RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000341935.9

CCR6-201, Transcript of C-C motif chemokine receptor 6, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCR6, Length 4,018 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCR6-201ENST00000341935 ANKRD22Q5VYY1 191 aa6.16□□□□□ -1.42
CCR6-201ENST00000341935 CCBE1Q6UXH8 406 aaPredicted RBP6.16□□□□□ -1.42
CCR6-201ENST00000341935 CFAP52Q8N1V2 620 aa6.16□□□□□ -1.42
CCR6-201ENST00000341935 LILRB1Q8NHL6 650 aaPredicted RBP6.16□□□□□ -1.42
CCR6-201ENST00000341935 PPP1R14CQ8TAE6 165 aa6.16□□□□□ -1.42
CCR6-201ENST00000341935 GIMAP1Q8WWP7 306 aa6.16□□□□□ -1.42
CCR6-201ENST00000341935 TIFAQ96CG3 184 aa6.16□□□□□ -1.42
CCR6-201ENST00000341935 PWWP2AQ96N64 755 aa6.16□□□□□ -1.42
CCR6-201ENST00000341935 TSGA13Q96PP4 275 aa6.16□□□□□ -1.42
CCR6-201ENST00000341935 PFDN2Q9UHV9 154 aa6.16□□□□□ -1.42
CCR6-201ENST00000341935 LSM7Q9UK45 103 aaKnown RBP6.16□□□□□ -1.42
CCR6-201ENST00000341935 CAPN7Q9Y6W3 813 aa6.16□□□□□ -1.42
CCR6-201ENST00000341935 TCRBV7S3A2A0A539 114 aa6.16□□□□□ -1.42
CCR6-201ENST00000341935 A6NCN8 305 aa6.16□□□□□ -1.42
CCR6-201ENST00000341935 RFXAPO00287 272 aa6.16□□□□□ -1.42
CCR6-201ENST00000341935 CHADO15335 359 aa6.16□□□□□ -1.42
CCR6-201ENST00000341935 MTSS1O43312 755 aa6.16□□□□□ -1.42
CCR6-201ENST00000341935 TSPAN3O60637 253 aa6.16□□□□□ -1.42
CCR6-201ENST00000341935 MAFKO60675 156 aa6.16□□□□□ -1.42
CCR6-201ENST00000341935 DIAPH2O60879 1101 aa6.16□□□□□ -1.42
CCR6-201ENST00000341935 OPHN1O60890 802 aa6.16□□□□□ -1.42
CCR6-201ENST00000341935 TSPAN9O75954 239 aa6.16□□□□□ -1.42
CCR6-201ENST00000341935 PAPLNO95428 1278 aa6.16□□□□□ -1.42
CCR6-201ENST00000341935 PTPN3P26045 913 aa6.16□□□□□ -1.42
CCR6-201ENST00000341935 HSD17B3P37058 310 aa6.16□□□□□ -1.42
CCR6-201ENST00000341935 SKIV2L2P42285 1042 aaKnown RBP6.16□□□□□ -1.42
CCR6-201ENST00000341935 SGSHP51688 502 aa6.16□□□□□ -1.42
CCR6-201ENST00000341935 CDH4P55283 916 aa6.16□□□□□ -1.42
CCR6-201ENST00000341935 MLLT1Q03111 559 aaPredicted RBP6.16□□□□□ -1.42
CCR6-201ENST00000341935 RNF187Q5TA31 235 aaPredicted RBP6.16□□□□□ -1.42
CCR6-201ENST00000341935 GRASPQ7Z6J2 395 aaPredicted RBP6.16□□□□□ -1.42
CCR6-201ENST00000341935 CCDC25Q86WR0 208 aa6.16□□□□□ -1.42
CCR6-201ENST00000341935 CMTM8Q8IZV2 173 aa6.16□□□□□ -1.42
CCR6-201ENST00000341935 ZNF567Q8N184 647 aa6.16□□□□□ -1.42
CCR6-201ENST00000341935 VN1R2Q8NFZ6 395 aa6.16□□□□□ -1.42
CCR6-201ENST00000341935 CEP70Q8NHQ1 597 aa6.16□□□□□ -1.42
CCR6-201ENST00000341935 MRPL38Q96DV4 380 aaKnown RBP6.16□□□□□ -1.42
CCR6-201ENST00000341935 DTNBP1Q96EV8 351 aa6.16□□□□□ -1.42
CCR6-201ENST00000341935 HMCESQ96FZ2 354 aa6.16□□□□□ -1.42
CCR6-201ENST00000341935 CDCA3Q99618 268 aaPredicted RBP6.16□□□□□ -1.42
CCR6-201ENST00000341935 CEP41Q9BYV8 373 aa6.16□□□□□ -1.42
CCR6-201ENST00000341935 FOXP3Q9BZS1 431 aa6.16□□□□□ -1.42
CCR6-201ENST00000341935 RAB6BQ9NRW1 208 aa6.16□□□□□ -1.42
CCR6-201ENST00000341935 CFAP97Q9P2B7 532 aa6.16□□□□□ -1.42
CCR6-201ENST00000341935 ZNF510Q9Y2H8 683 aa6.16□□□□□ -1.42
CCR6-201ENST00000341935 NUP210Q8TEM1 1887 aaPredicted RBP6.16□□□□□ -1.42
CCR6-201ENST00000341935 ARHGAP42A6NI28 874 aa6.16□□□□□ -1.42
CCR6-201ENST00000341935 SOBPA7XYQ1 873 aa6.16□□□□□ -1.42
CCR6-201ENST00000341935 LEFTY2O00292 366 aa6.16□□□□□ -1.42
CCR6-201ENST00000341935 TNRC18O15417 2968 aaPredicted RBP6.16□□□□□ -1.42
CCR6-201ENST00000341935 KLHL41O60662 606 aa6.16□□□□□ -1.42
CCR6-201ENST00000341935 METTL18O95568 372 aa6.16□□□□□ -1.42
CCR6-201ENST00000341935 PAHP00439 452 aa6.16□□□□□ -1.42
CCR6-201ENST00000341935 OR1E1P30953 314 aa6.16□□□□□ -1.42
CCR6-201ENST00000341935 FDFT1P37268 417 aa6.16□□□□□ -1.42
CCR6-201ENST00000341935 NTHL1P78549 312 aa6.16□□□□□ -1.42
CCR6-201ENST00000341935 KCNC3Q14003 757 aa6.16□□□□□ -1.42
CCR6-201ENST00000341935 UAP1Q16222 522 aaPredicted RBP6.16□□□□□ -1.42
CCR6-201ENST00000341935 SPDYCQ5MJ68 293 aa6.16□□□□□ -1.42
CCR6-201ENST00000341935 EGFLAMQ63HQ2 1017 aa6.16□□□□□ -1.42
CCR6-201ENST00000341935 HTR3DQ70Z44 454 aa6.16□□□□□ -1.42
CCR6-201ENST00000341935 CHST9Q7L1S5 443 aa6.16□□□□□ -1.42
CCR6-201ENST00000341935 LRRC49Q8IUZ0 686 aa6.16□□□□□ -1.42
CCR6-201ENST00000341935 UBLCP1Q8WVY7 318 aaPredicted RBP6.16□□□□□ -1.42
CCR6-201ENST00000341935 ZNF75CPQ92670 426 aaPredicted RBP6.16□□□□□ -1.42
CCR6-201ENST00000341935 ABTB1Q969K4 478 aaPredicted RBP6.16□□□□□ -1.42
CCR6-201ENST00000341935 MAELQ96JY0 434 aaKnown RBP6.16□□□□□ -1.42
CCR6-201ENST00000341935 SMG9Q9H0W8 520 aaKnown RBP6.16□□□□□ -1.42
CCR6-201ENST00000341935 ETNK1Q9HBU6 452 aa6.16□□□□□ -1.42
CCR6-201ENST00000341935 GALNT8Q9NY28 637 aa6.16□□□□□ -1.42
CCR6-201ENST00000341935 C2orf16Q68DN1 1984 aa6.16□□□□□ -1.42
CCR6-201ENST00000341935 GOLGA8MH3BSY2 632 aa6.15□□□□□ -1.42
CCR6-201ENST00000341935 KCNK1O00180 336 aa6.15□□□□□ -1.42
CCR6-201ENST00000341935 MATN3O15232 486 aa6.15□□□□□ -1.42
CCR6-201ENST00000341935 STAMBPO95630 424 aa6.15□□□□□ -1.42
CCR6-201ENST00000341935 MAGEA6P43360 314 aa6.15□□□□□ -1.42
CCR6-201ENST00000341935 GAD2Q05329 585 aa6.15□□□□□ -1.42
CCR6-201ENST00000341935 PARP15Q460N3 678 aa6.15□□□□□ -1.42
CCR6-201ENST00000341935 HABP4Q5JVS0 413 aaKnown RBP6.15□□□□□ -1.42
CCR6-201ENST00000341935 FAXCQ5TGI0 409 aa6.15□□□□□ -1.42
CCR6-201ENST00000341935 TIGD7Q6NT04 549 aaPredicted RBP6.15□□□□□ -1.42
CCR6-201ENST00000341935 FAM217AQ8IXS0 508 aa6.15□□□□□ -1.42
CCR6-201ENST00000341935 C12orf76Q8N812 135 aaPredicted RBP6.15□□□□□ -1.42
CCR6-201ENST00000341935 TASP1Q9H6P5 420 aa6.15□□□□□ -1.42
CCR6-201ENST00000341935 SFXN1Q9H9B4 322 aa6.15□□□□□ -1.42
CCR6-201ENST00000341935 DNAJC17Q9NVM6 304 aaKnown RBP6.15□□□□□ -1.42
CCR6-201ENST00000341935 MOSPD1Q9UJG1 213 aa6.15□□□□□ -1.42
CCR6-201ENST00000341935 TRHDEQ9UKU6 1024 aa6.15□□□□□ -1.42
CCR6-201ENST00000341935 ARHGAP26Q9UNA1 814 aa6.15□□□□□ -1.42
CCR6-201ENST00000341935 TSC22D4Q9Y3Q8 395 aa6.15□□□□□ -1.42
CCR6-201ENST00000341935 TRANK1O15050 2925 aa6.15□□□□□ -1.42
CCR6-201ENST00000341935 FAM25EA8MYX2 175 aa6.15□□□□□ -1.42
CCR6-201ENST00000341935 ZNF197O14709 1029 aa6.15□□□□□ -1.42
CCR6-201ENST00000341935 SCAMP3O14828 347 aaKnown RBP6.15□□□□□ -1.42
CCR6-201ENST00000341935 RAMP2O60895 175 aa6.15□□□□□ -1.42
CCR6-201ENST00000341935 CLDN11O75508 207 aa6.15□□□□□ -1.42
CCR6-201ENST00000341935 TMEM63AO94886 807 aa6.15□□□□□ -1.42
CCR6-201ENST00000341935 EPN2O95208 641 aa6.15□□□□□ -1.42
CCR6-201ENST00000341935 CEBPBP17676 345 aa6.15□□□□□ -1.42
CCR6-201ENST00000341935 RPS24P62847 133 aaKnown RBP6.15□□□□□ -1.42
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 61.3 ms