RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000398073.6

CTDSP2-201, Transcript of CTD small phosphatase 2, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CTDSP2, Length 4,795 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSP2-201ENST00000398073 CDH9Q9ULB4 789 aa16.55■□□□□ 0.24
CTDSP2-201ENST00000398073 FAM50BQ9Y247 325 aa16.55■□□□□ 0.24
CTDSP2-201ENST00000398073 EGFRP00533 1210 aa16.55■□□□□ 0.24
CTDSP2-201ENST00000398073 ACTR3P61158 418 aa16.55■□□□□ 0.24
CTDSP2-201ENST00000398073 MRPL28Q13084 256 aaKnown RBP16.55■□□□□ 0.24
CTDSP2-201ENST00000398073 TAF5Q15542 800 aa16.55■□□□□ 0.24
CTDSP2-201ENST00000398073 HSDL1Q3SXM5 330 aa16.55■□□□□ 0.24
CTDSP2-201ENST00000398073 DNAJC14Q6Y2X3 702 aaPredicted RBP16.55■□□□□ 0.24
CTDSP2-201ENST00000398073 ZNF516Q92618 1163 aa16.55■□□□□ 0.24
CTDSP2-201ENST00000398073 CD101Q93033 1021 aa16.55■□□□□ 0.24
CTDSP2-201ENST00000398073 BORCS6Q96GS4 357 aa16.55■□□□□ 0.24
CTDSP2-201ENST00000398073 POLR1BQ9H9Y6 1135 aa16.55■□□□□ 0.24
CTDSP2-201ENST00000398073 DNAJB4Q9UDY4 337 aa16.55■□□□□ 0.24
CTDSP2-201ENST00000398073 TNPO3Q9Y5L0 923 aaKnown RBP16.55■□□□□ 0.24
CTDSP2-201ENST00000398073 PTGES3LE9PB15 166 aa16.54■□□□□ 0.24
CTDSP2-201ENST00000398073 DPYSL4O14531 572 aa16.54■□□□□ 0.24
CTDSP2-201ENST00000398073 MAP3K13O43283 966 aa16.54■□□□□ 0.24
CTDSP2-201ENST00000398073 MFSD11O43934 449 aa16.54■□□□□ 0.24
CTDSP2-201ENST00000398073 FMO4P31512 558 aa16.54■□□□□ 0.24
CTDSP2-201ENST00000398073 ICAM3P32942 547 aa16.54■□□□□ 0.24
CTDSP2-201ENST00000398073 IL2P60568 153 aa16.54■□□□□ 0.24
CTDSP2-201ENST00000398073 PRKD1Q15139 912 aaPredicted RBP16.54■□□□□ 0.24
CTDSP2-201ENST00000398073 TEX44Q53QW1 395 aa16.54■□□□□ 0.24
CTDSP2-201ENST00000398073 PPM1JQ5JR12 505 aa16.54■□□□□ 0.24
CTDSP2-201ENST00000398073 NPAS2Q99743 824 aa16.54■□□□□ 0.24
CTDSP2-201ENST00000398073 IGF2BP1Q9NZI8 577 aaKnown RBP eCLIP16.54■□□□□ 0.242e-6■■□□□ 13.3
CTDSP2-201ENST00000398073 ATP6AP2A0A1C7CYW4 349 aa16.54■□□□□ 0.24
CTDSP2-201ENST00000398073 F8W810 466 aa16.54■□□□□ 0.24
CTDSP2-201ENST00000398073 NRP2O60462 931 aa16.54■□□□□ 0.24
CTDSP2-201ENST00000398073 ATP6AP2O75787 350 aa16.54■□□□□ 0.24
CTDSP2-201ENST00000398073 HGFP14210 728 aa16.54■□□□□ 0.24
CTDSP2-201ENST00000398073 STX19Q8N4C7 294 aa16.54■□□□□ 0.24
CTDSP2-201ENST00000398073 NETO2Q8NC67 525 aa16.54■□□□□ 0.24
CTDSP2-201ENST00000398073 LENG8Q96PV6 779 aaPredicted RBP16.54■□□□□ 0.24
CTDSP2-201ENST00000398073 GPR20Q99678 358 aa16.54■□□□□ 0.24
CTDSP2-201ENST00000398073 ZBED2Q9BTP6 218 aa16.54■□□□□ 0.24
CTDSP2-201ENST00000398073 USE1Q9NZ43 259 aa16.54■□□□□ 0.24
CTDSP2-201ENST00000398073 TRPM5Q9NZQ8 1165 aa16.54■□□□□ 0.24
CTDSP2-201ENST00000398073 PCDHB12Q9Y5F1 795 aa16.54■□□□□ 0.24
CTDSP2-201ENST00000398073 PTCH2Q9Y6C5 1203 aa16.54■□□□□ 0.24
CTDSP2-201ENST00000398073 TBX10O75333 385 aa16.54■□□□□ 0.24
CTDSP2-201ENST00000398073 MSX2P35548 267 aaPredicted RBP16.54■□□□□ 0.24
CTDSP2-201ENST00000398073 CD86P42081 329 aa16.54■□□□□ 0.24
CTDSP2-201ENST00000398073 PSEN2P49810 448 aa16.54■□□□□ 0.24
CTDSP2-201ENST00000398073 CNTD1Q8N815 330 aa16.54■□□□□ 0.24
CTDSP2-201ENST00000398073 KCTD15Q96SI1 283 aaPredicted RBP16.54■□□□□ 0.24
CTDSP2-201ENST00000398073 ATP13A1Q9HD20 1204 aa16.54■□□□□ 0.24
CTDSP2-201ENST00000398073 GUCA1CO95843 209 aa16.54■□□□□ 0.24
CTDSP2-201ENST00000398073 MZF1P28698 734 aaPredicted RBP16.54■□□□□ 0.24
CTDSP2-201ENST00000398073 VWA5B1Q5TIE3 1220 aa16.54■□□□□ 0.24
CTDSP2-201ENST00000398073 PMF1Q6P1K2 205 aa16.54■□□□□ 0.24
CTDSP2-201ENST00000398073 IL27RAQ6UWB1 636 aa16.54■□□□□ 0.24
CTDSP2-201ENST00000398073 ADHFE1Q8IWW8 467 aa16.54■□□□□ 0.24
CTDSP2-201ENST00000398073 CMASQ8NFW8 434 aaPredicted RBP16.54■□□□□ 0.24
CTDSP2-201ENST00000398073 DNAJB14Q8TBM8 379 aa16.54■□□□□ 0.24
CTDSP2-201ENST00000398073 DCAKDQ8WVC6 231 aa16.54■□□□□ 0.24
CTDSP2-201ENST00000398073 OTULINQ96BN8 352 aa16.54■□□□□ 0.24
CTDSP2-201ENST00000398073 GLT1D1Q96MS3 346 aa16.54■□□□□ 0.24
CTDSP2-201ENST00000398073 SYNDIG1LA6NDD5 238 aa16.53■□□□□ 0.24
CTDSP2-201ENST00000398073 SEC22BO75396 215 aa16.53■□□□□ 0.24
CTDSP2-201ENST00000398073 RECQL5O94762 991 aaPredicted RBP16.53■□□□□ 0.24
CTDSP2-201ENST00000398073 CPSF4O95639 269 aaKnown RBP16.53■□□□□ 0.24
CTDSP2-201ENST00000398073 ECHS1P30084 290 aa16.53■□□□□ 0.24
CTDSP2-201ENST00000398073 ST8SIA6P61647 398 aa16.53■□□□□ 0.24
CTDSP2-201ENST00000398073 DGUOKQ16854 277 aa16.53■□□□□ 0.24
CTDSP2-201ENST00000398073 BROXQ5VW32 411 aa16.53■□□□□ 0.24
CTDSP2-201ENST00000398073 TLK2Q86UE8 772 aa16.53■□□□□ 0.24
CTDSP2-201ENST00000398073 C7orf43Q8WVR3 580 aa16.53■□□□□ 0.24
CTDSP2-201ENST00000398073 CDK5RAP1Q96SZ6 601 aaKnown RBP16.53■□□□□ 0.24
CTDSP2-201ENST00000398073 GNEQ9Y223 722 aaKnown RBP16.53■□□□□ 0.24
CTDSP2-201ENST00000398073 RGS14O43566 566 aa16.53■□□□□ 0.24
CTDSP2-201ENST00000398073 ENDOD1O94919 500 aa16.53■□□□□ 0.24
CTDSP2-201ENST00000398073 MLYCDO95822 493 aa16.53■□□□□ 0.24
CTDSP2-201ENST00000398073 YWHAQP27348 245 aa16.53■□□□□ 0.24
CTDSP2-201ENST00000398073 ANKS3Q6ZW76 656 aa16.53■□□□□ 0.24
CTDSP2-201ENST00000398073 RELL1Q8IUW5 271 aa16.53■□□□□ 0.24
CTDSP2-201ENST00000398073 SPATA6LQ8N4H0 392 aa16.53■□□□□ 0.24
CTDSP2-201ENST00000398073 AADATQ8N5Z0 425 aa16.53■□□□□ 0.24
CTDSP2-201ENST00000398073 PCDH19Q8TAB3 1148 aa16.53■□□□□ 0.24
CTDSP2-201ENST00000398073 BHMTQ93088 406 aa16.53■□□□□ 0.24
CTDSP2-201ENST00000398073 ATAD3AQ9NVI7 634 aa16.53■□□□□ 0.24
CTDSP2-201ENST00000398073 TRAF6Q9Y4K3 522 aa16.53■□□□□ 0.24
CTDSP2-201ENST00000398073 MGAT4DA6NG13 374 aa16.53■□□□□ 0.24
CTDSP2-201ENST00000398073 AZIN1O14977 448 aa16.53■□□□□ 0.24
CTDSP2-201ENST00000398073 FAM20BO75063 409 aa16.53■□□□□ 0.24
CTDSP2-201ENST00000398073 ATG7O95352 703 aa16.53■□□□□ 0.24
CTDSP2-201ENST00000398073 AP2A1O95782 977 aa16.53■□□□□ 0.24
CTDSP2-201ENST00000398073 IFNA14P01570 189 aa16.53■□□□□ 0.24
CTDSP2-201ENST00000398073 HOXC6P09630 235 aa16.53■□□□□ 0.24
CTDSP2-201ENST00000398073 PEX2P28328 305 aa16.53■□□□□ 0.24
CTDSP2-201ENST00000398073 ARL13AQ5H913 290 aaPredicted RBP16.53■□□□□ 0.24
CTDSP2-201ENST00000398073 TOP6BLQ8N6T0 577 aa16.53■□□□□ 0.24
CTDSP2-201ENST00000398073 STK39Q9UEW8 545 aa16.53■□□□□ 0.24
CTDSP2-201ENST00000398073 PCDHB7Q9Y5E2 793 aa16.53■□□□□ 0.24
CTDSP2-201ENST00000398073 PIGRP01833 764 aa16.53■□□□□ 0.24
CTDSP2-201ENST00000398073 FESP07332 822 aa16.53■□□□□ 0.24
CTDSP2-201ENST00000398073 CSH1P0DML2 217 aa16.53■□□□□ 0.24
CTDSP2-201ENST00000398073 CSH2P0DML3 217 aa16.53■□□□□ 0.24
CTDSP2-201ENST00000398073 HALP42357 657 aa16.53■□□□□ 0.24
CTDSP2-201ENST00000398073 PSEN1P49768 467 aa16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.5 ms