RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000020163.6

Nedd1-201, Transcript of Protein NEDD1, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Nedd1, Length 3,534 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Hdgfl2Q3UMU9 669 aa10.06□□□□□ -0.8
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Supt20hQ7TT00 530 aaKnown RBP10.06□□□□□ -0.8
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Ric8bQ80XE1 520 aa10.06□□□□□ -0.8
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Aifm2Q8BUE4 373 aa10.06□□□□□ -0.8
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Ttc4Q8R3H9 386 aa10.06□□□□□ -0.8
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Fbxo33Q8VE08 562 aa10.06□□□□□ -0.8
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Olfr807Q8VGI9 311 aa10.06□□□□□ -0.8
Nedd1-201ENSMUST00000020163 WaslQ91YD9 501 aa10.06□□□□□ -0.8
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Atp13a2Q9CTG6 1169 aa10.06□□□□□ -0.8
Nedd1-201ENSMUST00000020163 CenpsQ9D084 142 aa10.06□□□□□ -0.8
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Cpsf3Q9QXK7 684 aa10.06□□□□□ -0.8
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Gm4841E9QAA8 417 aa10.06□□□□□ -0.8
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Speer4cG3UXD1 256 aa10.06□□□□□ -0.8
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Gm10354K7N6A0 256 aa10.06□□□□□ -0.8
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Vmn2r46L7N282 809 aa10.06□□□□□ -0.8
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Timm44O35857 452 aa10.06□□□□□ -0.8
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Tuba3aP05214 450 aaKnown RBP10.06□□□□□ -0.8
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Gstm1P10649 218 aa10.06□□□□□ -0.8
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Slc19a1P41438 512 aa10.06□□□□□ -0.8
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Serpinb5P70124 375 aaKnown RBP10.06□□□□□ -0.8
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Mpp1P70290 466 aa10.06□□□□□ -0.8
Nedd1-201ENSMUST00000020163 CtscP97821 462 aa10.06□□□□□ -0.8
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Pfdn6Q03958 127 aa10.06□□□□□ -0.8
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Sorbs2Q3UTJ2 1180 aaKnown RBP10.06□□□□□ -0.8
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Magee2Q52KG3 523 aa10.06□□□□□ -0.8
Nedd1-201ENSMUST00000020163 StyxQ60969 223 aa10.06□□□□□ -0.8
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Rundc3bQ6PDC0 408 aa10.06□□□□□ -0.8
Nedd1-201ENSMUST00000020163 4930503B20RikQ80ZP0 234 aa10.06□□□□□ -0.8
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Q8BHN7 327 aa10.06□□□□□ -0.8
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Prox2Q8BII1 593 aa10.06□□□□□ -0.8
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Cog3Q8CI04 820 aa10.06□□□□□ -0.8
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Kctd15Q8K0E1 283 aa10.06□□□□□ -0.8
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Acsm2Q8K0L3 575 aa10.06□□□□□ -0.8
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Mmgt2Q8R3L0 123 aa10.06□□□□□ -0.8
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Dapk2Q8VDF3 370 aa10.06□□□□□ -0.8
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Zfp617Q91WM0 559 aa10.06□□□□□ -0.8
Nedd1-201ENSMUST00000020163 CutalQ9D1U5 156 aa10.06□□□□□ -0.8
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Cpxm2Q9D2L5 764 aa10.06□□□□□ -0.8
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Akr1c12Q9JLI0 323 aa10.06□□□□□ -0.8
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Syndig1A2ANU3 258 aa10.06□□□□□ -0.8
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Gm2832F7AEC7 200 aa10.06□□□□□ -0.8
Nedd1-201ENSMUST00000020163 ClockO08785 855 aa10.06□□□□□ -0.8
Nedd1-201ENSMUST00000020163 H2-M9O19442 342 aa10.06□□□□□ -0.8
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Grk4O70291 574 aa10.06□□□□□ -0.8
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Actr2P61161 394 aa10.06□□□□□ -0.8
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Ncf4P97369 339 aa10.06□□□□□ -0.8
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Kcnj8P97794 424 aa10.06□□□□□ -0.8
Nedd1-201ENSMUST00000020163 PgrQ00175 926 aa10.06□□□□□ -0.8
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Gxylt1Q3UHH8 404 aa10.06□□□□□ -0.8
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Rnf215Q5SPX3 379 aa10.06□□□□□ -0.8
Nedd1-201ENSMUST00000020163 RimklbQ80WS1 387 aa10.06□□□□□ -0.8
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Iqsec1Q8R0S2 961 aa10.06□□□□□ -0.8
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Defb15Q8R2I5 79 aa10.06□□□□□ -0.8
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Guca1bQ8VBV8 201 aa10.06□□□□□ -0.8
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Frmd4bQ920B0 1035 aa10.06□□□□□ -0.8
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Marc2Q922Q1 338 aa10.06□□□□□ -0.8
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Nudt7Q99P30 236 aa10.06□□□□□ -0.8
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Lpin3Q99PI4 848 aa10.06□□□□□ -0.8
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Trim8Q99PJ2 551 aa10.06□□□□□ -0.8
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Sike1Q9CPR7 207 aa10.06□□□□□ -0.8
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Serbp1Q9CY58 407 aaKnown RBP10.06□□□□□ -0.8
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Fbxl20Q9CZV8 436 aa10.06□□□□□ -0.8
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Maf1Q9D0U6 258 aa10.06□□□□□ -0.8
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Ddx59Q9DBN9 619 aa10.06□□□□□ -0.8
Nedd1-201ENSMUST00000020163 MecrQ9DCS3 373 aa10.06□□□□□ -0.8
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Olfr703Q9EPF5 319 aa10.06□□□□□ -0.8
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Btbd35f21A0A140T8Q5 498 aa10.05□□□□□ -0.8
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Smok4aA0JLX3 433 aa10.05□□□□□ -0.8
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Pramef25A2ASI9 494 aa10.05□□□□□ -0.8
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Sec14l5B2RXM5 696 aa10.05□□□□□ -0.8
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Akap5D3YVF0 745 aa10.05□□□□□ -0.8
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Vmn1r39G3UWE6 305 aa10.05□□□□□ -0.8
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Obox5G3X9P6 291 aa10.05□□□□□ -0.8
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Btbd35f22J3QN64 498 aa10.05□□□□□ -0.8
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Nedd8P29595 81 aa10.05□□□□□ -0.8
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Cct8P42932 548 aa10.05□□□□□ -0.8
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Lrig1P70193 1091 aa10.05□□□□□ -0.8
Nedd1-201ENSMUST00000020163 InhbbQ04999 411 aa10.05□□□□□ -0.8
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Ptchd3Q0EEE2 906 aa10.05□□□□□ -0.8
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Olfr463Q5SW49 311 aa10.05□□□□□ -0.8
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Olfr462Q5SW50 311 aa10.05□□□□□ -0.8
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Itga2Q62469 1178 aa10.05□□□□□ -0.8
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Scaf8Q6DID3 1268 aa10.05□□□□□ -0.8
Nedd1-201ENSMUST00000020163 AftphQ80WT5 931 aa10.05□□□□□ -0.8
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Aste1Q8BIR2 672 aa10.05□□□□□ -0.8
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Hspbap1Q8BK58 483 aa10.05□□□□□ -0.8
Nedd1-201ENSMUST00000020163 OsgepQ8BWU5 335 aa10.05□□□□□ -0.8
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Rdh12Q8BYK4 316 aa10.05□□□□□ -0.8
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Uba3Q8C878 462 aa10.05□□□□□ -0.8
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Serpina3nQ91WP6 418 aa10.05□□□□□ -0.8
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Msi2Q920Q6 346 aaKnown RBP10.05□□□□□ -0.8
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Kif19Q99PT9 997 aa10.05□□□□□ -0.8
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Ndufb5Q9CQH3 189 aa10.05□□□□□ -0.8
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Dppa5aQ9CQS7 118 aa10.05□□□□□ -0.8
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Krt20Q9D312 431 aa10.05□□□□□ -0.8
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Fam162aQ9D6U8 155 aa10.05□□□□□ -0.8
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Chit1Q9D7Q1 464 aa10.05□□□□□ -0.8
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Cyp2ab1S4R196 498 aa10.05□□□□□ -0.8
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Gm28363A0A087WQW2 129 aa10.05□□□□□ -0.8
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Gp5O08742 567 aa10.05□□□□□ -0.8
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 20.3 ms