RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000436638.5

ECHDC1-208, Transcript of ethylmalonyl-CoA decarboxylase 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 3

Gene ECHDC1, Length 766 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECHDC1-208ENST00000436638 PCDHA13Q9Y5I0 950 aa6.36□□□□□ -1.39
ECHDC1-208ENST00000436638 HEPACAM2A8MVW5 462 aa6.35□□□□□ -1.39
ECHDC1-208ENST00000436638 MYO1FO00160 1098 aa6.35□□□□□ -1.39
ECHDC1-208ENST00000436638 LEFTY2O00292 366 aa6.35□□□□□ -1.39
ECHDC1-208ENST00000436638 SLC9A3R1O14745 358 aaPredicted RBP6.35□□□□□ -1.39
ECHDC1-208ENST00000436638 ZNF263O14978 683 aa6.35□□□□□ -1.39
ECHDC1-208ENST00000436638 PIP5K1CO60331 668 aa6.35□□□□□ -1.39
ECHDC1-208ENST00000436638 ECI2O75521 394 aa6.35□□□□□ -1.39
ECHDC1-208ENST00000436638 GJB6O95452 261 aa6.35□□□□□ -1.39
ECHDC1-208ENST00000436638 OLFM2O95897 454 aa6.35□□□□□ -1.39
ECHDC1-208ENST00000436638 TRUB2O95900 331 aaKnown RBP6.35□□□□□ -1.39
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ECHDC1-208ENST00000436638 SLC2A3P11169 496 aa6.35□□□□□ -1.39
ECHDC1-208ENST00000436638 RFC1P35251 1148 aaPredicted RBP6.35□□□□□ -1.39
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ECHDC1-208ENST00000436638 SLC11A2P49281 568 aa6.35□□□□□ -1.39
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ECHDC1-208ENST00000436638 LRRC14Q15048 493 aa6.35□□□□□ -1.39
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ECHDC1-208ENST00000436638 SLC25A52Q3SY17 297 aa6.35□□□□□ -1.39
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ECHDC1-208ENST00000436638 MEI1Q5TIA1 1274 aa6.35□□□□□ -1.39
ECHDC1-208ENST00000436638 SYPL2Q5VXT5 272 aa6.35□□□□□ -1.39
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ECHDC1-208ENST00000436638 PLEKHA7Q6IQ23 1121 aa6.35□□□□□ -1.39
ECHDC1-208ENST00000436638 SCYL2Q6P3W7 929 aa6.35□□□□□ -1.39
ECHDC1-208ENST00000436638 LVRNQ6Q4G3 990 aa6.35□□□□□ -1.39
ECHDC1-208ENST00000436638 RAD9BQ6WBX8 426 aa6.35□□□□□ -1.39
ECHDC1-208ENST00000436638 BHLHA9Q7RTU4 235 aa6.35□□□□□ -1.39
ECHDC1-208ENST00000436638 TAC4Q86UU9 113 aa6.35□□□□□ -1.39
ECHDC1-208ENST00000436638 SHISA5Q8N114 240 aa6.35□□□□□ -1.39
ECHDC1-208ENST00000436638 EMC1Q8N766 993 aa6.35□□□□□ -1.39
ECHDC1-208ENST00000436638 JOSD2Q8TAC2 188 aa6.35□□□□□ -1.39
ECHDC1-208ENST00000436638 ZNF564Q8TBZ8 553 aaPredicted RBP6.35□□□□□ -1.39
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ECHDC1-208ENST00000436638 DQX1Q8TE96 717 aaKnown RBP6.35□□□□□ -1.39
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ECHDC1-208ENST00000436638 ELSPBP1Q96BH3 223 aa6.35□□□□□ -1.39
ECHDC1-208ENST00000436638 PIWIL1Q96J94 861 aaKnown RBP6.35□□□□□ -1.39
ECHDC1-208ENST00000436638 ZSWIM3Q96MP5 696 aa6.35□□□□□ -1.39
ECHDC1-208ENST00000436638 CFAP57Q96MR6 1250 aa6.35□□□□□ -1.39
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ECHDC1-208ENST00000436638 SLC2A13Q96QE2 648 aa6.35□□□□□ -1.39
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ECHDC1-208ENST00000436638 NUP85Q9BW27 656 aa6.35□□□□□ -1.39
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ECHDC1-208ENST00000436638 SMOC2Q9H3U7 446 aa6.35□□□□□ -1.39
ECHDC1-208ENST00000436638 GSX1Q9H4S2 264 aaPredicted RBP6.35□□□□□ -1.39
ECHDC1-208ENST00000436638 GKN1Q9NS71 199 aa6.35□□□□□ -1.39
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ECHDC1-208ENST00000436638 DUS2Q9NX74 493 aaKnown RBP6.35□□□□□ -1.39
ECHDC1-208ENST00000436638 CFAP97Q9P2B7 532 aa6.35□□□□□ -1.39
ECHDC1-208ENST00000436638 TBC1D14Q9P2M4 693 aa6.35□□□□□ -1.39
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ECHDC1-208ENST00000436638 TMEM59LQ9UK28 342 aa6.35□□□□□ -1.39
ECHDC1-208ENST00000436638 TLR6Q9Y2C9 796 aa6.35□□□□□ -1.39
ECHDC1-208ENST00000436638 ZNF510Q9Y2H8 683 aa6.35□□□□□ -1.39
ECHDC1-208ENST00000436638 NUMBLQ9Y6R0 609 aa6.35□□□□□ -1.39
ECHDC1-208ENST00000436638 MYO16Q9Y6X6 1858 aa6.34□□□□□ -1.39
ECHDC1-208ENST00000436638 PATJQ8NI35 1801 aa6.34□□□□□ -1.39
ECHDC1-208ENST00000436638 E2F8A0AVK6 867 aa6.34□□□□□ -1.39
ECHDC1-208ENST00000436638 TYW5A2RUC4 315 aaKnown RBP6.34□□□□□ -1.39
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ECHDC1-208ENST00000436638 C2CD4BA6NLJ0 364 aa6.34□□□□□ -1.39
ECHDC1-208ENST00000436638 LOC730098B7Z3J9 87 aa6.34□□□□□ -1.39
ECHDC1-208ENST00000436638 ZSCAN9O15535 394 aaPredicted RBP6.34□□□□□ -1.39
ECHDC1-208ENST00000436638 IRAK2O43187 625 aa6.34□□□□□ -1.39
ECHDC1-208ENST00000436638 MSI1O43347 362 aaKnown RBP6.34□□□□□ -1.39
ECHDC1-208ENST00000436638 KDM1AO60341 852 aa6.34□□□□□ -1.39
ECHDC1-208ENST00000436638 TMCC2O75069 709 aa6.34□□□□□ -1.39
ECHDC1-208ENST00000436638 STC2O76061 302 aa6.34□□□□□ -1.39
ECHDC1-208ENST00000436638 LCA5LO95447 670 aa6.34□□□□□ -1.39
ECHDC1-208ENST00000436638 PRAMEF12O95522 483 aa6.34□□□□□ -1.39
ECHDC1-208ENST00000436638 MOCS2O96007 188 aaPredicted RBP6.34□□□□□ -1.39
ECHDC1-208ENST00000436638 CYBBP04839 570 aa6.34□□□□□ -1.39
ECHDC1-208ENST00000436638 CYP1A2P05177 515 aa6.34□□□□□ -1.39
ECHDC1-208ENST00000436638 FYNP06241 537 aa6.34□□□□□ -1.39
ECHDC1-208ENST00000436638 PSMC3P17980 439 aa6.34□□□□□ -1.39
ECHDC1-208ENST00000436638 TPP2P29144 1249 aaPredicted RBP6.34□□□□□ -1.39
ECHDC1-208ENST00000436638 CORO1AP31146 461 aaKnown RBP6.34□□□□□ -1.39
ECHDC1-208ENST00000436638 GDI1P31150 447 aa6.34□□□□□ -1.39
ECHDC1-208ENST00000436638 CCR1P32246 355 aa6.34□□□□□ -1.39
ECHDC1-208ENST00000436638 ADMP35318 185 aa6.34□□□□□ -1.39
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