RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000633035.1

JMJD1C-211, Transcript of jumonji domain containing 1C, humanhuman

TSL 3

Gene JMJD1C, Length 499 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
JMJD1C-211ENST00000633035 CCDC42Q96M95 316 aa16.88■□□□□ 0.29
JMJD1C-211ENST00000633035 PEBP4Q96S96 227 aa16.88■□□□□ 0.29
JMJD1C-211ENST00000633035 DNAJC7Q99615 494 aa16.88■□□□□ 0.29
JMJD1C-211ENST00000633035 ZDHHC6Q9H6R6 413 aa16.88■□□□□ 0.29
JMJD1C-211ENST00000633035 GAREM1Q9H706 876 aa16.88■□□□□ 0.29
JMJD1C-211ENST00000633035 CTTNBP2NLQ9P2B4 639 aa16.88■□□□□ 0.29
JMJD1C-211ENST00000633035 ACTL7AQ9Y615 435 aa16.88■□□□□ 0.29
JMJD1C-211ENST00000633035 SSU72P8A0A1W2PR75 194 aa16.87■□□□□ 0.29
JMJD1C-211ENST00000633035 H3BRJ5 948 aa16.87■□□□□ 0.29
JMJD1C-211ENST00000633035 KRIT1O00522 736 aa16.87■□□□□ 0.29
JMJD1C-211ENST00000633035 POP4O95707 220 aaKnown RBP16.87■□□□□ 0.29
JMJD1C-211ENST00000633035 CD160O95971 181 aa16.87■□□□□ 0.29
JMJD1C-211ENST00000633035 CSRP1P21291 193 aaKnown RBP16.87■□□□□ 0.29
JMJD1C-211ENST00000633035 NUDT1P36639 197 aa16.87■□□□□ 0.29
JMJD1C-211ENST00000633035 ADKP55263 362 aaKnown RBP16.87■□□□□ 0.29
JMJD1C-211ENST00000633035 SLC14A1Q13336 389 aa16.87■□□□□ 0.29
JMJD1C-211ENST00000633035 SERINC3Q13530 473 aa16.87■□□□□ 0.29
JMJD1C-211ENST00000633035 HADHQ16836 314 aaKnown RBP16.87■□□□□ 0.29
JMJD1C-211ENST00000633035 HLA-BQ31612 363 aa16.87■□□□□ 0.29
JMJD1C-211ENST00000633035 INO80DQ53TQ3 878 aaPredicted RBP16.87■□□□□ 0.29
JMJD1C-211ENST00000633035 KCNT1Q5JUK3 1230 aa16.87■□□□□ 0.29
JMJD1C-211ENST00000633035 AGBL4Q5VU57 503 aa16.87■□□□□ 0.29
JMJD1C-211ENST00000633035 PSAPL1Q6NUJ1 521 aa16.87■□□□□ 0.29
JMJD1C-211ENST00000633035 FBXL19Q6PCT2 694 aa16.87■□□□□ 0.29
JMJD1C-211ENST00000633035 CNGA4Q8IV77 575 aa16.87■□□□□ 0.29
JMJD1C-211ENST00000633035 OR2AP1Q8NGE2 309 aa16.87■□□□□ 0.29
JMJD1C-211ENST00000633035 LRIG1Q96JA1 1093 aa16.87■□□□□ 0.29
JMJD1C-211ENST00000633035 SERAC1Q96JX3 654 aa16.87■□□□□ 0.29
JMJD1C-211ENST00000633035 KCTD15Q96SI1 283 aaPredicted RBP16.87■□□□□ 0.29
JMJD1C-211ENST00000633035 NOL6Q9H6R4 1146 aaKnown RBP16.87■□□□□ 0.29
JMJD1C-211ENST00000633035 PREBQ9HCU5 417 aa16.87■□□□□ 0.29
JMJD1C-211ENST00000633035 ABHD10Q9NUJ1 306 aa16.87■□□□□ 0.29
JMJD1C-211ENST00000633035 DNAAF2Q9NVR5 837 aaKnown RBP16.87■□□□□ 0.29
JMJD1C-211ENST00000633035 ANKRD6Q9Y2G4 727 aa16.87■□□□□ 0.29
JMJD1C-211ENST00000633035 PI4KAP42356 2102 aa16.87■□□□□ 0.29
JMJD1C-211ENST00000633035 AKR1B15C9JRZ8 316 aaPredicted RBP16.86■□□□□ 0.29
JMJD1C-211ENST00000633035 ZNF821O75541 412 aaPredicted RBP16.86■□□□□ 0.29
JMJD1C-211ENST00000633035 PCDH8O95206 1070 aa16.86■□□□□ 0.29
JMJD1C-211ENST00000633035 IGSF6O95976 241 aa16.86■□□□□ 0.29
JMJD1C-211ENST00000633035 GSRP00390 522 aa16.86■□□□□ 0.29
JMJD1C-211ENST00000633035 CEACAM1P13688 526 aa16.86■□□□□ 0.29
JMJD1C-211ENST00000633035 ERCC2P18074 760 aa16.86■□□□□ 0.29
JMJD1C-211ENST00000633035 MAT2AP31153 395 aaKnown RBP16.86■□□□□ 0.29
JMJD1C-211ENST00000633035 HCAR3P49019 387 aa16.86■□□□□ 0.29
JMJD1C-211ENST00000633035 NEK3P51956 506 aa16.86■□□□□ 0.29
JMJD1C-211ENST00000633035 RHOAP61586 193 aa16.86■□□□□ 0.29
JMJD1C-211ENST00000633035 MAPK8IP2Q13387 824 aaPredicted RBP16.86■□□□□ 0.29
JMJD1C-211ENST00000633035 SMTNL2Q2TAL5 461 aa16.86■□□□□ 0.29
JMJD1C-211ENST00000633035 NEK5Q6P3R8 708 aa16.86■□□□□ 0.29
JMJD1C-211ENST00000633035 LZTR1Q8N653 840 aa16.86■□□□□ 0.29
JMJD1C-211ENST00000633035 ZNF564Q8TBZ8 553 aaPredicted RBP16.86■□□□□ 0.29
JMJD1C-211ENST00000633035 ARRDC3Q96B67 414 aa16.86■□□□□ 0.29
JMJD1C-211ENST00000633035 ARHGEF26Q96DR7 871 aa16.86■□□□□ 0.29
JMJD1C-211ENST00000633035 CELF6Q96J87 481 aaKnown RBP16.86■□□□□ 0.29
JMJD1C-211ENST00000633035 BTBD6Q96KE9 485 aa16.86■□□□□ 0.29
JMJD1C-211ENST00000633035 GDAP1L1Q96MZ0 367 aa16.86■□□□□ 0.29
JMJD1C-211ENST00000633035 SLC6A18Q96N87 628 aa16.86■□□□□ 0.29
JMJD1C-211ENST00000633035 HDAC8Q9BY41 377 aa16.86■□□□□ 0.29
JMJD1C-211ENST00000633035 UVRAGQ9P2Y5 699 aa16.86■□□□□ 0.29
JMJD1C-211ENST00000633035 UBA2Q9UBT2 640 aaPredicted RBP16.86■□□□□ 0.29
JMJD1C-211ENST00000633035 LCMT1Q9UIC8 334 aa16.86■□□□□ 0.29
JMJD1C-211ENST00000633035 PCDHB9Q9Y5E1 797 aa16.86■□□□□ 0.29
JMJD1C-211ENST00000633035 WASF2Q9Y6W5 498 aa16.86■□□□□ 0.29
JMJD1C-211ENST00000633035 CEP250Q9BV73 2442 aa16.86■□□□□ 0.29
JMJD1C-211ENST00000633035 FRYLO94915 3013 aa16.86■□□□□ 0.29
JMJD1C-211ENST00000633035 NUMA1Q14980 2115 aa16.85■□□□□ 0.29
JMJD1C-211ENST00000633035 DFFAO00273 331 aa16.85■□□□□ 0.29
JMJD1C-211ENST00000633035 RNGTTO60942 597 aaKnown RBP16.85■□□□□ 0.29
JMJD1C-211ENST00000633035 MFAP3LO75121 409 aa16.85■□□□□ 0.29
JMJD1C-211ENST00000633035 TMCC1O94876 653 aa16.85■□□□□ 0.29
JMJD1C-211ENST00000633035 ITGB7P26010 798 aa16.85■□□□□ 0.29
JMJD1C-211ENST00000633035 CD38P28907 300 aa16.85■□□□□ 0.29
JMJD1C-211ENST00000633035 KRT81Q14533 505 aa16.85■□□□□ 0.29
JMJD1C-211ENST00000633035 STAT4Q14765 748 aa16.85■□□□□ 0.29
JMJD1C-211ENST00000633035 SUZ12Q15022 739 aaKnown RBP16.85■□□□□ 0.29
JMJD1C-211ENST00000633035 KIF19Q2TAC6 998 aa16.85■□□□□ 0.29
JMJD1C-211ENST00000633035 MYLK3Q32MK0 819 aa16.85■□□□□ 0.29
JMJD1C-211ENST00000633035 SETMARQ53H47 684 aaPredicted RBP16.85■□□□□ 0.29
JMJD1C-211ENST00000633035 PIP5KL1Q5T9C9 394 aa16.85■□□□□ 0.29
JMJD1C-211ENST00000633035 SARM1Q6SZW1 724 aa16.85■□□□□ 0.29
JMJD1C-211ENST00000633035 TRIM69Q86WT6 500 aa16.85■□□□□ 0.29
JMJD1C-211ENST00000633035 NIPA2Q8N8Q9 360 aa16.85■□□□□ 0.29
JMJD1C-211ENST00000633035 DEFB124Q8NES8 71 aa16.85■□□□□ 0.29
JMJD1C-211ENST00000633035 OR6K2Q8NGY2 324 aa16.85■□□□□ 0.29
JMJD1C-211ENST00000633035 FAM131CQ96AQ9 280 aa16.85■□□□□ 0.29
JMJD1C-211ENST00000633035 ANP32EQ9BTT0 268 aa16.85■□□□□ 0.29
JMJD1C-211ENST00000633035 OSBPL1AQ9BXW6 950 aa16.85■□□□□ 0.29
JMJD1C-211ENST00000633035 SLC39A8Q9C0K1 460 aa16.85■□□□□ 0.29
JMJD1C-211ENST00000633035 SP110Q9HB58 689 aa16.85■□□□□ 0.29
JMJD1C-211ENST00000633035 STAU2Q9NUL3 570 aaKnown RBP eCLIP16.85■□□□□ 0.29
JMJD1C-211ENST00000633035 CWC15Q9P013 229 aaKnown RBP16.85■□□□□ 0.29
JMJD1C-211ENST00000633035 DMTF1Q9Y222 760 aa16.85■□□□□ 0.29
JMJD1C-211ENST00000633035 SNX11Q9Y5W9 270 aa16.85■□□□□ 0.29
JMJD1C-211ENST00000633035 SLCO1B1Q9Y6L6 691 aa16.85■□□□□ 0.29
JMJD1C-211ENST00000633035 SPTBN4Q9H254 2564 aa16.85■□□□□ 0.29
JMJD1C-211ENST00000633035 ADAMTS9Q9P2N4 1935 aa16.84■□□□□ 0.29
JMJD1C-211ENST00000633035 UPK3BL1B0FP48 263 aa16.84■□□□□ 0.29
JMJD1C-211ENST00000633035 UPK3BL2E5RIL1 263 aa16.84■□□□□ 0.29
JMJD1C-211ENST00000633035 NEMP1O14524 444 aa16.84■□□□□ 0.29
JMJD1C-211ENST00000633035 VILLO15195 856 aa16.84■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.7 ms