RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000369862.1

AMIGO1-201, Transcript of adhesion molecule with Ig like domain 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene AMIGO1, Length 2,229 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMIGO1-201ENST00000369862 MSI1O43347 362 aaKnown RBP24.2■■□□□ 1.47
AMIGO1-201ENST00000369862 ALDH1A3P47895 512 aa24.2■■□□□ 1.47
AMIGO1-201ENST00000369862 NPY2RP49146 381 aa24.2■■□□□ 1.47
AMIGO1-201ENST00000369862 SLC5A3P53794 718 aa24.2■■□□□ 1.47
AMIGO1-201ENST00000369862 SH3BGRP55822 239 aaPredicted RBP24.2■■□□□ 1.47
AMIGO1-201ENST00000369862 CACNB2Q08289 660 aaPredicted RBP24.2■■□□□ 1.47
AMIGO1-201ENST00000369862 DLG2Q15700 870 aa24.2■■□□□ 1.47
AMIGO1-201ENST00000369862 C16orf89Q6UX73 402 aa24.2■■□□□ 1.47
AMIGO1-201ENST00000369862 KCNMB4Q86W47 210 aa24.2■■□□□ 1.47
AMIGO1-201ENST00000369862 PQLC1Q8N2U9 271 aa24.2■■□□□ 1.47
AMIGO1-201ENST00000369862 URGCPQ8TCY9 931 aa24.2■■□□□ 1.47
AMIGO1-201ENST00000369862 SUSD3Q96L08 255 aa24.2■■□□□ 1.47
AMIGO1-201ENST00000369862 ZIC5Q96T25 663 aa24.2■■□□□ 1.47
AMIGO1-201ENST00000369862 MCMBPQ9BTE3 642 aa24.2■■□□□ 1.47
AMIGO1-201ENST00000369862 IL22Q9GZX6 179 aa24.2■■□□□ 1.47
AMIGO1-201ENST00000369862 CAB39LQ9H9S4 337 aa24.2■■□□□ 1.47
AMIGO1-201ENST00000369862 SFMBT1Q9UHJ3 866 aa24.2■■□□□ 1.47
AMIGO1-201ENST00000369862 TIMM44O43615 452 aa24.2■■□□□ 1.46
AMIGO1-201ENST00000369862 B4GALT3O60512 393 aa24.2■■□□□ 1.46
AMIGO1-201ENST00000369862 NMBRP28336 390 aa24.2■■□□□ 1.46
AMIGO1-201ENST00000369862 GRIA2P42262 883 aa24.2■■□□□ 1.46
AMIGO1-201ENST00000369862 IRF9Q00978 393 aa24.2■■□□□ 1.46
AMIGO1-201ENST00000369862 BEND5Q7L4P6 421 aa24.2■■□□□ 1.46
AMIGO1-201ENST00000369862 ACVR1CQ8NER5 493 aa24.2■■□□□ 1.46
AMIGO1-201ENST00000369862 SPATA22Q8NHS9 363 aa24.2■■□□□ 1.46
AMIGO1-201ENST00000369862 TSGA13Q96PP4 275 aa24.2■■□□□ 1.46
AMIGO1-201ENST00000369862 C20orf96Q9NUD7 363 aaPredicted RBP24.2■■□□□ 1.46
AMIGO1-201ENST00000369862 TRMT13Q9NUP7 481 aaKnown RBP24.2■■□□□ 1.46
AMIGO1-201ENST00000369862 OXSMQ9NWU1 459 aa24.2■■□□□ 1.46
AMIGO1-201ENST00000369862 HTTP42858 3142 aa24.2■■□□□ 1.46
AMIGO1-201ENST00000369862 SMIM31A0A1B0GVY4 71 aa24.19■■□□□ 1.46
AMIGO1-201ENST00000369862 RGSL1A5PLK6 1076 aa24.19■■□□□ 1.46
AMIGO1-201ENST00000369862 FAM155AB1AL88 458 aaPredicted RBP24.19■■□□□ 1.46
AMIGO1-201ENST00000369862 PALM2-AKAP2B1ALY0 433 aaPredicted RBP24.19■■□□□ 1.46
AMIGO1-201ENST00000369862 GOLGA8TH3BQL2 631 aa24.19■■□□□ 1.46
AMIGO1-201ENST00000369862 MATN2O00339 956 aa24.19■■□□□ 1.46
AMIGO1-201ENST00000369862 TNFRSF10BO14763 440 aa24.19■■□□□ 1.46
AMIGO1-201ENST00000369862 CACNG3O60359 315 aa24.19■■□□□ 1.46
AMIGO1-201ENST00000369862 PAGE1O75459 146 aa24.19■■□□□ 1.46
AMIGO1-201ENST00000369862 RPLP2P05387 115 aaKnown RBP24.19■■□□□ 1.46
AMIGO1-201ENST00000369862 HK2P52789 917 aa24.19■■□□□ 1.46
AMIGO1-201ENST00000369862 FBXL19Q6PCT2 694 aa24.19■■□□□ 1.46
AMIGO1-201ENST00000369862 CASP10Q92851 521 aa24.19■■□□□ 1.46
AMIGO1-201ENST00000369862 GATA5Q9BWX5 397 aaPredicted RBP24.19■■□□□ 1.46
AMIGO1-201ENST00000369862 EPB41L1Q9H4G0 881 aa24.19■■□□□ 1.46
AMIGO1-201ENST00000369862 NDUFA13Q9P0J0 144 aa24.19■■□□□ 1.46
AMIGO1-201ENST00000369862 MAGEB16A2A368 324 aa24.19■■□□□ 1.46
AMIGO1-201ENST00000369862 TXNDC9O14530 226 aa24.19■■□□□ 1.46
AMIGO1-201ENST00000369862 SLC22A2O15244 555 aa24.19■■□□□ 1.46
AMIGO1-201ENST00000369862 DENRO43583 198 aaKnown RBP24.19■■□□□ 1.46
AMIGO1-201ENST00000369862 C2P06681 752 aa24.19■■□□□ 1.46
AMIGO1-201ENST00000369862 APOA4P06727 396 aa24.19■■□□□ 1.46
AMIGO1-201ENST00000369862 OR4Q2P0C623 313 aa24.19■■□□□ 1.46
AMIGO1-201ENST00000369862 PIK3R1P27986 724 aa24.19■■□□□ 1.46
AMIGO1-201ENST00000369862 CCND3P30281 292 aaPredicted RBP24.19■■□□□ 1.46
AMIGO1-201ENST00000369862 SERPINB5P36952 375 aa24.19■■□□□ 1.46
AMIGO1-201ENST00000369862 NUDT2P50583 147 aa24.19■■□□□ 1.46
AMIGO1-201ENST00000369862 CSE1LP55060 971 aaKnown RBP24.19■■□□□ 1.46
AMIGO1-201ENST00000369862 TSPY1Q01534 308 aa24.19■■□□□ 1.46
AMIGO1-201ENST00000369862 CDH17Q12864 832 aa24.19■■□□□ 1.46
AMIGO1-201ENST00000369862 CCSAPQ6IQ19 270 aaPredicted RBP24.19■■□□□ 1.46
AMIGO1-201ENST00000369862 SCD5Q86SK9 330 aa24.19■■□□□ 1.46
AMIGO1-201ENST00000369862 ZNF598Q86UK7 904 aaKnown RBP24.19■■□□□ 1.46
AMIGO1-201ENST00000369862 TMEM126BQ8IUX1 230 aa24.19■■□□□ 1.46
AMIGO1-201ENST00000369862 KLHDC8BQ8IXV7 354 aa24.19■■□□□ 1.46
AMIGO1-201ENST00000369862 THEM5Q8N1Q8 247 aa24.19■■□□□ 1.46
AMIGO1-201ENST00000369862 NAT14Q8WUY8 206 aa24.19■■□□□ 1.46
AMIGO1-201ENST00000369862 IARS2Q9NSE4 1012 aaKnown RBP24.19■■□□□ 1.46
AMIGO1-201ENST00000369862 NDFIP2Q9NV92 336 aa24.19■■□□□ 1.46
AMIGO1-201ENST00000369862 NUDT5Q9UKK9 219 aa24.19■■□□□ 1.46
AMIGO1-201ENST00000369862 RAP2CQ9Y3L5 183 aa24.19■■□□□ 1.46
AMIGO1-201ENST00000369862 CCDC78A2IDD5 438 aa24.18■■□□□ 1.46
AMIGO1-201ENST00000369862 CYP2C18P33260 490 aa24.18■■□□□ 1.46
AMIGO1-201ENST00000369862 FCGRTP55899 365 aa24.18■■□□□ 1.46
AMIGO1-201ENST00000369862 MANEALQ5VSG8 457 aa24.18■■□□□ 1.46
AMIGO1-201ENST00000369862 NAPEPLDQ6IQ20 393 aa24.18■■□□□ 1.46
AMIGO1-201ENST00000369862 MARVELD2Q8N4S9 558 aa24.18■■□□□ 1.46
AMIGO1-201ENST00000369862 KYQ8NBH2 561 aa24.18■■□□□ 1.46
AMIGO1-201ENST00000369862 KLHDC9Q8NEP7 349 aa24.18■■□□□ 1.46
AMIGO1-201ENST00000369862 RDH11Q8TC12 318 aa24.18■■□□□ 1.46
AMIGO1-201ENST00000369862 ABCC13Q9NSE7 274 aa24.18■■□□□ 1.46
AMIGO1-201ENST00000369862 VPS28Q9UK41 221 aa24.18■■□□□ 1.46
AMIGO1-201ENST00000369862 C15orf38-AP3S2A0A0A6YYH1 394 aa24.18■■□□□ 1.46
AMIGO1-201ENST00000369862 CAPN8A6NHC0 703 aa24.18■■□□□ 1.46
AMIGO1-201ENST00000369862 AIM2O14862 343 aa24.18■■□□□ 1.46
AMIGO1-201ENST00000369862 HDAC3O15379 428 aa24.18■■□□□ 1.46
AMIGO1-201ENST00000369862 HOXC13P31276 330 aa24.18■■□□□ 1.46
AMIGO1-201ENST00000369862 GRIK1P39086 918 aa24.18■■□□□ 1.46
AMIGO1-201ENST00000369862 COG7P83436 770 aa24.18■■□□□ 1.46
AMIGO1-201ENST00000369862 PRKCZQ05513 592 aa24.18■■□□□ 1.46
AMIGO1-201ENST00000369862 ZNF33AQ06730 810 aa24.18■■□□□ 1.46
AMIGO1-201ENST00000369862 MPP3Q13368 585 aa24.18■■□□□ 1.46
AMIGO1-201ENST00000369862 MAPRE1Q15691 268 aaKnown RBP24.18■■□□□ 1.46
AMIGO1-201ENST00000369862 BTBD8Q5XKL5 378 aa24.18■■□□□ 1.46
AMIGO1-201ENST00000369862 TMC7Q7Z402 723 aa24.18■■□□□ 1.46
AMIGO1-201ENST00000369862 ARPINQ7Z6K5 226 aa24.18■■□□□ 1.46
AMIGO1-201ENST00000369862 RP9Q8TA86 221 aaKnown RBP24.18■■□□□ 1.46
AMIGO1-201ENST00000369862 UROC1Q96N76 676 aa24.18■■□□□ 1.46
AMIGO1-201ENST00000369862 GCNAQ96QF7 691 aa24.18■■□□□ 1.46
AMIGO1-201ENST00000369862 TRIM62Q9BVG3 475 aa24.18■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.3 ms