RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000409985.5

PMS1-205, Transcript of PMS1 homolog 1, mismatch repair system component, humanhuman

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Gene PMS1, Length 1,882 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS1-205ENST00000409985 MRGBPQ9NV56 204 aa24.09■■□□□ 1.45
PMS1-205ENST00000409985 CDH22Q9UJ99 828 aa24.09■■□□□ 1.45
PMS1-205ENST00000409985 PRPF19Q9UMS4 504 aaKnown RBP24.09■■□□□ 1.45
PMS1-205ENST00000409985 ACOT9Q9Y305 439 aa24.09■■□□□ 1.45
PMS1-205ENST00000409985 PTPRDP23468 1912 aa24.09■■□□□ 1.45
PMS1-205ENST00000409985 B3GAT3O94766 335 aa24.09■■□□□ 1.45
PMS1-205ENST00000409985 AHSGP02765 367 aa24.09■■□□□ 1.45
PMS1-205ENST00000409985 SLC35E2BP0CK96 405 aa24.09■■□□□ 1.45
PMS1-205ENST00000409985 ARCN1P48444 511 aaKnown RBP24.09■■□□□ 1.45
PMS1-205ENST00000409985 TSPY1Q01534 308 aa24.09■■□□□ 1.45
PMS1-205ENST00000409985 LRRC26Q2I0M4 334 aa24.09■■□□□ 1.45
PMS1-205ENST00000409985 TRIM71Q2Q1W2 868 aaKnown RBP24.09■■□□□ 1.45
PMS1-205ENST00000409985 KIAA0930Q6ICG6 404 aaPredicted RBP24.09■■□□□ 1.45
PMS1-205ENST00000409985 RWDD4Q6NW29 188 aaKnown RBP24.09■■□□□ 1.45
PMS1-205ENST00000409985 KIAA0408Q6ZU52 694 aa24.09■■□□□ 1.45
PMS1-205ENST00000409985 RAPH1Q70E73 1250 aa24.09■■□□□ 1.45
PMS1-205ENST00000409985 GABPB2Q8TAK5 448 aaPredicted RBP24.09■■□□□ 1.45
PMS1-205ENST00000409985 RSPH1Q8WYR4 309 aa24.09■■□□□ 1.45
PMS1-205ENST00000409985 SUSD3Q96L08 255 aa24.09■■□□□ 1.45
PMS1-205ENST00000409985 C1orf74Q96LT6 269 aa24.09■■□□□ 1.45
PMS1-205ENST00000409985 TCAF1Q9Y4C2 921 aa24.09■■□□□ 1.45
PMS1-205ENST00000409985 ITGAXP20702 1163 aa24.08■■□□□ 1.45
PMS1-205ENST00000409985 RAB10P61026 200 aa24.08■■□□□ 1.45
PMS1-205ENST00000409985 USP4Q13107 963 aa24.08■■□□□ 1.45
PMS1-205ENST00000409985 TRIM60Q495X7 471 aa24.08■■□□□ 1.45
PMS1-205ENST00000409985 ARTNQ5T4W7 220 aa24.08■■□□□ 1.45
PMS1-205ENST00000409985 VWA5B1Q5TIE3 1220 aa24.08■■□□□ 1.45
PMS1-205ENST00000409985 BTBD8Q5XKL5 378 aa24.08■■□□□ 1.45
PMS1-205ENST00000409985 SEL1L3Q68CR1 1132 aa24.08■■□□□ 1.45
PMS1-205ENST00000409985 FBXW8Q8N3Y1 598 aa24.08■■□□□ 1.45
PMS1-205ENST00000409985 SPDL1Q96EA4 605 aa24.08■■□□□ 1.45
PMS1-205ENST00000409985 PGLYRP2Q96PD5 576 aa24.08■■□□□ 1.45
PMS1-205ENST00000409985 PAAF1Q9BRP4 392 aa24.08■■□□□ 1.45
PMS1-205ENST00000409985 ARNT2Q9HBZ2 717 aa24.08■■□□□ 1.45
PMS1-205ENST00000409985 TBC1D13Q9NVG8 400 aa24.08■■□□□ 1.45
PMS1-205ENST00000409985 ZDHHC7Q9NXF8 308 aa24.08■■□□□ 1.45
PMS1-205ENST00000409985 VPS28Q9UK41 221 aa24.08■■□□□ 1.45
PMS1-205ENST00000409985 SHROOM3Q8TF72 1996 aa24.08■■□□□ 1.45
PMS1-205ENST00000409985 A0A087X1B8 175 aa24.07■■□□□ 1.44
PMS1-205ENST00000409985 MAGEA13PA6NCF6 341 aa24.07■■□□□ 1.44
PMS1-205ENST00000409985 TNFRSF10BO14763 440 aa24.07■■□□□ 1.44
PMS1-205ENST00000409985 NPHS1O60500 1241 aa24.07■■□□□ 1.44
PMS1-205ENST00000409985 PAGE1O75459 146 aa24.07■■□□□ 1.44
PMS1-205ENST00000409985 SBK3P0C264 359 aa24.07■■□□□ 1.44
PMS1-205ENST00000409985 DSG1Q02413 1049 aa24.07■■□□□ 1.44
PMS1-205ENST00000409985 HNRNPDQ14103 355 aaKnown RBP24.07■■□□□ 1.44
PMS1-205ENST00000409985 HERC3Q15034 1050 aa24.07■■□□□ 1.44
PMS1-205ENST00000409985 SLC9B1Q4ZJI4 515 aa24.07■■□□□ 1.44
PMS1-205ENST00000409985 OVOS1Q6IE37 1185 aa24.07■■□□□ 1.44
PMS1-205ENST00000409985 RANBP10Q6VN20 620 aa24.07■■□□□ 1.44
PMS1-205ENST00000409985 POU5F2Q8N7G0 328 aa24.07■■□□□ 1.44
PMS1-205ENST00000409985 GATA6Q92908 595 aa24.07■■□□□ 1.44
PMS1-205ENST00000409985 RHOBTB2Q9BYZ6 727 aa24.07■■□□□ 1.44
PMS1-205ENST00000409985 TREX1Q9NSU2 369 aa24.07■■□□□ 1.44
PMS1-205ENST00000409985 TMLHEQ9NVH6 421 aa24.07■■□□□ 1.44
PMS1-205ENST00000409985 MEI4A8MW99 385 aa24.07■■□□□ 1.44
PMS1-205ENST00000409985 DFFAO00273 331 aa24.07■■□□□ 1.44
PMS1-205ENST00000409985 DCXO43602 365 aa24.07■■□□□ 1.44
PMS1-205ENST00000409985 PQBP1O60828 265 aaKnown RBP24.07■■□□□ 1.44
PMS1-205ENST00000409985 GABRB3P28472 473 aa24.07■■□□□ 1.44
PMS1-205ENST00000409985 GRIA4P48058 902 aa24.07■■□□□ 1.44
PMS1-205ENST00000409985 MTTPP55157 894 aa24.07■■□□□ 1.44
PMS1-205ENST00000409985 RPL26P61254 145 aaKnown RBP24.07■■□□□ 1.44
PMS1-205ENST00000409985 RTL3Q8N8U3 475 aaKnown RBP24.07■■□□□ 1.44
PMS1-205ENST00000409985 C2CD4AQ8NCU7 369 aaPredicted RBP24.07■■□□□ 1.44
PMS1-205ENST00000409985 ACVR1CQ8NER5 493 aa24.07■■□□□ 1.44
PMS1-205ENST00000409985 RP9Q8TA86 221 aaKnown RBP24.07■■□□□ 1.44
PMS1-205ENST00000409985 SLC39A8Q9C0K1 460 aa24.07■■□□□ 1.44
PMS1-205ENST00000409985 UBP1Q9NZI7 540 aa24.07■■□□□ 1.44
PMS1-205ENST00000409985 SCOCQ9UIL1 159 aa24.07■■□□□ 1.44
PMS1-205ENST00000409985 RUVBL2Q9Y230 463 aaKnown RBP24.07■■□□□ 1.44
PMS1-205ENST00000409985 NLRC5Q86WI3 1866 aa24.06■■□□□ 1.44
PMS1-205ENST00000409985 NUP205Q92621 2012 aa24.06■■□□□ 1.44
PMS1-205ENST00000409985 RGSL1A5PLK6 1076 aa24.06■■□□□ 1.44
PMS1-205ENST00000409985 KCNU1A8MYU2 1149 aa24.06■■□□□ 1.44
PMS1-205ENST00000409985 ZBTB14O43829 449 aa24.06■■□□□ 1.44
PMS1-205ENST00000409985 STMN1P16949 149 aa24.06■■□□□ 1.44
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PMS1-205ENST00000409985 POU4F1Q01851 419 aa24.06■■□□□ 1.44
PMS1-205ENST00000409985 C1orf53Q5VUE5 145 aa24.06■■□□□ 1.44
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PMS1-205ENST00000409985 FRMD7Q6ZUT3 714 aa24.06■■□□□ 1.44
PMS1-205ENST00000409985 ACAD11Q709F0 780 aa24.06■■□□□ 1.44
PMS1-205ENST00000409985 ANKRD33Q7Z3H0 272 aa24.06■■□□□ 1.44
PMS1-205ENST00000409985 GALNT7Q86SF2 657 aa24.06■■□□□ 1.44
PMS1-205ENST00000409985 CENPLQ8N0S6 344 aaPredicted RBP24.06■■□□□ 1.44
PMS1-205ENST00000409985 PHTF2Q8N3S3 785 aa24.06■■□□□ 1.44
PMS1-205ENST00000409985 RANBP9Q96S59 729 aa24.06■■□□□ 1.44
PMS1-205ENST00000409985 AGO3Q9H9G7 860 aaKnown RBP24.06■■□□□ 1.44
PMS1-205ENST00000409985 OSER1Q9NX31 292 aa24.06■■□□□ 1.44
PMS1-205ENST00000409985 PADI3Q9ULW8 664 aa24.06■■□□□ 1.44
PMS1-205ENST00000409985 GOLGA8QA0A0J9YX86 632 aa24.05■■□□□ 1.44
PMS1-205ENST00000409985 GOLGA8OA6NCC3 632 aa24.05■■□□□ 1.44
PMS1-205ENST00000409985 GOLGA8NF8WBI6 632 aa24.05■■□□□ 1.44
PMS1-205ENST00000409985 TFEBP19484 476 aa24.05■■□□□ 1.44
PMS1-205ENST00000409985 GMPRP36959 345 aa24.05■■□□□ 1.44
PMS1-205ENST00000409985 TLE2Q04725 743 aa24.05■■□□□ 1.44
PMS1-205ENST00000409985 RALGPS1Q5JS13 557 aa24.05■■□□□ 1.44
PMS1-205ENST00000409985 SH2D4BQ5SQS7 431 aa24.05■■□□□ 1.44
PMS1-205ENST00000409985 NECAB2Q7Z6G3 386 aa24.05■■□□□ 1.44
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