RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000288840.9

SMAD6-201, Transcript of SMAD family member 6, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SMAD6, Length 3,835 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD6-201ENST00000288840 CYGBQ8WWM9 190 aa16.09■□□□□ 0.17
SMAD6-201ENST00000288840 TMEM209Q96SK2 561 aa16.09■□□□□ 0.17
SMAD6-201ENST00000288840 SLC39A3Q9BRY0 314 aa16.09■□□□□ 0.17
SMAD6-201ENST00000288840 VRTNQ9H8Y1 702 aa16.09■□□□□ 0.17
SMAD6-201ENST00000288840 CNGB3Q9NQW8 809 aa16.09■□□□□ 0.17
SMAD6-201ENST00000288840 MAGEB16A2A368 324 aa16.08■□□□□ 0.17
SMAD6-201ENST00000288840 PALM2-AKAP2B1ALY0 433 aaPredicted RBP16.08■□□□□ 0.17
SMAD6-201ENST00000288840 E5RI56 91 aa16.08■□□□□ 0.17
SMAD6-201ENST00000288840 CASQ2O14958 399 aaPredicted RBP16.08■□□□□ 0.17
SMAD6-201ENST00000288840 ZBTB14O43829 449 aa16.08■□□□□ 0.17
SMAD6-201ENST00000288840 RHOBTB1O94844 696 aa16.08■□□□□ 0.17
SMAD6-201ENST00000288840 XRCC1P18887 633 aaPredicted RBP16.08■□□□□ 0.17
SMAD6-201ENST00000288840 ITGAXP20702 1163 aa16.08■□□□□ 0.17
SMAD6-201ENST00000288840 PSEN1P49768 467 aa16.08■□□□□ 0.17
SMAD6-201ENST00000288840 TSTA3Q13630 321 aaPredicted RBP16.08■□□□□ 0.17
SMAD6-201ENST00000288840 PTPRCAPQ14761 206 aa16.08■□□□□ 0.17
SMAD6-201ENST00000288840 SFT2D3Q587I9 215 aa16.08■□□□□ 0.17
SMAD6-201ENST00000288840 ESAMQ96AP7 390 aa16.08■□□□□ 0.17
SMAD6-201ENST00000288840 CCDC106Q9BWC9 280 aa16.08■□□□□ 0.17
SMAD6-201ENST00000288840 UBE2OQ9C0C9 1292 aaKnown RBP16.08■□□□□ 0.17
SMAD6-201ENST00000288840 EML4Q9HC35 981 aaKnown RBP16.08■□□□□ 0.17
SMAD6-201ENST00000288840 ANGPTL3Q9Y5C1 460 aa16.08■□□□□ 0.17
SMAD6-201ENST00000288840 DNAJC25-GNG10A0A024R161 153 aa16.08■□□□□ 0.16
SMAD6-201ENST00000288840 IQCA1LA6NCM1 817 aa16.08■□□□□ 0.16
SMAD6-201ENST00000288840 VCLP18206 1134 aa16.08■□□□□ 0.16
SMAD6-201ENST00000288840 ITGB6P18564 788 aa16.08■□□□□ 0.16
SMAD6-201ENST00000288840 THOP1P52888 689 aa16.08■□□□□ 0.16
SMAD6-201ENST00000288840 TWF1Q12792 350 aa16.08■□□□□ 0.16
SMAD6-201ENST00000288840 C6orf10Q5SRN2 563 aa16.08■□□□□ 0.16
SMAD6-201ENST00000288840 SHCBP1Q8NEM2 672 aa16.08■□□□□ 0.16
SMAD6-201ENST00000288840 ARNTL2Q8WYA1 636 aa16.08■□□□□ 0.16
SMAD6-201ENST00000288840 CNDP1Q96KN2 507 aa16.08■□□□□ 0.16
SMAD6-201ENST00000288840 ZNF512Q96ME7 567 aaPredicted RBP16.08■□□□□ 0.16
SMAD6-201ENST00000288840 ANKRD27Q96NW4 1050 aa16.08■□□□□ 0.16
SMAD6-201ENST00000288840 NPY6RQ99463 290 aa16.08■□□□□ 0.16
SMAD6-201ENST00000288840 CCT7Q99832 543 aa16.08■□□□□ 0.16
SMAD6-201ENST00000288840 RGS18Q9NS28 235 aa16.08■□□□□ 0.16
SMAD6-201ENST00000288840 FBXW11Q9UKB1 542 aa16.08■□□□□ 0.16
SMAD6-201ENST00000288840 ABT1Q9ULW3 272 aaKnown RBP16.08■□□□□ 0.16
SMAD6-201ENST00000288840 FAF1Q9UNN5 650 aaPredicted RBP16.08■□□□□ 0.16
SMAD6-201ENST00000288840 PCDHB12Q9Y5F1 795 aa16.08■□□□□ 0.16
SMAD6-201ENST00000288840 SMIM35A0A1B0GVV1 85 aa16.08■□□□□ 0.16
SMAD6-201ENST00000288840 PABPN1LA6NDY0 278 aaKnown RBP16.08■□□□□ 0.16
SMAD6-201ENST00000288840 SNX2O60749 519 aa16.08■□□□□ 0.16
SMAD6-201ENST00000288840 APOA4P06727 396 aa16.08■□□□□ 0.16
SMAD6-201ENST00000288840 CHRM3P20309 590 aa16.08■□□□□ 0.16
SMAD6-201ENST00000288840 GRK4P32298 578 aa16.08■□□□□ 0.16
SMAD6-201ENST00000288840 CRYBB1P53674 252 aaPredicted RBP16.08■□□□□ 0.16
SMAD6-201ENST00000288840 PSMD5Q16401 504 aa16.08■□□□□ 0.16
SMAD6-201ENST00000288840 ZNF792Q3KQV3 632 aa16.08■□□□□ 0.16
SMAD6-201ENST00000288840 C6orf52Q5T4I8 152 aa16.08■□□□□ 0.16
SMAD6-201ENST00000288840 CES4AQ5XG92 561 aa16.08■□□□□ 0.16
SMAD6-201ENST00000288840 FAM117BQ6P1L5 589 aa16.08■□□□□ 0.16
SMAD6-201ENST00000288840 GLB1LQ6UWU2 654 aa16.08■□□□□ 0.16
SMAD6-201ENST00000288840 BBS5Q8N3I7 341 aa16.08■□□□□ 0.16
SMAD6-201ENST00000288840 ENDOVQ8N8Q3 282 aaKnown RBP16.08■□□□□ 0.16
SMAD6-201ENST00000288840 ATAD1Q8NBU5 361 aa16.08■□□□□ 0.16
SMAD6-201ENST00000288840 GIPC2Q8TF65 315 aa16.08■□□□□ 0.16
SMAD6-201ENST00000288840 FBXO32Q969P5 355 aa16.08■□□□□ 0.16
SMAD6-201ENST00000288840 HBEGFQ99075 208 aa16.08■□□□□ 0.16
SMAD6-201ENST00000288840 GBA3Q9H227 469 aa16.08■□□□□ 0.16
SMAD6-201ENST00000288840 MRPL46Q9H2W6 279 aaKnown RBP16.08■□□□□ 0.16
SMAD6-201ENST00000288840 RHOJQ9H4E5 214 aa16.08■□□□□ 0.16
SMAD6-201ENST00000288840 MID1IP1Q9NPA3 183 aa16.08■□□□□ 0.16
SMAD6-201ENST00000288840 A8MX80 341 aa16.07■□□□□ 0.16
SMAD6-201ENST00000288840 NT5C1B-RDH14C9J2C7 533 aa16.07■□□□□ 0.16
SMAD6-201ENST00000288840 TRAFD1O14545 582 aaPredicted RBP16.07■□□□□ 0.16
SMAD6-201ENST00000288840 KLF11O14901 512 aa16.07■□□□□ 0.16
SMAD6-201ENST00000288840 MT-ND1P03886 318 aa16.07■□□□□ 0.16
SMAD6-201ENST00000288840 ARSAP15289 507 aa16.07■□□□□ 0.16
SMAD6-201ENST00000288840 MAPK10P53779 464 aa16.07■□□□□ 0.16
SMAD6-201ENST00000288840 GALNT3Q14435 633 aa16.07■□□□□ 0.16
SMAD6-201ENST00000288840 TEKT5Q96M29 485 aa16.07■□□□□ 0.16
SMAD6-201ENST00000288840 OLFM3Q96PB7 478 aa16.07■□□□□ 0.16
SMAD6-201ENST00000288840 EMCNQ9ULC0 261 aa16.07■□□□□ 0.16
SMAD6-201ENST00000288840 ARL5CA6NH57 179 aa16.07■□□□□ 0.16
SMAD6-201ENST00000288840 NDUFS3O75489 264 aa16.07■□□□□ 0.16
SMAD6-201ENST00000288840 OR1E1P30953 314 aa16.07■□□□□ 0.16
SMAD6-201ENST00000288840 TOP6BLQ8N6T0 577 aa16.07■□□□□ 0.16
SMAD6-201ENST00000288840 JADE3Q92613 823 aa16.07■□□□□ 0.16
SMAD6-201ENST00000288840 SLC39A8Q9C0K1 460 aa16.07■□□□□ 0.16
SMAD6-201ENST00000288840 GLOD4Q9HC38 313 aa16.07■□□□□ 0.16
SMAD6-201ENST00000288840 SEMA4BQ9NPR2 832 aaPredicted RBP16.07■□□□□ 0.16
SMAD6-201ENST00000288840 CNTN3Q9P232 1028 aa16.07■□□□□ 0.16
SMAD6-201ENST00000288840 TLL2Q9Y6L7 1015 aa16.07■□□□□ 0.16
SMAD6-201ENST00000288840 A0A088AWK7 358 aa16.07■□□□□ 0.16
SMAD6-201ENST00000288840 ZNF839A8K0R7 811 aa16.07■□□□□ 0.16
SMAD6-201ENST00000288840 MRASO14807 208 aa16.07■□□□□ 0.16
SMAD6-201ENST00000288840 SRP72O76094 671 aaKnown RBP16.07■□□□□ 0.16
SMAD6-201ENST00000288840 TAZQ16635 292 aa16.07■□□□□ 0.16
SMAD6-201ENST00000288840 RBM20Q5T481 1227 aaKnown RBP16.07■□□□□ 0.16
SMAD6-201ENST00000288840 GPR158Q5T848 1215 aa16.07■□□□□ 0.16
SMAD6-201ENST00000288840 HEXDCQ8WVB3 486 aa16.07■□□□□ 0.16
SMAD6-201ENST00000288840 CCDC97Q96F63 343 aaPredicted RBP16.07■□□□□ 0.16
SMAD6-201ENST00000288840 NFKBIZQ9BYH8 718 aa16.07■□□□□ 0.16
SMAD6-201ENST00000288840 GIMAP2Q9UG22 337 aa16.07■□□□□ 0.16
SMAD6-201ENST00000288840 SUN2Q9UH99 717 aa16.07■□□□□ 0.16
SMAD6-201ENST00000288840 TRPC5OSA6NMA1 111 aa16.06■□□□□ 0.16
SMAD6-201ENST00000288840 PIRO00625 290 aa16.06■□□□□ 0.16
SMAD6-201ENST00000288840 DNAJA2O60884 412 aa16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20 ms