RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000340994.4

PKHD1-201, Transcript of PKHD1, fibrocystin/polyductin, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene PKHD1, Length 11,589 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKHD1-201ENST00000340994 GATBO75879 557 aaKnown RBP8.31□□□□□ -1.08
PKHD1-201ENST00000340994 NCF1P14598 390 aaPredicted RBP8.31□□□□□ -1.08
PKHD1-201ENST00000340994 RBM34P42696 430 aaKnown RBP8.31□□□□□ -1.08
PKHD1-201ENST00000340994 MYBPC3Q14896 1274 aa8.31□□□□□ -1.08
PKHD1-201ENST00000340994 KCNK18Q7Z418 384 aa8.31□□□□□ -1.08
PKHD1-201ENST00000340994 FBXL16Q8N461 479 aa8.31□□□□□ -1.08
PKHD1-201ENST00000340994 GALNT6Q8NCL4 622 aa8.31□□□□□ -1.08
PKHD1-201ENST00000340994 MCOLN3Q8TDD5 553 aa8.31□□□□□ -1.08
PKHD1-201ENST00000340994 PTCD2Q8WV60 388 aaKnown RBP8.31□□□□□ -1.08
PKHD1-201ENST00000340994 RHBDF1Q96CC6 855 aa8.31□□□□□ -1.08
PKHD1-201ENST00000340994 YTHDF1Q9BYJ9 559 aaKnown RBP8.31□□□□□ -1.08
PKHD1-201ENST00000340994 POMKQ9H5K3 350 aa8.31□□□□□ -1.08
PKHD1-201ENST00000340994 ENTPD4Q9Y227 616 aa8.31□□□□□ -1.08
PKHD1-201ENST00000340994 DUSP10Q9Y6W6 482 aa8.31□□□□□ -1.08
PKHD1-201ENST00000340994 FAM25EA8MYX2 175 aa8.31□□□□□ -1.08
PKHD1-201ENST00000340994 E7ENX8 843 aa8.31□□□□□ -1.08
PKHD1-201ENST00000340994 SUV39H1O43463 412 aa8.31□□□□□ -1.08
PKHD1-201ENST00000340994 FAM153CQ494X1 144 aa8.31□□□□□ -1.08
PKHD1-201ENST00000340994 C6orf52Q5T4I8 152 aa8.31□□□□□ -1.08
PKHD1-201ENST00000340994 ZNF470Q6ECI4 717 aa8.31□□□□□ -1.08
PKHD1-201ENST00000340994 ZFP28Q8NHY6 868 aa8.31□□□□□ -1.08
PKHD1-201ENST00000340994 ETNPPLQ8TBG4 499 aa8.31□□□□□ -1.08
PKHD1-201ENST00000340994 HTR3CQ8WXA8 447 aa8.31□□□□□ -1.08
PKHD1-201ENST00000340994 NINJ2Q9NZG7 142 aa8.31□□□□□ -1.08
PKHD1-201ENST00000340994 GABRB2P47870 512 aa8.31□□□□□ -1.08
PKHD1-201ENST00000340994 CLNKQ7Z7G1 428 aa8.31□□□□□ -1.08
PKHD1-201ENST00000340994 ZNF467Q7Z7K2 595 aaPredicted RBP8.31□□□□□ -1.08
PKHD1-201ENST00000340994 DNAJC28Q9NX36 388 aa8.31□□□□□ -1.08
PKHD1-201ENST00000340994 CST1P01037 141 aa8.3□□□□□ -1.08
PKHD1-201ENST00000340994 TFRCP02786 760 aaKnown RBP8.3□□□□□ -1.08
PKHD1-201ENST00000340994 RGS1Q08116 209 aa8.3□□□□□ -1.08
PKHD1-201ENST00000340994 ALG11Q2TAA5 492 aa8.3□□□□□ -1.08
PKHD1-201ENST00000340994 CREB3L1Q96BA8 519 aa8.3□□□□□ -1.08
PKHD1-201ENST00000340994 CRISPLD1Q9H336 500 aa8.3□□□□□ -1.08
PKHD1-201ENST00000340994 EVPLQ92817 2033 aa8.3□□□□□ -1.08
PKHD1-201ENST00000340994 NFKB1P19838 968 aa8.3□□□□□ -1.08
PKHD1-201ENST00000340994 CYP2F1P24903 491 aa8.3□□□□□ -1.08
PKHD1-201ENST00000340994 ZNF543Q08ER8 600 aa8.3□□□□□ -1.08
PKHD1-201ENST00000340994 TRIM32Q13049 653 aa8.3□□□□□ -1.08
PKHD1-201ENST00000340994 MSANTD1Q6ZTZ1 278 aa8.3□□□□□ -1.08
PKHD1-201ENST00000340994 PAGE2Q7Z2X7 111 aa8.3□□□□□ -1.08
PKHD1-201ENST00000340994 CLYBLQ8N0X4 340 aa8.3□□□□□ -1.08
PKHD1-201ENST00000340994 ZNF512Q96ME7 567 aaPredicted RBP8.3□□□□□ -1.08
PKHD1-201ENST00000340994 VPS35Q96QK1 796 aa8.3□□□□□ -1.08
PKHD1-201ENST00000340994 TMEM9Q9P0T7 183 aa8.3□□□□□ -1.08
PKHD1-201ENST00000340994 GRIP1Q9Y3R0 1128 aa8.3□□□□□ -1.08
PKHD1-201ENST00000340994 KBTBD13C9JR72 458 aa8.3□□□□□ -1.08
PKHD1-201ENST00000340994 ADAMDEC1O15204 470 aa8.3□□□□□ -1.08
PKHD1-201ENST00000340994 AP5Z1O43299 807 aa8.3□□□□□ -1.08
PKHD1-201ENST00000340994 RNASEH1O60930 286 aaKnown RBP8.3□□□□□ -1.08
PKHD1-201ENST00000340994 ACTR3P61158 418 aa8.3□□□□□ -1.08
PKHD1-201ENST00000340994 TMEM44Q2T9K0 475 aa8.3□□□□□ -1.08
PKHD1-201ENST00000340994 SNAP47Q5SQN1 464 aa8.3□□□□□ -1.08
PKHD1-201ENST00000340994 ART4Q93070 314 aa8.3□□□□□ -1.08
PKHD1-201ENST00000340994 MKL1Q969V6 931 aa8.3□□□□□ -1.08
PKHD1-201ENST00000340994 PTGFRNQ9P2B2 879 aa8.3□□□□□ -1.08
PKHD1-201ENST00000340994 CRYL1Q9Y2S2 319 aa8.3□□□□□ -1.08
PKHD1-201ENST00000340994 FRMPD4Q14CM0 1322 aa8.3□□□□□ -1.08
PKHD1-201ENST00000340994 AP3D1O14617 1153 aa8.3□□□□□ -1.08
PKHD1-201ENST00000340994 OGTO15294 1046 aa8.3□□□□□ -1.08
PKHD1-201ENST00000340994 CPSF4O95639 269 aaKnown RBP8.3□□□□□ -1.08
PKHD1-201ENST00000340994 VDRP11473 427 aa8.3□□□□□ -1.08
PKHD1-201ENST00000340994 PKNOX1P55347 436 aa8.3□□□□□ -1.08
PKHD1-201ENST00000340994 IL27RAQ6UWB1 636 aa8.3□□□□□ -1.08
PKHD1-201ENST00000340994 TMEM126BQ8IUX1 230 aa8.3□□□□□ -1.08
PKHD1-201ENST00000340994 PACRGLQ8N7B6 248 aa8.3□□□□□ -1.08
PKHD1-201ENST00000340994 DENND6BQ8NEG7 585 aa8.3□□□□□ -1.08
PKHD1-201ENST00000340994 STAG3L4Q8TBR4 150 aa8.3□□□□□ -1.08
PKHD1-201ENST00000340994 ROPN1LQ96C74 230 aa8.3□□□□□ -1.08
PKHD1-201ENST00000340994 REXO5Q96IC2 774 aaKnown RBP8.3□□□□□ -1.08
PKHD1-201ENST00000340994 PNMA8BQ9ULN7 279 aaPredicted RBP8.3□□□□□ -1.08
PKHD1-201ENST00000340994 PPLO60437 1756 aa8.3□□□□□ -1.08
PKHD1-201ENST00000340994 FAM172BPA6NC97 362 aa8.3□□□□□ -1.08
PKHD1-201ENST00000340994 KCNK1O00180 336 aa8.3□□□□□ -1.08
PKHD1-201ENST00000340994 H6PDO95479 791 aa8.3□□□□□ -1.08
PKHD1-201ENST00000340994 METTL21CQ5VZV1 264 aa8.3□□□□□ -1.08
PKHD1-201ENST00000340994 CYP2U1Q7Z449 544 aa8.3□□□□□ -1.08
PKHD1-201ENST00000340994 TMEM17Q86X19 198 aa8.3□□□□□ -1.08
PKHD1-201ENST00000340994 MPP5Q8N3R9 675 aa8.3□□□□□ -1.08
PKHD1-201ENST00000340994 METTL6Q8TCB7 284 aa8.3□□□□□ -1.08
PKHD1-201ENST00000340994 ANKRA2Q9H9E1 313 aa8.3□□□□□ -1.08
PKHD1-201ENST00000340994 EXD2Q9NVH0 621 aa8.3□□□□□ -1.08
PKHD1-201ENST00000340994 F5H5T6 163 aa8.3□□□□□ -1.08
PKHD1-201ENST00000340994 TPP1O14773 563 aa8.3□□□□□ -1.08
PKHD1-201ENST00000340994 HIST1H2ABP04908 130 aa8.3□□□□□ -1.08
PKHD1-201ENST00000340994 PLEKHG6Q3KR16 790 aa8.3□□□□□ -1.08
PKHD1-201ENST00000340994 IER5Q5VY09 327 aa8.3□□□□□ -1.08
PKHD1-201ENST00000340994 MFSD7Q6UXD7 560 aa8.3□□□□□ -1.08
PKHD1-201ENST00000340994 LRRC69Q6ZNQ3 347 aa8.3□□□□□ -1.08
PKHD1-201ENST00000340994 HIST3H2AQ7L7L0 130 aa8.3□□□□□ -1.08
PKHD1-201ENST00000340994 DDX53Q86TM3 631 aaKnown RBP8.3□□□□□ -1.08
PKHD1-201ENST00000340994 GPSM1Q86YR5 675 aa8.3□□□□□ -1.08
PKHD1-201ENST00000340994 HIST1H2ACQ93077 130 aa8.3□□□□□ -1.08
PKHD1-201ENST00000340994 CENPNQ96H22 339 aaPredicted RBP8.3□□□□□ -1.08
PKHD1-201ENST00000340994 MCCC1Q96RQ3 725 aaPredicted RBP8.3□□□□□ -1.08
PKHD1-201ENST00000340994 KCTD15Q96SI1 283 aaPredicted RBP8.3□□□□□ -1.08
PKHD1-201ENST00000340994 PHB2Q99623 299 aa8.3□□□□□ -1.08
PKHD1-201ENST00000340994 OR2B2Q9GZK3 357 aa8.3□□□□□ -1.08
PKHD1-201ENST00000340994 CASKO14936 926 aa8.3□□□□□ -1.08
PKHD1-201ENST00000340994 PRODHO43272 600 aa8.3□□□□□ -1.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.7 ms