RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000285679.10

USP25-201, Transcript of ubiquitin specific peptidase 25, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene USP25, Length 3,973 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP25-201ENST00000285679 MAP3K20Q9NYL2 800 aaKnown RBP15.48■□□□□ 0.07
USP25-201ENST00000285679 TIMM13Q9Y5L4 95 aaPredicted RBP15.48■□□□□ 0.07
USP25-201ENST00000285679 ERCC2P18074 760 aa15.48■□□□□ 0.07
USP25-201ENST00000285679 GSSP48637 474 aa15.48■□□□□ 0.07
USP25-201ENST00000285679 UGP2Q16851 508 aa15.48■□□□□ 0.07
USP25-201ENST00000285679 GALNT18Q6P9A2 607 aa15.48■□□□□ 0.07
USP25-201ENST00000285679 SH2D5Q6ZV89 423 aa15.48■□□□□ 0.07
USP25-201ENST00000285679 SHCBP1Q8NEM2 672 aa15.48■□□□□ 0.07
USP25-201ENST00000285679 FCRL3Q96P31 734 aaPredicted RBP15.48■□□□□ 0.07
USP25-201ENST00000285679 CYP3A43Q9HB55 503 aa15.48■□□□□ 0.07
USP25-201ENST00000285679 GIMAP2Q9UG22 337 aa15.48■□□□□ 0.07
USP25-201ENST00000285679 SNX10Q9Y5X0 201 aa15.48■□□□□ 0.07
USP25-201ENST00000285679 CCL22O00626 93 aa15.47■□□□□ 0.07
USP25-201ENST00000285679 HSPA1AP0DMV8 641 aaKnown RBP15.47■□□□□ 0.07
USP25-201ENST00000285679 HSPA1BP0DMV9 641 aaKnown RBP15.47■□□□□ 0.07
USP25-201ENST00000285679 CDH3P22223 829 aa15.47■□□□□ 0.07
USP25-201ENST00000285679 UGT1A1P22309 533 aa15.47■□□□□ 0.07
USP25-201ENST00000285679 UGT1A4P22310 534 aa15.47■□□□□ 0.07
USP25-201ENST00000285679 UGT1A3P35503 534 aa15.47■□□□□ 0.07
USP25-201ENST00000285679 UGT1A5P35504 534 aa15.47■□□□□ 0.07
USP25-201ENST00000285679 NFYCQ13952 458 aa15.47■□□□□ 0.07
USP25-201ENST00000285679 PPP1R3AQ16821 1122 aa15.47■□□□□ 0.07
USP25-201ENST00000285679 NAPEPLDQ6IQ20 393 aa15.47■□□□□ 0.07
USP25-201ENST00000285679 LDB1Q86U70 411 aaPredicted RBP15.47■□□□□ 0.07
USP25-201ENST00000285679 CAMK1DQ8IU85 385 aa15.47■□□□□ 0.07
USP25-201ENST00000285679 CROCCP3Q8IVE0 287 aa15.47■□□□□ 0.07
USP25-201ENST00000285679 CPNE9Q8IYJ1 553 aa15.47■□□□□ 0.07
USP25-201ENST00000285679 ACVR1CQ8NER5 493 aa15.47■□□□□ 0.07
USP25-201ENST00000285679 PPHLN1Q8NEY8 458 aaKnown RBP15.47■□□□□ 0.07
USP25-201ENST00000285679 SPATA22Q8NHS9 363 aa15.47■□□□□ 0.07
USP25-201ENST00000285679 FBXL20Q96IG2 436 aa15.47■□□□□ 0.07
USP25-201ENST00000285679 QKIQ96PU8 341 aaKnown RBP eCLIP15.47■□□□□ 0.072e-10■■■■■ 34
USP25-201ENST00000285679 VTI1BQ9UEU0 232 aa15.47■□□□□ 0.07
USP25-201ENST00000285679 SLCO1B7G3V0H7 640 aa15.47■□□□□ 0.07
USP25-201ENST00000285679 MAFO75444 373 aaPredicted RBP15.47■□□□□ 0.07
USP25-201ENST00000285679 NCK1P16333 377 aa15.47■□□□□ 0.07
USP25-201ENST00000285679 PAMP19021 973 aa15.47■□□□□ 0.07
USP25-201ENST00000285679 MAP3K7CLP57077 242 aa15.47■□□□□ 0.07
USP25-201ENST00000285679 SEMA5AQ13591 1074 aa15.47■□□□□ 0.07
USP25-201ENST00000285679 INSCQ1MX18 579 aa15.47■□□□□ 0.07
USP25-201ENST00000285679 SOWAHAQ2M3V2 549 aa15.47■□□□□ 0.07
USP25-201ENST00000285679 ARMCX2Q7L311 632 aa15.47■□□□□ 0.07
USP25-201ENST00000285679 STK32CQ86UX6 486 aa15.47■□□□□ 0.07
USP25-201ENST00000285679 TTC30AQ86WT1 665 aa15.47■□□□□ 0.07
USP25-201ENST00000285679 FTHL17Q9BXU8 183 aa15.47■□□□□ 0.07
USP25-201ENST00000285679 FBRSL1Q9HCM7 1045 aaKnown RBP15.47■□□□□ 0.07
USP25-201ENST00000285679 MOCS1Q9NZB8 636 aa15.47■□□□□ 0.07
USP25-201ENST00000285679 BTRCQ9Y297 605 aa15.47■□□□□ 0.07
USP25-201ENST00000285679 CRYL1Q9Y2S2 319 aa15.47■□□□□ 0.07
USP25-201ENST00000285679 TLL2Q9Y6L7 1015 aa15.47■□□□□ 0.07
USP25-201ENST00000285679 MICAL3Q7RTP6 2002 aa15.47■□□□□ 0.07
USP25-201ENST00000285679 DHRS12A0PJE2 317 aa15.47■□□□□ 0.07
USP25-201ENST00000285679 DENRO43583 198 aaKnown RBP15.47■□□□□ 0.07
USP25-201ENST00000285679 CES1P23141 567 aa15.47■□□□□ 0.07
USP25-201ENST00000285679 YWHAQP27348 245 aa15.47■□□□□ 0.07
USP25-201ENST00000285679 VPS26BQ4G0F5 336 aa15.47■□□□□ 0.07
USP25-201ENST00000285679 FAM91A1Q658Y4 838 aa15.47■□□□□ 0.07
USP25-201ENST00000285679 OTOP3Q7RTS5 596 aa15.47■□□□□ 0.07
USP25-201ENST00000285679 MIER2Q8N344 545 aa15.47■□□□□ 0.07
USP25-201ENST00000285679 ALG9Q9H6U8 611 aa15.47■□□□□ 0.07
USP25-201ENST00000285679 TRIM17Q9Y577 477 aa15.47■□□□□ 0.07
USP25-201ENST00000285679 FADS3Q9Y5Q0 445 aa15.47■□□□□ 0.07
USP25-201ENST00000285679 TMEM114B3SHH9 223 aa15.46■□□□□ 0.07
USP25-201ENST00000285679 ZNF182P17025 639 aaPredicted RBP15.46■□□□□ 0.07
USP25-201ENST00000285679 IMPG1Q17R60 797 aa15.46■□□□□ 0.07
USP25-201ENST00000285679 PABPC1LQ4VXU2 614 aaKnown RBP15.46■□□□□ 0.07
USP25-201ENST00000285679 SMYD1Q8NB12 490 aa15.46■□□□□ 0.07
USP25-201ENST00000285679 FNDC8Q8TC99 324 aa15.46■□□□□ 0.07
USP25-201ENST00000285679 GMPR2Q9P2T1 348 aaKnown RBP15.46■□□□□ 0.07
USP25-201ENST00000285679 CIDEBQ9UHD4 219 aa15.46■□□□□ 0.07
USP25-201ENST00000285679 TMA7Q9Y2S6 64 aaKnown RBP15.46■□□□□ 0.07
USP25-201ENST00000285679 ERI2A8K979 691 aaKnown RBP15.46■□□□□ 0.07
USP25-201ENST00000285679 H2AFYO75367 372 aaKnown RBP15.46■□□□□ 0.07
USP25-201ENST00000285679 CABYRO75952 493 aa15.46■□□□□ 0.07
USP25-201ENST00000285679 GNAO1P09471 354 aa15.46■□□□□ 0.07
USP25-201ENST00000285679 PITX1P78337 314 aaPredicted RBP15.46■□□□□ 0.07
USP25-201ENST00000285679 CXCL9Q07325 125 aa15.46■□□□□ 0.07
USP25-201ENST00000285679 ITGA7Q13683 1181 aa15.46■□□□□ 0.07
USP25-201ENST00000285679 SPIDRQ14159 915 aa15.46■□□□□ 0.07
USP25-201ENST00000285679 ZNF423Q2M1K9 1284 aa15.46■□□□□ 0.07
USP25-201ENST00000285679 CASP10Q92851 521 aa15.46■□□□□ 0.07
USP25-201ENST00000285679 PABPC5Q96DU9 382 aaKnown RBP15.46■□□□□ 0.07
USP25-201ENST00000285679 TCF12Q99081 682 aa15.46■□□□□ 0.07
USP25-201ENST00000285679 M0R3G1 203 aa15.46■□□□□ 0.06
USP25-201ENST00000285679 MATN2O00339 956 aa15.46■□□□□ 0.06
USP25-201ENST00000285679 ATP6V1B2P21281 511 aa15.46■□□□□ 0.06
USP25-201ENST00000285679 IL4RP24394 825 aa15.46■□□□□ 0.06
USP25-201ENST00000285679 DGCR6Q14129 220 aa15.46■□□□□ 0.06
USP25-201ENST00000285679 RGS21Q2M5E4 152 aa15.46■□□□□ 0.06
USP25-201ENST00000285679 ZNF618Q5T7W0 954 aa15.46■□□□□ 0.06
USP25-201ENST00000285679 NCBP2-AS2Q69YL0 99 aa15.46■□□□□ 0.06
USP25-201ENST00000285679 DCBLD1Q8N8Z6 715 aa15.46■□□□□ 0.06
USP25-201ENST00000285679 CNOT6Q9ULM6 557 aaKnown RBP15.46■□□□□ 0.06
USP25-201ENST00000285679 SLC8A2Q9UPR5 921 aa15.46■□□□□ 0.06
USP25-201ENST00000285679 CNTN6Q9UQ52 1028 aa15.46■□□□□ 0.06
USP25-201ENST00000285679 TCRBV5S1A1TA0A578 114 aa15.45■□□□□ 0.06
USP25-201ENST00000285679 NRP1O14786 923 aa15.45■□□□□ 0.06
USP25-201ENST00000285679 NRP2O60462 931 aa15.45■□□□□ 0.06
USP25-201ENST00000285679 NPM3O75607 178 aaKnown RBP15.45■□□□□ 0.06
USP25-201ENST00000285679 FBXO21O94952 628 aa15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.1 ms