RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000431413.5

HERC3-206, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 3, humanhuman

TSL 5

Gene HERC3, Length 761 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3-206ENST00000431413 NDFIP2Q9NV92 336 aa15.42■□□□□ 0.06
HERC3-206ENST00000431413 ZFR2Q9UPR6 939 aaKnown RBP15.42■□□□□ 0.06
HERC3-206ENST00000431413 FADS3Q9Y5Q0 445 aa15.42■□□□□ 0.06
HERC3-206ENST00000431413 ZFHX4Q86UP3 3567 aa15.42■□□□□ 0.06
HERC3-206ENST00000431413 C16orf96A6NNT2 1141 aa15.41■□□□□ 0.06
HERC3-206ENST00000431413 KRIT1O00522 736 aa15.41■□□□□ 0.06
HERC3-206ENST00000431413 BUB1O43683 1085 aa15.41■□□□□ 0.06
HERC3-206ENST00000431413 KDELR3O43731 214 aa15.41■□□□□ 0.06
HERC3-206ENST00000431413 CD160O95971 181 aa15.41■□□□□ 0.06
HERC3-206ENST00000431413 PAK4O96013 591 aaPredicted RBP15.41■□□□□ 0.06
HERC3-206ENST00000431413 DGKAP23743 735 aa15.41■□□□□ 0.06
HERC3-206ENST00000431413 YBEYP58557 167 aaPredicted RBP15.41■□□□□ 0.06
HERC3-206ENST00000431413 DAB2P98082 770 aa15.41■□□□□ 0.06
HERC3-206ENST00000431413 CYP4F3Q08477 520 aa15.41■□□□□ 0.06
HERC3-206ENST00000431413 Q6ZSR6 202 aa15.41■□□□□ 0.06
HERC3-206ENST00000431413 PARS2Q7L3T8 475 aaKnown RBP15.41■□□□□ 0.06
HERC3-206ENST00000431413 KANSL1Q7Z3B3 1105 aa15.41■□□□□ 0.06
HERC3-206ENST00000431413 PTAR1Q7Z6K3 402 aaPredicted RBP15.41■□□□□ 0.06
HERC3-206ENST00000431413 ABI3BPQ7Z7G0 1075 aa15.41■□□□□ 0.06
HERC3-206ENST00000431413 RTL3Q8N8U3 475 aaKnown RBP15.41■□□□□ 0.06
HERC3-206ENST00000431413 NXPE2Q96DL1 559 aa15.41■□□□□ 0.06
HERC3-206ENST00000431413 GDAP1L1Q96MZ0 367 aa15.41■□□□□ 0.06
HERC3-206ENST00000431413 MCEEQ96PE7 176 aa15.41■□□□□ 0.06
HERC3-206ENST00000431413 CNPY3Q9BT09 278 aa15.41■□□□□ 0.06
HERC3-206ENST00000431413 EVA1BQ9NVM1 165 aa15.41■□□□□ 0.06
HERC3-206ENST00000431413 IPO11Q9UI26 975 aaKnown RBP15.41■□□□□ 0.06
HERC3-206ENST00000431413 RALYQ9UKM9 306 aaKnown RBP15.41■□□□□ 0.06
HERC3-206ENST00000431413 MYO6Q9UM54 1294 aa15.41■□□□□ 0.06
HERC3-206ENST00000431413 PTPRBP23467 1997 aa15.41■□□□□ 0.06
HERC3-206ENST00000431413 DOCK4Q8N1I0 1966 aa15.41■□□□□ 0.06
HERC3-206ENST00000431413 DMXL2Q8TDJ6 3036 aa15.41■□□□□ 0.06
HERC3-206ENST00000431413 GOLGA4Q13439 2230 aaKnown RBP15.41■□□□□ 0.06
HERC3-206ENST00000431413 RNF103O00237 685 aa15.4■□□□□ 0.06
HERC3-206ENST00000431413 FPGTO14772 594 aa15.4■□□□□ 0.06
HERC3-206ENST00000431413 CCP110O43303 1012 aa15.4■□□□□ 0.06
HERC3-206ENST00000431413 SIGLEC6O43699 453 aa15.4■□□□□ 0.06
HERC3-206ENST00000431413 CREB3O43889 395 aa15.4■□□□□ 0.06
HERC3-206ENST00000431413 TNFAIP3P21580 790 aa15.4■□□□□ 0.06
HERC3-206ENST00000431413 ACP1P24666 158 aa15.4■□□□□ 0.06
HERC3-206ENST00000431413 CLDN2P57739 230 aa15.4■□□□□ 0.06
HERC3-206ENST00000431413 HNRNPKP61978 463 aaKnown RBP eCLIP15.4■□□□□ 0.06
HERC3-206ENST00000431413 E2F1Q01094 437 aa15.4■□□□□ 0.06
HERC3-206ENST00000431413 MYLK3Q32MK0 819 aa15.4■□□□□ 0.06
HERC3-206ENST00000431413 INO80DQ53TQ3 878 aaPredicted RBP15.4■□□□□ 0.06
HERC3-206ENST00000431413 ACAD10Q6JQN1 1059 aa15.4■□□□□ 0.06
HERC3-206ENST00000431413 KYAT3Q6YP21 454 aaKnown RBP15.4■□□□□ 0.06
HERC3-206ENST00000431413 GCNT7Q6ZNI0 430 aa15.4■□□□□ 0.06
HERC3-206ENST00000431413 MARCH9Q86YJ5 346 aa15.4■□□□□ 0.06
HERC3-206ENST00000431413 SLC25A45Q8N413 288 aa15.4■□□□□ 0.06
HERC3-206ENST00000431413 AOPEPQ8N6M6 819 aa15.4■□□□□ 0.06
HERC3-206ENST00000431413 OR6K2Q8NGY2 324 aa15.4■□□□□ 0.06
HERC3-206ENST00000431413 OR4C6Q8NH72 309 aa15.4■□□□□ 0.06
HERC3-206ENST00000431413 VCPIP1Q96JH7 1222 aa15.4■□□□□ 0.06
HERC3-206ENST00000431413 DNAJC28Q9NX36 388 aa15.4■□□□□ 0.06
HERC3-206ENST00000431413 RAXQ9Y2V3 346 aa15.4■□□□□ 0.06
HERC3-206ENST00000431413 GPSM3Q9Y4H4 160 aa15.4■□□□□ 0.06
HERC3-206ENST00000431413 ACTL7AQ9Y615 435 aa15.4■□□□□ 0.06
HERC3-206ENST00000431413 PLXNB3Q9ULL4 1909 aa15.4■□□□□ 0.06
HERC3-206ENST00000431413 TP53BP1Q12888 1972 aaPredicted RBP15.4■□□□□ 0.06
HERC3-206ENST00000431413 SMTNL1A8MU46 457 aa15.39■□□□□ 0.05
HERC3-206ENST00000431413 H3BM21 787 aa15.39■□□□□ 0.05
HERC3-206ENST00000431413 FGF10O15520 208 aaPredicted RBP15.39■□□□□ 0.05
HERC3-206ENST00000431413 PIAS2O75928 621 aa15.39■□□□□ 0.05
HERC3-206ENST00000431413 IGSF6O95976 241 aa15.39■□□□□ 0.05
HERC3-206ENST00000431413 UGT2B4P06133 528 aa15.39■□□□□ 0.05
HERC3-206ENST00000431413 HTR7P34969 479 aa15.39■□□□□ 0.05
HERC3-206ENST00000431413 RABIFP47224 123 aa15.39■□□□□ 0.05
HERC3-206ENST00000431413 RHOAP61586 193 aa15.39■□□□□ 0.05
HERC3-206ENST00000431413 TYRO3Q06418 890 aa15.39■□□□□ 0.05
HERC3-206ENST00000431413 NCAPHQ15003 741 aa15.39■□□□□ 0.05
HERC3-206ENST00000431413 PROX2Q3B8N5 592 aa15.39■□□□□ 0.05
HERC3-206ENST00000431413 PARP15Q460N3 678 aa15.39■□□□□ 0.05
HERC3-206ENST00000431413 FILIP1LQ4L180 1135 aa15.39■□□□□ 0.05
HERC3-206ENST00000431413 HES3Q5TGS1 186 aa15.39■□□□□ 0.05
HERC3-206ENST00000431413 GDPD4Q6W3E5 623 aa15.39■□□□□ 0.05
HERC3-206ENST00000431413 MCOLN2Q8IZK6 566 aa15.39■□□□□ 0.05
HERC3-206ENST00000431413 PYROXD2Q8N2H3 581 aa15.39■□□□□ 0.05
HERC3-206ENST00000431413 ASB12Q8WXK4 309 aa15.39■□□□□ 0.05
HERC3-206ENST00000431413 KLHL32Q96NJ5 620 aa15.39■□□□□ 0.05
HERC3-206ENST00000431413 LENG8Q96PV6 779 aaPredicted RBP15.39■□□□□ 0.05
HERC3-206ENST00000431413 DUSP23Q9BVJ7 150 aa15.39■□□□□ 0.05
HERC3-206ENST00000431413 C1QTNF2Q9BXJ5 285 aa15.39■□□□□ 0.05
HERC3-206ENST00000431413 MAGEB5Q9BZ81 275 aa15.39■□□□□ 0.05
HERC3-206ENST00000431413 TTYH3Q9C0H2 523 aa15.39■□□□□ 0.05
HERC3-206ENST00000431413 FZD10Q9ULW2 581 aa15.39■□□□□ 0.05
HERC3-206ENST00000431413 NEU3Q9UQ49 428 aa15.39■□□□□ 0.05
HERC3-206ENST00000431413 ACACAQ13085 2346 aa15.39■□□□□ 0.05
HERC3-206ENST00000431413 FREM2Q5SZK8 3169 aa15.38■□□□□ 0.05
HERC3-206ENST00000431413 SPEGQ15772 3267 aa15.38■□□□□ 0.05
HERC3-206ENST00000431413 KNTC1P50748 2209 aa15.38■□□□□ 0.05
HERC3-206ENST00000431413 TCRBV5S1A1TA0A578 114 aa15.38■□□□□ 0.05
HERC3-206ENST00000431413 IGLON5A6NGN9 336 aa15.38■□□□□ 0.05
HERC3-206ENST00000431413 EIF3CLB5ME19 914 aaKnown RBP15.38■□□□□ 0.05
HERC3-206ENST00000431413 TRIM38O00635 465 aa15.38■□□□□ 0.05
HERC3-206ENST00000431413 FFAR2O15552 330 aa15.38■□□□□ 0.05
HERC3-206ENST00000431413 TMCC1O94876 653 aa15.38■□□□□ 0.05
HERC3-206ENST00000431413 GKP32189 559 aa15.38■□□□□ 0.05
HERC3-206ENST00000431413 DUSP3P51452 185 aaPredicted RBP15.38■□□□□ 0.05
HERC3-206ENST00000431413 RPL7AP62424 266 aaKnown RBP15.38■□□□□ 0.05
HERC3-206ENST00000431413 TARDBPQ13148 414 aaKnown RBP eCLIP15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.4 ms