RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000284617.6

CCSAP-201, Transcript of centriole, cilia and spindle associated protein, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCSAP, Length 5,121 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSAP-201ENST00000284617 ENKURQ8TC29 256 aa21.36■■□□□ 1.01
CCSAP-201ENST00000284617 NACC2Q96BF6 587 aa21.36■■□□□ 1.01
CCSAP-201ENST00000284617 PRKAG3Q9UGI9 489 aa21.36■■□□□ 1.01
CCSAP-201ENST00000284617 C3orf18Q9UK00 162 aa21.36■■□□□ 1.01
CCSAP-201ENST00000284617 TCRBV9S1A1TA0A576 114 aa21.36■■□□□ 1.01
CCSAP-201ENST00000284617 MANSC4A6NHS7 340 aaPredicted RBP21.36■■□□□ 1.01
CCSAP-201ENST00000284617 TAS2R40P59535 323 aa21.36■■□□□ 1.01
CCSAP-201ENST00000284617 PABPC1LQ4VXU2 614 aaKnown RBP21.36■■□□□ 1.01
CCSAP-201ENST00000284617 AFTPHQ6ULP2 937 aa21.36■■□□□ 1.01
CCSAP-201ENST00000284617 RPS6KA6Q9UK32 745 aa21.36■■□□□ 1.01
CCSAP-201ENST00000284617 BCLAF3A2AJT9 711 aaKnown RBP21.35■■□□□ 1.01
CCSAP-201ENST00000284617 SNAP91O60641 907 aa21.35■■□□□ 1.01
CCSAP-201ENST00000284617 ALOX12P18054 663 aa21.35■■□□□ 1.01
CCSAP-201ENST00000284617 ACOX1Q15067 660 aa21.35■■□□□ 1.01
CCSAP-201ENST00000284617 TAF5Q15542 800 aa21.35■■□□□ 1.01
CCSAP-201ENST00000284617 MAPK11Q15759 364 aa21.35■■□□□ 1.01
CCSAP-201ENST00000284617 ATL1Q8WXF7 558 aa21.35■■□□□ 1.01
CCSAP-201ENST00000284617 PEX11AO75192 247 aa21.35■■□□□ 1.01
CCSAP-201ENST00000284617 SLCO1B3Q9NPD5 702 aa21.35■■□□□ 1.01
CCSAP-201ENST00000284617 GNPTGQ9UJJ9 305 aa21.35■■□□□ 1.01
CCSAP-201ENST00000284617 EFR3BQ9Y2G0 817 aa21.35■■□□□ 1.01
CCSAP-201ENST00000284617 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa21.35■■□□□ 1.01
CCSAP-201ENST00000284617 PDE9AO76083 593 aa21.35■■□□□ 1.01
CCSAP-201ENST00000284617 TSPAN19P0C672 248 aa21.35■■□□□ 1.01
CCSAP-201ENST00000284617 SGCGQ13326 291 aa21.35■■□□□ 1.01
CCSAP-201ENST00000284617 MARK2Q7KZI7 788 aaKnown RBP21.35■■□□□ 1.01
CCSAP-201ENST00000284617 UBE2E3Q969T4 207 aa21.35■■□□□ 1.01
CCSAP-201ENST00000284617 MLPHQ9BV36 600 aaPredicted RBP21.35■■□□□ 1.01
CCSAP-201ENST00000284617 RAD18Q9NS91 495 aa21.35■■□□□ 1.01
CCSAP-201ENST00000284617 ATP6V1C1P21283 382 aa21.35■■□□□ 1.01
CCSAP-201ENST00000284617 FGFR3P22607 806 aa21.35■■□□□ 1.01
CCSAP-201ENST00000284617 MAPKAPK3Q16644 382 aa21.35■■□□□ 1.01
CCSAP-201ENST00000284617 TRIM63Q969Q1 353 aa21.35■■□□□ 1.01
CCSAP-201ENST00000284617 ADAM2Q99965 735 aa21.35■■□□□ 1.01
CCSAP-201ENST00000284617 ZYG11BQ9C0D3 744 aa21.35■■□□□ 1.01
CCSAP-201ENST00000284617 NUDT5Q9UKK9 219 aa21.35■■□□□ 1.01
CCSAP-201ENST00000284617 STX11O75558 287 aa21.34■■□□□ 1.01
CCSAP-201ENST00000284617 BROXQ5VW32 411 aa21.34■■□□□ 1.01
CCSAP-201ENST00000284617 ABRAXAS1Q6UWZ7 409 aa21.34■■□□□ 1.01
CCSAP-201ENST00000284617 DGCR6LQ9BY27 220 aa21.34■■□□□ 1.01
CCSAP-201ENST00000284617 VPS45Q9NRW7 570 aa21.34■■□□□ 1.01
CCSAP-201ENST00000284617 SPG21Q9NZD8 308 aa21.34■■□□□ 1.01
CCSAP-201ENST00000284617 ATRNO75882 1429 aa21.34■■□□□ 1.01
CCSAP-201ENST00000284617 CYP7B1O75881 506 aa21.34■■□□□ 1.01
CCSAP-201ENST00000284617 FGRP09769 529 aa21.34■■□□□ 1.01
CCSAP-201ENST00000284617 MATKP42679 507 aa21.34■■□□□ 1.01
CCSAP-201ENST00000284617 EIF2B2P49770 351 aaKnown RBP21.34■■□□□ 1.01
CCSAP-201ENST00000284617 TSHZ1Q6ZSZ6 1077 aa21.34■■□□□ 1.01
CCSAP-201ENST00000284617 SFRP1Q8N474 314 aa21.34■■□□□ 1.01
CCSAP-201ENST00000284617 KCTD4Q8WVF5 259 aa21.34■■□□□ 1.01
CCSAP-201ENST00000284617 NFKBIZQ9BYH8 718 aa21.34■■□□□ 1.01
CCSAP-201ENST00000284617 FANCEQ9HB96 536 aa21.34■■□□□ 1.01
CCSAP-201ENST00000284617 SMIM22K7EJ46 135 aa21.34■■□□□ 1.01
CCSAP-201ENST00000284617 CABYRO75952 493 aa21.34■■□□□ 1.01
CCSAP-201ENST00000284617 ITGB5P18084 799 aa21.34■■□□□ 1.01
CCSAP-201ENST00000284617 GNA13Q14344 377 aa21.34■■□□□ 1.01
CCSAP-201ENST00000284617 MACC1Q6ZN28 852 aa21.34■■□□□ 1.01
CCSAP-201ENST00000284617 IRF2BP1Q8IU81 584 aa21.34■■□□□ 1.01
CCSAP-201ENST00000284617 LRRC52Q8N7C0 313 aa21.34■■□□□ 1.01
CCSAP-201ENST00000284617 NKX2-3Q8TAU0 364 aa21.34■■□□□ 1.01
CCSAP-201ENST00000284617 PTCH2Q9Y6C5 1203 aa21.34■■□□□ 1.01
CCSAP-201ENST00000284617 COL5A2P05997 1499 aaPredicted RBP21.34■■□□□ 1.01
CCSAP-201ENST00000284617 BANF1O75531 89 aa21.34■■□□□ 1.01
CCSAP-201ENST00000284617 GOT1P17174 413 aa21.34■■□□□ 1.01
CCSAP-201ENST00000284617 GSTT1P30711 240 aa21.34■■□□□ 1.01
CCSAP-201ENST00000284617 SCNN1GP51170 649 aa21.34■■□□□ 1.01
CCSAP-201ENST00000284617 TAB1Q15750 504 aa21.34■■□□□ 1.01
CCSAP-201ENST00000284617 CCDC149Q6ZUS6 474 aa21.34■■□□□ 1.01
CCSAP-201ENST00000284617 NUAK2Q9H093 628 aa21.34■■□□□ 1.01
CCSAP-201ENST00000284617 TDRKHQ9Y2W6 561 aaKnown RBP21.34■■□□□ 1.01
CCSAP-201ENST00000284617 MST1RQ04912 1400 aa21.33■■□□□ 1.01
CCSAP-201ENST00000284617 EFCAB10A6NFE3 127 aa21.33■■□□□ 1.01
CCSAP-201ENST00000284617 TMEM191CA6NGB0 347 aa21.33■■□□□ 1.01
CCSAP-201ENST00000284617 FAM47E-STBD1D6RA91 191 aa21.33■■□□□ 1.01
CCSAP-201ENST00000284617 KPNA5O15131 536 aa21.33■■□□□ 1.01
CCSAP-201ENST00000284617 VAV1P15498 845 aa21.33■■□□□ 1.01
CCSAP-201ENST00000284617 ERCC2P18074 760 aa21.33■■□□□ 1.01
CCSAP-201ENST00000284617 ADSSP30520 456 aa21.33■■□□□ 1.01
CCSAP-201ENST00000284617 XIAPP98170 497 aa21.33■■□□□ 1.01
CCSAP-201ENST00000284617 POTEHQ6S545 545 aa21.33■■□□□ 1.01
CCSAP-201ENST00000284617 C4orf32Q8N8J7 132 aa21.33■■□□□ 1.01
CCSAP-201ENST00000284617 ULK1O75385 1050 aa21.33■■□□□ 1.01
CCSAP-201ENST00000284617 WFS1O76024 890 aa21.33■■□□□ 1.01
CCSAP-201ENST00000284617 TNFSF9P41273 254 aa21.33■■□□□ 1.01
CCSAP-201ENST00000284617 AIF1P55008 147 aa21.33■■□□□ 1.01
CCSAP-201ENST00000284617 ATP6V0D1P61421 351 aa21.33■■□□□ 1.01
CCSAP-201ENST00000284617 STX4Q12846 297 aa21.33■■□□□ 1.01
CCSAP-201ENST00000284617 PRKG2Q13237 762 aa21.33■■□□□ 1.01
CCSAP-201ENST00000284617 GPC2Q8N158 579 aa21.33■■□□□ 1.01
CCSAP-201ENST00000284617 TNFRSF25Q93038 417 aa21.33■■□□□ 1.01
CCSAP-201ENST00000284617 SENP6Q9GZR1 1112 aaPredicted RBP21.33■■□□□ 1.01
CCSAP-201ENST00000284617 SNX15Q9NRS6 342 aa21.33■■□□□ 1.01
CCSAP-201ENST00000284617 THG1LQ9NWX6 298 aaKnown RBP21.33■■□□□ 1.01
CCSAP-201ENST00000284617 FBXO5Q9UKT4 447 aa21.33■■□□□ 1.01
CCSAP-201ENST00000284617 ATXN2Q99700 1313 aaKnown RBP21.33■■□□□ 1.01
CCSAP-201ENST00000284617 CASZ1Q86V15 1759 aa21.33■■□□□ 1
CCSAP-201ENST00000284617 TRAFD1O14545 582 aaPredicted RBP21.33■■□□□ 1
CCSAP-201ENST00000284617 CDC42P60953 191 aa21.33■■□□□ 1
CCSAP-201ENST00000284617 FUT2Q10981 343 aa21.33■■□□□ 1
CCSAP-201ENST00000284617 GJC2Q5T442 439 aaPredicted RBP21.33■■□□□ 1
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.1 ms