RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000440289.6

PTPRJ-202, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type J, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRJ, Length 3,158 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRJ-202ENST00000440289 SSC5DA1L4H1 1573 aa18.48■□□□□ 0.55
PTPRJ-202ENST00000440289 MYBPHLA2RUH7 354 aa18.48■□□□□ 0.55
PTPRJ-202ENST00000440289 CASTOR2A6NHX0 329 aa18.48■□□□□ 0.55
PTPRJ-202ENST00000440289 MSI1O43347 362 aaKnown RBP18.48■□□□□ 0.55
PTPRJ-202ENST00000440289 CTSHP09668 335 aa18.48■□□□□ 0.55
PTPRJ-202ENST00000440289 PIRTP0C851 137 aa18.48■□□□□ 0.55
PTPRJ-202ENST00000440289 GABRB3P28472 473 aa18.48■□□□□ 0.55
PTPRJ-202ENST00000440289 RGS2P41220 211 aa18.48■□□□□ 0.55
PTPRJ-202ENST00000440289 TAF6P49848 677 aa18.48■□□□□ 0.55
PTPRJ-202ENST00000440289 SCIMPQ6UWF3 145 aa18.48■□□□□ 0.55
PTPRJ-202ENST00000440289 TFAP2DQ7Z6R9 452 aa18.48■□□□□ 0.55
PTPRJ-202ENST00000440289 DDIASQ8IXT1 998 aa18.48■□□□□ 0.55
PTPRJ-202ENST00000440289 NAT16Q8N8M0 369 aa18.48■□□□□ 0.55
PTPRJ-202ENST00000440289 FAM47BQ8NA70 645 aa18.48■□□□□ 0.55
PTPRJ-202ENST00000440289 RP9Q8TA86 221 aaKnown RBP18.48■□□□□ 0.55
PTPRJ-202ENST00000440289 HEXDCQ8WVB3 486 aa18.48■□□□□ 0.55
PTPRJ-202ENST00000440289 HDAC11Q96DB2 347 aa18.48■□□□□ 0.55
PTPRJ-202ENST00000440289 PRICKLE1Q96MT3 831 aaPredicted RBP18.48■□□□□ 0.55
PTPRJ-202ENST00000440289 STN1Q9H668 368 aaKnown RBP18.48■□□□□ 0.55
PTPRJ-202ENST00000440289 TNFRSF12AQ9NP84 129 aa18.48■□□□□ 0.55
PTPRJ-202ENST00000440289 C6orf203Q9P0P8 240 aaPredicted RBP18.48■□□□□ 0.55
PTPRJ-202ENST00000440289 CPA4Q9UI42 421 aa18.48■□□□□ 0.55
PTPRJ-202ENST00000440289 OR51F1A6NGY5 319 aa18.48■□□□□ 0.55
PTPRJ-202ENST00000440289 PLOD2O00469 737 aa18.48■□□□□ 0.55
PTPRJ-202ENST00000440289 NR5A2O00482 541 aa18.48■□□□□ 0.55
PTPRJ-202ENST00000440289 LRIG2O94898 1065 aa18.48■□□□□ 0.55
PTPRJ-202ENST00000440289 MPOP05164 745 aa18.48■□□□□ 0.55
PTPRJ-202ENST00000440289 TFPTP0C1Z6 253 aa18.48■□□□□ 0.55
PTPRJ-202ENST00000440289 SLC35E2BP0CK96 405 aa18.48■□□□□ 0.55
PTPRJ-202ENST00000440289 CYP2C9P11712 490 aa18.48■□□□□ 0.55
PTPRJ-202ENST00000440289 MYL4P12829 197 aa18.48■□□□□ 0.55
PTPRJ-202ENST00000440289 CHRM3P20309 590 aa18.48■□□□□ 0.55
PTPRJ-202ENST00000440289 GLDCP23378 1020 aa18.48■□□□□ 0.55
PTPRJ-202ENST00000440289 HOXA11P31270 313 aaPredicted RBP18.48■□□□□ 0.55
PTPRJ-202ENST00000440289 NOS2P35228 1153 aa18.48■□□□□ 0.55
PTPRJ-202ENST00000440289 SLC7A2P52569 658 aa18.48■□□□□ 0.55
PTPRJ-202ENST00000440289 CCNA1P78396 465 aa18.48■□□□□ 0.55
PTPRJ-202ENST00000440289 PPIDQ08752 370 aaKnown RBP18.48■□□□□ 0.55
PTPRJ-202ENST00000440289 ZNF484Q5JVG2 852 aa18.48■□□□□ 0.55
PTPRJ-202ENST00000440289 SLC27A1Q6PCB7 646 aa18.48■□□□□ 0.55
PTPRJ-202ENST00000440289 PDZD4Q76G19 769 aaPredicted RBP18.48■□□□□ 0.55
PTPRJ-202ENST00000440289 LPCAT2Q7L5N7 544 aa18.48■□□□□ 0.55
PTPRJ-202ENST00000440289 HERC6Q8IVU3 1022 aa18.48■□□□□ 0.55
PTPRJ-202ENST00000440289 TXNDC5Q8NBS9 432 aaKnown RBP18.48■□□□□ 0.55
PTPRJ-202ENST00000440289 TSPAN14Q8NG11 270 aa18.48■□□□□ 0.55
PTPRJ-202ENST00000440289 LPPQ93052 612 aa18.48■□□□□ 0.55
PTPRJ-202ENST00000440289 TNIP3Q96KP6 325 aa18.48■□□□□ 0.55
PTPRJ-202ENST00000440289 MPP6Q9NZW5 540 aa18.48■□□□□ 0.55
PTPRJ-202ENST00000440289 ATXN10Q9UBB4 475 aa18.48■□□□□ 0.55
PTPRJ-202ENST00000440289 C7orf72A4D263 438 aa18.47■□□□□ 0.55
PTPRJ-202ENST00000440289 HACD1B0YJ81 288 aa18.47■□□□□ 0.55
PTPRJ-202ENST00000440289 TSPAN3O60637 253 aa18.47■□□□□ 0.55
PTPRJ-202ENST00000440289 NPR3P17342 541 aa18.47■□□□□ 0.55
PTPRJ-202ENST00000440289 STT3AP46977 705 aa18.47■□□□□ 0.55
PTPRJ-202ENST00000440289 INSCQ1MX18 579 aa18.47■□□□□ 0.55
PTPRJ-202ENST00000440289 PIGGQ5H8A4 983 aa18.47■□□□□ 0.55
PTPRJ-202ENST00000440289 ZBTB49Q6ZSB9 765 aa18.47■□□□□ 0.55
PTPRJ-202ENST00000440289 ZC3HC1Q86WB0 502 aaKnown RBP18.47■□□□□ 0.55
PTPRJ-202ENST00000440289 OFCC1Q8IZS5 231 aa18.47■□□□□ 0.55
PTPRJ-202ENST00000440289 TMEM40Q8WWA1 233 aa18.47■□□□□ 0.55
PTPRJ-202ENST00000440289 DCPSQ96C86 337 aaKnown RBP18.47■□□□□ 0.55
PTPRJ-202ENST00000440289 USP3Q9Y6I4 520 aa18.47■□□□□ 0.55
PTPRJ-202ENST00000440289 TMX2-CTNND1H3BSU7 103 aa18.47■□□□□ 0.55
PTPRJ-202ENST00000440289 PGK1P00558 417 aa18.47■□□□□ 0.55
PTPRJ-202ENST00000440289 GRM5P41594 1212 aa18.47■□□□□ 0.55
PTPRJ-202ENST00000440289 KCTD21Q4G0X4 260 aa18.47■□□□□ 0.55
PTPRJ-202ENST00000440289 STRADAQ7RTN6 431 aa18.47■□□□□ 0.55
PTPRJ-202ENST00000440289 OR52K2Q8NGK3 314 aa18.47■□□□□ 0.55
PTPRJ-202ENST00000440289 LRCH3Q96II8 777 aa18.47■□□□□ 0.55
PTPRJ-202ENST00000440289 ALG9Q9H6U8 611 aa18.47■□□□□ 0.55
PTPRJ-202ENST00000440289 MGAMO43451 1857 aa18.47■□□□□ 0.55
PTPRJ-202ENST00000440289 SMIM31A0A1B0GVY4 71 aa18.46■□□□□ 0.55
PTPRJ-202ENST00000440289 SETSIPP0DME0 302 aa18.46■□□□□ 0.55
PTPRJ-202ENST00000440289 CLVS1Q8IUQ0 354 aaPredicted RBP18.46■□□□□ 0.55
PTPRJ-202ENST00000440289 CENPLQ8N0S6 344 aaPredicted RBP18.46■□□□□ 0.55
PTPRJ-202ENST00000440289 OR6J1Q8NGC5 347 aa18.46■□□□□ 0.55
PTPRJ-202ENST00000440289 PABPC5Q96DU9 382 aaKnown RBP18.46■□□□□ 0.55
PTPRJ-202ENST00000440289 DRC3Q9H069 523 aa18.46■□□□□ 0.55
PTPRJ-202ENST00000440289 BRD8Q9H0E9 1235 aa18.46■□□□□ 0.55
PTPRJ-202ENST00000440289 RLFQ13129 1914 aa18.46■□□□□ 0.55
PTPRJ-202ENST00000440289 NCF1BA6NI72 391 aaPredicted RBP18.46■□□□□ 0.55
PTPRJ-202ENST00000440289 NCF1CA8MVU1 366 aaPredicted RBP18.46■□□□□ 0.55
PTPRJ-202ENST00000440289 UBDO15205 165 aa18.46■□□□□ 0.55
PTPRJ-202ENST00000440289 CCDC166P0CW27 439 aa18.46■□□□□ 0.55
PTPRJ-202ENST00000440289 NCF1P14598 390 aaPredicted RBP18.46■□□□□ 0.55
PTPRJ-202ENST00000440289 SLC1A2P43004 574 aa18.46■□□□□ 0.55
PTPRJ-202ENST00000440289 YAP1P46937 504 aaKnown RBP18.46■□□□□ 0.55
PTPRJ-202ENST00000440289 CDH17Q12864 832 aa18.46■□□□□ 0.55
PTPRJ-202ENST00000440289 RPS6KA2Q15349 733 aa18.46■□□□□ 0.55
PTPRJ-202ENST00000440289 NOTUMQ6P988 496 aa18.46■□□□□ 0.55
PTPRJ-202ENST00000440289 CLEC20AQ6ZU45 233 aa18.46■□□□□ 0.55
PTPRJ-202ENST00000440289 SNX27Q96L92 541 aa18.46■□□□□ 0.55
PTPRJ-202ENST00000440289 VRTNQ9H8Y1 702 aa18.46■□□□□ 0.55
PTPRJ-202ENST00000440289 ARHGEF38Q9NXL2 777 aa18.46■□□□□ 0.55
PTPRJ-202ENST00000440289 C1QTNF8P60827 252 aa18.46■□□□□ 0.55
PTPRJ-202ENST00000440289 OTUD1Q5VV17 481 aaPredicted RBP18.46■□□□□ 0.55
PTPRJ-202ENST00000440289 ZYG11AQ6WRX3 759 aa18.46■□□□□ 0.55
PTPRJ-202ENST00000440289 RIMS3Q9UJD0 308 aa18.46■□□□□ 0.55
PTPRJ-202ENST00000440289 UBQLN1Q9UMX0 589 aaKnown RBP18.46■□□□□ 0.55
PTPRJ-202ENST00000440289 LRRC14BA6NHZ5 514 aa18.45■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 17.2 ms