RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000412806.1

SH3BP5-204, Transcript of SH3 domain binding protein 5, humanhuman

TSL 5

Gene SH3BP5, Length 1,900 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP5-204ENST00000412806 POLR1EQ9GZS1 481 aaKnown RBP21.86■■□□□ 1.09
SH3BP5-204ENST00000412806 IQCGQ9H095 443 aaKnown RBP21.86■■□□□ 1.09
SH3BP5-204ENST00000412806 VPS11Q9H270 941 aa21.86■■□□□ 1.09
SH3BP5-204ENST00000412806 MRM3Q9HC36 420 aaKnown RBP21.86■■□□□ 1.09
SH3BP5-204ENST00000412806 SLCO1B3Q9NPD5 702 aa21.86■■□□□ 1.09
SH3BP5-204ENST00000412806 PLLPQ9Y342 182 aa21.86■■□□□ 1.09
SH3BP5-204ENST00000412806 ILVBLA1L0T0 632 aa21.86■■□□□ 1.09
SH3BP5-204ENST00000412806 ANKRD65E5RJM6 399 aa21.86■■□□□ 1.09
SH3BP5-204ENST00000412806 KDELR3O43731 214 aa21.86■■□□□ 1.09
SH3BP5-204ENST00000412806 TLL1O43897 1013 aa21.86■■□□□ 1.09
SH3BP5-204ENST00000412806 CTNNB1P35222 781 aa21.86■■□□□ 1.09
SH3BP5-204ENST00000412806 PDPK2PQ6A1A2 396 aa21.86■■□□□ 1.09
SH3BP5-204ENST00000412806 ESRP1Q6NXG1 681 aaKnown RBP21.86■■□□□ 1.09
SH3BP5-204ENST00000412806 CCDC149Q6ZUS6 474 aa21.86■■□□□ 1.09
SH3BP5-204ENST00000412806 PITPNM3Q9BZ71 974 aa21.86■■□□□ 1.09
SH3BP5-204ENST00000412806 PRKAG3Q9UGI9 489 aa21.86■■□□□ 1.09
SH3BP5-204ENST00000412806 SLC2A6Q9UGQ3 507 aa21.86■■□□□ 1.09
SH3BP5-204ENST00000412806 TBC1D30Q9Y2I9 924 aa21.86■■□□□ 1.09
SH3BP5-204ENST00000412806 HIDE1A8MVS5 230 aa21.85■■□□□ 1.09
SH3BP5-204ENST00000412806 LATS1O95835 1130 aa21.85■■□□□ 1.09
SH3BP5-204ENST00000412806 TOP3BO95985 862 aaKnown RBP21.85■■□□□ 1.09
SH3BP5-204ENST00000412806 CRHR1P34998 444 aa21.85■■□□□ 1.09
SH3BP5-204ENST00000412806 OXCT1P55809 520 aa21.85■■□□□ 1.09
SH3BP5-204ENST00000412806 PLPP4Q5VZY2 271 aa21.85■■□□□ 1.09
SH3BP5-204ENST00000412806 CXorf57Q6NSI4 855 aaKnown RBP21.85■■□□□ 1.09
SH3BP5-204ENST00000412806 Q6ZNB5 142 aa21.85■■□□□ 1.09
SH3BP5-204ENST00000412806 SETD3Q86TU7 594 aaPredicted RBP21.85■■□□□ 1.09
SH3BP5-204ENST00000412806 C7orf61Q8IZ16 206 aa21.85■■□□□ 1.09
SH3BP5-204ENST00000412806 PTCD2Q8WV60 388 aaKnown RBP21.85■■□□□ 1.09
SH3BP5-204ENST00000412806 ATP2A3Q93084 1043 aa21.85■■□□□ 1.09
SH3BP5-204ENST00000412806 PHTF1Q9UMS5 762 aa21.85■■□□□ 1.09
SH3BP5-204ENST00000412806 SLC4A7Q9Y6M7 1214 aa21.85■■□□□ 1.09
SH3BP5-204ENST00000412806 DNAJB1P25685 340 aa21.84■■□□□ 1.09
SH3BP5-204ENST00000412806 BMPR1AP36894 532 aa21.84■■□□□ 1.09
SH3BP5-204ENST00000412806 LIMK2P53671 638 aa21.84■■□□□ 1.09
SH3BP5-204ENST00000412806 PDE1BQ01064 536 aa21.84■■□□□ 1.09
SH3BP5-204ENST00000412806 SEPT6Q14141 434 aa21.84■■□□□ 1.09
SH3BP5-204ENST00000412806 ITIH4Q14624 930 aa21.84■■□□□ 1.09
SH3BP5-204ENST00000412806 SPATA21Q7Z572 469 aa21.84■■□□□ 1.09
SH3BP5-204ENST00000412806 SRLQ86TD4 932 aa21.84■■□□□ 1.09
SH3BP5-204ENST00000412806 MAB21L3Q8N8X9 362 aa21.84■■□□□ 1.09
SH3BP5-204ENST00000412806 ACMSDQ8TDX5 336 aa21.84■■□□□ 1.09
SH3BP5-204ENST00000412806 HERVK_113Q902F9 699 aa21.84■■□□□ 1.09
SH3BP5-204ENST00000412806 MRPS31Q92665 395 aaKnown RBP21.84■■□□□ 1.09
SH3BP5-204ENST00000412806 ATXN7L3BQ96GX2 97 aa21.84■■□□□ 1.09
SH3BP5-204ENST00000412806 UBA2Q9UBT2 640 aaPredicted RBP21.84■■□□□ 1.09
SH3BP5-204ENST00000412806 RRP15Q9Y3B9 282 aaKnown RBP21.84■■□□□ 1.09
SH3BP5-204ENST00000412806 TBL1XO60907 577 aa21.84■■□□□ 1.09
SH3BP5-204ENST00000412806 GJA1P17302 382 aa21.84■■□□□ 1.09
SH3BP5-204ENST00000412806 SYN1P17600 705 aa21.84■■□□□ 1.09
SH3BP5-204ENST00000412806 SPRP35270 261 aaPredicted RBP21.84■■□□□ 1.09
SH3BP5-204ENST00000412806 ABCG1P45844 678 aa21.84■■□□□ 1.09
SH3BP5-204ENST00000412806 SERPINH1P50454 418 aaKnown RBP21.84■■□□□ 1.09
SH3BP5-204ENST00000412806 MSLNQ13421 630 aaPredicted RBP21.84■■□□□ 1.09
SH3BP5-204ENST00000412806 RNF219Q5W0B1 726 aaPredicted RBP21.84■■□□□ 1.09
SH3BP5-204ENST00000412806 DCLK2Q8N568 766 aa21.84■■□□□ 1.09
SH3BP5-204ENST00000412806 SLC22A17Q8WUG5 538 aa21.84■■□□□ 1.09
SH3BP5-204ENST00000412806 PTPRN2Q92932 1015 aa21.84■■□□□ 1.09
SH3BP5-204ENST00000412806 EMILIN2Q9BXX0 1053 aa21.84■■□□□ 1.09
SH3BP5-204ENST00000412806 ACE2Q9BYF1 805 aaPredicted RBP21.84■■□□□ 1.09
SH3BP5-204ENST00000412806 TREX1Q9NSU2 369 aa21.84■■□□□ 1.09
SH3BP5-204ENST00000412806 USP15Q9Y4E8 981 aaPredicted RBP21.84■■□□□ 1.09
SH3BP5-204ENST00000412806 IRAK3Q9Y616 596 aa21.84■■□□□ 1.09
SH3BP5-204ENST00000412806 ATXN2Q99700 1313 aaKnown RBP21.84■■□□□ 1.09
SH3BP5-204ENST00000412806 C2orf71A6NGG8 1288 aa21.83■■□□□ 1.09
SH3BP5-204ENST00000412806 EDF1O60869 148 aaKnown RBP21.83■■□□□ 1.09
SH3BP5-204ENST00000412806 ARNTP27540 789 aa21.83■■□□□ 1.09
SH3BP5-204ENST00000412806 ARCN1P48444 511 aaKnown RBP21.83■■□□□ 1.09
SH3BP5-204ENST00000412806 SERPINB4P48594 390 aa21.83■■□□□ 1.09
SH3BP5-204ENST00000412806 PDE1CQ14123 709 aaPredicted RBP21.83■■□□□ 1.09
SH3BP5-204ENST00000412806 SIRPB2Q5JXA9 342 aa21.83■■□□□ 1.09
SH3BP5-204ENST00000412806 ANKS4BQ8N8V4 417 aa21.83■■□□□ 1.09
SH3BP5-204ENST00000412806 TTC16Q8NEE8 873 aa21.83■■□□□ 1.09
SH3BP5-204ENST00000412806 ARMC2Q8NEN0 867 aa21.83■■□□□ 1.09
SH3BP5-204ENST00000412806 MCMBPQ9BTE3 642 aa21.83■■□□□ 1.09
SH3BP5-204ENST00000412806 MANSC1Q9H8J5 431 aa21.83■■□□□ 1.09
SH3BP5-204ENST00000412806 MTO1Q9Y2Z2 717 aaKnown RBP21.83■■□□□ 1.09
SH3BP5-204ENST00000412806 LOC285095A0A1B0GVY8 99 aa21.82■■□□□ 1.08
SH3BP5-204ENST00000412806 A0A1W2PRU2 124 aa21.82■■□□□ 1.08
SH3BP5-204ENST00000412806 CCL16O15467 120 aa21.82■■□□□ 1.08
SH3BP5-204ENST00000412806 VAPBO95292 243 aa21.82■■□□□ 1.08
SH3BP5-204ENST00000412806 GLUD1P00367 558 aa21.82■■□□□ 1.08
SH3BP5-204ENST00000412806 ATXN1LP0C7T5 689 aaKnown RBP21.82■■□□□ 1.08
SH3BP5-204ENST00000412806 CSE1LP55060 971 aaKnown RBP21.82■■□□□ 1.08
SH3BP5-204ENST00000412806 STXBP5Q5T5C0 1151 aa21.82■■□□□ 1.08
SH3BP5-204ENST00000412806 ALG1LQ6GMV1 187 aa21.82■■□□□ 1.08
SH3BP5-204ENST00000412806 FSTL4Q6MZW2 842 aa21.82■■□□□ 1.08
SH3BP5-204ENST00000412806 CARNMT1Q8N4J0 409 aa21.82■■□□□ 1.08
SH3BP5-204ENST00000412806 POF1BQ8WVV4 589 aa21.82■■□□□ 1.08
SH3BP5-204ENST00000412806 RANBP9Q96S59 729 aa21.82■■□□□ 1.08
SH3BP5-204ENST00000412806 MGME1Q9BQP7 344 aa21.82■■□□□ 1.08
SH3BP5-204ENST00000412806 SEPT3Q9UH03 358 aa21.82■■□□□ 1.08
SH3BP5-204ENST00000412806 LZTS1Q9Y250 596 aa21.82■■□□□ 1.08
SH3BP5-204ENST00000412806 CBX4O00257 560 aa21.82■■□□□ 1.08
SH3BP5-204ENST00000412806 GFRA2O00451 464 aa21.82■■□□□ 1.08
SH3BP5-204ENST00000412806 CKMP06732 381 aa21.82■■□□□ 1.08
SH3BP5-204ENST00000412806 MYL4P12829 197 aa21.82■■□□□ 1.08
SH3BP5-204ENST00000412806 RGRP47804 291 aa21.82■■□□□ 1.08
SH3BP5-204ENST00000412806 CNGA3Q16281 694 aa21.82■■□□□ 1.08
SH3BP5-204ENST00000412806 FSCBQ5H9T9 825 aa21.82■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.7 ms