RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000639534.1

CHD1L-211, Transcript of chromodomain helicase DNA binding protein 1 like, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene CHD1L, Length 1,144 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHD1L-211ENST00000639534 EPOP01588 193 aa14.72□□□□□ -0.05
CHD1L-211ENST00000639534 ALDOAP04075 364 aaKnown RBP14.72□□□□□ -0.05
CHD1L-211ENST00000639534 APOA4P06727 396 aa14.72□□□□□ -0.05
CHD1L-211ENST00000639534 TPH1P17752 444 aa14.72□□□□□ -0.05
CHD1L-211ENST00000639534 CES1P23141 567 aa14.72□□□□□ -0.05
CHD1L-211ENST00000639534 NMBRP28336 390 aa14.72□□□□□ -0.05
CHD1L-211ENST00000639534 TYK2P29597 1187 aa14.72□□□□□ -0.05
CHD1L-211ENST00000639534 SERPINH1P50454 418 aaKnown RBP14.72□□□□□ -0.05
CHD1L-211ENST00000639534 KCNQ1P51787 676 aa14.72□□□□□ -0.05
CHD1L-211ENST00000639534 GNA12Q03113 381 aa14.72□□□□□ -0.05
CHD1L-211ENST00000639534 ITKQ08881 620 aa14.72□□□□□ -0.05
CHD1L-211ENST00000639534 OLIG2Q13516 323 aa14.72□□□□□ -0.05
CHD1L-211ENST00000639534 ZNF235Q14590 738 aa14.72□□□□□ -0.05
CHD1L-211ENST00000639534 LRRC26Q2I0M4 334 aa14.72□□□□□ -0.05
CHD1L-211ENST00000639534 CCDC153Q494R4 210 aa14.72□□□□□ -0.05
CHD1L-211ENST00000639534 HSP90AA5PQ58FG0 334 aa14.72□□□□□ -0.05
CHD1L-211ENST00000639534 CES3Q6UWW8 571 aa14.72□□□□□ -0.05
CHD1L-211ENST00000639534 ZNF783Q6ZMS7 281 aa14.72□□□□□ -0.05
CHD1L-211ENST00000639534 SETD3Q86TU7 594 aaPredicted RBP14.72□□□□□ -0.05
CHD1L-211ENST00000639534 NUDCD3Q8IVD9 361 aa14.72□□□□□ -0.05
CHD1L-211ENST00000639534 CNTN4Q8IWV2 1026 aa14.72□□□□□ -0.05
CHD1L-211ENST00000639534 LMNTD2Q8IXW0 634 aa14.72□□□□□ -0.05
CHD1L-211ENST00000639534 CALML6Q8TD86 181 aa14.72□□□□□ -0.05
CHD1L-211ENST00000639534 SREK1Q8WXA9 508 aaKnown RBP14.72□□□□□ -0.05
CHD1L-211ENST00000639534 PSMG2Q969U7 264 aa14.72□□□□□ -0.05
CHD1L-211ENST00000639534 E2F7Q96AV8 911 aa14.72□□□□□ -0.05
CHD1L-211ENST00000639534 TADA1Q96BN2 335 aa14.72□□□□□ -0.05
CHD1L-211ENST00000639534 MFSD3Q96ES6 412 aa14.72□□□□□ -0.05
CHD1L-211ENST00000639534 C7orf26Q96N11 449 aa14.72□□□□□ -0.05
CHD1L-211ENST00000639534 YME1L1Q96TA2 773 aa14.72□□□□□ -0.05
CHD1L-211ENST00000639534 KLF16Q9BXK1 252 aaPredicted RBP14.72□□□□□ -0.05
CHD1L-211ENST00000639534 SIRPGQ9P1W8 387 aa14.72□□□□□ -0.05
CHD1L-211ENST00000639534 NYNRINQ9P2P1 1898 aaKnown RBP14.72□□□□□ -0.05
CHD1L-211ENST00000639534 TET1Q8NFU7 2136 aa14.71□□□□□ -0.05
CHD1L-211ENST00000639534 ZNF559-ZNF177A0A0A6YYI6 481 aaPredicted RBP14.71□□□□□ -0.05
CHD1L-211ENST00000639534 A0A1B0GVM2 712 aa14.71□□□□□ -0.05
CHD1L-211ENST00000639534 ILVBLA1L0T0 632 aa14.71□□□□□ -0.05
CHD1L-211ENST00000639534 TCAF2A6NFQ2 919 aa14.71□□□□□ -0.05
CHD1L-211ENST00000639534 DNAJC8O75937 253 aaPredicted RBP14.71□□□□□ -0.05
CHD1L-211ENST00000639534 ATP5HO75947 161 aa14.71□□□□□ -0.05
CHD1L-211ENST00000639534 STC2O76061 302 aa14.71□□□□□ -0.05
CHD1L-211ENST00000639534 BPGMP07738 259 aa14.71□□□□□ -0.05
CHD1L-211ENST00000639534 CSF2RAP15509 400 aa14.71□□□□□ -0.05
CHD1L-211ENST00000639534 HLA-DPA1P20036 260 aa14.71□□□□□ -0.05
CHD1L-211ENST00000639534 DEFB103AP81534 67 aa14.71□□□□□ -0.05
CHD1L-211ENST00000639534 SLC10A7Q0GE19 358 aa14.71□□□□□ -0.05
CHD1L-211ENST00000639534 ZNF177Q13360 481 aaPredicted RBP14.71□□□□□ -0.05
CHD1L-211ENST00000639534 THOC5Q13769 683 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.05
CHD1L-211ENST00000639534 FAM133BQ5BKY9 247 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.05
CHD1L-211ENST00000639534 ADGRF1Q5T601 910 aa14.71□□□□□ -0.05
CHD1L-211ENST00000639534 ALG1LQ6GMV1 187 aa14.71□□□□□ -0.05
CHD1L-211ENST00000639534 CDHR3Q6ZTQ4 885 aa14.71□□□□□ -0.05
CHD1L-211ENST00000639534 KIAA0408Q6ZU52 694 aa14.71□□□□□ -0.05
CHD1L-211ENST00000639534 DCLK2Q8N568 766 aa14.71□□□□□ -0.05
CHD1L-211ENST00000639534 ARMC2Q8NEN0 867 aa14.71□□□□□ -0.05
CHD1L-211ENST00000639534 SPOCK2Q92563 424 aa14.71□□□□□ -0.05
CHD1L-211ENST00000639534 PEX13Q92968 403 aa14.71□□□□□ -0.05
CHD1L-211ENST00000639534 PAWRQ96IZ0 340 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.05
CHD1L-211ENST00000639534 FEM1CQ96JP0 617 aa14.71□□□□□ -0.05
CHD1L-211ENST00000639534 TSNARE1Q96NA8 513 aa14.71□□□□□ -0.05
CHD1L-211ENST00000639534 RHOJQ9H4E5 214 aa14.71□□□□□ -0.05
CHD1L-211ENST00000639534 SLCO1B3Q9NPD5 702 aa14.71□□□□□ -0.05
CHD1L-211ENST00000639534 IL23AQ9NPF7 189 aa14.71□□□□□ -0.05
CHD1L-211ENST00000639534 SNX15Q9NRS6 342 aa14.71□□□□□ -0.05
CHD1L-211ENST00000639534 IARS2Q9NSE4 1012 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.05
CHD1L-211ENST00000639534 SEPT3Q9UH03 358 aa14.71□□□□□ -0.05
CHD1L-211ENST00000639534 STOML2Q9UJZ1 356 aa14.71□□□□□ -0.05
CHD1L-211ENST00000639534 INSL5Q9Y5Q6 135 aa14.71□□□□□ -0.05
CHD1L-211ENST00000639534 PSAT1Q9Y617 370 aa14.71□□□□□ -0.05
CHD1L-211ENST00000639534 H0YHG0 523 aa14.7□□□□□ -0.06
CHD1L-211ENST00000639534 KDELR3O43731 214 aa14.7□□□□□ -0.06
CHD1L-211ENST00000639534 GJB5O95377 273 aa14.7□□□□□ -0.06
CHD1L-211ENST00000639534 FGF1P05230 155 aa14.7□□□□□ -0.06
CHD1L-211ENST00000639534 ATP5BP06576 529 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
CHD1L-211ENST00000639534 COL6A2P12110 1019 aa14.7□□□□□ -0.06
CHD1L-211ENST00000639534 BGNP21810 368 aa14.7□□□□□ -0.06
CHD1L-211ENST00000639534 CORO1AP31146 461 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
CHD1L-211ENST00000639534 CD86P42081 329 aa14.7□□□□□ -0.06
CHD1L-211ENST00000639534 SKIV2L2P42285 1042 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
CHD1L-211ENST00000639534 SCTRP47872 440 aa14.7□□□□□ -0.06
CHD1L-211ENST00000639534 LIG3P49916 1009 aa14.7□□□□□ -0.06
CHD1L-211ENST00000639534 OXCT1P55809 520 aa14.7□□□□□ -0.06
CHD1L-211ENST00000639534 TWF1Q12792 350 aa14.7□□□□□ -0.06
CHD1L-211ENST00000639534 PDE1CQ14123 709 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
CHD1L-211ENST00000639534 POU6F1Q14863 301 aa14.7□□□□□ -0.06
CHD1L-211ENST00000639534 FSTL4Q6MZW2 842 aa14.7□□□□□ -0.06
CHD1L-211ENST00000639534 DNAJB7Q7Z6W7 309 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
CHD1L-211ENST00000639534 C10orf82Q8WW14 230 aa14.7□□□□□ -0.06
CHD1L-211ENST00000639534 ZNF419Q96HQ0 510 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
CHD1L-211ENST00000639534 GPR22Q99680 433 aa14.7□□□□□ -0.06
CHD1L-211ENST00000639534 SIKE1Q9BRV8 207 aa14.7□□□□□ -0.06
CHD1L-211ENST00000639534 MCMBPQ9BTE3 642 aa14.7□□□□□ -0.06
CHD1L-211ENST00000639534 RASSF4Q9H2L5 321 aa14.7□□□□□ -0.06
CHD1L-211ENST00000639534 PDFQ9HBH1 243 aa14.7□□□□□ -0.06
CHD1L-211ENST00000639534 TREX1Q9NSU2 369 aa14.7□□□□□ -0.06
CHD1L-211ENST00000639534 SLC12A4Q9UP95 1085 aa14.7□□□□□ -0.06
CHD1L-211ENST00000639534 MTO1Q9Y2Z2 717 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
CHD1L-211ENST00000639534 ZFP37Q9Y6Q3 630 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
CHD1L-211ENST00000639534 LOC285095A0A1B0GVY8 99 aa14.69□□□□□ -0.06
CHD1L-211ENST00000639534 TYW5A2RUC4 315 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.6 ms