RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000440835.6

PTPRR-204, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type R, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRR, Length 2,818 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRR-204ENST00000440835 TCERG1LQ5VWI1 586 aa6.16□□□□□ -1.42
PTPRR-204ENST00000440835 CAPRIN2Q6IMN6 1127 aaKnown RBP6.16□□□□□ -1.42
PTPRR-204ENST00000440835 ZNF783Q6ZMS7 281 aa6.16□□□□□ -1.42
PTPRR-204ENST00000440835 TMEM110Q86TL2 294 aa6.16□□□□□ -1.42
PTPRR-204ENST00000440835 ZDHHC17Q8IUH5 632 aa6.16□□□□□ -1.42
PTPRR-204ENST00000440835 PNPLA1Q8N8W4 532 aa6.16□□□□□ -1.42
PTPRR-204ENST00000440835 DCBLD1Q8N8Z6 715 aa6.16□□□□□ -1.42
PTPRR-204ENST00000440835 TPCN2Q8NHX9 752 aa6.16□□□□□ -1.42
PTPRR-204ENST00000440835 MDM1Q8TC05 714 aa6.16□□□□□ -1.42
PTPRR-204ENST00000440835 DQX1Q8TE96 717 aaKnown RBP6.16□□□□□ -1.42
PTPRR-204ENST00000440835 NSMCE1Q8WV22 266 aa6.16□□□□□ -1.42
PTPRR-204ENST00000440835 SORCS1Q8WY21 1168 aa6.16□□□□□ -1.42
PTPRR-204ENST00000440835 EEF2KMTQ96G04 330 aa6.16□□□□□ -1.42
PTPRR-204ENST00000440835 RMDN2Q96LZ7 410 aa6.16□□□□□ -1.42
PTPRR-204ENST00000440835 ERGIC2Q96RQ1 377 aa6.16□□□□□ -1.42
PTPRR-204ENST00000440835 FAM129BQ96TA1 746 aa6.16□□□□□ -1.42
PTPRR-204ENST00000440835 IQCGQ9H095 443 aaKnown RBP6.16□□□□□ -1.42
PTPRR-204ENST00000440835 POPDC2Q9HBU9 364 aa6.16□□□□□ -1.42
PTPRR-204ENST00000440835 SFMBT1Q9UHJ3 866 aa6.16□□□□□ -1.42
PTPRR-204ENST00000440835 BTBD3Q9Y2F9 522 aa6.16□□□□□ -1.42
PTPRR-204ENST00000440835 LUC7L2Q9Y383 392 aaKnown RBP6.16□□□□□ -1.42
PTPRR-204ENST00000440835 DAAM1Q9Y4D1 1078 aa6.16□□□□□ -1.42
PTPRR-204ENST00000440835 IGF2RP11717 2491 aa6.15□□□□□ -1.42
PTPRR-204ENST00000440835 M0QYV0 167 aa6.15□□□□□ -1.42
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PTPRR-204ENST00000440835 TACR2P21452 398 aa6.15□□□□□ -1.42
PTPRR-204ENST00000440835 MZF1P28698 734 aaPredicted RBP6.15□□□□□ -1.42
PTPRR-204ENST00000440835 SLC6A4P31645 630 aa6.15□□□□□ -1.42
PTPRR-204ENST00000440835 SCNN1AP37088 669 aa6.15□□□□□ -1.42
PTPRR-204ENST00000440835 KRT83P78385 493 aa6.15□□□□□ -1.42
PTPRR-204ENST00000440835 GUCY1A3Q02108 690 aa6.15□□□□□ -1.42
PTPRR-204ENST00000440835 CYP4F3Q08477 520 aa6.15□□□□□ -1.42
PTPRR-204ENST00000440835 EIF4EBP2Q13542 120 aaPredicted RBP6.15□□□□□ -1.42
PTPRR-204ENST00000440835 PDCD2Q16342 344 aaPredicted RBP6.15□□□□□ -1.42
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PTPRR-204ENST00000440835 CBWD3Q5JTY5 395 aa6.15□□□□□ -1.42
PTPRR-204ENST00000440835 EFHC1Q5JVL4 640 aa6.15□□□□□ -1.42
PTPRR-204ENST00000440835 CBWD5Q5RIA9 395 aa6.15□□□□□ -1.42
PTPRR-204ENST00000440835 BROXQ5VW32 411 aa6.15□□□□□ -1.42
PTPRR-204ENST00000440835 NCEH1Q6PIU2 408 aa6.15□□□□□ -1.42
PTPRR-204ENST00000440835 APTXQ7Z2E3 356 aaKnown RBP6.15□□□□□ -1.42
PTPRR-204ENST00000440835 NOP9Q86U38 636 aaKnown RBP6.15□□□□□ -1.42
PTPRR-204ENST00000440835 TMTC1Q8IUR5 882 aa6.15□□□□□ -1.42
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PTPRR-204ENST00000440835 EHBP1Q8NDI1 1231 aa6.15□□□□□ -1.42
PTPRR-204ENST00000440835 TMIEQ8NEW7 156 aa6.15□□□□□ -1.42
PTPRR-204ENST00000440835 AENQ8WTP8 325 aaKnown RBP6.15□□□□□ -1.42
PTPRR-204ENST00000440835 ASB12Q8WXK4 309 aa6.15□□□□□ -1.42
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PTPRR-204ENST00000440835 FGF11Q92914 225 aa6.15□□□□□ -1.42
PTPRR-204ENST00000440835 TBC1D31Q96DN5 1066 aa6.15□□□□□ -1.42
PTPRR-204ENST00000440835 RSRC1Q96IZ7 334 aaKnown RBP6.15□□□□□ -1.42
PTPRR-204ENST00000440835 NOX5Q96PH1 765 aa6.15□□□□□ -1.42
PTPRR-204ENST00000440835 DUSP23Q9BVJ7 150 aa6.15□□□□□ -1.42
PTPRR-204ENST00000440835 DPH1Q9BZG8 443 aa6.15□□□□□ -1.42
PTPRR-204ENST00000440835 YIPF3Q9GZM5 350 aa6.15□□□□□ -1.42
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PTPRR-204ENST00000440835 KLHL11Q9NVR0 708 aa6.15□□□□□ -1.42
PTPRR-204ENST00000440835 G3BP2Q9UN86 482 aaKnown RBP6.15□□□□□ -1.42
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PTPRR-204ENST00000440835 MID1O15344 667 aa6.15□□□□□ -1.43
PTPRR-204ENST00000440835 TEX33O43247 280 aa6.15□□□□□ -1.43
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PTPRR-204ENST00000440835 MFAP3LO75121 409 aa6.15□□□□□ -1.43
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PTPRR-204ENST00000440835 RNASEH2AO75792 299 aaKnown RBP6.15□□□□□ -1.43
PTPRR-204ENST00000440835 PYGBP11216 843 aa6.15□□□□□ -1.43
PTPRR-204ENST00000440835 LCP1P13796 627 aa6.15□□□□□ -1.43
PTPRR-204ENST00000440835 PBX1P40424 430 aa6.15□□□□□ -1.43
PTPRR-204ENST00000440835 ERVPABLB-1P60509 514 aa6.15□□□□□ -1.43
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PTPRR-204ENST00000440835 TMED1Q13445 227 aa6.15□□□□□ -1.43
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PTPRR-204ENST00000440835 DCAF6Q58WW2 860 aa6.15□□□□□ -1.43
PTPRR-204ENST00000440835 DCAF17Q5H9S7 520 aaPredicted RBP6.15□□□□□ -1.43
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PTPRR-204ENST00000440835 PMF1Q6P1K2 205 aa6.15□□□□□ -1.43
PTPRR-204ENST00000440835 C19orf48Q6RUI8 117 aa6.15□□□□□ -1.43
PTPRR-204ENST00000440835 TMEM270Q6UE05 265 aa6.15□□□□□ -1.43
PTPRR-204ENST00000440835 MICALCLQ6ZW33 695 aa6.15□□□□□ -1.43
PTPRR-204ENST00000440835 TAX1BP1Q86VP1 789 aa6.15□□□□□ -1.43
PTPRR-204ENST00000440835 IRF2BP1Q8IU81 584 aa6.15□□□□□ -1.43
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PTPRR-204ENST00000440835 PLPP6Q8IY26 295 aa6.15□□□□□ -1.43
PTPRR-204ENST00000440835 CARNMT1Q8N4J0 409 aa6.15□□□□□ -1.43
PTPRR-204ENST00000440835 TSEN2Q8NCE0 465 aaKnown RBP6.15□□□□□ -1.43
PTPRR-204ENST00000440835 RNF34Q969K3 372 aa6.15□□□□□ -1.43
PTPRR-204ENST00000440835 SERAC1Q96JX3 654 aa6.15□□□□□ -1.43
PTPRR-204ENST00000440835 PRICKLE1Q96MT3 831 aaPredicted RBP6.15□□□□□ -1.43
PTPRR-204ENST00000440835 SLC6A18Q96N87 628 aa6.15□□□□□ -1.43
PTPRR-204ENST00000440835 CCT8L2Q96SF2 557 aa6.15□□□□□ -1.43
PTPRR-204ENST00000440835 NEUROG2Q9H2A3 272 aa6.15□□□□□ -1.43
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