RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000390606.3

IGHV3-20-201, Transcript of immunoglobulin heavy variable 3-20, humanhuman

APPRIS P1 BASIC

Gene IGHV3-20, Length 415 nt, Biotype IG V gene.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGHV3-20-201ENST00000390606 LRIG1Q96JA1 1093 aa22.37■■□□□ 1.17
IGHV3-20-201ENST00000390606 GDAP1L1Q96MZ0 367 aa22.37■■□□□ 1.17
IGHV3-20-201ENST00000390606 CALN1Q9BXU9 219 aa22.37■■□□□ 1.17
IGHV3-20-201ENST00000390606 HDAC8Q9BY41 377 aa22.37■■□□□ 1.17
IGHV3-20-201ENST00000390606 EBF2Q9HAK2 575 aa22.37■■□□□ 1.17
IGHV3-20-201ENST00000390606 SP110Q9HB58 689 aa22.37■■□□□ 1.17
IGHV3-20-201ENST00000390606 CDV3Q9UKY7 258 aaKnown RBP22.37■■□□□ 1.17
IGHV3-20-201ENST00000390606 PCDH15Q96QU1 1955 aa22.37■■□□□ 1.17
IGHV3-20-201ENST00000390606 CACNA1EQ15878 2313 aa22.36■■□□□ 1.17
IGHV3-20-201ENST00000390606 A0A0A6YYK5 440 aaPredicted RBP22.36■■□□□ 1.17
IGHV3-20-201ENST00000390606 RCCD1A6NED2 376 aa22.36■■□□□ 1.17
IGHV3-20-201ENST00000390606 CDX4O14627 284 aaPredicted RBP22.36■■□□□ 1.17
IGHV3-20-201ENST00000390606 SLC30A4O14863 429 aa22.36■■□□□ 1.17
IGHV3-20-201ENST00000390606 BCAT2O15382 392 aaPredicted RBP22.36■■□□□ 1.17
IGHV3-20-201ENST00000390606 IGSF6O95976 241 aa22.36■■□□□ 1.17
IGHV3-20-201ENST00000390606 ENGP17813 658 aa22.36■■□□□ 1.17
IGHV3-20-201ENST00000390606 ITGB7P26010 798 aa22.36■■□□□ 1.17
IGHV3-20-201ENST00000390606 SLC1A1P43005 524 aa22.36■■□□□ 1.17
IGHV3-20-201ENST00000390606 STPG1Q5TH74 334 aa22.36■■□□□ 1.17
IGHV3-20-201ENST00000390606 LRRC38Q5VT99 294 aa22.36■■□□□ 1.17
IGHV3-20-201ENST00000390606 ERN2Q76MJ5 926 aaKnown RBP22.36■■□□□ 1.17
IGHV3-20-201ENST00000390606 PPP1R16AQ96I34 528 aa22.36■■□□□ 1.17
IGHV3-20-201ENST00000390606 BAG1Q99933 345 aaPredicted RBP22.36■■□□□ 1.17
IGHV3-20-201ENST00000390606 DYRK4Q9NR20 520 aa22.36■■□□□ 1.17
IGHV3-20-201ENST00000390606 HYOU1Q9Y4L1 999 aa22.36■■□□□ 1.17
IGHV3-20-201ENST00000390606 TBC1D3DA0A087WVF3 549 aa22.35■■□□□ 1.17
IGHV3-20-201ENST00000390606 TBC1D3IA0A087WXS9 549 aa22.35■■□□□ 1.17
IGHV3-20-201ENST00000390606 TBC1D3EA0A087X179 549 aa22.35■■□□□ 1.17
IGHV3-20-201ENST00000390606 TBC1D3KA0A087X1G2 549 aa22.35■■□□□ 1.17
IGHV3-20-201ENST00000390606 A0A1W2PPC4 97 aa22.35■■□□□ 1.17
IGHV3-20-201ENST00000390606 TBC1D3FA6NER0 549 aaPredicted RBP22.35■■□□□ 1.17
IGHV3-20-201ENST00000390606 TBC1D3LB9A6J9 549 aa22.35■■□□□ 1.17
IGHV3-20-201ENST00000390606 KRIT1O00522 736 aa22.35■■□□□ 1.17
IGHV3-20-201ENST00000390606 LATO43561 262 aa22.35■■□□□ 1.17
IGHV3-20-201ENST00000390606 BUB1BO60566 1050 aaPredicted RBP22.35■■□□□ 1.17
IGHV3-20-201ENST00000390606 TBC1D3HP0C7X1 549 aa22.35■■□□□ 1.17
IGHV3-20-201ENST00000390606 COMTP21964 271 aa22.35■■□□□ 1.17
IGHV3-20-201ENST00000390606 KDELR1P24390 212 aa22.35■■□□□ 1.17
IGHV3-20-201ENST00000390606 SERPINB6P35237 376 aa22.35■■□□□ 1.17
IGHV3-20-201ENST00000390606 ID4P47928 161 aa22.35■■□□□ 1.17
IGHV3-20-201ENST00000390606 ANKRD20A8PQ5CZ79 823 aa22.35■■□□□ 1.17
IGHV3-20-201ENST00000390606 NCBP2-AS2Q69YL0 99 aa22.35■■□□□ 1.17
IGHV3-20-201ENST00000390606 TBC1D3GQ6DHY5 549 aa22.35■■□□□ 1.17
IGHV3-20-201ENST00000390606 TBC1D3CQ6IPX1 549 aa22.35■■□□□ 1.17
IGHV3-20-201ENST00000390606 PARS2Q7L3T8 475 aaKnown RBP22.35■■□□□ 1.17
IGHV3-20-201ENST00000390606 MAP7D3Q8IWC1 876 aa22.35■■□□□ 1.17
IGHV3-20-201ENST00000390606 TBC1D3Q8IZP1 549 aaPredicted RBP22.35■■□□□ 1.17
IGHV3-20-201ENST00000390606 PQLC3Q8N755 202 aa22.35■■□□□ 1.17
IGHV3-20-201ENST00000390606 EXOC2Q96KP1 924 aa22.35■■□□□ 1.17
IGHV3-20-201ENST00000390606 LUC7LQ9NQ29 371 aaKnown RBP22.35■■□□□ 1.17
IGHV3-20-201ENST00000390606 SALL4Q9UJQ4 1053 aa22.35■■□□□ 1.17
IGHV3-20-201ENST00000390606 DMXL1Q9Y485 3027 aa22.35■■□□□ 1.17
IGHV3-20-201ENST00000390606 INSIG1O15503 277 aa22.34■■□□□ 1.17
IGHV3-20-201ENST00000390606 MAFKO60675 156 aa22.34■■□□□ 1.17
IGHV3-20-201ENST00000390606 PALMO75781 387 aa22.34■■□□□ 1.17
IGHV3-20-201ENST00000390606 PEX11BO96011 259 aa22.34■■□□□ 1.17
IGHV3-20-201ENST00000390606 SDHBP21912 280 aa22.34■■□□□ 1.17
IGHV3-20-201ENST00000390606 NOP2P46087 812 aaKnown RBP22.34■■□□□ 1.17
IGHV3-20-201ENST00000390606 RGRP47804 291 aa22.34■■□□□ 1.17
IGHV3-20-201ENST00000390606 NEK3P51956 506 aa22.34■■□□□ 1.17
IGHV3-20-201ENST00000390606 CCDC15Q0P6D6 951 aa22.34■■□□□ 1.17
IGHV3-20-201ENST00000390606 PUM1Q14671 1186 aaKnown RBP eCLIP22.34■■□□□ 1.17
IGHV3-20-201ENST00000390606 RFTN1Q14699 578 aaPredicted RBP22.34■■□□□ 1.17
IGHV3-20-201ENST00000390606 PAFAH1B3Q15102 231 aaKnown RBP22.34■■□□□ 1.17
IGHV3-20-201ENST00000390606 ZNF805Q5CZA5 627 aa22.34■■□□□ 1.17
IGHV3-20-201ENST00000390606 TRIM69Q86WT6 500 aa22.34■■□□□ 1.17
IGHV3-20-201ENST00000390606 TSEN2Q8NCE0 465 aaKnown RBP22.34■■□□□ 1.17
IGHV3-20-201ENST00000390606 PREBQ9HCU5 417 aa22.34■■□□□ 1.17
IGHV3-20-201ENST00000390606 TM9SF3Q9HD45 589 aa22.34■■□□□ 1.17
IGHV3-20-201ENST00000390606 TPX2Q9ULW0 747 aaKnown RBP22.34■■□□□ 1.17
IGHV3-20-201ENST00000390606 SPTBN4Q9H254 2564 aa22.33■■□□□ 1.17
IGHV3-20-201ENST00000390606 C3orf70A6NLC5 250 aaPredicted RBP22.33■■□□□ 1.17
IGHV3-20-201ENST00000390606 C4orf47A7E2U8 309 aa22.33■■□□□ 1.17
IGHV3-20-201ENST00000390606 ARHGAP33O14559 1287 aa22.33■■□□□ 1.17
IGHV3-20-201ENST00000390606 MFSD11O43934 449 aa22.33■■□□□ 1.17
IGHV3-20-201ENST00000390606 UGT2B4P06133 528 aa22.33■■□□□ 1.17
IGHV3-20-201ENST00000390606 ADRB3P13945 408 aa22.33■■□□□ 1.17
IGHV3-20-201ENST00000390606 BNC1Q01954 994 aa22.33■■□□□ 1.17
IGHV3-20-201ENST00000390606 ACRBPQ8NEB7 543 aa22.33■■□□□ 1.17
IGHV3-20-201ENST00000390606 ZNF599Q96NL3 588 aa22.33■■□□□ 1.17
IGHV3-20-201ENST00000390606 RTKNQ9BST9 563 aa22.33■■□□□ 1.17
IGHV3-20-201ENST00000390606 OSBPL1AQ9BXW6 950 aa22.33■■□□□ 1.17
IGHV3-20-201ENST00000390606 CPEB1Q9BZB8 566 aaKnown RBP22.33■■□□□ 1.17
IGHV3-20-201ENST00000390606 GOLPH3Q9H4A6 298 aa22.33■■□□□ 1.17
IGHV3-20-201ENST00000390606 TMEM9BQ9NQ34 198 aa22.33■■□□□ 1.17
IGHV3-20-201ENST00000390606 ALG6Q9Y672 507 aa22.33■■□□□ 1.17
IGHV3-20-201ENST00000390606 LRRD1A4D1F6 860 aa22.32■■□□□ 1.16
IGHV3-20-201ENST00000390606 C16orf96A6NNT2 1141 aa22.32■■□□□ 1.16
IGHV3-20-201ENST00000390606 ZNF487B1APH4 448 aa22.32■■□□□ 1.16
IGHV3-20-201ENST00000390606 TM4SF5O14894 197 aa22.32■■□□□ 1.16
IGHV3-20-201ENST00000390606 MUSKO15146 869 aa22.32■■□□□ 1.16
IGHV3-20-201ENST00000390606 CSNK1DP48730 415 aa22.32■■□□□ 1.16
IGHV3-20-201ENST00000390606 RAD51Q06609 339 aa22.32■■□□□ 1.16
IGHV3-20-201ENST00000390606 SLC10A7Q0GE19 358 aa22.32■■□□□ 1.16
IGHV3-20-201ENST00000390606 GRIK2Q13002 908 aa22.32■■□□□ 1.16
IGHV3-20-201ENST00000390606 ZFYVE27Q5T4F4 411 aa22.32■■□□□ 1.16
IGHV3-20-201ENST00000390606 TMCO4Q5TGY1 634 aa22.32■■□□□ 1.16
IGHV3-20-201ENST00000390606 GDPD4Q6W3E5 623 aa22.32■■□□□ 1.16
IGHV3-20-201ENST00000390606 VSIG1Q86XK7 387 aa22.32■■□□□ 1.16
IGHV3-20-201ENST00000390606 RHOT1Q8IXI2 618 aa22.32■■□□□ 1.16
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