RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000216014.8

KDELR3-201, Transcript of KDEL endoplasmic reticulum protein retention receptor 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene KDELR3, Length 1,728 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDELR3-201ENST00000216014 GEMIN4P57678 1058 aaKnown RBP20.26■□□□□ 0.83
KDELR3-201ENST00000216014 ST8SIA6P61647 398 aa20.26■□□□□ 0.83
KDELR3-201ENST00000216014 MRPS21P82921 87 aaKnown RBP20.26■□□□□ 0.83
KDELR3-201ENST00000216014 ALG1LQ6GMV1 187 aa20.26■□□□□ 0.83
KDELR3-201ENST00000216014 GSTA5Q7RTV2 222 aa20.26■□□□□ 0.83
KDELR3-201ENST00000216014 JAMLQ86YT9 394 aa20.26■□□□□ 0.83
KDELR3-201ENST00000216014 PCDH20Q8N6Y1 951 aaKnown RBP20.26■□□□□ 0.83
KDELR3-201ENST00000216014 KDM1BQ8NB78 822 aa20.26■□□□□ 0.83
KDELR3-201ENST00000216014 OR2AP1Q8NGE2 309 aa20.26■□□□□ 0.83
KDELR3-201ENST00000216014 SLCO2A1Q92959 643 aa20.26■□□□□ 0.83
KDELR3-201ENST00000216014 ISG20Q96AZ6 181 aaKnown RBP20.26■□□□□ 0.83
KDELR3-201ENST00000216014 CLDN23Q96B33 292 aa20.26■□□□□ 0.83
KDELR3-201ENST00000216014 RBM15Q96T37 977 aaKnown RBP eCLIP20.26■□□□□ 0.83
KDELR3-201ENST00000216014 MLPHQ9BV36 600 aaPredicted RBP20.26■□□□□ 0.83
KDELR3-201ENST00000216014 EPHX3Q9H6B9 360 aa20.26■□□□□ 0.83
KDELR3-201ENST00000216014 DLGAP2Q9P1A6 1054 aa20.26■□□□□ 0.83
KDELR3-201ENST00000216014 SARDHQ9UL12 918 aa20.26■□□□□ 0.83
KDELR3-201ENST00000216014 MYLKQ15746 1914 aa20.26■□□□□ 0.83
KDELR3-201ENST00000216014 CFAP69A5D8W1 941 aa20.25■□□□□ 0.83
KDELR3-201ENST00000216014 PIGNO95427 931 aa20.25■□□□□ 0.83
KDELR3-201ENST00000216014 KRT14P02533 472 aa20.25■□□□□ 0.83
KDELR3-201ENST00000216014 SCNN1BP51168 640 aa20.25■□□□□ 0.83
KDELR3-201ENST00000216014 ITKQ08881 620 aa20.25■□□□□ 0.83
KDELR3-201ENST00000216014 TRADDQ15628 312 aa20.25■□□□□ 0.83
KDELR3-201ENST00000216014 CARD16Q5EG05 197 aa20.25■□□□□ 0.83
KDELR3-201ENST00000216014 NUDT18Q6ZVK8 323 aa20.25■□□□□ 0.83
KDELR3-201ENST00000216014 NSMCE1Q8WV22 266 aa20.25■□□□□ 0.83
KDELR3-201ENST00000216014 CASKIN2Q8WXE0 1202 aa20.25■□□□□ 0.83
KDELR3-201ENST00000216014 LRRC1Q9BTT6 524 aa20.25■□□□□ 0.83
KDELR3-201ENST00000216014 WASF2Q9Y6W5 498 aa20.25■□□□□ 0.83
KDELR3-201ENST00000216014 CTAGE15A4D2H0 777 aa20.24■□□□□ 0.83
KDELR3-201ENST00000216014 TMEM221A6NGB7 291 aa20.24■□□□□ 0.83
KDELR3-201ENST00000216014 M0R296 226 aa20.24■□□□□ 0.83
KDELR3-201ENST00000216014 MTSS1O43312 755 aa20.24■□□□□ 0.83
KDELR3-201ENST00000216014 CTAGE8P0CG41 777 aa20.24■□□□□ 0.83
KDELR3-201ENST00000216014 STIP1P31948 543 aaKnown RBP20.24■□□□□ 0.83
KDELR3-201ENST00000216014 CD86P42081 329 aa20.24■□□□□ 0.83
KDELR3-201ENST00000216014 SKOR1P84550 965 aa20.24■□□□□ 0.83
KDELR3-201ENST00000216014 DR1Q01658 176 aa20.24■□□□□ 0.83
KDELR3-201ENST00000216014 FBXO43Q4G163 708 aa20.24■□□□□ 0.83
KDELR3-201ENST00000216014 SRLQ86TD4 932 aa20.24■□□□□ 0.83
KDELR3-201ENST00000216014 CTAGE6Q86UF2 777 aa20.24■□□□□ 0.83
KDELR3-201ENST00000216014 CACUL1Q86Y37 369 aa20.24■□□□□ 0.83
KDELR3-201ENST00000216014 CTAGE4Q8IX94 777 aa20.24■□□□□ 0.83
KDELR3-201ENST00000216014 GRIN3AQ8TCU5 1115 aa20.24■□□□□ 0.83
KDELR3-201ENST00000216014 TADA1Q96BN2 335 aa20.24■□□□□ 0.83
KDELR3-201ENST00000216014 IMP4Q96G21 291 aaKnown RBP20.24■□□□□ 0.83
KDELR3-201ENST00000216014 SMIM14Q96QK8 99 aa20.24■□□□□ 0.83
KDELR3-201ENST00000216014 GBA3Q9H227 469 aa20.24■□□□□ 0.83
KDELR3-201ENST00000216014 MRPS17Q9Y2R5 130 aaKnown RBP20.24■□□□□ 0.83
KDELR3-201ENST00000216014 EDDM13A0A1B0GTR0 161 aa20.24■□□□□ 0.83
KDELR3-201ENST00000216014 ECEL1O95672 775 aa20.24■□□□□ 0.83
KDELR3-201ENST00000216014 GSRP00390 522 aa20.24■□□□□ 0.83
KDELR3-201ENST00000216014 HOXB2P14652 356 aa20.24■□□□□ 0.83
KDELR3-201ENST00000216014 IVDP26440 423 aa20.24■□□□□ 0.83
KDELR3-201ENST00000216014 COPAP53621 1224 aa20.24■□□□□ 0.83
KDELR3-201ENST00000216014 SLC7A5Q01650 507 aa20.24■□□□□ 0.83
KDELR3-201ENST00000216014 CAMK2GQ13555 558 aaPredicted RBP20.24■□□□□ 0.83
KDELR3-201ENST00000216014 MYLK3Q32MK0 819 aa20.24■□□□□ 0.83
KDELR3-201ENST00000216014 P3H1Q32P28 736 aa20.24■□□□□ 0.83
KDELR3-201ENST00000216014 POM121L1PQ3SYA9 428 aa20.24■□□□□ 0.83
KDELR3-201ENST00000216014 NCEH1Q6PIU2 408 aa20.24■□□□□ 0.83
KDELR3-201ENST00000216014 ZSWIM9Q86XI8 627 aa20.24■□□□□ 0.83
KDELR3-201ENST00000216014 MMGT1Q8N4V1 131 aa20.24■□□□□ 0.83
KDELR3-201ENST00000216014 EXOC4Q96A65 974 aa20.24■□□□□ 0.83
KDELR3-201ENST00000216014 NUDCD1Q96RS6 583 aa20.24■□□□□ 0.83
KDELR3-201ENST00000216014 POLR1EQ9GZS1 481 aaKnown RBP20.24■□□□□ 0.83
KDELR3-201ENST00000216014 PCDH9Q9HC56 1237 aa20.24■□□□□ 0.83
KDELR3-201ENST00000216014 RSPH14Q9UHP6 348 aa20.24■□□□□ 0.83
KDELR3-201ENST00000216014 MMP17Q9ULZ9 603 aa20.24■□□□□ 0.83
KDELR3-201ENST00000216014 SIT1Q9Y3P8 196 aa20.24■□□□□ 0.83
KDELR3-201ENST00000216014 CACNA1IQ9P0X4 2223 aa20.24■□□□□ 0.83
KDELR3-201ENST00000216014 TCRBV7S3A2A0A539 114 aa20.23■□□□□ 0.83
KDELR3-201ENST00000216014 OPHN1O60890 802 aa20.23■□□□□ 0.83
KDELR3-201ENST00000216014 NNMTP40261 264 aa20.23■□□□□ 0.83
KDELR3-201ENST00000216014 NSUN2Q08J23 767 aaKnown RBP eCLIP20.23■□□□□ 0.83
KDELR3-201ENST00000216014 TRAF2Q12933 501 aa20.23■□□□□ 0.83
KDELR3-201ENST00000216014 PTK6Q13882 451 aa20.23■□□□□ 0.83
KDELR3-201ENST00000216014 PTPRRQ15256 657 aa20.23■□□□□ 0.83
KDELR3-201ENST00000216014 CAMK1DQ8IU85 385 aa20.23■□□□□ 0.83
KDELR3-201ENST00000216014 RYBPQ8N488 228 aaPredicted RBP20.23■□□□□ 0.83
KDELR3-201ENST00000216014 CEP112Q8N8E3 955 aa20.23■□□□□ 0.83
KDELR3-201ENST00000216014 CCDC89Q8N998 374 aa20.23■□□□□ 0.83
KDELR3-201ENST00000216014 KCNV2Q8TDN2 545 aa20.23■□□□□ 0.83
KDELR3-201ENST00000216014 GDAP1L1Q96MZ0 367 aa20.23■□□□□ 0.83
KDELR3-201ENST00000216014 VAT1Q99536 393 aa20.23■□□□□ 0.83
KDELR3-201ENST00000216014 COL25A1Q9BXS0 654 aaPredicted RBP20.23■□□□□ 0.83
KDELR3-201ENST00000216014 MKRN2Q9H000 416 aaKnown RBP20.23■□□□□ 0.83
KDELR3-201ENST00000216014 SLC25A51Q9H1U9 297 aa20.23■□□□□ 0.83
KDELR3-201ENST00000216014 ZDHHC6Q9H6R6 413 aa20.23■□□□□ 0.83
KDELR3-201ENST00000216014 ETNK1Q9HBU6 452 aa20.23■□□□□ 0.83
KDELR3-201ENST00000216014 TRHDEQ9UKU6 1024 aa20.23■□□□□ 0.83
KDELR3-201ENST00000216014 PCDHGC4Q9Y5F7 938 aa20.23■□□□□ 0.83
KDELR3-201ENST00000216014 WDFY4Q6ZS81 3184 aa20.23■□□□□ 0.83
KDELR3-201ENST00000216014 PLK4O00444 970 aa20.22■□□□□ 0.83
KDELR3-201ENST00000216014 RIOK3O14730 519 aaKnown RBP20.22■□□□□ 0.83
KDELR3-201ENST00000216014 TP73O15350 636 aa20.22■□□□□ 0.83
KDELR3-201ENST00000216014 MTAPQ13126 283 aa20.22■□□□□ 0.83
KDELR3-201ENST00000216014 LRRC32Q14392 662 aa20.22■□□□□ 0.83
KDELR3-201ENST00000216014 SPARCL1Q14515 664 aa20.22■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39.5 ms