RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000298454.3

VSTM4-201, Transcript of V-set and transmembrane domain containing 4, humanhuman

APPRIS P3 TSL 2 BASIC

Gene VSTM4, Length 2,170 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VSTM4-201ENST00000298454 LCHNA4D1U4 455 aa23.04■■□□□ 1.28
VSTM4-201ENST00000298454 VAPBO95292 243 aa23.04■■□□□ 1.28
VSTM4-201ENST00000298454 HDCP19113 662 aa23.04■■□□□ 1.28
VSTM4-201ENST00000298454 SPRP35270 261 aaPredicted RBP23.04■■□□□ 1.28
VSTM4-201ENST00000298454 ZNF177Q13360 481 aaPredicted RBP23.04■■□□□ 1.28
VSTM4-201ENST00000298454 PABPC1LQ4VXU2 614 aaKnown RBP23.04■■□□□ 1.28
VSTM4-201ENST00000298454 GAREM2Q75VX8 874 aa23.04■■□□□ 1.28
VSTM4-201ENST00000298454 CMC1Q7Z7K0 106 aa23.04■■□□□ 1.28
VSTM4-201ENST00000298454 TTC16Q8NEE8 873 aa23.04■■□□□ 1.28
VSTM4-201ENST00000298454 ACMSDQ8TDX5 336 aa23.04■■□□□ 1.28
VSTM4-201ENST00000298454 PRKAG3Q9UGI9 489 aa23.04■■□□□ 1.28
VSTM4-201ENST00000298454 SSX2IPQ9Y2D8 614 aa23.04■■□□□ 1.28
VSTM4-201ENST00000298454 CPQQ9Y646 472 aa23.04■■□□□ 1.28
VSTM4-201ENST00000298454 A0A1B0GVM2 712 aa23.04■■□□□ 1.28
VSTM4-201ENST00000298454 TCAF2A6NFQ2 919 aa23.04■■□□□ 1.28
VSTM4-201ENST00000298454 BGNP21810 368 aa23.04■■□□□ 1.28
VSTM4-201ENST00000298454 ARNTP27540 789 aa23.04■■□□□ 1.28
VSTM4-201ENST00000298454 GMPRP36959 345 aa23.04■■□□□ 1.28
VSTM4-201ENST00000298454 CORO7P57737 925 aa23.04■■□□□ 1.28
VSTM4-201ENST00000298454 ERVFC1P60507 584 aa23.04■■□□□ 1.28
VSTM4-201ENST00000298454 CNGA3Q16281 694 aa23.04■■□□□ 1.28
VSTM4-201ENST00000298454 TMEM240Q5SV17 173 aa23.04■■□□□ 1.28
VSTM4-201ENST00000298454 LILRA6Q6PI73 481 aa23.04■■□□□ 1.28
VSTM4-201ENST00000298454 OTOAQ7RTW8 1153 aa23.04■■□□□ 1.28
VSTM4-201ENST00000298454 HERC6Q8IVU3 1022 aa23.04■■□□□ 1.28
VSTM4-201ENST00000298454 PTCD2Q8WV60 388 aaKnown RBP23.04■■□□□ 1.28
VSTM4-201ENST00000298454 ZNF599Q96NL3 588 aa23.04■■□□□ 1.28
VSTM4-201ENST00000298454 MRM3Q9HC36 420 aaKnown RBP23.04■■□□□ 1.28
VSTM4-201ENST00000298454 STOML2Q9UJZ1 356 aa23.04■■□□□ 1.28
VSTM4-201ENST00000298454 MTO1Q9Y2Z2 717 aaKnown RBP23.04■■□□□ 1.28
VSTM4-201ENST00000298454 GREM1O60565 184 aa23.03■■□□□ 1.28
VSTM4-201ENST00000298454 OLFM2O95897 454 aa23.03■■□□□ 1.28
VSTM4-201ENST00000298454 LRG1P02750 347 aa23.03■■□□□ 1.28
VSTM4-201ENST00000298454 TYK2P29597 1187 aa23.03■■□□□ 1.28
VSTM4-201ENST00000298454 ARCN1P48444 511 aaKnown RBP23.03■■□□□ 1.28
VSTM4-201ENST00000298454 C1QTNF8P60827 252 aa23.03■■□□□ 1.28
VSTM4-201ENST00000298454 SPRED3Q2MJR0 410 aa23.03■■□□□ 1.28
VSTM4-201ENST00000298454 CCDC121Q6ZUS5 278 aa23.03■■□□□ 1.28
VSTM4-201ENST00000298454 CHST9Q7L1S5 443 aa23.03■■□□□ 1.28
VSTM4-201ENST00000298454 CCT6BQ92526 530 aa23.03■■□□□ 1.28
VSTM4-201ENST00000298454 TCF25Q9BQ70 676 aa23.03■■□□□ 1.28
VSTM4-201ENST00000298454 MCMBPQ9BTE3 642 aa23.03■■□□□ 1.28
VSTM4-201ENST00000298454 SNX15Q9NRS6 342 aa23.03■■□□□ 1.28
VSTM4-201ENST00000298454 TREX1Q9NSU2 369 aa23.03■■□□□ 1.28
VSTM4-201ENST00000298454 GGT7Q9UJ14 662 aa23.03■■□□□ 1.28
VSTM4-201ENST00000298454 MYLKQ15746 1914 aa23.03■■□□□ 1.28
VSTM4-201ENST00000298454 BPTFQ12830 3046 aa23.03■■□□□ 1.28
VSTM4-201ENST00000298454 E2F8A0AVK6 867 aa23.03■■□□□ 1.28
VSTM4-201ENST00000298454 ILVBLA1L0T0 632 aa23.03■■□□□ 1.28
VSTM4-201ENST00000298454 CCT8L1PA6NM43 557 aa23.03■■□□□ 1.28
VSTM4-201ENST00000298454 NRG2O14511 850 aaPredicted RBP23.03■■□□□ 1.28
VSTM4-201ENST00000298454 KDELR3O43731 214 aa23.03■■□□□ 1.28
VSTM4-201ENST00000298454 C8AP07357 584 aa23.03■■□□□ 1.28
VSTM4-201ENST00000298454 NEFHP12036 1026 aa23.03■■□□□ 1.28
VSTM4-201ENST00000298454 SERPINH1P50454 418 aaKnown RBP23.03■■□□□ 1.28
VSTM4-201ENST00000298454 OXCT1P55809 520 aa23.03■■□□□ 1.28
VSTM4-201ENST00000298454 MSLNQ13421 630 aaPredicted RBP23.03■■□□□ 1.28
VSTM4-201ENST00000298454 CXorf57Q6NSI4 855 aaKnown RBP23.03■■□□□ 1.28
VSTM4-201ENST00000298454 C16orf46Q6P387 395 aa23.03■■□□□ 1.28
VSTM4-201ENST00000298454 UBE2Q1Q7Z7E8 422 aa23.03■■□□□ 1.28
VSTM4-201ENST00000298454 TMC8Q8IU68 726 aa23.03■■□□□ 1.28
VSTM4-201ENST00000298454 ACVR1CQ8NER5 493 aa23.03■■□□□ 1.28
VSTM4-201ENST00000298454 TBC1D30Q9Y2I9 924 aa23.03■■□□□ 1.28
VSTM4-201ENST00000298454 ARL2BPQ9Y2Y0 163 aa23.03■■□□□ 1.28
VSTM4-201ENST00000298454 ASB3Q9Y575 518 aa23.03■■□□□ 1.28
VSTM4-201ENST00000298454 SIRPB2Q5JXA9 342 aa23.02■■□□□ 1.28
VSTM4-201ENST00000298454 SETD3Q86TU7 594 aaPredicted RBP23.02■■□□□ 1.28
VSTM4-201ENST00000298454 DDX50Q9BQ39 737 aaKnown RBP23.02■■□□□ 1.28
VSTM4-201ENST00000298454 LRRC3Q9BY71 257 aa23.02■■□□□ 1.28
VSTM4-201ENST00000298454 CAB39LQ9H9S4 337 aa23.02■■□□□ 1.28
VSTM4-201ENST00000298454 UBA2Q9UBT2 640 aaPredicted RBP23.02■■□□□ 1.28
VSTM4-201ENST00000298454 LOC285095A0A1B0GVY8 99 aa23.01■■□□□ 1.27
VSTM4-201ENST00000298454 ADH1AP07327 375 aa23.01■■□□□ 1.27
VSTM4-201ENST00000298454 ATXN1LP0C7T5 689 aaKnown RBP23.01■■□□□ 1.27
VSTM4-201ENST00000298454 IRX4P78413 519 aa23.01■■□□□ 1.27
VSTM4-201ENST00000298454 RNF219Q5W0B1 726 aaPredicted RBP23.01■■□□□ 1.27
VSTM4-201ENST00000298454 DENND6AQ8IWF6 608 aa23.01■■□□□ 1.27
VSTM4-201ENST00000298454 MAB21L3Q8N8X9 362 aa23.01■■□□□ 1.27
VSTM4-201ENST00000298454 ABCF3Q9NUQ8 709 aa23.01■■□□□ 1.27
VSTM4-201ENST00000298454 EMCNQ9ULC0 261 aa23.01■■□□□ 1.27
VSTM4-201ENST00000298454 PLXNA4Q9HCM2 1894 aa23.01■■□□□ 1.27
VSTM4-201ENST00000298454 CHD5Q8TDI0 1954 aa23.01■■□□□ 1.27
VSTM4-201ENST00000298454 HIDE1A8MVS5 230 aa23.01■■□□□ 1.27
VSTM4-201ENST00000298454 CBX4O00257 560 aa23.01■■□□□ 1.27
VSTM4-201ENST00000298454 GJA1P17302 382 aa23.01■■□□□ 1.27
VSTM4-201ENST00000298454 CSE1LP55060 971 aaKnown RBP23.01■■□□□ 1.27
VSTM4-201ENST00000298454 FSCBQ5H9T9 825 aa23.01■■□□□ 1.27
VSTM4-201ENST00000298454 KREMEN2Q8NCW0 462 aa23.01■■□□□ 1.27
VSTM4-201ENST00000298454 ISL2Q96A47 359 aa23.01■■□□□ 1.27
VSTM4-201ENST00000298454 VPS39Q96JC1 886 aa23.01■■□□□ 1.27
VSTM4-201ENST00000298454 ACE2Q9BYF1 805 aaPredicted RBP23.01■■□□□ 1.27
VSTM4-201ENST00000298454 MYO1CO00159 1063 aa23■■□□□ 1.27
VSTM4-201ENST00000298454 TBL1XO60907 577 aa23■■□□□ 1.27
VSTM4-201ENST00000298454 GLRA3O75311 464 aa23■■□□□ 1.27
VSTM4-201ENST00000298454 GABRB3P28472 473 aa23■■□□□ 1.27
VSTM4-201ENST00000298454 MAGEA12P43365 314 aa23■■□□□ 1.27
VSTM4-201ENST00000298454 CTBP1Q13363 440 aa23■■□□□ 1.27
VSTM4-201ENST00000298454 DLG2Q15700 870 aa23■■□□□ 1.27
VSTM4-201ENST00000298454 N4BP2L1Q5TBK1 243 aaPredicted RBP23■■□□□ 1.27
VSTM4-201ENST00000298454 TRPM8Q7Z2W7 1104 aa23■■□□□ 1.27
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