RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000366687.5

CCSAP-203, Transcript of centriole, cilia and spindle associated protein, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCSAP, Length 5,089 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSAP-203ENST00000366687 VN1R5Q7Z5H4 357 aa20.48■□□□□ 0.87
CCSAP-203ENST00000366687 CACUL1Q86Y37 369 aa20.48■□□□□ 0.87
CCSAP-203ENST00000366687 LPPQ93052 612 aa20.48■□□□□ 0.87
CCSAP-203ENST00000366687 SKA1Q96BD8 255 aa20.48■□□□□ 0.87
CCSAP-203ENST00000366687 ZFRQ96KR1 1074 aaKnown RBP20.48■□□□□ 0.87
CCSAP-203ENST00000366687 BTBD7Q9P203 1132 aa20.48■□□□□ 0.87
CCSAP-203ENST00000366687 ANAPC2Q9UJX6 822 aa20.48■□□□□ 0.87
CCSAP-203ENST00000366687 BCL10O95999 233 aa20.48■□□□□ 0.87
CCSAP-203ENST00000366687 GJB1P08034 283 aa20.48■□□□□ 0.87
CCSAP-203ENST00000366687 THOP1P52888 689 aa20.48■□□□□ 0.87
CCSAP-203ENST00000366687 GNA13Q14344 377 aa20.48■□□□□ 0.87
CCSAP-203ENST00000366687 MON1AQ86VX9 555 aa20.48■□□□□ 0.87
CCSAP-203ENST00000366687 DEPDC7Q96QD5 511 aa20.48■□□□□ 0.87
CCSAP-203ENST00000366687 FHDC1Q9C0D6 1143 aaPredicted RBP20.48■□□□□ 0.87
CCSAP-203ENST00000366687 WNT7AO00755 349 aa20.47■□□□□ 0.87
CCSAP-203ENST00000366687 MRPS22P82650 360 aaKnown RBP20.47■□□□□ 0.87
CCSAP-203ENST00000366687 DUSP28Q4G0W2 176 aa20.47■□□□□ 0.87
CCSAP-203ENST00000366687 RNF43Q68DV7 783 aa20.47■□□□□ 0.87
CCSAP-203ENST00000366687 STRADAQ7RTN6 431 aa20.47■□□□□ 0.87
CCSAP-203ENST00000366687 IRF2BP1Q8IU81 584 aa20.47■□□□□ 0.87
CCSAP-203ENST00000366687 ZSCAN18Q8TBC5 510 aaPredicted RBP20.47■□□□□ 0.87
CCSAP-203ENST00000366687 ELMO1Q92556 727 aa20.47■□□□□ 0.87
CCSAP-203ENST00000366687 ZNF184Q99676 751 aaPredicted RBP20.47■□□□□ 0.87
CCSAP-203ENST00000366687 TBCDQ9BTW9 1192 aa20.47■□□□□ 0.87
CCSAP-203ENST00000366687 LINC00854A0A1B0GVQ3 168 aa20.47■□□□□ 0.87
CCSAP-203ENST00000366687 IFNGR2P38484 337 aa20.47■□□□□ 0.87
CCSAP-203ENST00000366687 CCDC157Q569K6 752 aa20.47■□□□□ 0.87
CCSAP-203ENST00000366687 HLA-DQA1Q5Y7H0 255 aa20.47■□□□□ 0.87
CCSAP-203ENST00000366687 TTC7BQ86TV6 843 aa20.47■□□□□ 0.87
CCSAP-203ENST00000366687 KRT73Q86Y46 540 aa20.47■□□□□ 0.87
CCSAP-203ENST00000366687 DENND1CQ8IV53 801 aa20.47■□□□□ 0.87
CCSAP-203ENST00000366687 HJURPQ8NCD3 748 aaPredicted RBP20.47■□□□□ 0.87
CCSAP-203ENST00000366687 PPTC7Q8NI37 304 aa20.47■□□□□ 0.87
CCSAP-203ENST00000366687 PPP1R13LQ8WUF5 828 aa20.47■□□□□ 0.87
CCSAP-203ENST00000366687 EFR3BQ9Y2G0 817 aa20.47■□□□□ 0.87
CCSAP-203ENST00000366687 CXCR2P25025 360 aa20.47■□□□□ 0.87
CCSAP-203ENST00000366687 GTF2E2P29084 291 aaKnown RBP20.47■□□□□ 0.87
CCSAP-203ENST00000366687 GRIA4P48058 902 aa20.47■□□□□ 0.87
CCSAP-203ENST00000366687 EPS8Q12929 822 aa20.47■□□□□ 0.87
CCSAP-203ENST00000366687 ADAMTSL2Q86TH1 951 aa20.47■□□□□ 0.87
CCSAP-203ENST00000366687 ADHFE1Q8IWW8 467 aa20.47■□□□□ 0.87
CCSAP-203ENST00000366687 ZBTB10Q96DT7 871 aa20.47■□□□□ 0.87
CCSAP-203ENST00000366687 MAGEB10Q96LZ2 347 aaPredicted RBP20.47■□□□□ 0.87
CCSAP-203ENST00000366687 TRAPPC9Q96Q05 1148 aa20.47■□□□□ 0.87
CCSAP-203ENST00000366687 GGA2Q9UJY4 613 aa20.47■□□□□ 0.87
CCSAP-203ENST00000366687 SH3BGRLO75368 114 aa20.47■□□□□ 0.87
CCSAP-203ENST00000366687 ULK1O75385 1050 aa20.47■□□□□ 0.87
CCSAP-203ENST00000366687 PBX1P40424 430 aa20.47■□□□□ 0.87
CCSAP-203ENST00000366687 ABL2P42684 1182 aa20.47■□□□□ 0.87
CCSAP-203ENST00000366687 INSCQ1MX18 579 aa20.47■□□□□ 0.87
CCSAP-203ENST00000366687 BNIPLQ7Z465 357 aa20.47■□□□□ 0.87
CCSAP-203ENST00000366687 GRIN3AQ8TCU5 1115 aa20.47■□□□□ 0.87
CCSAP-203ENST00000366687 PHACTR1Q9C0D0 580 aa20.47■□□□□ 0.87
CCSAP-203ENST00000366687 REEP1Q9H902 201 aa20.47■□□□□ 0.87
CCSAP-203ENST00000366687 OR6C75A6NL08 312 aa20.46■□□□□ 0.87
CCSAP-203ENST00000366687 SGTAO43765 313 aa20.46■□□□□ 0.87
CCSAP-203ENST00000366687 SNRPB2P08579 225 aaKnown RBP20.46■□□□□ 0.87
CCSAP-203ENST00000366687 CES1P23141 567 aa20.46■□□□□ 0.87
CCSAP-203ENST00000366687 SMAD3P84022 425 aaKnown RBP20.46■□□□□ 0.87
CCSAP-203ENST00000366687 CDK18Q07002 472 aa20.46■□□□□ 0.87
CCSAP-203ENST00000366687 TRPM4Q8TD43 1214 aa20.46■□□□□ 0.87
CCSAP-203ENST00000366687 SNRNP27Q8WVK2 155 aaKnown RBP20.46■□□□□ 0.87
CCSAP-203ENST00000366687 PPP3R2Q96LZ3 170 aa20.46■□□□□ 0.87
CCSAP-203ENST00000366687 RAP2CQ9Y3L5 183 aa20.46■□□□□ 0.87
CCSAP-203ENST00000366687 TLR5O60602 858 aa20.46■□□□□ 0.87
CCSAP-203ENST00000366687 PEX11AO75192 247 aa20.46■□□□□ 0.87
CCSAP-203ENST00000366687 KCNH1O95259 989 aa20.46■□□□□ 0.87
CCSAP-203ENST00000366687 KRT75O95678 551 aa20.46■□□□□ 0.87
CCSAP-203ENST00000366687 LPOP22079 712 aaPredicted RBP20.46■□□□□ 0.87
CCSAP-203ENST00000366687 TUSC3Q13454 348 aa20.46■□□□□ 0.87
CCSAP-203ENST00000366687 HSDL1Q3SXM5 330 aa20.46■□□□□ 0.87
CCSAP-203ENST00000366687 CAMK1DQ8IU85 385 aa20.46■□□□□ 0.87
CCSAP-203ENST00000366687 RDH11Q8TC12 318 aa20.46■□□□□ 0.87
CCSAP-203ENST00000366687 KREMEN1Q96MU8 473 aa20.46■□□□□ 0.87
CCSAP-203ENST00000366687 RNPEPL1Q9HAU8 725 aa20.46■□□□□ 0.87
CCSAP-203ENST00000366687 COL1A2P08123 1366 aa20.46■□□□□ 0.87
CCSAP-203ENST00000366687 BIRC5O15392 142 aa20.46■□□□□ 0.87
CCSAP-203ENST00000366687 PSMG1O95456 288 aa20.46■□□□□ 0.87
CCSAP-203ENST00000366687 MYBL2P10244 700 aa20.46■□□□□ 0.87
CCSAP-203ENST00000366687 CLK2P49760 499 aaKnown RBP20.46■□□□□ 0.87
CCSAP-203ENST00000366687 HIRAP54198 1017 aaPredicted RBP20.46■□□□□ 0.87
CCSAP-203ENST00000366687 SLC25A52Q3SY17 297 aa20.46■□□□□ 0.87
CCSAP-203ENST00000366687 ARHGEF28Q8N1W1 1705 aaKnown RBP20.46■□□□□ 0.87
CCSAP-203ENST00000366687 WDR36Q8NI36 951 aaKnown RBP20.46■□□□□ 0.87
CCSAP-203ENST00000366687 NACC2Q96BF6 587 aa20.46■□□□□ 0.87
CCSAP-203ENST00000366687 RNPEPQ9H4A4 650 aa20.46■□□□□ 0.87
CCSAP-203ENST00000366687 PCDH18Q9HCL0 1135 aa20.46■□□□□ 0.87
CCSAP-203ENST00000366687 VPS45Q9NRW7 570 aa20.46■□□□□ 0.87
CCSAP-203ENST00000366687 A0A087WXM4 84 aa20.46■□□□□ 0.87
CCSAP-203ENST00000366687 SMIM35A0A1B0GVV1 85 aa20.46■□□□□ 0.87
CCSAP-203ENST00000366687 ATP6V0D1P61421 351 aa20.46■□□□□ 0.87
CCSAP-203ENST00000366687 RGMBQ6NW40 437 aa20.46■□□□□ 0.87
CCSAP-203ENST00000366687 USP7Q93009 1102 aa20.46■□□□□ 0.87
CCSAP-203ENST00000366687 EPB41L4BQ9H329 900 aa20.46■□□□□ 0.87
CCSAP-203ENST00000366687 FGF1P05230 155 aa20.45■□□□□ 0.86
CCSAP-203ENST00000366687 SQLEQ14534 574 aa20.45■□□□□ 0.86
CCSAP-203ENST00000366687 IRGCQ6NXR0 463 aa20.45■□□□□ 0.86
CCSAP-203ENST00000366687 MAML3Q96JK9 1138 aa20.45■□□□□ 0.86
CCSAP-203ENST00000366687 FCRL2Q96LA5 508 aaPredicted RBP20.45■□□□□ 0.86
CCSAP-203ENST00000366687 RIBC2Q9H4K1 309 aa20.45■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.6 ms