RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000216416.8

CNIH1-201, Transcript of cornichon family AMPA receptor auxiliary protein 1, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CNIH1, Length 4,793 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNIH1-201ENST00000216416 HLA-FP30511 346 aa6.67□□□□□ -1.34
CNIH1-201ENST00000216416 PPM1AP35813 382 aa6.67□□□□□ -1.34
CNIH1-201ENST00000216416 METAP1P53582 386 aa6.67□□□□□ -1.34
CNIH1-201ENST00000216416 GEMIN4P57678 1058 aaKnown RBP6.67□□□□□ -1.34
CNIH1-201ENST00000216416 XRCC4Q13426 336 aa6.67□□□□□ -1.34
CNIH1-201ENST00000216416 TCEA2Q15560 299 aa6.67□□□□□ -1.34
CNIH1-201ENST00000216416 SPRED3Q2MJR0 410 aa6.67□□□□□ -1.34
CNIH1-201ENST00000216416 TRABD2AQ86V40 505 aa6.67□□□□□ -1.34
CNIH1-201ENST00000216416 PLD6Q8N2A8 252 aaKnown RBP6.67□□□□□ -1.34
CNIH1-201ENST00000216416 PLCD3Q8N3E9 789 aa6.67□□□□□ -1.34
CNIH1-201ENST00000216416 ABHD8Q96I13 439 aa6.67□□□□□ -1.34
CNIH1-201ENST00000216416 TBATAQ96M53 351 aa6.67□□□□□ -1.34
CNIH1-201ENST00000216416 TTLL2Q9BWV7 592 aa6.67□□□□□ -1.34
CNIH1-201ENST00000216416 LRRC3Q9BY71 257 aa6.67□□□□□ -1.34
CNIH1-201ENST00000216416 ACSS3Q9H6R3 686 aa6.67□□□□□ -1.34
CNIH1-201ENST00000216416 FBXO6Q9NRD1 293 aaPredicted RBP6.67□□□□□ -1.34
CNIH1-201ENST00000216416 RRN3Q9NYV6 651 aa6.67□□□□□ -1.34
CNIH1-201ENST00000216416 BFARQ9NZS9 450 aa6.67□□□□□ -1.34
CNIH1-201ENST00000216416 URB1O60287 2271 aaKnown RBP6.67□□□□□ -1.34
CNIH1-201ENST00000216416 PIKFYVEQ9Y2I7 2098 aa6.67□□□□□ -1.34
CNIH1-201ENST00000216416 H3BQ06 376 aaPredicted RBP6.66□□□□□ -1.34
CNIH1-201ENST00000216416 AP2A1O95782 977 aa6.66□□□□□ -1.34
CNIH1-201ENST00000216416 C1QAP02745 245 aa6.66□□□□□ -1.34
CNIH1-201ENST00000216416 CCR10P46092 362 aa6.66□□□□□ -1.34
CNIH1-201ENST00000216416 CSE1LP55060 971 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
CNIH1-201ENST00000216416 SERINC3Q13530 473 aa6.66□□□□□ -1.34
CNIH1-201ENST00000216416 GRM2Q14416 872 aa6.66□□□□□ -1.34
CNIH1-201ENST00000216416 PABPC1LQ4VXU2 614 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
CNIH1-201ENST00000216416 CCDC63Q8NA47 563 aa6.66□□□□□ -1.34
CNIH1-201ENST00000216416 ARMC2Q8NEN0 867 aa6.66□□□□□ -1.34
CNIH1-201ENST00000216416 SMG7Q92540 1137 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
CNIH1-201ENST00000216416 RTP4Q96DX8 246 aa6.66□□□□□ -1.34
CNIH1-201ENST00000216416 ASIC4Q96FT7 647 aa6.66□□□□□ -1.34
CNIH1-201ENST00000216416 GBA3Q9H227 469 aa6.66□□□□□ -1.34
CNIH1-201ENST00000216416 VPS51Q9UID3 782 aa6.66□□□□□ -1.34
CNIH1-201ENST00000216416 SPO11Q9Y5K1 396 aa6.66□□□□□ -1.34
CNIH1-201ENST00000216416 CFAP69A5D8W1 941 aa6.66□□□□□ -1.34
CNIH1-201ENST00000216416 E7ESA3 106 aa6.66□□□□□ -1.34
CNIH1-201ENST00000216416 GREM1O60565 184 aa6.66□□□□□ -1.34
CNIH1-201ENST00000216416 IGLV3-27P01718 113 aa6.66□□□□□ -1.34
CNIH1-201ENST00000216416 MMP2P08253 660 aa6.66□□□□□ -1.34
CNIH1-201ENST00000216416 IGFBP4P22692 258 aa6.66□□□□□ -1.34
CNIH1-201ENST00000216416 HNRNPH2P55795 449 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
CNIH1-201ENST00000216416 PDE1BQ01064 536 aa6.66□□□□□ -1.34
CNIH1-201ENST00000216416 CAV1Q03135 178 aa6.66□□□□□ -1.34
CNIH1-201ENST00000216416 PSRC1Q6PGN9 363 aaPredicted RBP6.66□□□□□ -1.34
CNIH1-201ENST00000216416 LVRNQ6Q4G3 990 aa6.66□□□□□ -1.34
CNIH1-201ENST00000216416 BZW1Q7L1Q6 419 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
CNIH1-201ENST00000216416 STRA8Q7Z7C7 330 aa6.66□□□□□ -1.34
CNIH1-201ENST00000216416 PCGF5Q86SE9 256 aa6.66□□□□□ -1.34
CNIH1-201ENST00000216416 NDUFAF2Q8N183 169 aa6.66□□□□□ -1.34
CNIH1-201ENST00000216416 LPCAT1Q8NF37 534 aa6.66□□□□□ -1.34
CNIH1-201ENST00000216416 CCHCR1Q8TD31 782 aa6.66□□□□□ -1.34
CNIH1-201ENST00000216416 CYTH2Q99418 400 aa6.66□□□□□ -1.34
CNIH1-201ENST00000216416 OMDQ99983 421 aa6.66□□□□□ -1.34
CNIH1-201ENST00000216416 CCDC77Q9BR77 488 aa6.66□□□□□ -1.34
CNIH1-201ENST00000216416 HERC2P3Q9BVR0 1158 aa6.66□□□□□ -1.34
CNIH1-201ENST00000216416 BBS2Q9BXC9 721 aa6.66□□□□□ -1.34
CNIH1-201ENST00000216416 MARCH4Q9P2E8 410 aaPredicted RBP6.66□□□□□ -1.34
CNIH1-201ENST00000216416 RCOR3Q9P2K3 495 aaPredicted RBP6.66□□□□□ -1.34
CNIH1-201ENST00000216416 PLXNA3P51805 1871 aa6.66□□□□□ -1.34
CNIH1-201ENST00000216416 HLA-EP13747 358 aa6.66□□□□□ -1.34
CNIH1-201ENST00000216416 KCNA4P22459 653 aa6.66□□□□□ -1.34
CNIH1-201ENST00000216416 GABRB3P28472 473 aa6.66□□□□□ -1.34
CNIH1-201ENST00000216416 STX2P32856 288 aa6.66□□□□□ -1.34
CNIH1-201ENST00000216416 SOX9P48436 509 aa6.66□□□□□ -1.34
CNIH1-201ENST00000216416 PLK1P53350 603 aa6.66□□□□□ -1.34
CNIH1-201ENST00000216416 LBRQ14739 615 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
CNIH1-201ENST00000216416 ZSCAN26Q16670 478 aa6.66□□□□□ -1.34
CNIH1-201ENST00000216416 ANKRD20A4Q4UJ75 823 aa6.66□□□□□ -1.34
CNIH1-201ENST00000216416 TPGS2Q68CL5 300 aa6.66□□□□□ -1.34
CNIH1-201ENST00000216416 FUBP1Q96AE4 644 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
CNIH1-201ENST00000216416 CCT8L2Q96SF2 557 aa6.66□□□□□ -1.34
CNIH1-201ENST00000216416 CAAP1Q9H8G2 361 aa6.66□□□□□ -1.34
CNIH1-201ENST00000216416 DCTN4Q9UJW0 460 aa6.66□□□□□ -1.34
CNIH1-201ENST00000216416 SLC39A10Q9ULF5 831 aa6.66□□□□□ -1.34
CNIH1-201ENST00000216416 MTO1Q9Y2Z2 717 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
CNIH1-201ENST00000216416 MT-ND3P03897 115 aa6.66□□□□□ -1.34
CNIH1-201ENST00000216416 SLC2A3P11169 496 aa6.66□□□□□ -1.34
CNIH1-201ENST00000216416 RFC2P35250 354 aa6.66□□□□□ -1.34
CNIH1-201ENST00000216416 OXCT1P55809 520 aa6.66□□□□□ -1.34
CNIH1-201ENST00000216416 KCTD11Q693B1 232 aa6.66□□□□□ -1.34
CNIH1-201ENST00000216416 LRIG3Q6UXM1 1119 aa6.66□□□□□ -1.34
CNIH1-201ENST00000216416 CPLX4Q7Z7G2 160 aa6.66□□□□□ -1.34
CNIH1-201ENST00000216416 ARRDC2Q8TBH0 407 aa6.66□□□□□ -1.34
CNIH1-201ENST00000216416 HDAC10Q969S8 669 aa6.66□□□□□ -1.34
CNIH1-201ENST00000216416 DNAJC1Q96KC8 554 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
CNIH1-201ENST00000216416 FEM1AQ9BSK4 669 aa6.66□□□□□ -1.34
CNIH1-201ENST00000216416 TMEM248Q9NWD8 314 aa6.66□□□□□ -1.34
CNIH1-201ENST00000216416 NUP214P35658 2090 aaPredicted RBP6.66□□□□□ -1.34
CNIH1-201ENST00000216416 ZCWPW2A0A1B0GU75 182 aa6.65□□□□□ -1.34
CNIH1-201ENST00000216416 IQCF5A8MTL0 148 aa6.65□□□□□ -1.34
CNIH1-201ENST00000216416 BAIAP3O94812 1187 aa6.65□□□□□ -1.34
CNIH1-201ENST00000216416 ITGB6P18564 788 aa6.65□□□□□ -1.34
CNIH1-201ENST00000216416 TSPAN8P19075 237 aa6.65□□□□□ -1.34
CNIH1-201ENST00000216416 CA5AP35218 305 aa6.65□□□□□ -1.34
CNIH1-201ENST00000216416 ERFP50548 548 aa6.65□□□□□ -1.34
CNIH1-201ENST00000216416 EIF3BP55884 814 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
CNIH1-201ENST00000216416 LMAN2Q12907 356 aa6.65□□□□□ -1.34
CNIH1-201ENST00000216416 STAT4Q14765 748 aa6.65□□□□□ -1.34
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