RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000367067.8

CD55-205, Transcript of CD55 molecule (Cromer blood group), human

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene CD55, Length 1,843 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CD55-205	ENST00000367067	CFAP58	Q5T655	872 aa		21.42	■■□□□ 1.02
CD55-205	ENST00000367067	LINC00523	Q86TU6	105 aa		21.42	■■□□□ 1.02
CD55-205	ENST00000367067	AHI1	Q8N157	1196 aa		21.42	■■□□□ 1.02
CD55-205	ENST00000367067	IPMK	Q8NFU5	416 aa		21.42	■■□□□ 1.02
CD55-205	ENST00000367067	NINJ2	Q9NZG7	142 aa		21.42	■■□□□ 1.02
CD55-205	ENST00000367067	KIAA1549L	Q6ZVL6	1849 aa		21.42	■■□□□ 1.02
CD55-205	ENST00000367067	GRXCR2	A6NFK2	248 aa		21.41	■■□□□ 1.02
CD55-205	ENST00000367067	TRIM24	O15164	1050 aa		21.41	■■□□□ 1.02
CD55-205	ENST00000367067	RIPK2	O43353	540 aa		21.41	■■□□□ 1.02
CD55-205	ENST00000367067	SYF2	O95926	243 aa	Known RBP	21.41	■■□□□ 1.02
CD55-205	ENST00000367067	NR1H3	Q13133	447 aa		21.41	■■□□□ 1.02
CD55-205	ENST00000367067	SKIV2L	Q15477	1246 aa	Known RBP	21.41	■■□□□ 1.02
CD55-205	ENST00000367067	GPR153	Q6NV75	609 aa		21.41	■■□□□ 1.02
CD55-205	ENST00000367067	METTL3	Q86U44	580 aa	Known RBP	21.41	■■□□□ 1.02
CD55-205	ENST00000367067	ADIPOR2	Q86V24	386 aa		21.41	■■□□□ 1.02
CD55-205	ENST00000367067	C12orf40	Q86WS4	652 aa		21.41	■■□□□ 1.02
CD55-205	ENST00000367067	ANKMY2	Q8IV38	441 aa		21.41	■■□□□ 1.02
CD55-205	ENST00000367067	ETFBKMT	Q8IXQ9	262 aa		21.41	■■□□□ 1.02
CD55-205	ENST00000367067	IQCK	Q8N0W5	287 aa		21.41	■■□□□ 1.02
CD55-205	ENST00000367067	CPA6	Q8N4T0	437 aa		21.41	■■□□□ 1.02
CD55-205	ENST00000367067	OR52K1	Q8NGK4	314 aa		21.41	■■□□□ 1.02
CD55-205	ENST00000367067	PYROXD1	Q8WU10	500 aa		21.41	■■□□□ 1.02
CD55-205	ENST00000367067	TADA1	Q96BN2	335 aa		21.41	■■□□□ 1.02
CD55-205	ENST00000367067	EXOC2	Q96KP1	924 aa		21.41	■■□□□ 1.02
CD55-205	ENST00000367067	TTC25	Q96NG3	672 aa		21.41	■■□□□ 1.02
CD55-205	ENST00000367067	RPP25	Q9BUL9	199 aa	Known RBP	21.41	■■□□□ 1.02
CD55-205	ENST00000367067	FSD1L	Q9BXM9	530 aa		21.41	■■□□□ 1.02
CD55-205	ENST00000367067	FCF1	Q9Y324	198 aa	Known RBP	21.41	■■□□□ 1.02
CD55-205	ENST00000367067	TEX264	Q9Y6I9	313 aa		21.41	■■□□□ 1.02
CD55-205	ENST00000367067	COL4A3	Q01955	1670 aa		21.41	■■□□□ 1.02
CD55-205	ENST00000367067	POLR3G	O15318	223 aa	Predicted RBP	21.41	■■□□□ 1.02
CD55-205	ENST00000367067	TULP3	O75386	442 aa		21.41	■■□□□ 1.02
CD55-205	ENST00000367067	ACSL3	O95573	720 aa		21.41	■■□□□ 1.02
CD55-205	ENST00000367067	RGR	P47804	291 aa		21.41	■■□□□ 1.02
CD55-205	ENST00000367067	SULT2A1	Q06520	285 aa		21.41	■■□□□ 1.02
CD55-205	ENST00000367067	RUNX3	Q13761	415 aa		21.41	■■□□□ 1.02
CD55-205	ENST00000367067	SLC29A2	Q14542	456 aa		21.41	■■□□□ 1.02
CD55-205	ENST00000367067	GAB4	Q2WGN9	574 aa		21.41	■■□□□ 1.02
CD55-205	ENST00000367067	CCDC38	Q502W7	563 aa		21.41	■■□□□ 1.02
CD55-205	ENST00000367067	DENND2C	Q68D51	928 aa		21.41	■■□□□ 1.02
CD55-205	ENST00000367067	KDELC1	Q6UW63	502 aa		21.41	■■□□□ 1.02
CD55-205	ENST00000367067	AGGF1	Q8N302	714 aa	eCLIP	21.41	■■□□□ 1.02
CD55-205	ENST00000367067	DNAAF3	Q8N9W5	541 aa		21.41	■■□□□ 1.02
CD55-205	ENST00000367067	FBXO36	Q8NEA4	188 aa		21.41	■■□□□ 1.02
CD55-205	ENST00000367067	LRRC39	Q96DD0	335 aa		21.41	■■□□□ 1.02
CD55-205	ENST00000367067	MRGPRX2	Q96LB1	330 aa		21.41	■■□□□ 1.02
CD55-205	ENST00000367067	RUFY1	Q96T51	708 aa		21.41	■■□□□ 1.02
CD55-205	ENST00000367067	TBL1Y	Q9BQ87	522 aa		21.41	■■□□□ 1.02
CD55-205	ENST00000367067	APOL2	Q9BQE5	337 aa		21.41	■■□□□ 1.02
CD55-205	ENST00000367067	WDR83	Q9BRX9	315 aa	Known RBP	21.41	■■□□□ 1.02
CD55-205	ENST00000367067	TRMT61B	Q9BVS5	477 aa	Known RBP	21.41	■■□□□ 1.02
CD55-205	ENST00000367067	CASS4	Q9NQ75	786 aa		21.41	■■□□□ 1.02
CD55-205	ENST00000367067	PIH1D1	Q9NWS0	290 aa	Known RBP	21.41	■■□□□ 1.02
CD55-205	ENST00000367067		K7ERQ8	282 aa		21.4	■■□□□ 1.02
CD55-205	ENST00000367067	GJB3	O75712	270 aa		21.4	■■□□□ 1.02
CD55-205	ENST00000367067	SERPINF2	P08697	491 aa		21.4	■■□□□ 1.02
CD55-205	ENST00000367067	CISD3	P0C7P0	127 aa		21.4	■■□□□ 1.02
CD55-205	ENST00000367067	CR2	P20023	1033 aa		21.4	■■□□□ 1.02
CD55-205	ENST00000367067	CES1	P23141	567 aa		21.4	■■□□□ 1.02
CD55-205	ENST00000367067	GDI1	P31150	447 aa		21.4	■■□□□ 1.02
CD55-205	ENST00000367067	ADRA1A	P35348	466 aa		21.4	■■□□□ 1.02
CD55-205	ENST00000367067	ELK3	P41970	407 aa		21.4	■■□□□ 1.02
CD55-205	ENST00000367067	CTSO	P43234	321 aa	Predicted RBP	21.4	■■□□□ 1.02
CD55-205	ENST00000367067	SCNN1B	P51168	640 aa		21.4	■■□□□ 1.02
CD55-205	ENST00000367067	WNT3A	P56704	352 aa		21.4	■■□□□ 1.02
CD55-205	ENST00000367067	RHOA	P61586	193 aa		21.4	■■□□□ 1.02
CD55-205	ENST00000367067	SKOR1	P84550	965 aa		21.4	■■□□□ 1.02
CD55-205	ENST00000367067	NSUN2	Q08J23	767 aa	Known RBP eCLIP	21.4	■■□□□ 1.02
CD55-205	ENST00000367067	SMAD4	Q13485	552 aa	Known RBP	21.4	■■□□□ 1.02
CD55-205	ENST00000367067	IHH	Q14623	411 aa		21.4	■■□□□ 1.02
CD55-205	ENST00000367067	GEN1	Q17RS7	908 aa		21.4	■■□□□ 1.02
CD55-205	ENST00000367067	UBAP2	Q5T6F2	1119 aa	Known RBP	21.4	■■□□□ 1.02
CD55-205	ENST00000367067	ATP11C	Q8NB49	1132 aa		21.4	■■□□□ 1.02
CD55-205	ENST00000367067	RPL10L	Q96L21	214 aa	Known RBP	21.4	■■□□□ 1.02
CD55-205	ENST00000367067	SIGLEC10	Q96LC7	697 aa		21.4	■■□□□ 1.02
CD55-205	ENST00000367067	ZIM3	Q96PE6	472 aa		21.4	■■□□□ 1.02
CD55-205	ENST00000367067	LHX3	Q9UBR4	397 aa		21.4	■■□□□ 1.02
CD55-205	ENST00000367067	SLC25A13	Q9UJS0	675 aa		21.4	■■□□□ 1.02
CD55-205	ENST00000367067	CHMP2B	Q9UQN3	213 aa		21.4	■■□□□ 1.02
CD55-205	ENST00000367067	PLAA	Q9Y263	795 aa		21.4	■■□□□ 1.02
CD55-205	ENST00000367067	HS3ST2	Q9Y278	367 aa		21.4	■■□□□ 1.02
CD55-205	ENST00000367067	SLC27A6	Q9Y2P4	619 aa		21.4	■■□□□ 1.02
CD55-205	ENST00000367067	NUMBL	Q9Y6R0	609 aa		21.4	■■□□□ 1.02
CD55-205	ENST00000367067	AP3B1	O00203	1094 aa		21.39	■■□□□ 1.02
CD55-205	ENST00000367067	SMAD6	O43541	496 aa	Known RBP	21.39	■■□□□ 1.02
CD55-205	ENST00000367067	AGT	P01019	485 aa		21.39	■■□□□ 1.02
CD55-205	ENST00000367067	SESN2	P58004	480 aa	Predicted RBP	21.39	■■□□□ 1.02
CD55-205	ENST00000367067	ECT2L	Q008S8	904 aa		21.39	■■□□□ 1.02
CD55-205	ENST00000367067	CDH17	Q12864	832 aa		21.39	■■□□□ 1.02
CD55-205	ENST00000367067	HTR4	Q13639	388 aa		21.39	■■□□□ 1.02
CD55-205	ENST00000367067	PCSK7	Q16549	785 aa		21.39	■■□□□ 1.02
CD55-205	ENST00000367067	HABP4	Q5JVS0	413 aa	Known RBP	21.39	■■□□□ 1.02
CD55-205	ENST00000367067	TMEM215	Q68D42	235 aa		21.39	■■□□□ 1.02
CD55-205	ENST00000367067	MBLAC2	Q68D91	279 aa		21.39	■■□□□ 1.02
CD55-205	ENST00000367067	NUDCD1	Q96RS6	583 aa		21.39	■■□□□ 1.02
CD55-205	ENST00000367067	FICD	Q9BVA6	458 aa		21.39	■■□□□ 1.02
CD55-205	ENST00000367067	NOD2	Q9HC29	1040 aa		21.39	■■□□□ 1.02
CD55-205	ENST00000367067	GTSE1	Q9NYZ3	720 aa		21.39	■■□□□ 1.02
CD55-205	ENST00000367067	DYNC1LI1	Q9Y6G9	523 aa	Known RBP	21.39	■■□□□ 1.02
CD55-205	ENST00000367067	ANHX	E9PGG2	379 aa		21.39	■■□□□ 1.01

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