RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000394202.8

CNN3-202, Transcript of calponin 3, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene CNN3, Length 1,974 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNN3-202ENST00000394202 ALG1LQ6GMV1 187 aa23.61■■□□□ 1.37
CNN3-202ENST00000394202 PHTF2Q8N3S3 785 aa23.61■■□□□ 1.37
CNN3-202ENST00000394202 IPMKQ8NFU5 416 aa23.61■■□□□ 1.37
CNN3-202ENST00000394202 TTC17Q96AE7 1141 aa23.61■■□□□ 1.37
CNN3-202ENST00000394202 DEC1Q9P2X7 70 aa23.61■■□□□ 1.37
CNN3-202ENST00000394202 PPFIA2O75334 1257 aa23.6■■□□□ 1.37
CNN3-202ENST00000394202 AGTP01019 485 aa23.6■■□□□ 1.37
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CNN3-202ENST00000394202 SKOR1P84550 965 aa23.6■■□□□ 1.37
CNN3-202ENST00000394202 PRPSAP1Q14558 356 aa23.6■■□□□ 1.37
CNN3-202ENST00000394202 DMC1Q14565 340 aa23.6■■□□□ 1.37
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CNN3-202ENST00000394202 SEMA4AQ9H3S1 761 aa23.6■■□□□ 1.37
CNN3-202ENST00000394202 HS3ST2Q9Y278 367 aa23.6■■□□□ 1.37
CNN3-202ENST00000394202 SMAPO00193 183 aa23.6■■□□□ 1.37
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CNN3-202ENST00000394202 BBS5Q8N3I7 341 aa23.6■■□□□ 1.37
CNN3-202ENST00000394202 SLC44A3Q8N4M1 653 aa23.6■■□□□ 1.37
CNN3-202ENST00000394202 OR52K1Q8NGK4 314 aa23.6■■□□□ 1.37
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CNN3-202ENST00000394202 ARL4CP56559 192 aa23.59■■□□□ 1.37
CNN3-202ENST00000394202 RHOAP61586 193 aa23.59■■□□□ 1.37
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CNN3-202ENST00000394202 IGDCC3Q8IVU1 814 aa23.59■■□□□ 1.37
CNN3-202ENST00000394202 SH2D3CQ8N5H7 860 aa23.59■■□□□ 1.37
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CNN3-202ENST00000394202 PTPRNQ16849 979 aa23.58■■□□□ 1.37
CNN3-202ENST00000394202 BBS9Q3SYG4 887 aa23.58■■□□□ 1.37
CNN3-202ENST00000394202 ANKMY2Q8IV38 441 aa23.58■■□□□ 1.37
CNN3-202ENST00000394202 PDIK1LQ8N165 341 aa23.58■■□□□ 1.37
CNN3-202ENST00000394202 MPP5Q8N3R9 675 aa23.58■■□□□ 1.37
CNN3-202ENST00000394202 OR6K2Q8NGY2 324 aa23.58■■□□□ 1.37
CNN3-202ENST00000394202 C9orf72Q96LT7 481 aa23.58■■□□□ 1.37
CNN3-202ENST00000394202 EPB41L4BQ9H329 900 aa23.58■■□□□ 1.37
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CNN3-202ENST00000394202 FOXP3Q9BZS1 431 aa23.58■■□□□ 1.36
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CNN3-202ENST00000394202 ELOVL2Q9NXB9 296 aa23.58■■□□□ 1.36
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CNN3-202ENST00000394202 E7ESA3 106 aa23.57■■□□□ 1.36
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CNN3-202ENST00000394202 CHRNA4P43681 627 aa23.57■■□□□ 1.36
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CNN3-202ENST00000394202 ZBED8Q8IZ13 594 aa23.57■■□□□ 1.36
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CNN3-202ENST00000394202 CDC42EP4Q9H3Q1 356 aaKnown RBP23.57■■□□□ 1.36
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CNN3-202ENST00000394202 GKP32189 559 aa23.56■■□□□ 1.36
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CNN3-202ENST00000394202 TPH1P17752 444 aa23.56■■□□□ 1.36
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