RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000556593.1

CTAGE5-215, Transcript of Endoplasmic reticulum export factor CTAGE5, human

TSL 3

Gene CTAGE5, Length 605 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CTAGE5-215	ENST00000556593	ATRX	P46100	2492 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CTAGE5-215	ENST00000556593	CACNA1B	Q00975	2339 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CTAGE5-215	ENST00000556593	DOCK8	Q8NF50	2099 aa		4.9	□□□□□ -1.62
CTAGE5-215	ENST00000556593	ASPM	Q8IZT6	3477 aa		4.9	□□□□□ -1.62
CTAGE5-215	ENST00000556593	PTPRD	P23468	1912 aa		4.9	□□□□□ -1.62
CTAGE5-215	ENST00000556593	GREB1	Q4ZG55	1949 aa		4.9	□□□□□ -1.62
CTAGE5-215	ENST00000556593	SMCO2	A6NFE2	343 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CTAGE5-215	ENST00000556593	PRSS47	A8MTI9	375 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CTAGE5-215	ENST00000556593	PRR5-ARHGAP8	B1AHC4	643 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CTAGE5-215	ENST00000556593		J3KRW8	73 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CTAGE5-215	ENST00000556593	HAS3	O00219	553 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CTAGE5-215	ENST00000556593	FCHO1	O14526	889 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CTAGE5-215	ENST00000556593	ZNF185	O15231	689 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CTAGE5-215	ENST00000556593	ATP9A	O75110	1047 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CTAGE5-215	ENST00000556593	USP1	O94782	785 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CTAGE5-215	ENST00000556593	ELANE	P08246	267 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CTAGE5-215	ENST00000556593	SMIM10L2A	P0DMW4	78 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CTAGE5-215	ENST00000556593	SMIM10L2B	P0DMW5	78 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CTAGE5-215	ENST00000556593	KCNA2	P16389	499 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CTAGE5-215	ENST00000556593	PSMA5	P28066	241 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CTAGE5-215	ENST00000556593	TCF7	P36402	384 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
CTAGE5-215	ENST00000556593	GDF5	P43026	501 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CTAGE5-215	ENST00000556593	SELENOP	P49908	381 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CTAGE5-215	ENST00000556593	TUB	P50607	506 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CTAGE5-215	ENST00000556593	RCAN1	P53805	252 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CTAGE5-215	ENST00000556593	BFSP2	Q13515	415 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CTAGE5-215	ENST00000556593	GRM7	Q14831	915 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CTAGE5-215	ENST00000556593	GPNMB	Q14956	572 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CTAGE5-215	ENST00000556593	ELAVL1	Q15717	326 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
CTAGE5-215	ENST00000556593	PFKFB3	Q16875	520 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
CTAGE5-215	ENST00000556593	TCTN1	Q2MV58	587 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CTAGE5-215	ENST00000556593	HERC4	Q5GLZ8	1057 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
CTAGE5-215	ENST00000556593	TCEAL5	Q5H9L2	206 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CTAGE5-215	ENST00000556593	EEF1AKMT2	Q5JPI9	291 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
CTAGE5-215	ENST00000556593	INTS11	Q5TA45	600 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
CTAGE5-215	ENST00000556593	EFCAB12	Q6NXP0	572 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CTAGE5-215	ENST00000556593	ZNF585A	Q6P3V2	769 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CTAGE5-215	ENST00000556593	NFRKB	Q6P4R8	1299 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CTAGE5-215	ENST00000556593	CRIP3	Q6Q6R5	217 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CTAGE5-215	ENST00000556593	LRRC55	Q6ZSA7	311 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CTAGE5-215	ENST00000556593	TAX1BP1	Q86VP1	789 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CTAGE5-215	ENST00000556593	SDR16C5	Q8N3Y7	309 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CTAGE5-215	ENST00000556593	BPIFB1	Q8TDL5	484 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CTAGE5-215	ENST00000556593	ST8SIA2	Q92186	375 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CTAGE5-215	ENST00000556593	ZBTB10	Q96DT7	871 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CTAGE5-215	ENST00000556593	PABPC5	Q96DU9	382 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
CTAGE5-215	ENST00000556593	MRPL38	Q96DV4	380 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
CTAGE5-215	ENST00000556593	PPM1M	Q96MI6	270 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CTAGE5-215	ENST00000556593	WWC2-AS2	Q96NR7	200 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CTAGE5-215	ENST00000556593	TRIB1	Q96RU8	372 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CTAGE5-215	ENST00000556593	PRPF18	Q99633	342 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
CTAGE5-215	ENST00000556593	RAD9A	Q99638	391 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CTAGE5-215	ENST00000556593	C16orf70	Q9BSU1	422 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CTAGE5-215	ENST00000556593	DDX23	Q9BUQ8	820 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
CTAGE5-215	ENST00000556593	SEC61A2	Q9H9S3	476 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CTAGE5-215	ENST00000556593	RIC8A	Q9NPQ8	531 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CTAGE5-215	ENST00000556593	PDRG1	Q9NUG6	133 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CTAGE5-215	ENST00000556593	BARHL2	Q9NY43	387 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CTAGE5-215	ENST00000556593	PLA2G3	Q9NZ20	509 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CTAGE5-215	ENST00000556593	IFT80	Q9P2H3	777 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
CTAGE5-215	ENST00000556593	TCAF1	Q9Y4C2	921 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CTAGE5-215	ENST00000556593	UBIAD1	Q9Y5Z9	338 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CTAGE5-215	ENST00000556593	TPR	P12270	2363 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
CTAGE5-215	ENST00000556593	USP24	Q9UPU5	2620 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CTAGE5-215	ENST00000556593	EP300	Q09472	2414 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
CTAGE5-215	ENST00000556593	SCN1A	P35498	2009 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CTAGE5-215	ENST00000556593	GSTTP1	A0A1W2PQM5	241 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CTAGE5-215	ENST00000556593	FAM90A18P	A6NE21	464 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CTAGE5-215	ENST00000556593	FAM90A16P	A6NEW6	464 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CTAGE5-215	ENST00000556593	TMEM221	A6NGB7	291 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CTAGE5-215	ENST00000556593	FAM90A9P	A6NNJ1	464 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CTAGE5-215	ENST00000556593	FAM90A5P	A8MXJ8	464 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CTAGE5-215	ENST00000556593		M0R296	226 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CTAGE5-215	ENST00000556593	MYO1C	O00159	1063 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CTAGE5-215	ENST00000556593	DNPH1	O43598	174 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CTAGE5-215	ENST00000556593	ZNF623	O75123	536 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CTAGE5-215	ENST00000556593	STAM2	O75886	525 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CTAGE5-215	ENST00000556593	SUN1	O94901	812 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CTAGE5-215	ENST00000556593	LMNA	P02545	664 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
CTAGE5-215	ENST00000556593	FAM90A15P	P0C7V4	464 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CTAGE5-215	ENST00000556593	FAM90A14P	P0C7W9	464 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CTAGE5-215	ENST00000556593	TPH1	P17752	444 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CTAGE5-215	ENST00000556593	ICAM3	P32942	547 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CTAGE5-215	ENST00000556593	MSX2	P35548	267 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
CTAGE5-215	ENST00000556593	CCR5	P51681	352 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CTAGE5-215	ENST00000556593	DGKE	P52429	567 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CTAGE5-215	ENST00000556593	VCP	P55072	806 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
CTAGE5-215	ENST00000556593	MPP1	Q00013	466 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CTAGE5-215	ENST00000556593	AKAP17A	Q02040	695 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
CTAGE5-215	ENST00000556593	OCA2	Q04671	838 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CTAGE5-215	ENST00000556593	MYO1E	Q12965	1108 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CTAGE5-215	ENST00000556593	ITGB3BP	Q13352	177 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
CTAGE5-215	ENST00000556593	CUL4B	Q13620	913 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CTAGE5-215	ENST00000556593	NEDD9	Q14511	834 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CTAGE5-215	ENST00000556593	TRIM71	Q2Q1W2	868 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
CTAGE5-215	ENST00000556593	FBXO47	Q5MNV8	452 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CTAGE5-215	ENST00000556593	ZNF618	Q5T7W0	954 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CTAGE5-215	ENST00000556593	ARL6IP4	Q66PJ3	421 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
CTAGE5-215	ENST00000556593	ABLIM2	Q6H8Q1	611 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CTAGE5-215	ENST00000556593	MRNIP	Q6NTE8	343 aa		4.89	□□□□□ -1.63

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