RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000344528.8

SH3BP4-201, Transcript of SH3 domain binding protein 4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SH3BP4, Length 5,044 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4-201ENST00000344528 HTR7P34969 479 aa16.5■□□□□ 0.23
SH3BP4-201ENST00000344528 RXRGP48443 463 aa16.5■□□□□ 0.23
SH3BP4-201ENST00000344528 ATAD1Q8NBU5 361 aa16.5■□□□□ 0.23
SH3BP4-201ENST00000344528 CKAP2Q8WWK9 683 aa16.5■□□□□ 0.23
SH3BP4-201ENST00000344528 CENPTQ96BT3 561 aa16.5■□□□□ 0.23
SH3BP4-201ENST00000344528 MMADHCQ9H3L0 296 aaPredicted RBP16.5■□□□□ 0.23
SH3BP4-201ENST00000344528 KLQ9UEF7 1012 aa16.5■□□□□ 0.23
SH3BP4-201ENST00000344528 SNX6Q9UNH7 406 aa16.5■□□□□ 0.23
SH3BP4-201ENST00000344528 E7ENQ6 273 aa16.5■□□□□ 0.23
SH3BP4-201ENST00000344528 NFKBIEO00221 500 aa16.5■□□□□ 0.23
SH3BP4-201ENST00000344528 CA12O43570 354 aa16.5■□□□□ 0.23
SH3BP4-201ENST00000344528 TFEBP19484 476 aa16.5■□□□□ 0.23
SH3BP4-201ENST00000344528 RPA3P35244 121 aaPredicted RBP16.5■□□□□ 0.23
SH3BP4-201ENST00000344528 RAB10P61026 200 aa16.5■□□□□ 0.23
SH3BP4-201ENST00000344528 MAXP61244 160 aa16.5■□□□□ 0.23
SH3BP4-201ENST00000344528 NOMO1Q15155 1222 aa16.5■□□□□ 0.23
SH3BP4-201ENST00000344528 WASHC2DQ5SRD0 308 aa16.5■□□□□ 0.23
SH3BP4-201ENST00000344528 XYLT1Q86Y38 959 aa16.5■□□□□ 0.23
SH3BP4-201ENST00000344528 SLC41A1Q8IVJ1 513 aa16.5■□□□□ 0.23
SH3BP4-201ENST00000344528 PIK3R5Q8WYR1 880 aa16.5■□□□□ 0.23
SH3BP4-201ENST00000344528 AHCYL2Q96HN2 611 aaKnown RBP16.5■□□□□ 0.23
SH3BP4-201ENST00000344528 NDUFA13Q9P0J0 144 aa16.5■□□□□ 0.23
SH3BP4-201ENST00000344528 TBC1D14Q9P2M4 693 aa16.5■□□□□ 0.23
SH3BP4-201ENST00000344528 ZNF655Q8N720 491 aaPredicted RBP16.49■□□□□ 0.23
SH3BP4-201ENST00000344528 FIG4Q92562 907 aa16.49■□□□□ 0.23
SH3BP4-201ENST00000344528 FAXDC2Q96IV6 333 aa16.49■□□□□ 0.23
SH3BP4-201ENST00000344528 KLHL4Q9C0H6 718 aa16.49■□□□□ 0.23
SH3BP4-201ENST00000344528 MFSD1Q9H3U5 465 aa16.49■□□□□ 0.23
SH3BP4-201ENST00000344528 SYN3O14994 580 aa16.49■□□□□ 0.23
SH3BP4-201ENST00000344528 ALOX15BO15296 676 aa16.49■□□□□ 0.23
SH3BP4-201ENST00000344528 ATP6V0D1P61421 351 aa16.49■□□□□ 0.23
SH3BP4-201ENST00000344528 GRM3Q14832 879 aa16.49■□□□□ 0.23
SH3BP4-201ENST00000344528 HLA-DQA1Q5Y7H0 255 aa16.49■□□□□ 0.23
SH3BP4-201ENST00000344528 KIAA1324Q6UXG2 1013 aaKnown RBP16.49■□□□□ 0.23
SH3BP4-201ENST00000344528 ARCQ7LC44 396 aa16.49■□□□□ 0.23
SH3BP4-201ENST00000344528 MRPL48Q96GC5 212 aaKnown RBP16.49■□□□□ 0.23
SH3BP4-201ENST00000344528 EXOC2Q96KP1 924 aa16.49■□□□□ 0.23
SH3BP4-201ENST00000344528 ACBD6Q9BR61 282 aa16.49■□□□□ 0.23
SH3BP4-201ENST00000344528 PHACTR1Q9C0D0 580 aa16.49■□□□□ 0.23
SH3BP4-201ENST00000344528 PSME2Q9UL46 239 aa16.49■□□□□ 0.23
SH3BP4-201ENST00000344528 ENTPD4Q9Y227 616 aa16.49■□□□□ 0.23
SH3BP4-201ENST00000344528 A0A1W2PQH9 124 aa16.49■□□□□ 0.23
SH3BP4-201ENST00000344528 INPP4BO15327 924 aa16.49■□□□□ 0.23
SH3BP4-201ENST00000344528 PABPC1P11940 636 aaKnown RBP16.49■□□□□ 0.23
SH3BP4-201ENST00000344528 NEK3P51956 506 aa16.49■□□□□ 0.23
SH3BP4-201ENST00000344528 DEFA1P59665 94 aa16.49■□□□□ 0.23
SH3BP4-201ENST00000344528 DEFA3P59666 94 aa16.49■□□□□ 0.23
SH3BP4-201ENST00000344528 RPS7P62081 194 aaKnown RBP16.49■□□□□ 0.23
SH3BP4-201ENST00000344528 ZCWPW2Q504Y3 356 aa16.49■□□□□ 0.23
SH3BP4-201ENST00000344528 WDR48Q8TAF3 677 aa16.49■□□□□ 0.23
SH3BP4-201ENST00000344528 GPR152Q8TDT2 470 aa16.49■□□□□ 0.23
SH3BP4-201ENST00000344528 MAGED4Q96JG8 741 aa16.49■□□□□ 0.23
SH3BP4-201ENST00000344528 TBC1D23Q9NUY8 699 aa16.49■□□□□ 0.23
SH3BP4-201ENST00000344528 ENOPH1Q9UHY7 261 aa16.49■□□□□ 0.23
SH3BP4-201ENST00000344528 PCDHB9Q9Y5E1 797 aa16.49■□□□□ 0.23
SH3BP4-201ENST00000344528 TRIM60Q495X7 471 aa16.48■□□□□ 0.23
SH3BP4-201ENST00000344528 MARK2Q7KZI7 788 aaKnown RBP16.48■□□□□ 0.23
SH3BP4-201ENST00000344528 RGL4Q8IZJ4 473 aa16.48■□□□□ 0.23
SH3BP4-201ENST00000344528 CSPG4P5Q96PW8 444 aa16.48■□□□□ 0.23
SH3BP4-201ENST00000344528 MRPL57Q9BQC6 102 aaKnown RBP16.48■□□□□ 0.23
SH3BP4-201ENST00000344528 NTPCRQ9BSD7 190 aaKnown RBP16.48■□□□□ 0.23
SH3BP4-201ENST00000344528 PIF1Q9H611 641 aa16.48■□□□□ 0.23
SH3BP4-201ENST00000344528 GLOD4Q9HC38 313 aa16.48■□□□□ 0.23
SH3BP4-201ENST00000344528 ADPRHL2Q9NX46 363 aa16.48■□□□□ 0.23
SH3BP4-201ENST00000344528 FLT3P36888 993 aa16.48■□□□□ 0.23
SH3BP4-201ENST00000344528 YBEYP58557 167 aaPredicted RBP16.48■□□□□ 0.23
SH3BP4-201ENST00000344528 PARP15Q460N3 678 aa16.48■□□□□ 0.23
SH3BP4-201ENST00000344528 DNAJC14Q6Y2X3 702 aaPredicted RBP16.48■□□□□ 0.23
SH3BP4-201ENST00000344528 ACTRT2Q8TDY3 377 aa16.48■□□□□ 0.23
SH3BP4-201ENST00000344528 MAGEB10Q96LZ2 347 aaPredicted RBP16.48■□□□□ 0.23
SH3BP4-201ENST00000344528 COPS8Q99627 209 aa16.48■□□□□ 0.23
SH3BP4-201ENST00000344528 ITGA2BP08514 1039 aa16.48■□□□□ 0.23
SH3BP4-201ENST00000344528 NDUFV1P49821 464 aa16.48■□□□□ 0.23
SH3BP4-201ENST00000344528 POU5F2Q8N7G0 328 aa16.48■□□□□ 0.23
SH3BP4-201ENST00000344528 ZNF513Q8N8E2 541 aaPredicted RBP16.48■□□□□ 0.23
SH3BP4-201ENST00000344528 PAWRQ96IZ0 340 aaKnown RBP16.48■□□□□ 0.23
SH3BP4-201ENST00000344528 UGT2B28Q9BY64 529 aa16.48■□□□□ 0.23
SH3BP4-201ENST00000344528 USE1Q9NZ43 259 aa16.48■□□□□ 0.23
SH3BP4-201ENST00000344528 AKAP7Q9P0M2 348 aaPredicted RBP16.48■□□□□ 0.23
SH3BP4-201ENST00000344528 RBPJLQ9UBG7 517 aa16.48■□□□□ 0.23
SH3BP4-201ENST00000344528 MAP2K7O14733 419 aa16.48■□□□□ 0.23
SH3BP4-201ENST00000344528 SGTAO43765 313 aa16.48■□□□□ 0.23
SH3BP4-201ENST00000344528 HTR1BP28222 390 aa16.48■□□□□ 0.23
SH3BP4-201ENST00000344528 LLGL2Q6P1M3 1020 aa16.48■□□□□ 0.23
SH3BP4-201ENST00000344528 ZFP1Q6P2D0 407 aa16.48■□□□□ 0.23
SH3BP4-201ENST00000344528 CHPFQ8IZ52 775 aa16.48■□□□□ 0.23
SH3BP4-201ENST00000344528 OR8D1Q8WZ84 308 aa16.48■□□□□ 0.23
SH3BP4-201ENST00000344528 SNX27Q96L92 541 aa16.48■□□□□ 0.23
SH3BP4-201ENST00000344528 ACE2Q9BYF1 805 aaPredicted RBP16.48■□□□□ 0.23
SH3BP4-201ENST00000344528 PTPRHQ9HD43 1115 aa16.48■□□□□ 0.23
SH3BP4-201ENST00000344528 XPNPEP1Q9NQW7 623 aa16.48■□□□□ 0.23
SH3BP4-201ENST00000344528 ATAD3AQ9NVI7 634 aa16.48■□□□□ 0.23
SH3BP4-201ENST00000344528 FZD9O00144 591 aa16.47■□□□□ 0.23
SH3BP4-201ENST00000344528 LDLRP01130 860 aa16.47■□□□□ 0.23
SH3BP4-201ENST00000344528 SLC5A3P53794 718 aa16.47■□□□□ 0.23
SH3BP4-201ENST00000344528 IRAK1BP1Q5VVH5 260 aa16.47■□□□□ 0.23
SH3BP4-201ENST00000344528 RDH11Q8TC12 318 aa16.47■□□□□ 0.23
SH3BP4-201ENST00000344528 STK32AQ8WU08 396 aa16.47■□□□□ 0.23
SH3BP4-201ENST00000344528 MBOAT7Q96N66 472 aa16.47■□□□□ 0.23
SH3BP4-201ENST00000344528 SEPHS2Q99611 448 aa16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.1 ms