RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000567642.1

PPP4C-211, Transcript of protein phosphatase 4 catalytic subunit, humanhuman

TSL 2

Gene PPP4C, Length 658 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP4C-211ENST00000567642 GSCP56915 257 aaPredicted RBP21.36■■□□□ 1.01
PPP4C-211ENST00000567642 TYRO3Q06418 890 aa21.36■■□□□ 1.01
PPP4C-211ENST00000567642 DNAJC24Q6P3W2 148 aa21.36■■□□□ 1.01
PPP4C-211ENST00000567642 SCYL2Q6P3W7 929 aa21.36■■□□□ 1.01
PPP4C-211ENST00000567642 DHRS13Q6UX07 377 aa21.36■■□□□ 1.01
PPP4C-211ENST00000567642 NLRP14Q86W24 1093 aa21.36■■□□□ 1.01
PPP4C-211ENST00000567642 HORMAD1Q86X24 394 aa21.36■■□□□ 1.01
PPP4C-211ENST00000567642 C3orf20Q8ND61 904 aa21.36■■□□□ 1.01
PPP4C-211ENST00000567642 HDAC8Q9BY41 377 aa21.36■■□□□ 1.01
PPP4C-211ENST00000567642 CCDC86Q9H6F5 360 aaKnown RBP21.36■■□□□ 1.01
PPP4C-211ENST00000567642 ZDHHC6Q9H6R6 413 aa21.36■■□□□ 1.01
PPP4C-211ENST00000567642 TMEM248Q9NWD8 314 aa21.36■■□□□ 1.01
PPP4C-211ENST00000567642 RALYQ9UKM9 306 aaKnown RBP21.36■■□□□ 1.01
PPP4C-211ENST00000567642 MYLKQ15746 1914 aa21.35■■□□□ 1.01
PPP4C-211ENST00000567642 WDFY3Q8IZQ1 3526 aa21.35■■□□□ 1.01
PPP4C-211ENST00000567642 FAM149AA5PLN7 773 aa21.35■■□□□ 1.01
PPP4C-211ENST00000567642 ANKRD62A6NC57 917 aa21.35■■□□□ 1.01
PPP4C-211ENST00000567642 SIGLEC16A6NMB1 481 aa21.35■■□□□ 1.01
PPP4C-211ENST00000567642 THEGLP0DJG4 465 aa21.35■■□□□ 1.01
PPP4C-211ENST00000567642 AKT2P31751 481 aa21.35■■□□□ 1.01
PPP4C-211ENST00000567642 NEK3P51956 506 aa21.35■■□□□ 1.01
PPP4C-211ENST00000567642 DNAJC3Q13217 504 aa21.35■■□□□ 1.01
PPP4C-211ENST00000567642 ZNF284Q2VY69 593 aa21.35■■□□□ 1.01
PPP4C-211ENST00000567642 FBXL19Q6PCT2 694 aa21.35■■□□□ 1.01
PPP4C-211ENST00000567642 LEKR1Q6ZMV7 388 aa21.35■■□□□ 1.01
PPP4C-211ENST00000567642 MON1BQ7L1V2 547 aa21.35■■□□□ 1.01
PPP4C-211ENST00000567642 APTXQ7Z2E3 356 aaKnown RBP21.35■■□□□ 1.01
PPP4C-211ENST00000567642 SLFN11Q7Z7L1 901 aa21.35■■□□□ 1.01
PPP4C-211ENST00000567642 ARHGEF2Q92974 986 aaKnown RBP21.35■■□□□ 1.01
PPP4C-211ENST00000567642 MAGEH1Q9H213 219 aa21.35■■□□□ 1.01
PPP4C-211ENST00000567642 HSD3B7Q9H2F3 369 aa21.35■■□□□ 1.01
PPP4C-211ENST00000567642 RETREG1Q9H6L5 497 aa21.35■■□□□ 1.01
PPP4C-211ENST00000567642 HECAQ9UBI9 543 aaPredicted RBP21.35■■□□□ 1.01
PPP4C-211ENST00000567642 ARID1BQ8NFD5 2236 aaPredicted RBP21.35■■□□□ 1.01
PPP4C-211ENST00000567642 CCP110O43303 1012 aa21.34■■□□□ 1.01
PPP4C-211ENST00000567642 RAMP2O60895 175 aa21.34■■□□□ 1.01
PPP4C-211ENST00000567642 SDC3O75056 442 aa21.34■■□□□ 1.01
PPP4C-211ENST00000567642 CCDC172P0C7W6 258 aa21.34■■□□□ 1.01
PPP4C-211ENST00000567642 FERP16591 822 aa21.34■■□□□ 1.01
PPP4C-211ENST00000567642 HNRNPA2B1P22626 353 aaKnown RBP21.34■■□□□ 1.01
PPP4C-211ENST00000567642 ITGB7P26010 798 aa21.34■■□□□ 1.01
PPP4C-211ENST00000567642 L1CAMP32004 1257 aa21.34■■□□□ 1.01
PPP4C-211ENST00000567642 GEMIN4P57678 1058 aaKnown RBP21.34■■□□□ 1.01
PPP4C-211ENST00000567642 C1QBPQ07021 282 aaKnown RBP21.34■■□□□ 1.01
PPP4C-211ENST00000567642 MAPK8IP2Q13387 824 aaPredicted RBP21.34■■□□□ 1.01
PPP4C-211ENST00000567642 POLD3Q15054 466 aaPredicted RBP21.34■■□□□ 1.01
PPP4C-211ENST00000567642 EFHC2Q5JST6 749 aa21.34■■□□□ 1.01
PPP4C-211ENST00000567642 SEL1L3Q68CR1 1132 aa21.34■■□□□ 1.01
PPP4C-211ENST00000567642 PROSER1Q86XN7 944 aa21.34■■□□□ 1.01
PPP4C-211ENST00000567642 PYROXD2Q8N2H3 581 aa21.34■■□□□ 1.01
PPP4C-211ENST00000567642 OR6K2Q8NGY2 324 aa21.34■■□□□ 1.01
PPP4C-211ENST00000567642 MDM1Q8TC05 714 aa21.34■■□□□ 1.01
PPP4C-211ENST00000567642 NTAN1Q96AB6 310 aa21.34■■□□□ 1.01
PPP4C-211ENST00000567642 MCEEQ96PE7 176 aa21.34■■□□□ 1.01
PPP4C-211ENST00000567642 NAT10Q9H0A0 1025 aaKnown RBP21.34■■□□□ 1.01
PPP4C-211ENST00000567642 ZFR2Q9UPR6 939 aaKnown RBP21.34■■□□□ 1.01
PPP4C-211ENST00000567642 TAF4O00268 1085 aa21.33■■□□□ 1.01
PPP4C-211ENST00000567642 CD160O95971 181 aa21.33■■□□□ 1.01
PPP4C-211ENST00000567642 ADRB3P13945 408 aa21.33■■□□□ 1.01
PPP4C-211ENST00000567642 ANO6Q4KMQ2 910 aa21.33■■□□□ 1.01
PPP4C-211ENST00000567642 DCUN1D2Q6PH85 259 aa21.33■■□□□ 1.01
PPP4C-211ENST00000567642 TMEM145Q8NBT3 493 aa21.33■■□□□ 1.01
PPP4C-211ENST00000567642 CALN1Q9BXU9 219 aa21.33■■□□□ 1.01
PPP4C-211ENST00000567642 NEU3Q9UQ49 428 aa21.33■■□□□ 1.01
PPP4C-211ENST00000567642 CFAP47Q6ZTR5 3102 aa21.33■■□□□ 1
PPP4C-211ENST00000567642 TEX33O43247 280 aa21.32■■□□□ 1
PPP4C-211ENST00000567642 CREB3O43889 395 aa21.32■■□□□ 1
PPP4C-211ENST00000567642 RFPL3O75679 317 aa21.32■■□□□ 1
PPP4C-211ENST00000567642 CAPNS1P04632 268 aa21.32■■□□□ 1
PPP4C-211ENST00000567642 TNFAIP3P21580 790 aa21.32■■□□□ 1
PPP4C-211ENST00000567642 EPHB2P29323 1055 aa21.32■■□□□ 1
PPP4C-211ENST00000567642 GKP32189 559 aa21.32■■□□□ 1
PPP4C-211ENST00000567642 ZNF143P52747 638 aaPredicted RBP21.32■■□□□ 1
PPP4C-211ENST00000567642 CLDN2P57739 230 aa21.32■■□□□ 1
PPP4C-211ENST00000567642 SNRPD1P62314 119 aaKnown RBP21.32■■□□□ 1
PPP4C-211ENST00000567642 RPL7AP62424 266 aaKnown RBP21.32■■□□□ 1
PPP4C-211ENST00000567642 SMAD1Q15797 465 aaKnown RBP21.32■■□□□ 1
PPP4C-211ENST00000567642 ACAD10Q6JQN1 1059 aa21.32■■□□□ 1
PPP4C-211ENST00000567642 PARS2Q7L3T8 475 aaKnown RBP21.32■■□□□ 1
PPP4C-211ENST00000567642 ISG20Q96AZ6 181 aaKnown RBP21.32■■□□□ 1
PPP4C-211ENST00000567642 FEM1CQ96JP0 617 aa21.32■■□□□ 1
PPP4C-211ENST00000567642 TMEM63CQ9P1W3 806 aa21.32■■□□□ 1
PPP4C-211ENST00000567642 PCDHGA1Q9Y5H4 931 aa21.32■■□□□ 1
PPP4C-211ENST00000567642 TMCO5BA8MYB1 307 aa21.31■■□□□ 1
PPP4C-211ENST00000567642 KRIT1O00522 736 aa21.31■■□□□ 1
PPP4C-211ENST00000567642 BUB1O43683 1085 aa21.31■■□□□ 1
PPP4C-211ENST00000567642 KDELR3O43731 214 aa21.31■■□□□ 1
PPP4C-211ENST00000567642 DESP17661 470 aa21.31■■□□□ 1
PPP4C-211ENST00000567642 RPS21P63220 83 aaKnown RBP21.31■■□□□ 1
PPP4C-211ENST00000567642 SFMBT2Q5VUG0 894 aa21.31■■□□□ 1
PPP4C-211ENST00000567642 KIAA1161Q6NSJ0 714 aa21.31■■□□□ 1
PPP4C-211ENST00000567642 KANSL1Q7Z3B3 1105 aa21.31■■□□□ 1
PPP4C-211ENST00000567642 MCOLN2Q8IZK6 566 aa21.31■■□□□ 1
PPP4C-211ENST00000567642 OR13H1Q8NG92 308 aa21.31■■□□□ 1
PPP4C-211ENST00000567642 SLC17A9Q9BYT1 436 aa21.31■■□□□ 1
PPP4C-211ENST00000567642 FADS3Q9Y5Q0 445 aa21.31■■□□□ 1
PPP4C-211ENST00000567642 ADAMTS20P59510 1910 aa21.3■■□□□ 1
PPP4C-211ENST00000567642 CXorf51AA0A1B0GTR3 108 aa21.3■■□□□ 1
PPP4C-211ENST00000567642 TCRBV5S1A1TA0A578 114 aa21.3■■□□□ 1
PPP4C-211ENST00000567642 TRABD2BA6NFA1 517 aa21.3■■□□□ 1
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37.2 ms