RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000437713.5

TTC28-AS1-216, TTC28 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene TTC28-AS1, Length 854 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC28-AS1-216ENST00000437713 SF3A2Q15428 464 aaKnown RBP8.28□□□□□ -1.08
TTC28-AS1-216ENST00000437713 SPA17Q15506 151 aa8.28□□□□□ -1.08
TTC28-AS1-216ENST00000437713 CA9Q16790 459 aa8.28□□□□□ -1.08
TTC28-AS1-216ENST00000437713 RSPO4Q2I0M5 234 aaPredicted RBP8.28□□□□□ -1.08
TTC28-AS1-216ENST00000437713 KCNT1Q5JUK3 1230 aa8.28□□□□□ -1.08
TTC28-AS1-216ENST00000437713 DAB2IPQ5VWQ8 1189 aa8.28□□□□□ -1.08
TTC28-AS1-216ENST00000437713 KIAA0895LQ68EN5 471 aa8.28□□□□□ -1.08
TTC28-AS1-216ENST00000437713 RAB11FIP1Q6WKZ4 1283 aaPredicted RBP8.28□□□□□ -1.08
TTC28-AS1-216ENST00000437713 DPY19L3Q6ZPD9 716 aa8.28□□□□□ -1.08
TTC28-AS1-216ENST00000437713 ARMCX6Q7L4S7 300 aa8.28□□□□□ -1.08
TTC28-AS1-216ENST00000437713 POLNQ7Z5Q5 900 aa8.28□□□□□ -1.08
TTC28-AS1-216ENST00000437713 ZNF354CQ86Y25 554 aa8.28□□□□□ -1.08
TTC28-AS1-216ENST00000437713 CACUL1Q86Y37 369 aa8.28□□□□□ -1.08
TTC28-AS1-216ENST00000437713 AADATQ8N5Z0 425 aa8.28□□□□□ -1.08
TTC28-AS1-216ENST00000437713 DEFB119Q8N690 84 aa8.28□□□□□ -1.08
TTC28-AS1-216ENST00000437713 OR2AP1Q8NGE2 309 aa8.28□□□□□ -1.08
TTC28-AS1-216ENST00000437713 C1orf216Q8TAB5 229 aa8.28□□□□□ -1.08
TTC28-AS1-216ENST00000437713 SLC35G2Q8TBE7 412 aa8.28□□□□□ -1.08
TTC28-AS1-216ENST00000437713 HCAR2Q8TDS4 363 aa8.28□□□□□ -1.08
TTC28-AS1-216ENST00000437713 RFFLQ8WZ73 363 aa8.28□□□□□ -1.08
TTC28-AS1-216ENST00000437713 SKA1Q96BD8 255 aa8.28□□□□□ -1.08
TTC28-AS1-216ENST00000437713 BTBD6Q96KE9 485 aa8.28□□□□□ -1.08
TTC28-AS1-216ENST00000437713 OSBPL1AQ9BXW6 950 aa8.28□□□□□ -1.08
TTC28-AS1-216ENST00000437713 C6orf106Q9H6K1 298 aaPredicted RBP8.28□□□□□ -1.08
TTC28-AS1-216ENST00000437713 CAPN10Q9HC96 672 aa8.28□□□□□ -1.08
TTC28-AS1-216ENST00000437713 TMEM9BQ9NQ34 198 aa8.28□□□□□ -1.08
TTC28-AS1-216ENST00000437713 DYRK4Q9NR20 520 aa8.28□□□□□ -1.08
TTC28-AS1-216ENST00000437713 STAU2Q9NUL3 570 aaKnown RBP eCLIP8.28□□□□□ -1.08
TTC28-AS1-216ENST00000437713 GPATCH2LQ9NWQ4 482 aa8.28□□□□□ -1.08
TTC28-AS1-216ENST00000437713 IMPACTQ9P2X3 320 aa8.28□□□□□ -1.08
TTC28-AS1-216ENST00000437713 SARDHQ9UL12 918 aa8.28□□□□□ -1.08
TTC28-AS1-216ENST00000437713 MFHAS1Q9Y4C4 1052 aa8.28□□□□□ -1.08
TTC28-AS1-216ENST00000437713 CEP192Q8TEP8 1941 aa8.28□□□□□ -1.08
TTC28-AS1-216ENST00000437713 TBC1D3DA0A087WVF3 549 aa8.27□□□□□ -1.09
TTC28-AS1-216ENST00000437713 TBC1D3IA0A087WXS9 549 aa8.27□□□□□ -1.09
TTC28-AS1-216ENST00000437713 TBC1D3EA0A087X179 549 aa8.27□□□□□ -1.09
TTC28-AS1-216ENST00000437713 TBC1D3KA0A087X1G2 549 aa8.27□□□□□ -1.09
TTC28-AS1-216ENST00000437713 A0A0A6YYK5 440 aaPredicted RBP8.27□□□□□ -1.09
TTC28-AS1-216ENST00000437713 A0A1W2PPC4 97 aa8.27□□□□□ -1.09
TTC28-AS1-216ENST00000437713 LNP1A1A4G5 178 aa8.27□□□□□ -1.09
TTC28-AS1-216ENST00000437713 TBC1D3FA6NER0 549 aaPredicted RBP8.27□□□□□ -1.09
TTC28-AS1-216ENST00000437713 ZNF487B1APH4 448 aa8.27□□□□□ -1.09
TTC28-AS1-216ENST00000437713 TBC1D3LB9A6J9 549 aa8.27□□□□□ -1.09
TTC28-AS1-216ENST00000437713 CFAP99D6REC4 459 aa8.27□□□□□ -1.09
TTC28-AS1-216ENST00000437713 KPNA3O00505 521 aaPredicted RBP8.27□□□□□ -1.09
TTC28-AS1-216ENST00000437713 PLRG1O43660 514 aaKnown RBP8.27□□□□□ -1.09
TTC28-AS1-216ENST00000437713 AP1G1O43747 822 aa8.27□□□□□ -1.09
TTC28-AS1-216ENST00000437713 BNIP3LO60238 219 aa8.27□□□□□ -1.09
TTC28-AS1-216ENST00000437713 PRAMEF11O60813 436 aa8.27□□□□□ -1.09
TTC28-AS1-216ENST00000437713 RNGTTO60942 597 aaKnown RBP8.27□□□□□ -1.09
TTC28-AS1-216ENST00000437713 LEFTY1O75610 366 aa8.27□□□□□ -1.09
TTC28-AS1-216ENST00000437713 IPO7O95373 1038 aaKnown RBP8.27□□□□□ -1.09
TTC28-AS1-216ENST00000437713 TBC1D3HP0C7X1 549 aa8.27□□□□□ -1.09
TTC28-AS1-216ENST00000437713 CDC25BP30305 580 aa8.27□□□□□ -1.09
TTC28-AS1-216ENST00000437713 DRD3P35462 400 aa8.27□□□□□ -1.09
TTC28-AS1-216ENST00000437713 SSR1P43307 286 aaKnown RBP8.27□□□□□ -1.09
TTC28-AS1-216ENST00000437713 NUMBP49757 651 aa8.27□□□□□ -1.09
TTC28-AS1-216ENST00000437713 DNA2P51530 1060 aa8.27□□□□□ -1.09
TTC28-AS1-216ENST00000437713 SUOXP51687 545 aa8.27□□□□□ -1.09
TTC28-AS1-216ENST00000437713 AFF3P51826 1226 aaKnown RBP8.27□□□□□ -1.09
TTC28-AS1-216ENST00000437713 CCNHP51946 323 aaPredicted RBP8.27□□□□□ -1.09
TTC28-AS1-216ENST00000437713 ATXN3P54252 364 aaPredicted RBP8.27□□□□□ -1.09
TTC28-AS1-216ENST00000437713 ADPRHP54922 357 aa8.27□□□□□ -1.09
TTC28-AS1-216ENST00000437713 HADHBP55084 474 aaKnown RBP8.27□□□□□ -1.09
TTC28-AS1-216ENST00000437713 RACK1P63244 317 aaKnown RBP8.27□□□□□ -1.09
TTC28-AS1-216ENST00000437713 IL10RBQ08334 325 aa8.27□□□□□ -1.09
TTC28-AS1-216ENST00000437713 NSUN2Q08J23 767 aaKnown RBP eCLIP8.27□□□□□ -1.09
TTC28-AS1-216ENST00000437713 KRT81Q14533 505 aa8.27□□□□□ -1.09
TTC28-AS1-216ENST00000437713 TEAD4Q15561 434 aa8.27□□□□□ -1.09
TTC28-AS1-216ENST00000437713 CCDC6Q16204 474 aa8.27□□□□□ -1.09
TTC28-AS1-216ENST00000437713 MYLK3Q32MK0 819 aa8.27□□□□□ -1.09
TTC28-AS1-216ENST00000437713 STPG1Q5TH74 334 aa8.27□□□□□ -1.09
TTC28-AS1-216ENST00000437713 LRRC38Q5VT99 294 aa8.27□□□□□ -1.09
TTC28-AS1-216ENST00000437713 TBC1D3GQ6DHY5 549 aa8.27□□□□□ -1.09
TTC28-AS1-216ENST00000437713 TBC1D3CQ6IPX1 549 aa8.27□□□□□ -1.09
TTC28-AS1-216ENST00000437713 NCEH1Q6PIU2 408 aa8.27□□□□□ -1.09
TTC28-AS1-216ENST00000437713 IL27RAQ6UWB1 636 aa8.27□□□□□ -1.09
TTC28-AS1-216ENST00000437713 TMCO3Q6UWJ1 677 aa8.27□□□□□ -1.09
TTC28-AS1-216ENST00000437713 ERN2Q76MJ5 926 aaKnown RBP8.27□□□□□ -1.09
TTC28-AS1-216ENST00000437713 ERMP1Q7Z2K6 904 aa8.27□□□□□ -1.09
TTC28-AS1-216ENST00000437713 PRPF39Q86UA1 669 aaKnown RBP8.27□□□□□ -1.09
TTC28-AS1-216ENST00000437713 VSIG1Q86XK7 387 aa8.27□□□□□ -1.09
TTC28-AS1-216ENST00000437713 TBC1D3Q8IZP1 549 aaPredicted RBP8.27□□□□□ -1.09
TTC28-AS1-216ENST00000437713 ARMC2Q8NEN0 867 aa8.27□□□□□ -1.09
TTC28-AS1-216ENST00000437713 OR14C36Q8NHC7 312 aa8.27□□□□□ -1.09
TTC28-AS1-216ENST00000437713 TSC1Q92574 1164 aa8.27□□□□□ -1.09
TTC28-AS1-216ENST00000437713 HSPH1Q92598 858 aa8.27□□□□□ -1.09
TTC28-AS1-216ENST00000437713 RAB7BQ96AH8 199 aa8.27□□□□□ -1.09
TTC28-AS1-216ENST00000437713 BIRC7Q96CA5 298 aa8.27□□□□□ -1.09
TTC28-AS1-216ENST00000437713 RMDN1Q96DB5 314 aa8.27□□□□□ -1.09
TTC28-AS1-216ENST00000437713 HMCESQ96FZ2 354 aa8.27□□□□□ -1.09
TTC28-AS1-216ENST00000437713 GDAP1L1Q96MZ0 367 aa8.27□□□□□ -1.09
TTC28-AS1-216ENST00000437713 ZNF599Q96NL3 588 aa8.27□□□□□ -1.09
TTC28-AS1-216ENST00000437713 CSPG4P5Q96PW8 444 aa8.27□□□□□ -1.09
TTC28-AS1-216ENST00000437713 EDEM2Q9BV94 578 aa8.27□□□□□ -1.09
TTC28-AS1-216ENST00000437713 PACSIN1Q9BY11 444 aa8.27□□□□□ -1.09
TTC28-AS1-216ENST00000437713 CPEB1Q9BZB8 566 aaKnown RBP8.27□□□□□ -1.09
TTC28-AS1-216ENST00000437713 SLC39A8Q9C0K1 460 aa8.27□□□□□ -1.09
TTC28-AS1-216ENST00000437713 KLC2Q9H0B6 622 aa8.27□□□□□ -1.09
TTC28-AS1-216ENST00000437713 PCDH18Q9HCL0 1135 aa8.27□□□□□ -1.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 10.4 ms