3-222	ENST00000459758	MRGPRX2	Q96LB1	330 aa		11.64	□□□□□ -0.55
TTLL3-222	ENST00000459758	TTLL2	Q9BWV7	592 aa		11.64	□□□□□ -0.55
TTLL3-222	ENST00000459758	MFSD1	Q9H3U5	465 aa		11.64	□□□□□ -0.55
TTLL3-222	ENST00000459758	NMUR1	Q9HB89	426 aa		11.64	□□□□□ -0.55
TTLL3-222	ENST00000459758	ATP13A1	Q9HD20	1204 aa		11.64	□□□□□ -0.55
TTLL3-222	ENST00000459758	FBXO6	Q9NRD1	293 aa	Predicted RBP	11.64	□□□□□ -0.55
TTLL3-222	ENST00000459758	RNF186	Q9NXI6	227 aa		11.64	□□□□□ -0.55
TTLL3-222	ENST00000459758	GMIP	Q9P107	970 aa		11.64	□□□□□ -0.55
TTLL3-222	ENST00000459758	MCM8	Q9UJA3	840 aa		11.64	□□□□□ -0.55
TTLL3-222	ENST00000459758	DNMT3L	Q9UJW3	386 aa		11.64	□□□□□ -0.55
TTLL3-222	ENST00000459758	FBXO5	Q9UKT4	447 aa		11.64	□□□□□ -0.55
TTLL3-222	ENST00000459758	TMCO1	Q9UM00	188 aa		11.64	□□□□□ -0.55
TTLL3-222	ENST00000459758	ARHGAP26	Q9UNA1	814 aa		11.64	□□□□□ -0.55
TTLL3-222	ENST00000459758	PRG3	Q9Y2Y8	225 aa	Predicted RBP	11.64	□□□□□ -0.55
TTLL3-222	ENST00000459758	NR2E3	Q9Y5X4	410 aa		11.64	□□□□□ -0.55
TTLL3-222	ENST00000459758	PLXNA4	Q9HCM2	1894 aa		11.63	□□□□□ -0.55
TTLL3-222	ENST00000459758	ANAPC1	Q9H1A4	1944 aa		11.63	□□□□□ -0.55
TTLL3-222	ENST00000459758	GOLGA8CP	A6NN73	597 aa		11.63	□□□□□ -0.55
TTLL3-222	ENST00000459758	MSI1	O43347	362 aa	Known RBP	11.63	□□□□□ -0.55
TTLL3-222	ENST00000459758	PEX11A	O75192	247 aa		11.63	□□□□□ -0.55
TTLL3-222	ENST00000459758	PMPCB	O75439	489 aa		11.63	□□□□□ -0.55
TTLL3-222	ENST00000459758	CRTAM	O95727	393 aa		11.63	□□□□□ -0.55
TTLL3-222	ENST00000459758	LATS1	O95835	1130 aa		11.63	□□□□□ -0.55
TTLL3-222	ENST00000459758	GSR	P00390	522 aa		11.63	□□□□□ -0.55
TTLL3-222	ENST00000459758	ITGB1	P05556	798 aa		11.63	□□□□□ -0.55
TTLL3-222	ENST00000459758	SERPINF2	P08697	491 aa		11.63	□□□□□ -0.55
TTLL3-222	ENST00000459758	ZDHHC11B	P0C7U3	371 aa		11.63	□□□□□ -0.55
TTLL3-222	ENST00000459758	OGN	P20774	298 aa	Known RBP	11.63	□□□□□ -0.55
TTLL3-222	ENST00000459758	ATP5F1	P24539	256 aa	Predicted RBP	11.63	□□□□□ -0.55

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