RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000330070.5

HOXB2-201, Transcript of homeobox B2, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HOXB2, Length 1,562 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB2-201ENST00000330070 RYBPQ8N488 228 aaPredicted RBP20.29■□□□□ 0.84
HOXB2-201ENST00000330070 C1orf216Q8TAB5 229 aa20.29■□□□□ 0.84
HOXB2-201ENST00000330070 SNX19Q92543 992 aa20.29■□□□□ 0.84
HOXB2-201ENST00000330070 TCEAL3Q969E4 200 aa20.29■□□□□ 0.84
HOXB2-201ENST00000330070 RAB7BQ96AH8 199 aa20.29■□□□□ 0.84
HOXB2-201ENST00000330070 RTKNQ9BST9 563 aa20.29■□□□□ 0.84
HOXB2-201ENST00000330070 CPEB1Q9BZB8 566 aaKnown RBP20.29■□□□□ 0.84
HOXB2-201ENST00000330070 ZDHHC6Q9H6R6 413 aa20.29■□□□□ 0.84
HOXB2-201ENST00000330070 DDX56Q9NY93 547 aaKnown RBP20.29■□□□□ 0.84
HOXB2-201ENST00000330070 DLL3Q9NYJ7 618 aa20.29■□□□□ 0.84
HOXB2-201ENST00000330070 LOC105378220A0A1B0GUY1 285 aaPredicted RBP20.28■□□□□ 0.84
HOXB2-201ENST00000330070 A0A1W2PPC4 97 aa20.28■□□□□ 0.84
HOXB2-201ENST00000330070 FAM47DPA6NHR8 397 aa20.28■□□□□ 0.84
HOXB2-201ENST00000330070 PATE3B3GLJ2 98 aa20.28■□□□□ 0.84
HOXB2-201ENST00000330070 LATO43561 262 aa20.28■□□□□ 0.84
HOXB2-201ENST00000330070 PALMO75781 387 aa20.28■□□□□ 0.84
HOXB2-201ENST00000330070 IGHV4-34P06331 123 aa20.28■□□□□ 0.84
HOXB2-201ENST00000330070 RENBPP51606 427 aa20.28■□□□□ 0.84
HOXB2-201ENST00000330070 PUM1Q14671 1186 aaKnown RBP eCLIP20.28■□□□□ 0.84
HOXB2-201ENST00000330070 CYTH1Q15438 398 aa20.28■□□□□ 0.84
HOXB2-201ENST00000330070 ANKRD20A8PQ5CZ79 823 aa20.28■□□□□ 0.84
HOXB2-201ENST00000330070 ZNF805Q5CZA5 627 aa20.28■□□□□ 0.84
HOXB2-201ENST00000330070 LEKR1Q6ZMV7 388 aa20.28■□□□□ 0.84
HOXB2-201ENST00000330070 ARRDC3Q96B67 414 aa20.28■□□□□ 0.84
HOXB2-201ENST00000330070 GRPEL1Q9HAV7 217 aa20.28■□□□□ 0.84
HOXB2-201ENST00000330070 ETNK2Q9NVF9 386 aa20.28■□□□□ 0.84
HOXB2-201ENST00000330070 LHX3Q9UBR4 397 aa20.28■□□□□ 0.84
HOXB2-201ENST00000330070 CACNA1EQ15878 2313 aa20.27■□□□□ 0.84
HOXB2-201ENST00000330070 CEP250Q9BV73 2442 aa20.27■□□□□ 0.84
HOXB2-201ENST00000330070 TBC1D3DA0A087WVF3 549 aa20.27■□□□□ 0.84
HOXB2-201ENST00000330070 TBC1D3IA0A087WXS9 549 aa20.27■□□□□ 0.84
HOXB2-201ENST00000330070 TBC1D3EA0A087X179 549 aa20.27■□□□□ 0.84
HOXB2-201ENST00000330070 TBC1D3KA0A087X1G2 549 aa20.27■□□□□ 0.84
HOXB2-201ENST00000330070 TBC1D3FA6NER0 549 aaPredicted RBP20.27■□□□□ 0.84
HOXB2-201ENST00000330070 GOLGA6L3A6NEY3 463 aa20.27■□□□□ 0.84
HOXB2-201ENST00000330070 TBC1D3LB9A6J9 549 aa20.27■□□□□ 0.84
HOXB2-201ENST00000330070 KRIT1O00522 736 aa20.27■□□□□ 0.84
HOXB2-201ENST00000330070 SLC30A4O14863 429 aa20.27■□□□□ 0.84
HOXB2-201ENST00000330070 PSTPIP1O43586 416 aa20.27■□□□□ 0.84
HOXB2-201ENST00000330070 SPOPO43791 374 aa20.27■□□□□ 0.84
HOXB2-201ENST00000330070 CD48P09326 243 aa20.27■□□□□ 0.84
HOXB2-201ENST00000330070 TBC1D3HP0C7X1 549 aa20.27■□□□□ 0.84
HOXB2-201ENST00000330070 KDELR1P24390 212 aa20.27■□□□□ 0.84
HOXB2-201ENST00000330070 MAOBP27338 520 aa20.27■□□□□ 0.84
HOXB2-201ENST00000330070 HSPA9P38646 679 aaKnown RBP20.27■□□□□ 0.84
HOXB2-201ENST00000330070 MAPK8P45983 427 aa20.27■□□□□ 0.84
HOXB2-201ENST00000330070 AFF3P51826 1226 aaKnown RBP20.27■□□□□ 0.84
HOXB2-201ENST00000330070 NSUN2Q08J23 767 aaKnown RBP eCLIP20.27■□□□□ 0.84
HOXB2-201ENST00000330070 RSPO4Q2I0M5 234 aaPredicted RBP20.27■□□□□ 0.84
HOXB2-201ENST00000330070 ATP13A4Q4VNC1 1196 aa20.27■□□□□ 0.84
HOXB2-201ENST00000330070 TBC1D3GQ6DHY5 549 aa20.27■□□□□ 0.84
HOXB2-201ENST00000330070 TBC1D3CQ6IPX1 549 aa20.27■□□□□ 0.84
HOXB2-201ENST00000330070 C11orf63Q6NUN7 778 aa20.27■□□□□ 0.84
HOXB2-201ENST00000330070 CPNE8Q86YQ8 564 aa20.27■□□□□ 0.84
HOXB2-201ENST00000330070 TBC1D3Q8IZP1 549 aaPredicted RBP20.27■□□□□ 0.84
HOXB2-201ENST00000330070 ZCCHC9Q8N567 271 aaKnown RBP20.27■□□□□ 0.84
HOXB2-201ENST00000330070 ATPAF2Q8N5M1 289 aa20.27■□□□□ 0.84
HOXB2-201ENST00000330070 HCAR2Q8TDS4 363 aa20.27■□□□□ 0.84
HOXB2-201ENST00000330070 TUBGCP5Q96RT8 1024 aa20.27■□□□□ 0.84
HOXB2-201ENST00000330070 CINPQ9BW66 212 aaPredicted RBP20.27■□□□□ 0.84
HOXB2-201ENST00000330070 MIR1-1HGQ9H1L0 117 aa20.27■□□□□ 0.84
HOXB2-201ENST00000330070 TMEM9BQ9NQ34 198 aa20.27■□□□□ 0.84
HOXB2-201ENST00000330070 DKK3Q9UBP4 350 aa20.27■□□□□ 0.84
HOXB2-201ENST00000330070 SEPT3Q9UH03 358 aa20.27■□□□□ 0.84
HOXB2-201ENST00000330070 DMTF1Q9Y222 760 aa20.27■□□□□ 0.84
HOXB2-201ENST00000330070 AP1G1O43747 822 aa20.26■□□□□ 0.83
HOXB2-201ENST00000330070 ID4P47928 161 aa20.26■□□□□ 0.83
HOXB2-201ENST00000330070 GRIA4P48058 902 aa20.26■□□□□ 0.83
HOXB2-201ENST00000330070 SUOXP51687 545 aa20.26■□□□□ 0.83
HOXB2-201ENST00000330070 RACK1P63244 317 aaKnown RBP20.26■□□□□ 0.83
HOXB2-201ENST00000330070 MMRN1Q13201 1228 aa20.26■□□□□ 0.83
HOXB2-201ENST00000330070 TEAD4Q15561 434 aa20.26■□□□□ 0.83
HOXB2-201ENST00000330070 POM121L1PQ3SYA9 428 aa20.26■□□□□ 0.83
HOXB2-201ENST00000330070 FBXL19Q6PCT2 694 aa20.26■□□□□ 0.83
HOXB2-201ENST00000330070 RAD9BQ6WBX8 426 aa20.26■□□□□ 0.83
HOXB2-201ENST00000330070 PRPF39Q86UA1 669 aaKnown RBP20.26■□□□□ 0.83
HOXB2-201ENST00000330070 TMEM139Q8IV31 216 aa20.26■□□□□ 0.83
HOXB2-201ENST00000330070 BBS5Q8N3I7 341 aa20.26■□□□□ 0.83
HOXB2-201ENST00000330070 PCDH19Q8TAB3 1148 aa20.26■□□□□ 0.83
HOXB2-201ENST00000330070 NSMCE1Q8WV22 266 aa20.26■□□□□ 0.83
HOXB2-201ENST00000330070 PSKH2Q96QS6 385 aa20.26■□□□□ 0.83
HOXB2-201ENST00000330070 ARHGAP33O14559 1287 aa20.25■□□□□ 0.83
HOXB2-201ENST00000330070 GDF9O60383 454 aa20.25■□□□□ 0.83
HOXB2-201ENST00000330070 BUB1BO60566 1050 aaPredicted RBP20.25■□□□□ 0.83
HOXB2-201ENST00000330070 ADRB3P13945 408 aa20.25■□□□□ 0.83
HOXB2-201ENST00000330070 ENGP17813 658 aa20.25■□□□□ 0.83
HOXB2-201ENST00000330070 MX2P20592 715 aa20.25■□□□□ 0.83
HOXB2-201ENST00000330070 COMTP21964 271 aa20.25■□□□□ 0.83
HOXB2-201ENST00000330070 VAV2P52735 878 aa20.25■□□□□ 0.83
HOXB2-201ENST00000330070 ATXN3P54252 364 aaPredicted RBP20.25■□□□□ 0.83
HOXB2-201ENST00000330070 TAS2R38P59533 333 aa20.25■□□□□ 0.83
HOXB2-201ENST00000330070 ODF2Q5BJF6 829 aa20.25■□□□□ 0.83
HOXB2-201ENST00000330070 ATXN7L2Q5T6C5 722 aaPredicted RBP20.25■□□□□ 0.83
HOXB2-201ENST00000330070 STPG1Q5TH74 334 aa20.25■□□□□ 0.83
HOXB2-201ENST00000330070 NCBP2-AS2Q69YL0 99 aa20.25■□□□□ 0.83
HOXB2-201ENST00000330070 IL27RAQ6UWB1 636 aa20.25■□□□□ 0.83
HOXB2-201ENST00000330070 GDPD4Q6W3E5 623 aa20.25■□□□□ 0.83
HOXB2-201ENST00000330070 RAPGEF5Q92565 580 aa20.25■□□□□ 0.83
HOXB2-201ENST00000330070 FATE1Q969F0 183 aa20.25■□□□□ 0.83
HOXB2-201ENST00000330070 SKA1Q96BD8 255 aa20.25■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34 ms