RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000424089.5

POLR1A-204, Transcript of RNA polymerase I subunit A, human

TSL 3

Gene POLR1A, Length 576 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
POLR1A-204	ENST00000424089	MTPAP	Q9NVV4	582 aa	Known RBP eCLIP	10.2	□□□□□ -0.78
POLR1A-204	ENST00000424089	TMEM248	Q9NWD8	314 aa		10.2	□□□□□ -0.78
POLR1A-204	ENST00000424089	STK39	Q9UEW8	545 aa		10.2	□□□□□ -0.78
POLR1A-204	ENST00000424089	DCDC2	Q9UHG0	476 aa		10.2	□□□□□ -0.78
POLR1A-204	ENST00000424089	GRID1	Q9ULK0	1009 aa		10.2	□□□□□ -0.78
POLR1A-204	ENST00000424089	MAFF	Q9ULX9	164 aa		10.2	□□□□□ -0.78
POLR1A-204	ENST00000424089	HBS1L	Q9Y450	684 aa	Known RBP	10.2	□□□□□ -0.78
POLR1A-204	ENST00000424089	HS3ST4	Q9Y661	456 aa		10.2	□□□□□ -0.78
POLR1A-204	ENST00000424089	USH1C	Q9Y6N9	552 aa		10.2	□□□□□ -0.78
POLR1A-204	ENST00000424089	RPS6KL1	Q9Y6S9	549 aa		10.2	□□□□□ -0.78
POLR1A-204	ENST00000424089	C2orf16	Q68DN1	1984 aa		10.19	□□□□□ -0.78
POLR1A-204	ENST00000424089	TDRD15	B5MCY1	1934 aa	Known RBP	10.19	□□□□□ -0.78
POLR1A-204	ENST00000424089	CFAP73	A6NFT4	308 aa		10.19	□□□□□ -0.78
POLR1A-204	ENST00000424089	NT5C1B-RDH14	C9J2C7	533 aa		10.19	□□□□□ -0.78
POLR1A-204	ENST00000424089	DFFA	O00273	331 aa		10.19	□□□□□ -0.78
POLR1A-204	ENST00000424089	MAFK	O60675	156 aa		10.19	□□□□□ -0.78
POLR1A-204	ENST00000424089	DNAJC8	O75937	253 aa	Predicted RBP	10.19	□□□□□ -0.78
POLR1A-204	ENST00000424089	NEBL	O76041	1014 aa		10.19	□□□□□ -0.78
POLR1A-204	ENST00000424089	EFEMP2	O95967	443 aa		10.19	□□□□□ -0.78
POLR1A-204	ENST00000424089	IGLV3-27	P01718	113 aa		10.19	□□□□□ -0.78
POLR1A-204	ENST00000424089	CSH1	P0DML2	217 aa		10.19	□□□□□ -0.78
POLR1A-204	ENST00000424089	CSH2	P0DML3	217 aa		10.19	□□□□□ -0.78
POLR1A-204	ENST00000424089	CTSA	P10619	480 aa		10.19	□□□□□ -0.78
POLR1A-204	ENST00000424089	EPCAM	P16422	314 aa		10.19	□□□□□ -0.78
POLR1A-204	ENST00000424089	ADRA1D	P25100	572 aa		10.19	□□□□□ -0.78
POLR1A-204	ENST00000424089	SPR	P35270	261 aa	Predicted RBP	10.19	□□□□□ -0.78
POLR1A-204	ENST00000424089	GP5	P40197	560 aa		10.19	□□□□□ -0.78
POLR1A-204	ENST00000424089	SKIV2L2	P42285	1042 aa	Known RBP	10.19	□□□□□ -0.78
POLR1A-204	ENST00000424089	CSE1L	P55060	971 aa	Known RBP	10.19	□□□□□ -0.78
POLR1A-204	ENST00000424089	YBEY	P58557	167 aa	Predicted RBP	10.19	□□□□□ -0.78
POLR1A-204	ENST00000424089	CDK18	Q07002	472 aa		10.19	□□□□□ -0.78
POLR1A-204	ENST00000424089	ZBTB17	Q13105	803 aa		10.19	□□□□□ -0.78
POLR1A-204	ENST00000424089	MPP3	Q13368	585 aa		10.19	□□□□□ -0.78
POLR1A-204	ENST00000424089	RSPO4	Q2I0M5	234 aa	Predicted RBP	10.19	□□□□□ -0.78
POLR1A-204	ENST00000424089	USP41	Q3LFD5	358 aa		10.19	□□□□□ -0.78
POLR1A-204	ENST00000424089	ANKRD20A4	Q4UJ75	823 aa		10.19	□□□□□ -0.78
POLR1A-204	ENST00000424089	PCID2	Q5JVF3	399 aa		10.19	□□□□□ -0.78
POLR1A-204	ENST00000424089	SNX30	Q5VWJ9	437 aa		10.19	□□□□□ -0.78
POLR1A-204	ENST00000424089	SLC8B1	Q6J4K2	584 aa		10.19	□□□□□ -0.78
POLR1A-204	ENST00000424089	TRMT10B	Q6PF06	316 aa	Known RBP	10.19	□□□□□ -0.78
POLR1A-204	ENST00000424089	KLHDC10	Q6PID8	442 aa		10.19	□□□□□ -0.78
POLR1A-204	ENST00000424089	POTEH	Q6S545	545 aa		10.19	□□□□□ -0.78
POLR1A-204	ENST00000424089	PACS1	Q6VY07	963 aa		10.19	□□□□□ -0.78
POLR1A-204	ENST00000424089	GPR149	Q86SP6	731 aa		10.19	□□□□□ -0.78
POLR1A-204	ENST00000424089	LCA5	Q86VQ0	697 aa		10.19	□□□□□ -0.78
POLR1A-204	ENST00000424089	TP53INP2	Q8IXH6	220 aa		10.19	□□□□□ -0.78
POLR1A-204	ENST00000424089	C10orf67	Q8IYJ2	551 aa		10.19	□□□□□ -0.78
POLR1A-204	ENST00000424089	ZNF683	Q8IZ20	524 aa		10.19	□□□□□ -0.78
POLR1A-204	ENST00000424089	ATAD1	Q8NBU5	361 aa		10.19	□□□□□ -0.78
POLR1A-204	ENST00000424089	SERBP1	Q8NC51	408 aa	Known RBP eCLIP	10.19	□□□□□ -0.78
POLR1A-204	ENST00000424089	OR52K1	Q8NGK4	314 aa		10.19	□□□□□ -0.78
POLR1A-204	ENST00000424089	GABPB2	Q8TAK5	448 aa	Predicted RBP	10.19	□□□□□ -0.78
POLR1A-204	ENST00000424089	NSMCE1	Q8WV22	266 aa		10.19	□□□□□ -0.78
POLR1A-204	ENST00000424089	ISL2	Q96A47	359 aa		10.19	□□□□□ -0.78
POLR1A-204	ENST00000424089	CERS2	Q96G23	380 aa		10.19	□□□□□ -0.78
POLR1A-204	ENST00000424089	AGAP3	Q96P47	875 aa		10.19	□□□□□ -0.78
POLR1A-204	ENST00000424089	GORASP1	Q9BQQ3	440 aa		10.19	□□□□□ -0.78
POLR1A-204	ENST00000424089	MLPH	Q9BV36	600 aa	Predicted RBP	10.19	□□□□□ -0.78
POLR1A-204	ENST00000424089	KIFC1	Q9BW19	673 aa		10.19	□□□□□ -0.78
POLR1A-204	ENST00000424089	SLC39A8	Q9C0K1	460 aa		10.19	□□□□□ -0.78
POLR1A-204	ENST00000424089	KCNK12	Q9HB15	430 aa		10.19	□□□□□ -0.78
POLR1A-204	ENST00000424089	MRM3	Q9HC36	420 aa	Known RBP	10.19	□□□□□ -0.78
POLR1A-204	ENST00000424089	VPS45	Q9NRW7	570 aa		10.19	□□□□□ -0.78
POLR1A-204	ENST00000424089	SYBU	Q9NX95	663 aa		10.19	□□□□□ -0.78
POLR1A-204	ENST00000424089	MARCH2	Q9P0N8	246 aa		10.19	□□□□□ -0.78
POLR1A-204	ENST00000424089	GMIP	Q9P107	970 aa		10.19	□□□□□ -0.78
POLR1A-204	ENST00000424089	ZFAT	Q9P243	1243 aa		10.19	□□□□□ -0.78
POLR1A-204	ENST00000424089	WNT16	Q9UBV4	365 aa		10.19	□□□□□ -0.78
POLR1A-204	ENST00000424089	SOX13	Q9UN79	622 aa		10.19	□□□□□ -0.78
POLR1A-204	ENST00000424089	SLC12A4	Q9UP95	1085 aa		10.19	□□□□□ -0.78
POLR1A-204	ENST00000424089	SNX10	Q9Y5X0	201 aa		10.19	□□□□□ -0.78
POLR1A-204	ENST00000424089	IRAK3	Q9Y616	596 aa		10.19	□□□□□ -0.78
POLR1A-204	ENST00000424089		R4GN57	208 aa		10.19	□□□□□ -0.78
POLR1A-204	ENST00000424089	DMD	P11532	3685 aa		10.18	□□□□□ -0.78
POLR1A-204	ENST00000424089		H0YHG0	523 aa		10.18	□□□□□ -0.78
POLR1A-204	ENST00000424089	GOLGA8R	I6L899	631 aa		10.18	□□□□□ -0.78
POLR1A-204	ENST00000424089	MSI1	O43347	362 aa	Known RBP	10.18	□□□□□ -0.78
POLR1A-204	ENST00000424089	TIMM44	O43615	452 aa		10.18	□□□□□ -0.78
POLR1A-204	ENST00000424089	GLRA3	O75311	464 aa		10.18	□□□□□ -0.78
POLR1A-204	ENST00000424089	ATP5B	P06576	529 aa	Known RBP	10.18	□□□□□ -0.78
POLR1A-204	ENST00000424089	SCTR	P47872	440 aa		10.18	□□□□□ -0.78
POLR1A-204	ENST00000424089	PPP3CC	P48454	512 aa		10.18	□□□□□ -0.78
POLR1A-204	ENST00000424089	SERPINB4	P48594	390 aa		10.18	□□□□□ -0.78
POLR1A-204	ENST00000424089	MAPKAPK2	P49137	400 aa		10.18	□□□□□ -0.78
POLR1A-204	ENST00000424089	EFEMP1	Q12805	493 aa		10.18	□□□□□ -0.78
POLR1A-204	ENST00000424089	TAF10	Q12962	218 aa		10.18	□□□□□ -0.78
POLR1A-204	ENST00000424089	ZKSCAN8	Q15776	578 aa	Predicted RBP	10.18	□□□□□ -0.78
POLR1A-204	ENST00000424089	MGAT5B	Q3V5L5	792 aa		10.18	□□□□□ -0.78
POLR1A-204	ENST00000424089	PARP15	Q460N3	678 aa		10.18	□□□□□ -0.78
POLR1A-204	ENST00000424089	GALNTL6	Q49A17	601 aa		10.18	□□□□□ -0.78
POLR1A-204	ENST00000424089	MS4A13	Q5J8X5	152 aa		10.18	□□□□□ -0.78
POLR1A-204	ENST00000424089	ARTN	Q5T4W7	220 aa		10.18	□□□□□ -0.78
POLR1A-204	ENST00000424089	TPGS2	Q68CL5	300 aa		10.18	□□□□□ -0.78
POLR1A-204	ENST00000424089	PDPK2P	Q6A1A2	396 aa		10.18	□□□□□ -0.78
POLR1A-204	ENST00000424089	DDX53	Q86TM3	631 aa	Known RBP	10.18	□□□□□ -0.78
POLR1A-204	ENST00000424089	RASSF3	Q86WH2	238 aa		10.18	□□□□□ -0.78
POLR1A-204	ENST00000424089	GPR65	Q8IYL9	337 aa		10.18	□□□□□ -0.78
POLR1A-204	ENST00000424089	NDUFAF2	Q8N183	169 aa		10.18	□□□□□ -0.78
POLR1A-204	ENST00000424089	CNTD1	Q8N815	330 aa		10.18	□□□□□ -0.78
POLR1A-204	ENST00000424089	CCDC63	Q8NA47	563 aa		10.18	□□□□□ -0.78

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