RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000285681.6

USP25-202, Transcript of ubiquitin specific peptidase 25, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene USP25, Length 5,216 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP25-202ENST00000285681 CFAP97Q9P2B7 532 aa20.45■□□□□ 0.86
USP25-202ENST00000285681 DDX20Q9UHI6 824 aaKnown RBP20.45■□□□□ 0.86
USP25-202ENST00000285681 PCDHB9Q9Y5E1 797 aa20.45■□□□□ 0.86
USP25-202ENST00000285681 A0A1W2PQH9 124 aa20.44■□□□□ 0.86
USP25-202ENST00000285681 PEX10O60683 326 aa20.44■□□□□ 0.86
USP25-202ENST00000285681 MAGEC1O60732 1142 aa20.44■□□□□ 0.86
USP25-202ENST00000285681 ARL2P36404 184 aa20.44■□□□□ 0.86
USP25-202ENST00000285681 SULT2A1Q06520 285 aa20.44■□□□□ 0.86
USP25-202ENST00000285681 GPR158Q5T848 1215 aa20.44■□□□□ 0.86
USP25-202ENST00000285681 FAM228AQ86W67 206 aa20.44■□□□□ 0.86
USP25-202ENST00000285681 BTN2A3PQ96KV6 586 aa20.44■□□□□ 0.86
USP25-202ENST00000285681 KLHL4Q9C0H6 718 aa20.44■□□□□ 0.86
USP25-202ENST00000285681 PDZD7Q9H5P4 517 aa20.44■□□□□ 0.86
USP25-202ENST00000285681 DHX33Q9H6R0 707 aaKnown RBP20.44■□□□□ 0.86
USP25-202ENST00000285681 SOHLH2Q9NX45 425 aa20.44■□□□□ 0.86
USP25-202ENST00000285681 AP4S1Q9Y587 144 aa20.44■□□□□ 0.86
USP25-202ENST00000285681 SAC3D1A6NKF1 404 aa20.44■□□□□ 0.86
USP25-202ENST00000285681 CLDN11O75508 207 aa20.44■□□□□ 0.86
USP25-202ENST00000285681 NUDT14O95848 222 aa20.44■□□□□ 0.86
USP25-202ENST00000285681 NTSP30990 170 aa20.44■□□□□ 0.86
USP25-202ENST00000285681 TLX1P31314 330 aaPredicted RBP20.44■□□□□ 0.86
USP25-202ENST00000285681 VN1R5Q7Z5H4 357 aa20.44■□□□□ 0.86
USP25-202ENST00000285681 EBNA1BP2Q99848 306 aaKnown RBP20.44■□□□□ 0.86
USP25-202ENST00000285681 RHBGQ9H310 441 aa20.44■□□□□ 0.86
USP25-202ENST00000285681 SGTAO43765 313 aa20.44■□□□□ 0.86
USP25-202ENST00000285681 TSPAN1O60635 241 aa20.44■□□□□ 0.86
USP25-202ENST00000285681 SMPD1P17405 629 aa20.44■□□□□ 0.86
USP25-202ENST00000285681 CTPS1P17812 591 aa20.44■□□□□ 0.86
USP25-202ENST00000285681 TFEBP19484 476 aa20.44■□□□□ 0.86
USP25-202ENST00000285681 NOS3P29474 1203 aa20.44■□□□□ 0.86
USP25-202ENST00000285681 NEK3P51956 506 aa20.44■□□□□ 0.86
USP25-202ENST00000285681 MRPS15P82914 257 aaKnown RBP20.44■□□□□ 0.86
USP25-202ENST00000285681 PTPN20Q4JDL3 420 aa20.44■□□□□ 0.86
USP25-202ENST00000285681 DPP10Q8N608 796 aa20.44■□□□□ 0.86
USP25-202ENST00000285681 TPD52L3Q96J77 140 aa20.44■□□□□ 0.86
USP25-202ENST00000285681 KREMEN1Q96MU8 473 aa20.44■□□□□ 0.86
USP25-202ENST00000285681 B3GNT5Q9BYG0 378 aa20.44■□□□□ 0.86
USP25-202ENST00000285681 PDP2Q9P2J9 529 aa20.44■□□□□ 0.86
USP25-202ENST00000285681 TMEM191CA6NGB0 347 aa20.44■□□□□ 0.86
USP25-202ENST00000285681 FSCN2O14926 492 aa20.44■□□□□ 0.86
USP25-202ENST00000285681 CILPO75339 1184 aa20.44■□□□□ 0.86
USP25-202ENST00000285681 ATP6V1C1P21283 382 aa20.44■□□□□ 0.86
USP25-202ENST00000285681 PCDH18Q9HCL0 1135 aa20.44■□□□□ 0.86
USP25-202ENST00000285681 TMPRSS4Q9NRS4 437 aa20.44■□□□□ 0.86
USP25-202ENST00000285681 OR4Q2P0C623 313 aa20.43■□□□□ 0.86
USP25-202ENST00000285681 ACTRT2Q8TDY3 377 aa20.43■□□□□ 0.86
USP25-202ENST00000285681 IKZF4Q9H2S9 585 aa20.43■□□□□ 0.86
USP25-202ENST00000285681 ADRA1BP35368 520 aa20.43■□□□□ 0.86
USP25-202ENST00000285681 RXRGP48443 463 aa20.43■□□□□ 0.86
USP25-202ENST00000285681 GPR141Q7Z602 305 aa20.43■□□□□ 0.86
USP25-202ENST00000285681 LZTS1Q9Y250 596 aa20.43■□□□□ 0.86
USP25-202ENST00000285681 C3P01024 1663 aa20.43■□□□□ 0.86
USP25-202ENST00000285681 A0A0G2JLL6 359 aaPredicted RBP20.43■□□□□ 0.86
USP25-202ENST00000285681 RPA3P35244 121 aaPredicted RBP20.43■□□□□ 0.86
USP25-202ENST00000285681 PRRT2Q7Z6L0 340 aaPredicted RBP20.43■□□□□ 0.86
USP25-202ENST00000285681 LRRN4CLQ8ND94 238 aa20.43■□□□□ 0.86
USP25-202ENST00000285681 BTBD10Q9BSF8 475 aa20.43■□□□□ 0.86
USP25-202ENST00000285681 UGT2B28Q9BY64 529 aa20.43■□□□□ 0.86
USP25-202ENST00000285681 RERGLQ9H628 205 aa20.43■□□□□ 0.86
USP25-202ENST00000285681 ADGRA3Q8IWK6 1321 aa20.43■□□□□ 0.86
USP25-202ENST00000285681 ME2P23368 584 aa20.43■□□□□ 0.86
USP25-202ENST00000285681 WNT3AP56704 352 aa20.43■□□□□ 0.86
USP25-202ENST00000285681 GALNT3Q14435 633 aa20.43■□□□□ 0.86
USP25-202ENST00000285681 TCEA2Q15560 299 aa20.43■□□□□ 0.86
USP25-202ENST00000285681 PPP1R3FQ6ZSY5 799 aaPredicted RBP20.43■□□□□ 0.86
USP25-202ENST00000285681 EID3Q8N140 333 aa20.43■□□□□ 0.86
USP25-202ENST00000285681 NDNQ99608 321 aa20.43■□□□□ 0.86
USP25-202ENST00000285681 OXCT2Q9BYC2 517 aaPredicted RBP20.43■□□□□ 0.86
USP25-202ENST00000285681 ATAD3AQ9NVI7 634 aa20.43■□□□□ 0.86
USP25-202ENST00000285681 COL20A1Q9P218 1284 aa20.43■□□□□ 0.86
USP25-202ENST00000285681 SOWAHBA6NEL2 793 aa20.42■□□□□ 0.86
USP25-202ENST00000285681 NEDD8-MDP1E9PL57 170 aa20.42■□□□□ 0.86
USP25-202ENST00000285681 EPN2O95208 641 aa20.42■□□□□ 0.86
USP25-202ENST00000285681 MMP8P22894 467 aa20.42■□□□□ 0.86
USP25-202ENST00000285681 HNRNPH1P31943 449 aaKnown RBP20.42■□□□□ 0.86
USP25-202ENST00000285681 NAA20P61599 178 aa20.42■□□□□ 0.86
USP25-202ENST00000285681 ADRM1Q16186 407 aa20.42■□□□□ 0.86
USP25-202ENST00000285681 SAMD4BQ5PRF9 694 aaKnown RBP20.42■□□□□ 0.86
USP25-202ENST00000285681 POTEHQ6S545 545 aa20.42■□□□□ 0.86
USP25-202ENST00000285681 OTOP2Q7RTS6 562 aa20.42■□□□□ 0.86
USP25-202ENST00000285681 ROGDIQ9GZN7 287 aa20.42■□□□□ 0.86
USP25-202ENST00000285681 TBC1D14Q9P2M4 693 aa20.42■□□□□ 0.86
USP25-202ENST00000285681 CAB39Q9Y376 341 aaPredicted RBP20.42■□□□□ 0.86
USP25-202ENST00000285681 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP20.42■□□□□ 0.86
USP25-202ENST00000285681 RGS5O15539 181 aa20.42■□□□□ 0.86
USP25-202ENST00000285681 KHDRBS1Q07666 443 aaKnown RBP eCLIP20.42■□□□□ 0.867e-6■■■□□ 17.7
USP25-202ENST00000285681 NAT16Q8N8M0 369 aa20.42■□□□□ 0.86
USP25-202ENST00000285681 COPS8Q99627 209 aa20.42■□□□□ 0.86
USP25-202ENST00000285681 BRD9Q9H8M2 597 aa20.42■□□□□ 0.86
USP25-202ENST00000285681 ARMCX1Q9P291 453 aa20.42■□□□□ 0.86
USP25-202ENST00000285681 RCCD1A6NED2 376 aa20.42■□□□□ 0.86
USP25-202ENST00000285681 MSI1O43347 362 aaKnown RBP20.42■□□□□ 0.86
USP25-202ENST00000285681 MLYCDO95822 493 aa20.42■□□□□ 0.86
USP25-202ENST00000285681 LDLRP01130 860 aa20.42■□□□□ 0.86
USP25-202ENST00000285681 FAM187BQ17R55 369 aa20.42■□□□□ 0.86
USP25-202ENST00000285681 LRRN4Q8WUT4 740 aa20.42■□□□□ 0.86
USP25-202ENST00000285681 CLEC4DQ8WXI8 215 aa20.42■□□□□ 0.86
USP25-202ENST00000285681 FBXO5Q9UKT4 447 aa20.42■□□□□ 0.86
USP25-202ENST00000285681 CYP3A5P20815 502 aa20.42■□□□□ 0.86
USP25-202ENST00000285681 IL5RAQ01344 420 aa20.42■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.4 ms