RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000271628.8

SF3B4-201, Transcript of splicing factor 3b subunit 4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SF3B4, Length 2,085 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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SF3B4-201ENST00000271628 ATG16L1Q676U5 607 aa15.48■□□□□ 0.07
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SF3B4-201ENST00000271628 CCDC149Q6ZUS6 474 aa15.48■□□□□ 0.07
SF3B4-201ENST00000271628 TMEM150AQ86TG1 271 aa15.48■□□□□ 0.07
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SF3B4-201ENST00000271628 ARRDC2Q8TBH0 407 aa15.48■□□□□ 0.07
SF3B4-201ENST00000271628 N4BP2L2Q92802 583 aaPredicted RBP15.48■□□□□ 0.07
SF3B4-201ENST00000271628 CLP1Q92989 425 aaKnown RBP15.48■□□□□ 0.07
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SF3B4-201ENST00000271628 TRIM33Q9UPN9 1127 aa15.48■□□□□ 0.07
SF3B4-201ENST00000271628 TBC1D30Q9Y2I9 924 aa15.48■□□□□ 0.07
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