RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000437078.6

RABGEF1-210, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene RABGEF1, Length 4,319 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-210ENST00000437078 ANXA9O76027 345 aa13.73□□□□□ -0.21
RABGEF1-210ENST00000437078 CCDC166P0CW27 439 aa13.73□□□□□ -0.21
RABGEF1-210ENST00000437078 ZRANB3Q5FWF4 1079 aa13.73□□□□□ -0.21
RABGEF1-210ENST00000437078 TMC7Q7Z402 723 aa13.73□□□□□ -0.21
RABGEF1-210ENST00000437078 WDR60Q8WVS4 1066 aa13.73□□□□□ -0.21
RABGEF1-210ENST00000437078 MLPHQ9BV36 600 aaPredicted RBP13.73□□□□□ -0.21
RABGEF1-210ENST00000437078 TBC1D13Q9NVG8 400 aa13.73□□□□□ -0.21
RABGEF1-210ENST00000437078 ATP11BQ9Y2G3 1177 aa13.73□□□□□ -0.21
RABGEF1-210ENST00000437078 MKI67P46013 3256 aaKnown RBP13.73□□□□□ -0.21
RABGEF1-210ENST00000437078 MAP3K7O43318 606 aa13.73□□□□□ -0.21
RABGEF1-210ENST00000437078 TLR5O60602 858 aa13.73□□□□□ -0.21
RABGEF1-210ENST00000437078 SORBS2O94875 1100 aaKnown RBP13.73□□□□□ -0.21
RABGEF1-210ENST00000437078 AP2A1O95782 977 aa13.73□□□□□ -0.21
RABGEF1-210ENST00000437078 ARSAP15289 507 aa13.73□□□□□ -0.21
RABGEF1-210ENST00000437078 TPSB2P20231 275 aa13.73□□□□□ -0.21
RABGEF1-210ENST00000437078 ACVRL1P37023 503 aa13.73□□□□□ -0.21
RABGEF1-210ENST00000437078 TPSAB1Q15661 275 aa13.73□□□□□ -0.21
RABGEF1-210ENST00000437078 CNSTQ6PJW8 725 aa13.73□□□□□ -0.21
RABGEF1-210ENST00000437078 ZNF534Q76KX8 674 aa13.73□□□□□ -0.21
RABGEF1-210ENST00000437078 LPCAT1Q8NF37 534 aa13.73□□□□□ -0.21
RABGEF1-210ENST00000437078 PIP4K2CQ8TBX8 421 aa13.73□□□□□ -0.21
RABGEF1-210ENST00000437078 LRRC39Q96DD0 335 aa13.73□□□□□ -0.21
RABGEF1-210ENST00000437078 DEFB118Q96PH6 123 aa13.73□□□□□ -0.21
RABGEF1-210ENST00000437078 CPNE1Q99829 537 aa13.73□□□□□ -0.21
RABGEF1-210ENST00000437078 ILKAPQ9H0C8 392 aaPredicted RBP13.73□□□□□ -0.21
RABGEF1-210ENST00000437078 DSEQ9UL01 958 aa13.73□□□□□ -0.21
RABGEF1-210ENST00000437078 NOL3O60936 208 aaKnown RBP13.73□□□□□ -0.21
RABGEF1-210ENST00000437078 CALB2P22676 271 aa13.73□□□□□ -0.21
RABGEF1-210ENST00000437078 COPAP53621 1224 aa13.73□□□□□ -0.21
RABGEF1-210ENST00000437078 RPS24P62847 133 aaKnown RBP13.73□□□□□ -0.21
RABGEF1-210ENST00000437078 GRIK3Q13003 919 aa13.73□□□□□ -0.21
RABGEF1-210ENST00000437078 MAPRE1Q15691 268 aaKnown RBP13.73□□□□□ -0.21
RABGEF1-210ENST00000437078 TPGS1Q6ZTW0 290 aa13.73□□□□□ -0.21
RABGEF1-210ENST00000437078 ACAD11Q709F0 780 aa13.73□□□□□ -0.21
RABGEF1-210ENST00000437078 SNX32Q86XE0 403 aa13.73□□□□□ -0.21
RABGEF1-210ENST00000437078 PCDH20Q8N6Y1 951 aaKnown RBP13.73□□□□□ -0.21
RABGEF1-210ENST00000437078 FAM156AQ8NDB6 213 aa13.73□□□□□ -0.21
RABGEF1-210ENST00000437078 GLOD4Q9HC38 313 aa13.73□□□□□ -0.21
RABGEF1-210ENST00000437078 SATB2Q9UPW6 733 aa13.73□□□□□ -0.21
RABGEF1-210ENST00000437078 AAR2Q9Y312 384 aaKnown RBP13.73□□□□□ -0.21
RABGEF1-210ENST00000437078 TRIM13O60858 407 aa13.73□□□□□ -0.21
RABGEF1-210ENST00000437078 ABL2P42684 1182 aa13.73□□□□□ -0.21
RABGEF1-210ENST00000437078 ABCE1P61221 599 aaKnown RBP13.73□□□□□ -0.21
RABGEF1-210ENST00000437078 PRKD1Q15139 912 aaPredicted RBP13.73□□□□□ -0.21
RABGEF1-210ENST00000437078 SPANXN3Q5MJ09 141 aa13.73□□□□□ -0.21
RABGEF1-210ENST00000437078 ALKAL1Q6UXT8 129 aa13.73□□□□□ -0.21
RABGEF1-210ENST00000437078 NUP93Q8N1F7 819 aa13.73□□□□□ -0.21
RABGEF1-210ENST00000437078 HBEGFQ99075 208 aa13.73□□□□□ -0.21
RABGEF1-210ENST00000437078 GPR62Q9BZJ7 368 aa13.73□□□□□ -0.21
RABGEF1-210ENST00000437078 A0A0U1RQF3 1178 aa13.72□□□□□ -0.21
RABGEF1-210ENST00000437078 MOXD2PA6NHM9 499 aa13.72□□□□□ -0.21
RABGEF1-210ENST00000437078 HAPLN1P10915 354 aaPredicted RBP13.72□□□□□ -0.21
RABGEF1-210ENST00000437078 HDCP19113 662 aa13.72□□□□□ -0.21
RABGEF1-210ENST00000437078 GEMP55040 296 aa13.72□□□□□ -0.21
RABGEF1-210ENST00000437078 SGO1Q5FBB7 561 aa13.72□□□□□ -0.21
RABGEF1-210ENST00000437078 KLC3Q6P597 504 aa13.72□□□□□ -0.21
RABGEF1-210ENST00000437078 NAPRTQ6XQN6 538 aa13.72□□□□□ -0.21
RABGEF1-210ENST00000437078 COG4Q9H9E3 785 aa13.72□□□□□ -0.21
RABGEF1-210ENST00000437078 STOML1Q9UBI4 398 aa13.72□□□□□ -0.21
RABGEF1-210ENST00000437078 PTCH2Q9Y6C5 1203 aa13.72□□□□□ -0.21
RABGEF1-210ENST00000437078 GSC2O15499 205 aa13.72□□□□□ -0.21
RABGEF1-210ENST00000437078 MGRN1O60291 552 aa13.72□□□□□ -0.21
RABGEF1-210ENST00000437078 ATXN8OSP0DMR3 200 aa13.72□□□□□ -0.21
RABGEF1-210ENST00000437078 CD68P34810 354 aaPredicted RBP13.72□□□□□ -0.21
RABGEF1-210ENST00000437078 NEK3P51956 506 aa13.72□□□□□ -0.21
RABGEF1-210ENST00000437078 TRIP10Q15642 601 aa13.72□□□□□ -0.21
RABGEF1-210ENST00000437078 RBM20Q5T481 1227 aaKnown RBP13.72□□□□□ -0.21
RABGEF1-210ENST00000437078 CNTD1Q8N815 330 aa13.72□□□□□ -0.21
RABGEF1-210ENST00000437078 CDC26Q8NHZ8 85 aa13.72□□□□□ -0.21
RABGEF1-210ENST00000437078 POMKQ9H5K3 350 aa13.72□□□□□ -0.21
RABGEF1-210ENST00000437078 WDR6Q9NNW5 1121 aaKnown RBP13.72□□□□□ -0.21
RABGEF1-210ENST00000437078 COPG2Q9UBF2 871 aa13.72□□□□□ -0.21
RABGEF1-210ENST00000437078 NUMBLQ9Y6R0 609 aa13.72□□□□□ -0.21
RABGEF1-210ENST00000437078 FAM159BA6NKW6 160 aa13.72□□□□□ -0.21
RABGEF1-210ENST00000437078 NVLO15381 856 aaKnown RBP13.72□□□□□ -0.21
RABGEF1-210ENST00000437078 CHRM3P20309 590 aa13.72□□□□□ -0.21
RABGEF1-210ENST00000437078 PTDSS1P48651 473 aaKnown RBP13.72□□□□□ -0.21
RABGEF1-210ENST00000437078 PDAP1Q13442 181 aaKnown RBP13.72□□□□□ -0.21
RABGEF1-210ENST00000437078 TNFAIP8L3Q5GJ75 292 aa13.72□□□□□ -0.21
RABGEF1-210ENST00000437078 GRTP1Q5TC63 336 aa13.72□□□□□ -0.21
RABGEF1-210ENST00000437078 SNX30Q5VWJ9 437 aa13.72□□□□□ -0.21
RABGEF1-210ENST00000437078 DCLRE1AQ6PJP8 1040 aa13.72□□□□□ -0.21
RABGEF1-210ENST00000437078 DNAJC9Q8WXX5 260 aa13.72□□□□□ -0.21
RABGEF1-210ENST00000437078 TEKT5Q96M29 485 aa13.72□□□□□ -0.21
RABGEF1-210ENST00000437078 TBATAQ96M53 351 aa13.72□□□□□ -0.21
RABGEF1-210ENST00000437078 ACBD6Q9BR61 282 aa13.72□□□□□ -0.21
RABGEF1-210ENST00000437078 TCF7L2Q9NQB0 619 aa13.72□□□□□ -0.21
RABGEF1-210ENST00000437078 CCDC167Q9P0B6 97 aa13.72□□□□□ -0.21
RABGEF1-210ENST00000437078 TAGLN3Q9UI15 199 aa13.72□□□□□ -0.21
RABGEF1-210ENST00000437078 FBXO5Q9UKT4 447 aa13.72□□□□□ -0.21
RABGEF1-210ENST00000437078 C15orf41Q9Y2V0 281 aa13.72□□□□□ -0.21
RABGEF1-210ENST00000437078 HS3ST4Q9Y661 456 aa13.72□□□□□ -0.21
RABGEF1-210ENST00000437078 LOXHD1Q8IVV2 1947 aa13.72□□□□□ -0.21
RABGEF1-210ENST00000437078 SUPT3HB4E1H0 165 aa13.71□□□□□ -0.21
RABGEF1-210ENST00000437078 F5H5T6 163 aa13.71□□□□□ -0.21
RABGEF1-210ENST00000437078 PRSS56P0CW18 603 aa13.71□□□□□ -0.21
RABGEF1-210ENST00000437078 FMO4P31512 558 aa13.71□□□□□ -0.21
RABGEF1-210ENST00000437078 RPL9P32969 192 aaKnown RBP13.71□□□□□ -0.21
RABGEF1-210ENST00000437078 POM121L1PQ3SYA9 428 aa13.71□□□□□ -0.21
RABGEF1-210ENST00000437078 PPM1LQ5SGD2 360 aa13.71□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.3 ms