RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000296642.4

PGGT1B-201, Transcript of protein geranylgeranyltransferase type I subunit beta, humanhuman

TSL 3

Gene PGGT1B, Length 552 nt, Biotype processed transcript.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1B-201ENST00000296642 KIAA0895Q8NCT3 520 aa8.02□□□□□ -1.13
PGGT1B-201ENST00000296642 OR2A12Q8NGT7 310 aa8.02□□□□□ -1.13
PGGT1B-201ENST00000296642 GRIN3AQ8TCU5 1115 aa8.02□□□□□ -1.13
PGGT1B-201ENST00000296642 KCTD12Q96CX2 325 aaKnown RBP8.02□□□□□ -1.13
PGGT1B-201ENST00000296642 PPP1R13BQ96KQ4 1090 aa8.02□□□□□ -1.13
PGGT1B-201ENST00000296642 HEPHQ9BQS7 1158 aa8.02□□□□□ -1.13
PGGT1B-201ENST00000296642 ASPSCR1Q9BZE9 553 aa8.02□□□□□ -1.13
PGGT1B-201ENST00000296642 FOXP3Q9BZS1 431 aa8.02□□□□□ -1.13
PGGT1B-201ENST00000296642 CEP44Q9C0F1 390 aa8.02□□□□□ -1.13
PGGT1B-201ENST00000296642 CDH19Q9H159 772 aa8.02□□□□□ -1.13
PGGT1B-201ENST00000296642 GPR34Q9UPC5 381 aa8.02□□□□□ -1.13
PGGT1B-201ENST00000296642 ZFR2Q9UPR6 939 aaKnown RBP8.02□□□□□ -1.13
PGGT1B-201ENST00000296642 FADS3Q9Y5Q0 445 aa8.02□□□□□ -1.13
PGGT1B-201ENST00000296642 PMS2P1A4D2B8 440 aa8.01□□□□□ -1.13
PGGT1B-201ENST00000296642 PIK3R2O00459 728 aa8.01□□□□□ -1.13
PGGT1B-201ENST00000296642 HGSO14964 777 aaPredicted RBP8.01□□□□□ -1.13
PGGT1B-201ENST00000296642 MED7O43513 233 aa8.01□□□□□ -1.13
PGGT1B-201ENST00000296642 LEFTY1O75610 366 aa8.01□□□□□ -1.13
PGGT1B-201ENST00000296642 HGFP14210 728 aa8.01□□□□□ -1.13
PGGT1B-201ENST00000296642 SYT1P21579 422 aa8.01□□□□□ -1.13
PGGT1B-201ENST00000296642 ME1P48163 572 aa8.01□□□□□ -1.13
PGGT1B-201ENST00000296642 PEX5P50542 639 aa8.01□□□□□ -1.13
PGGT1B-201ENST00000296642 RIPPLY3P57055 190 aa8.01□□□□□ -1.13
PGGT1B-201ENST00000296642 GEMIN4P57678 1058 aaKnown RBP8.01□□□□□ -1.13
PGGT1B-201ENST00000296642 CYP4F2P78329 520 aa8.01□□□□□ -1.13
PGGT1B-201ENST00000296642 CCL7P80098 99 aa8.01□□□□□ -1.13
PGGT1B-201ENST00000296642 EIF2B5Q13144 721 aaKnown RBP8.01□□□□□ -1.13
PGGT1B-201ENST00000296642 PEX6Q13608 980 aa8.01□□□□□ -1.13
PGGT1B-201ENST00000296642 DRAP1Q14919 205 aaPredicted RBP8.01□□□□□ -1.13
PGGT1B-201ENST00000296642 MAP9Q49MG5 647 aa8.01□□□□□ -1.13
PGGT1B-201ENST00000296642 LACTB2Q53H82 288 aaPredicted RBP8.01□□□□□ -1.13
PGGT1B-201ENST00000296642 CXorf57Q6NSI4 855 aaKnown RBP8.01□□□□□ -1.13
PGGT1B-201ENST00000296642 FAM173BQ6P4H8 233 aa8.01□□□□□ -1.13
PGGT1B-201ENST00000296642 C22orf39Q6P5X5 142 aa8.01□□□□□ -1.13
PGGT1B-201ENST00000296642 TMEM270Q6UE05 265 aa8.01□□□□□ -1.13
PGGT1B-201ENST00000296642 B3GNT8Q7Z7M8 397 aa8.01□□□□□ -1.13
PGGT1B-201ENST00000296642 SETD3Q86TU7 594 aaPredicted RBP8.01□□□□□ -1.13
PGGT1B-201ENST00000296642 PIM3Q86V86 326 aa8.01□□□□□ -1.13
PGGT1B-201ENST00000296642 HEATR4Q86WZ0 1026 aa8.01□□□□□ -1.13
PGGT1B-201ENST00000296642 ZFAND4Q86XD8 727 aa8.01□□□□□ -1.13
PGGT1B-201ENST00000296642 PCDH20Q8N6Y1 951 aaKnown RBP8.01□□□□□ -1.13
PGGT1B-201ENST00000296642 DCAF4L2Q8NA75 395 aa8.01□□□□□ -1.13
PGGT1B-201ENST00000296642 CXorf40AQ8TE69 158 aa8.01□□□□□ -1.13
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PGGT1B-201ENST00000296642 TAAR9Q96RI9 348 aa8.01□□□□□ -1.13
PGGT1B-201ENST00000296642 TSG101Q99816 390 aa8.01□□□□□ -1.13
PGGT1B-201ENST00000296642 LRRC61Q9BV99 259 aa8.01□□□□□ -1.13
PGGT1B-201ENST00000296642 C1QTNF2Q9BXJ5 285 aa8.01□□□□□ -1.13
PGGT1B-201ENST00000296642 SLC12A9Q9BXP2 914 aa8.01□□□□□ -1.13
PGGT1B-201ENST00000296642 OSBPL1AQ9BXW6 950 aa8.01□□□□□ -1.13
PGGT1B-201ENST00000296642 EDEM3Q9BZQ6 932 aa8.01□□□□□ -1.13
PGGT1B-201ENST00000296642 THAP9Q9H5L6 903 aa8.01□□□□□ -1.13
PGGT1B-201ENST00000296642 CUEDC1Q9NWM3 386 aaPredicted RBP8.01□□□□□ -1.13
PGGT1B-201ENST00000296642 SIRPGQ9P1W8 387 aa8.01□□□□□ -1.13
PGGT1B-201ENST00000296642 APPL1Q9UKG1 709 aa8.01□□□□□ -1.13
PGGT1B-201ENST00000296642 NAALADL1Q9UQQ1 740 aa8.01□□□□□ -1.13
PGGT1B-201ENST00000296642 TBC1D30Q9Y2I9 924 aa8.01□□□□□ -1.13
PGGT1B-201ENST00000296642 PCDHB4Q9Y5E5 795 aa8.01□□□□□ -1.13
PGGT1B-201ENST00000296642 UBR5O95071 2799 aaPredicted RBP8.01□□□□□ -1.13
PGGT1B-201ENST00000296642 TRPM6Q9BX84 2022 aa8□□□□□ -1.13
PGGT1B-201ENST00000296642 MKRN2OSH3BPM6 223 aa8□□□□□ -1.13
PGGT1B-201ENST00000296642 GCATO75600 419 aa8□□□□□ -1.13
PGGT1B-201ENST00000296642 TM7SF2O76062 418 aa8□□□□□ -1.13
PGGT1B-201ENST00000296642 CPNE6O95741 557 aa8□□□□□ -1.13
PGGT1B-201ENST00000296642 TNFP01375 233 aa8□□□□□ -1.13
PGGT1B-201ENST00000296642 CTSLP07711 333 aa8□□□□□ -1.13
PGGT1B-201ENST00000296642 GLI1P08151 1106 aa8□□□□□ -1.13
PGGT1B-201ENST00000296642 ITIH1P19827 911 aa8□□□□□ -1.13
PGGT1B-201ENST00000296642 XPAP23025 273 aaPredicted RBP8□□□□□ -1.13
PGGT1B-201ENST00000296642 KELP23276 732 aa8□□□□□ -1.13
PGGT1B-201ENST00000296642 CASP1P29466 404 aa8□□□□□ -1.13
PGGT1B-201ENST00000296642 ETFBP38117 255 aa8□□□□□ -1.13
PGGT1B-201ENST00000296642 EIF4A3P38919 411 aaKnown RBP8□□□□□ -1.13
PGGT1B-201ENST00000296642 CD97P48960 835 aa8□□□□□ -1.13
PGGT1B-201ENST00000296642 DNA2P51530 1060 aa8□□□□□ -1.13
PGGT1B-201ENST00000296642 HK3P52790 923 aa8□□□□□ -1.13
PGGT1B-201ENST00000296642 RAD51Q06609 339 aa8□□□□□ -1.13
PGGT1B-201ENST00000296642 ZFP36L1Q07352 338 aaKnown RBP8□□□□□ -1.13
PGGT1B-201ENST00000296642 TRA2AQ13595 282 aaKnown RBP eCLIP8□□□□□ -1.13
PGGT1B-201ENST00000296642 AUHQ13825 339 aaKnown RBP8□□□□□ -1.13
PGGT1B-201ENST00000296642 POLD3Q15054 466 aaPredicted RBP8□□□□□ -1.13
PGGT1B-201ENST00000296642 EDRF1Q3B7T1 1238 aa8□□□□□ -1.13
PGGT1B-201ENST00000296642 DCAF17Q5H9S7 520 aaPredicted RBP8□□□□□ -1.13
PGGT1B-201ENST00000296642 FBXL22Q6P050 247 aa8□□□□□ -1.13
PGGT1B-201ENST00000296642 SHC4Q6S5L8 630 aa8□□□□□ -1.13
PGGT1B-201ENST00000296642 ZNF783Q6ZMS7 281 aa8□□□□□ -1.13
PGGT1B-201ENST00000296642 HID1Q8IV36 788 aa8□□□□□ -1.13
PGGT1B-201ENST00000296642 RBFAQ8N0V3 343 aa8□□□□□ -1.13
PGGT1B-201ENST00000296642 GUF1Q8N442 669 aaKnown RBP8□□□□□ -1.13
PGGT1B-201ENST00000296642 RYBPQ8N488 228 aaPredicted RBP8□□□□□ -1.13
PGGT1B-201ENST00000296642 PCDH19Q8TAB3 1148 aa8□□□□□ -1.13
PGGT1B-201ENST00000296642 KIAA1524Q8TCG1 905 aa8□□□□□ -1.13
PGGT1B-201ENST00000296642 SSC4DQ8WTU2 575 aa8□□□□□ -1.13
PGGT1B-201ENST00000296642 STK32AQ8WU08 396 aa8□□□□□ -1.13
PGGT1B-201ENST00000296642 HTR3CQ8WXA8 447 aa8□□□□□ -1.13
PGGT1B-201ENST00000296642 SEMA4DQ92854 862 aa8□□□□□ -1.13
PGGT1B-201ENST00000296642 MYEOVQ96EZ4 313 aa8□□□□□ -1.13
PGGT1B-201ENST00000296642 EEF2KMTQ96G04 330 aa8□□□□□ -1.13
PGGT1B-201ENST00000296642 NT5C1BQ96P26 610 aa8□□□□□ -1.13
PGGT1B-201ENST00000296642 TEFMQ96QE5 360 aaKnown RBP8□□□□□ -1.13
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