RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000442563.5

RABGEF1-204, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

TSL 4

Gene RABGEF1, Length 553 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-204ENST00000442563 NEK5Q6P3R8 708 aa17.11■□□□□ 0.33
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RABGEF1-204ENST00000442563 NCEH1Q6PIU2 408 aa17.11■□□□□ 0.33
RABGEF1-204ENST00000442563 ARHGAP36Q6ZRI8 547 aa17.11■□□□□ 0.33
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RABGEF1-204ENST00000442563 C12orf50Q8NA57 414 aaPredicted RBP17.11■□□□□ 0.33
RABGEF1-204ENST00000442563 NETO2Q8NC67 525 aa17.11■□□□□ 0.33
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RABGEF1-204ENST00000442563 HCAR2Q8TDS4 363 aa17.11■□□□□ 0.33
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RABGEF1-204ENST00000442563 ATXN7L2Q5T6C5 722 aaPredicted RBP17.1■□□□□ 0.33
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RABGEF1-204ENST00000442563 ATPAF2Q8N5M1 289 aa17.1■□□□□ 0.33
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RABGEF1-204ENST00000442563 PREBQ9HCU5 417 aa17.1■□□□□ 0.33
RABGEF1-204ENST00000442563 SLC6A14Q9UN76 642 aa17.1■□□□□ 0.33
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RABGEF1-204ENST00000442563 TBC1D3EA0A087X179 549 aa17.09■□□□□ 0.33
RABGEF1-204ENST00000442563 TBC1D3KA0A087X1G2 549 aa17.09■□□□□ 0.33
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RABGEF1-204ENST00000442563 TBC1D3LB9A6J9 549 aa17.09■□□□□ 0.33
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RABGEF1-204ENST00000442563 ZRANB2O95218 330 aaKnown RBP eCLIP17.09■□□□□ 0.33
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RABGEF1-204ENST00000442563 RCOR2Q8IZ40 523 aa17.09■□□□□ 0.33
RABGEF1-204ENST00000442563 TBC1D3Q8IZP1 549 aaPredicted RBP17.09■□□□□ 0.33
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RABGEF1-204ENST00000442563 BCAT2O15382 392 aaPredicted RBP17.08■□□□□ 0.32
RABGEF1-204ENST00000442563 LATO43561 262 aa17.08■□□□□ 0.32
RABGEF1-204ENST00000442563 AP1G1O43747 822 aa17.08■□□□□ 0.32
RABGEF1-204ENST00000442563 MFSD11O43934 449 aa17.08■□□□□ 0.32
RABGEF1-204ENST00000442563 FSBPO95073 299 aa17.08■□□□□ 0.32
RABGEF1-204ENST00000442563 TNNT1P13805 278 aa17.08■□□□□ 0.32
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RABGEF1-204ENST00000442563 CCNCP24863 283 aa17.08■□□□□ 0.32
RABGEF1-204ENST00000442563 GKP32189 559 aa17.08■□□□□ 0.32
RABGEF1-204ENST00000442563 MAPK8P45983 427 aa17.08■□□□□ 0.32
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