RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000592561.5

PSMD8-208, Transcript of proteasome 26S subunit, non-ATPase 8, human

TSL 2

Gene PSMD8, Length 771 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PSMD8-208	ENST00000592561	HOMER3	Q9NSC5	361 aa		11.18	□□□□□ -0.62
PSMD8-208	ENST00000592561	FAM86C1	Q9NVL1	165 aa		11.18	□□□□□ -0.62
PSMD8-208	ENST00000592561	THAP10	Q9P2Z0	257 aa	Predicted RBP	11.18	□□□□□ -0.62
PSMD8-208	ENST00000592561	PCYOX1	Q9UHG3	505 aa		11.18	□□□□□ -0.62
PSMD8-208	ENST00000592561	VPS51	Q9UID3	782 aa		11.18	□□□□□ -0.62
PSMD8-208	ENST00000592561	HCN2	Q9UL51	889 aa		11.18	□□□□□ -0.62
PSMD8-208	ENST00000592561	PLA2G4C	Q9UP65	541 aa		11.18	□□□□□ -0.62
PSMD8-208	ENST00000592561	ANTXRL	A6NF34	631 aa		11.17	□□□□□ -0.62
PSMD8-208	ENST00000592561	ZSCAN5C	A6NGD5	496 aa	Predicted RBP	11.17	□□□□□ -0.62
PSMD8-208	ENST00000592561	CHURC1-FNTB	B4DL54	471 aa		11.17	□□□□□ -0.62
PSMD8-208	ENST00000592561	CBX4	O00257	560 aa		11.17	□□□□□ -0.62
PSMD8-208	ENST00000592561	KDELR3	O43731	214 aa		11.17	□□□□□ -0.62
PSMD8-208	ENST00000592561	SNAP91	O60641	907 aa		11.17	□□□□□ -0.62
PSMD8-208	ENST00000592561	CST8	O60676	142 aa		11.17	□□□□□ -0.62
PSMD8-208	ENST00000592561	ZMPSTE24	O75844	475 aa		11.17	□□□□□ -0.62
PSMD8-208	ENST00000592561	TJP3	O95049	919 aa		11.17	□□□□□ -0.62
PSMD8-208	ENST00000592561	FGG	P02679	453 aa		11.17	□□□□□ -0.62
PSMD8-208	ENST00000592561	TGM2	P21980	687 aa		11.17	□□□□□ -0.62
PSMD8-208	ENST00000592561	CTSO	P43234	321 aa	Predicted RBP	11.17	□□□□□ -0.62
PSMD8-208	ENST00000592561	NR2C2	P49116	596 aa		11.17	□□□□□ -0.62
PSMD8-208	ENST00000592561	PAPOLA	P51003	745 aa	Known RBP	11.17	□□□□□ -0.62
PSMD8-208	ENST00000592561	ARF5	P84085	180 aa		11.17	□□□□□ -0.62
PSMD8-208	ENST00000592561	GBE1	Q04446	702 aa		11.17	□□□□□ -0.62
PSMD8-208	ENST00000592561	SLC20A2	Q08357	652 aa		11.17	□□□□□ -0.62
PSMD8-208	ENST00000592561	ADCY2	Q08462	1091 aa		11.17	□□□□□ -0.62
PSMD8-208	ENST00000592561	GALNT2	Q10471	571 aa		11.17	□□□□□ -0.62
PSMD8-208	ENST00000592561	ZNF211	Q13398	564 aa	Predicted RBP	11.17	□□□□□ -0.62
PSMD8-208	ENST00000592561	ENPP2	Q13822	863 aa		11.17	□□□□□ -0.62
PSMD8-208	ENST00000592561	PTPRN	Q16849	979 aa		11.17	□□□□□ -0.62
PSMD8-208	ENST00000592561	C2orf27A	Q580R0	203 aa		11.17	□□□□□ -0.62
PSMD8-208	ENST00000592561	SEL1L2	Q5TEA6	688 aa		11.17	□□□□□ -0.62
PSMD8-208	ENST00000592561	EGFLAM	Q63HQ2	1017 aa		11.17	□□□□□ -0.62
PSMD8-208	ENST00000592561	KAZN	Q674X7	775 aa		11.17	□□□□□ -0.62
PSMD8-208	ENST00000592561	RETSAT	Q6NUM9	610 aa		11.17	□□□□□ -0.62
PSMD8-208	ENST00000592561	AADACL2	Q6P093	401 aa		11.17	□□□□□ -0.62
PSMD8-208	ENST00000592561	SYDE1	Q6ZW31	735 aa	Predicted RBP	11.17	□□□□□ -0.62
PSMD8-208	ENST00000592561	BBS12	Q6ZW61	710 aa		11.17	□□□□□ -0.62
PSMD8-208	ENST00000592561	LRRC49	Q8IUZ0	686 aa		11.17	□□□□□ -0.62
PSMD8-208	ENST00000592561	KLHL7	Q8IXQ5	586 aa		11.17	□□□□□ -0.62
PSMD8-208	ENST00000592561	ZNF513	Q8N8E2	541 aa	Predicted RBP	11.17	□□□□□ -0.62
PSMD8-208	ENST00000592561	CYB5D2	Q8WUJ1	264 aa		11.17	□□□□□ -0.62
PSMD8-208	ENST00000592561	SORCS1	Q8WY21	1168 aa		11.17	□□□□□ -0.62
PSMD8-208	ENST00000592561	MRGPRX3	Q96LB0	322 aa		11.17	□□□□□ -0.62
PSMD8-208	ENST00000592561	ERP44	Q9BS26	406 aa		11.17	□□□□□ -0.62
PSMD8-208	ENST00000592561	IER2	Q9BTL4	223 aa		11.17	□□□□□ -0.62
PSMD8-208	ENST00000592561	CHRD	Q9H2X0	955 aa		11.17	□□□□□ -0.62
PSMD8-208	ENST00000592561	SMARCAL1	Q9NZC9	954 aa		11.17	□□□□□ -0.62
PSMD8-208	ENST00000592561	DTL	Q9NZJ0	730 aa		11.17	□□□□□ -0.62
PSMD8-208	ENST00000592561	DLGAP2	Q9P1A6	1054 aa		11.17	□□□□□ -0.62
PSMD8-208	ENST00000592561	SLC25A13	Q9UJS0	675 aa		11.17	□□□□□ -0.62
PSMD8-208	ENST00000592561	ERVW-1	Q9UQF0	538 aa		11.17	□□□□□ -0.62
PSMD8-208	ENST00000592561	HS3ST2	Q9Y278	367 aa		11.17	□□□□□ -0.62
PSMD8-208	ENST00000592561	RAD54B	Q9Y620	910 aa		11.17	□□□□□ -0.62
PSMD8-208	ENST00000592561	CHD5	Q8TDI0	1954 aa		11.17	□□□□□ -0.62
PSMD8-208	ENST00000592561	DFFA	O00273	331 aa		11.16	□□□□□ -0.62
PSMD8-208	ENST00000592561	ATG13	O75143	517 aa		11.16	□□□□□ -0.62
PSMD8-208	ENST00000592561	DCN	P07585	359 aa	Known RBP	11.16	□□□□□ -0.62
PSMD8-208	ENST00000592561	MX2	P20592	715 aa		11.16	□□□□□ -0.62
PSMD8-208	ENST00000592561	GLDC	P23378	1020 aa		11.16	□□□□□ -0.62
PSMD8-208	ENST00000592561	NTSR1	P30989	418 aa		11.16	□□□□□ -0.62
PSMD8-208	ENST00000592561	NNMT	P40261	264 aa		11.16	□□□□□ -0.62
PSMD8-208	ENST00000592561	FNTA	P49354	379 aa		11.16	□□□□□ -0.62
PSMD8-208	ENST00000592561	NUMB	P49757	651 aa		11.16	□□□□□ -0.62
PSMD8-208	ENST00000592561	PTPN5	P54829	565 aa		11.16	□□□□□ -0.62
PSMD8-208	ENST00000592561	HNRNPH2	P55795	449 aa	Known RBP	11.16	□□□□□ -0.62
PSMD8-208	ENST00000592561	GEMIN4	P57678	1058 aa	Known RBP	11.16	□□□□□ -0.62
PSMD8-208	ENST00000592561	ST8SIA6	P61647	398 aa		11.16	□□□□□ -0.62
PSMD8-208	ENST00000592561	DYNLT1	P63172	113 aa		11.16	□□□□□ -0.62
PSMD8-208	ENST00000592561	SLC10A2	Q12908	348 aa	Predicted RBP	11.16	□□□□□ -0.62
PSMD8-208	ENST00000592561	HLTF	Q14527	1009 aa	Known RBP eCLIP	11.16	□□□□□ -0.62
PSMD8-208	ENST00000592561	ZNF234	Q14588	700 aa		11.16	□□□□□ -0.62
PSMD8-208	ENST00000592561	LLGL1	Q15334	1064 aa		11.16	□□□□□ -0.62
PSMD8-208	ENST00000592561	CYP1B1	Q16678	543 aa		11.16	□□□□□ -0.62
PSMD8-208	ENST00000592561	AGBL2	Q5U5Z8	902 aa		11.16	□□□□□ -0.62
PSMD8-208	ENST00000592561	DUPD1	Q68J44	220 aa		11.16	□□□□□ -0.62
PSMD8-208	ENST00000592561		Q6ZS52	159 aa		11.16	□□□□□ -0.62
PSMD8-208	ENST00000592561	BZW1	Q7L1Q6	419 aa	Known RBP	11.16	□□□□□ -0.62
PSMD8-208	ENST00000592561	SPATS2	Q86XZ4	545 aa	Known RBP	11.16	□□□□□ -0.62
PSMD8-208	ENST00000592561	ZNF354C	Q86Y25	554 aa		11.16	□□□□□ -0.62
PSMD8-208	ENST00000592561	TP53INP2	Q8IXH6	220 aa		11.16	□□□□□ -0.62
PSMD8-208	ENST00000592561	CHPF	Q8IZ52	775 aa		11.16	□□□□□ -0.62
PSMD8-208	ENST00000592561	FBXL6	Q8N531	539 aa		11.16	□□□□□ -0.62
PSMD8-208	ENST00000592561	ATPAF2	Q8N5M1	289 aa		11.16	□□□□□ -0.62
PSMD8-208	ENST00000592561	ALLC	Q8N6M5	410 aa		11.16	□□□□□ -0.62
PSMD8-208	ENST00000592561	IL17RC	Q8NAC3	791 aa		11.16	□□□□□ -0.62
PSMD8-208	ENST00000592561	NETO2	Q8NC67	525 aa		11.16	□□□□□ -0.62
PSMD8-208	ENST00000592561	RPLP0P6	Q8NHW5	317 aa		11.16	□□□□□ -0.62
PSMD8-208	ENST00000592561	P3H4	Q92791	437 aa		11.16	□□□□□ -0.62
PSMD8-208	ENST00000592561	SLCO2A1	Q92959	643 aa		11.16	□□□□□ -0.62
PSMD8-208	ENST00000592561	MYO19	Q96H55	970 aa		11.16	□□□□□ -0.62
PSMD8-208	ENST00000592561	RPL10L	Q96L21	214 aa	Known RBP	11.16	□□□□□ -0.62
PSMD8-208	ENST00000592561	HERPUD2	Q9BSE4	406 aa		11.16	□□□□□ -0.62
PSMD8-208	ENST00000592561	HEMGN	Q9BXL5	484 aa		11.16	□□□□□ -0.62
PSMD8-208	ENST00000592561	TMEM245	Q9H330	911 aa		11.16	□□□□□ -0.62
PSMD8-208	ENST00000592561	PDF	Q9HBH1	243 aa		11.16	□□□□□ -0.62
PSMD8-208	ENST00000592561	IPO11	Q9UI26	975 aa	Known RBP	11.16	□□□□□ -0.62
PSMD8-208	ENST00000592561	HEY1	Q9Y5J3	304 aa		11.16	□□□□□ -0.62
PSMD8-208	ENST00000592561	MUC22	E2RYF6	1773 aa	Predicted RBP	11.16	□□□□□ -0.62
PSMD8-208	ENST00000592561	WDFY4	Q6ZS81	3184 aa		11.15	□□□□□ -0.62
PSMD8-208	ENST00000592561	APOC4-APOC2	K7ER74	178 aa		11.15	□□□□□ -0.62

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 43 ms