RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000586851.5

CAPNS1-202, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 3

Gene CAPNS1, Length 616 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-202ENST00000586851 SLC10A2Q12908 348 aaPredicted RBP7.83□□□□□ -1.16
CAPNS1-202ENST00000586851 IRF5Q13568 498 aa7.83□□□□□ -1.16
CAPNS1-202ENST00000586851 IKBKEQ14164 716 aa7.83□□□□□ -1.16
CAPNS1-202ENST00000586851 AMHR2Q16671 573 aa7.83□□□□□ -1.16
CAPNS1-202ENST00000586851 MYLK3Q32MK0 819 aa7.83□□□□□ -1.16
CAPNS1-202ENST00000586851 SLC9B1Q4ZJI4 515 aa7.83□□□□□ -1.16
CAPNS1-202ENST00000586851 ARL13AQ5H913 290 aaPredicted RBP7.83□□□□□ -1.16
CAPNS1-202ENST00000586851 TMTC4Q5T4D3 741 aa7.83□□□□□ -1.16
CAPNS1-202ENST00000586851 PPP1R26Q5T8A7 1209 aaPredicted RBP7.83□□□□□ -1.16
CAPNS1-202ENST00000586851 EEF1DP3Q658K8 133 aa7.83□□□□□ -1.16
CAPNS1-202ENST00000586851 MAP1SQ66K74 1059 aaPredicted RBP7.83□□□□□ -1.16
CAPNS1-202ENST00000586851 KIAA0930Q6ICG6 404 aaPredicted RBP7.83□□□□□ -1.16
CAPNS1-202ENST00000586851 LRRC8EQ6NSJ5 796 aa7.83□□□□□ -1.16
CAPNS1-202ENST00000586851 TIGD7Q6NT04 549 aaPredicted RBP7.83□□□□□ -1.16
CAPNS1-202ENST00000586851 MAMDC4Q6UXC1 1216 aa7.83□□□□□ -1.16
CAPNS1-202ENST00000586851 FRA10AC1Q70Z53 315 aa7.83□□□□□ -1.16
CAPNS1-202ENST00000586851 ZC3HC1Q86WB0 502 aaKnown RBP7.83□□□□□ -1.16
CAPNS1-202ENST00000586851 ZNF567Q8N184 647 aa7.83□□□□□ -1.16
CAPNS1-202ENST00000586851 SCML4Q8N228 414 aa7.83□□□□□ -1.16
CAPNS1-202ENST00000586851 PELI3Q8N2H9 469 aa7.83□□□□□ -1.16
CAPNS1-202ENST00000586851 AADATQ8N5Z0 425 aa7.83□□□□□ -1.16
CAPNS1-202ENST00000586851 TOP6BLQ8N6T0 577 aa7.83□□□□□ -1.16
CAPNS1-202ENST00000586851 MINDY2Q8NBR6 621 aa7.83□□□□□ -1.16
CAPNS1-202ENST00000586851 CCNYQ8ND76 341 aa7.83□□□□□ -1.16
CAPNS1-202ENST00000586851 SHCBP1Q8NEM2 672 aa7.83□□□□□ -1.16
CAPNS1-202ENST00000586851 ZNF526Q8TF50 670 aaPredicted RBP7.83□□□□□ -1.16
CAPNS1-202ENST00000586851 PEX13Q92968 403 aa7.83□□□□□ -1.16
CAPNS1-202ENST00000586851 FATE1Q969F0 183 aa7.83□□□□□ -1.16
CAPNS1-202ENST00000586851 C18orf25Q96B23 403 aaPredicted RBP7.83□□□□□ -1.16
CAPNS1-202ENST00000586851 RCN3Q96D15 328 aa7.83□□□□□ -1.16
CAPNS1-202ENST00000586851 FAM84AQ96KN4 292 aa7.83□□□□□ -1.16
CAPNS1-202ENST00000586851 CNBD2Q96M20 576 aa7.83□□□□□ -1.16
CAPNS1-202ENST00000586851 SPATA33Q96N06 139 aa7.83□□□□□ -1.16
CAPNS1-202ENST00000586851 RDH12Q96NR8 316 aa7.83□□□□□ -1.16
CAPNS1-202ENST00000586851 SLC2A13Q96QE2 648 aa7.83□□□□□ -1.16
CAPNS1-202ENST00000586851 TCF12Q99081 682 aa7.83□□□□□ -1.16
CAPNS1-202ENST00000586851 NPY6RQ99463 290 aa7.83□□□□□ -1.16
CAPNS1-202ENST00000586851 HNRNPABQ99729 332 aaKnown RBP7.83□□□□□ -1.16
CAPNS1-202ENST00000586851 OSBPL6Q9BZF3 934 aa7.83□□□□□ -1.16
CAPNS1-202ENST00000586851 GRIP2Q9C0E4 1043 aa7.83□□□□□ -1.16
CAPNS1-202ENST00000586851 ADAMTS10Q9H324 1103 aa7.83□□□□□ -1.16
CAPNS1-202ENST00000586851 HIPK3Q9H422 1215 aa7.83□□□□□ -1.16
CAPNS1-202ENST00000586851 PRDM12Q9H4Q4 367 aa7.83□□□□□ -1.16
CAPNS1-202ENST00000586851 MROH8Q9H579 483 aa7.83□□□□□ -1.16
CAPNS1-202ENST00000586851 QTRT2Q9H974 415 aaKnown RBP7.83□□□□□ -1.16
CAPNS1-202ENST00000586851 COPS7BQ9H9Q2 264 aaPredicted RBP7.83□□□□□ -1.16
CAPNS1-202ENST00000586851 MEAF6Q9HAF1 191 aa7.83□□□□□ -1.16
CAPNS1-202ENST00000586851 ENTPD7Q9NQZ7 604 aa7.83□□□□□ -1.16
CAPNS1-202ENST00000586851 C20orf96Q9NUD7 363 aaPredicted RBP7.83□□□□□ -1.16
CAPNS1-202ENST00000586851 DDX18Q9NVP1 670 aaKnown RBP7.83□□□□□ -1.16
CAPNS1-202ENST00000586851 FAIMQ9NVQ4 179 aa7.83□□□□□ -1.16
CAPNS1-202ENST00000586851 SNTG2Q9NY99 539 aa7.83□□□□□ -1.16
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CAPNS1-202ENST00000586851 CROTQ9UKG9 612 aa7.83□□□□□ -1.16
CAPNS1-202ENST00000586851 PAIP2BQ9ULR5 123 aaKnown RBP7.83□□□□□ -1.16
CAPNS1-202ENST00000586851 B3GNT3Q9Y2A9 372 aa7.83□□□□□ -1.16
CAPNS1-202ENST00000586851 AP3M1Q9Y2T2 418 aa7.83□□□□□ -1.16
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CAPNS1-202ENST00000586851 TNS1Q9HBL0 1735 aaKnown RBP7.83□□□□□ -1.16
CAPNS1-202ENST00000586851 PDCD11Q14690 1871 aaKnown RBP7.83□□□□□ -1.16
CAPNS1-202ENST00000586851 A0A0J9YVX5 310 aa7.82□□□□□ -1.16
CAPNS1-202ENST00000586851 TCAF2A6NFQ2 919 aa7.82□□□□□ -1.16
CAPNS1-202ENST00000586851 TARM1B6A8C7 271 aa7.82□□□□□ -1.16
CAPNS1-202ENST00000586851 H0YAE9 185 aa7.82□□□□□ -1.16
CAPNS1-202ENST00000586851 PSMD12O00232 456 aaPredicted RBP7.82□□□□□ -1.16
CAPNS1-202ENST00000586851 TRIM24O15164 1050 aa7.82□□□□□ -1.16
CAPNS1-202ENST00000586851 UBDO15205 165 aa7.82□□□□□ -1.16
CAPNS1-202ENST00000586851 FGF10O15520 208 aaPredicted RBP7.82□□□□□ -1.16
CAPNS1-202ENST00000586851 GRID2O43424 1007 aa7.82□□□□□ -1.16
CAPNS1-202ENST00000586851 MGAMO43451 1857 aa7.82□□□□□ -1.16
CAPNS1-202ENST00000586851 MFSD11O43934 449 aa7.82□□□□□ -1.16
CAPNS1-202ENST00000586851 GPC4O75487 556 aa7.82□□□□□ -1.16
CAPNS1-202ENST00000586851 UPP2O95045 317 aa7.82□□□□□ -1.16
CAPNS1-202ENST00000586851 PAPSS2O95340 614 aaPredicted RBP7.82□□□□□ -1.16
CAPNS1-202ENST00000586851 APBA3O96018 575 aa7.82□□□□□ -1.16
CAPNS1-202ENST00000586851 ERVK-10P10266 1014 aa7.82□□□□□ -1.16
CAPNS1-202ENST00000586851 HSD17B1P14061 328 aa7.82□□□□□ -1.16
CAPNS1-202ENST00000586851 GOT1P17174 413 aa7.82□□□□□ -1.16
CAPNS1-202ENST00000586851 XRCC1P18887 633 aaPredicted RBP7.82□□□□□ -1.16
CAPNS1-202ENST00000586851 WARSP23381 471 aaKnown RBP7.82□□□□□ -1.16
CAPNS1-202ENST00000586851 MYF6P23409 242 aa7.82□□□□□ -1.16
CAPNS1-202ENST00000586851 PSMA4P25789 261 aaKnown RBP7.82□□□□□ -1.16
CAPNS1-202ENST00000586851 PTPN3P26045 913 aa7.82□□□□□ -1.16
CAPNS1-202ENST00000586851 TPI1P60174 286 aa7.82□□□□□ -1.16
CAPNS1-202ENST00000586851 ATP6V0D1P61421 351 aa7.82□□□□□ -1.16
CAPNS1-202ENST00000586851 NFKB2Q00653 900 aa7.82□□□□□ -1.16
CAPNS1-202ENST00000586851 FSTL1Q12841 308 aa7.82□□□□□ -1.16
CAPNS1-202ENST00000586851 USP4Q13107 963 aa7.82□□□□□ -1.16
CAPNS1-202ENST00000586851 CEACAM7Q14002 265 aa7.82□□□□□ -1.16
CAPNS1-202ENST00000586851 TTLL12Q14166 644 aaPredicted RBP7.82□□□□□ -1.16
CAPNS1-202ENST00000586851 KCTD2Q14681 263 aa7.82□□□□□ -1.16
CAPNS1-202ENST00000586851 USP10Q14694 798 aaKnown RBP7.82□□□□□ -1.16
CAPNS1-202ENST00000586851 PPP2R5DQ14738 602 aa7.82□□□□□ -1.16
CAPNS1-202ENST00000586851 ZBTB6Q15916 424 aa7.82□□□□□ -1.16
CAPNS1-202ENST00000586851 CA9Q16790 459 aa7.82□□□□□ -1.16
CAPNS1-202ENST00000586851 KIZQ2M2Z5 673 aa7.82□□□□□ -1.16
CAPNS1-202ENST00000586851 ZNF829Q3KNS6 432 aaPredicted RBP7.82□□□□□ -1.16
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