RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000552222.5

CS-231, Transcript of citrate synthase, human

TSL 4

Gene CS, Length 555 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CS-231	ENST00000552222	TBC1D3I	A0A087WXS9	549 aa		14.17	□□□□□ -0.14
CS-231	ENST00000552222	TBC1D3E	A0A087X179	549 aa		14.17	□□□□□ -0.14
CS-231	ENST00000552222	TBC1D3K	A0A087X1G2	549 aa		14.17	□□□□□ -0.14
CS-231	ENST00000552222	TBC1D3F	A6NER0	549 aa	Predicted RBP	14.17	□□□□□ -0.14
CS-231	ENST00000552222	LRRC72	A6NJI9	287 aa		14.17	□□□□□ -0.14
CS-231	ENST00000552222	TMCO5B	A8MYB1	307 aa		14.17	□□□□□ -0.14
CS-231	ENST00000552222	TBC1D3L	B9A6J9	549 aa		14.17	□□□□□ -0.14
CS-231	ENST00000552222	HSF2BP	O75031	334 aa		14.17	□□□□□ -0.14
CS-231	ENST00000552222	FTL	P02792	175 aa	Predicted RBP	14.17	□□□□□ -0.14
CS-231	ENST00000552222	TBC1D3H	P0C7X1	549 aa		14.17	□□□□□ -0.14
CS-231	ENST00000552222	FECH	P22830	423 aa		14.17	□□□□□ -0.14
CS-231	ENST00000552222	CYP4F2	P78329	520 aa		14.17	□□□□□ -0.14
CS-231	ENST00000552222	COG7	P83436	770 aa		14.17	□□□□□ -0.14
CS-231	ENST00000552222	SKOR1	P84550	965 aa		14.17	□□□□□ -0.14
CS-231	ENST00000552222	TLE1	Q04724	770 aa		14.17	□□□□□ -0.14
CS-231	ENST00000552222	ZNF211	Q13398	564 aa	Predicted RBP	14.17	□□□□□ -0.14
CS-231	ENST00000552222	ARL13B	Q3SXY8	428 aa		14.17	□□□□□ -0.14
CS-231	ENST00000552222	MPPE1	Q53F39	396 aa		14.17	□□□□□ -0.14
CS-231	ENST00000552222	TBC1D3G	Q6DHY5	549 aa		14.17	□□□□□ -0.14
CS-231	ENST00000552222	TBC1D3C	Q6IPX1	549 aa		14.17	□□□□□ -0.14
CS-231	ENST00000552222	MSANTD2	Q6P1R3	559 aa		14.17	□□□□□ -0.14
CS-231	ENST00000552222	ATG14	Q6ZNE5	492 aa		14.17	□□□□□ -0.14
CS-231	ENST00000552222	USP30	Q70CQ3	517 aa		14.17	□□□□□ -0.14
CS-231	ENST00000552222	RSRC2	Q7L4I2	434 aa	Known RBP	14.17	□□□□□ -0.14
CS-231	ENST00000552222	TBC1D3	Q8IZP1	549 aa	Predicted RBP	14.17	□□□□□ -0.14
CS-231	ENST00000552222	RNF139	Q8WU17	664 aa		14.17	□□□□□ -0.14
CS-231	ENST00000552222	SKA1	Q96BD8	255 aa		14.17	□□□□□ -0.14
CS-231	ENST00000552222	TMA16	Q96EY4	203 aa	Known RBP	14.17	□□□□□ -0.14
CS-231	ENST00000552222	LMLN	Q96KR4	655 aa		14.17	□□□□□ -0.14
CS-231	ENST00000552222	APOLD1	Q96LR9	279 aa		14.17	□□□□□ -0.14
CS-231	ENST00000552222	SLC46A1	Q96NT5	459 aa		14.17	□□□□□ -0.14
CS-231	ENST00000552222	DEPDC7	Q96QD5	511 aa		14.17	□□□□□ -0.14
CS-231	ENST00000552222	SLC2A13	Q96QE2	648 aa		14.17	□□□□□ -0.14
CS-231	ENST00000552222	NHEJ1	Q9H9Q4	299 aa	Predicted RBP	14.17	□□□□□ -0.14
CS-231	ENST00000552222	THSD1	Q9NS62	852 aa		14.17	□□□□□ -0.14
CS-231	ENST00000552222	STARD5	Q9NSY2	213 aa		14.17	□□□□□ -0.14
CS-231	ENST00000552222	SLCO3A1	Q9UIG8	710 aa		14.17	□□□□□ -0.14
CS-231	ENST00000552222	GOLGA8S	H3BPF8	625 aa		14.16	□□□□□ -0.14
CS-231	ENST00000552222	TBL1X	O60907	577 aa		14.16	□□□□□ -0.14
CS-231	ENST00000552222	GRAP2	O75791	330 aa		14.16	□□□□□ -0.14
CS-231	ENST00000552222	POLR2E	P19388	210 aa	Known RBP	14.16	□□□□□ -0.14
CS-231	ENST00000552222	SLC6A4	P31645	630 aa		14.16	□□□□□ -0.14
CS-231	ENST00000552222	CSK	P41240	450 aa		14.16	□□□□□ -0.14
CS-231	ENST00000552222	UBAP2L	Q14157	1087 aa	Known RBP	14.16	□□□□□ -0.14
CS-231	ENST00000552222	SLC18A3	Q16572	532 aa		14.16	□□□□□ -0.14
CS-231	ENST00000552222	ISX	Q2M1V0	245 aa		14.16	□□□□□ -0.14
CS-231	ENST00000552222	FAM102A	Q5T9C2	384 aa	Predicted RBP	14.16	□□□□□ -0.14
CS-231	ENST00000552222	SYPL2	Q5VXT5	272 aa		14.16	□□□□□ -0.14
CS-231	ENST00000552222	ALKBH5	Q6P6C2	394 aa	Known RBP	14.16	□□□□□ -0.14
CS-231	ENST00000552222	ZNF574	Q6ZN55	896 aa	Predicted RBP	14.16	□□□□□ -0.14
CS-231	ENST00000552222	ARC	Q7LC44	396 aa		14.16	□□□□□ -0.14
CS-231	ENST00000552222	DNAAF5	Q86Y56	855 aa		14.16	□□□□□ -0.14
CS-231	ENST00000552222	AHI1	Q8N157	1196 aa		14.16	□□□□□ -0.14
CS-231	ENST00000552222	DDX51	Q8N8A6	666 aa	Known RBP eCLIP	14.16	□□□□□ -0.14
CS-231	ENST00000552222	C3orf20	Q8ND61	904 aa		14.16	□□□□□ -0.14
CS-231	ENST00000552222	CCDC42	Q96M95	316 aa		14.16	□□□□□ -0.14
CS-231	ENST00000552222	DCLK3	Q9C098	648 aa		14.16	□□□□□ -0.14
CS-231	ENST00000552222	ERVMER34-1	Q9H9K5	563 aa		14.16	□□□□□ -0.14
CS-231	ENST00000552222	FZD3	Q9NPG1	666 aa		14.16	□□□□□ -0.14
CS-231	ENST00000552222	TMEM59L	Q9UK28	342 aa		14.16	□□□□□ -0.14
CS-231	ENST00000552222	NAALADL1	Q9UQQ1	740 aa		14.16	□□□□□ -0.14
CS-231	ENST00000552222	TCRBV5S1A1T	A0A578	114 aa		14.15	□□□□□ -0.14
CS-231	ENST00000552222	YKT6	O15498	198 aa		14.15	□□□□□ -0.14
CS-231	ENST00000552222	DAB1	O75553	588 aa		14.15	□□□□□ -0.14
CS-231	ENST00000552222	GP1BB	P13224	206 aa		14.15	□□□□□ -0.14
CS-231	ENST00000552222	PRLR	P16471	622 aa		14.15	□□□□□ -0.14
CS-231	ENST00000552222	RRM1	P23921	792 aa		14.15	□□□□□ -0.14
CS-231	ENST00000552222	DRD3	P35462	400 aa		14.15	□□□□□ -0.14
CS-231	ENST00000552222	CCR5	P51681	352 aa		14.15	□□□□□ -0.14
CS-231	ENST00000552222	TRIP4	Q15650	581 aa	Predicted RBP	14.15	□□□□□ -0.14
CS-231	ENST00000552222	HNRNPA1L2	Q32P51	320 aa	Known RBP	14.15	□□□□□ -0.14
CS-231	ENST00000552222	FSCB	Q5H9T9	825 aa		14.15	□□□□□ -0.14
CS-231	ENST00000552222	CCDC122	Q5T0U0	273 aa		14.15	□□□□□ -0.14
CS-231	ENST00000552222	NAPEPLD	Q6IQ20	393 aa		14.15	□□□□□ -0.14
CS-231	ENST00000552222	PTRH1	Q86Y79	214 aa	Known RBP	14.15	□□□□□ -0.14
CS-231	ENST00000552222	DEFB106A	Q8N104	65 aa		14.15	□□□□□ -0.14
CS-231	ENST00000552222	LSMEM2	Q8N112	164 aa		14.15	□□□□□ -0.14
CS-231	ENST00000552222	MFSD2A	Q8NA29	543 aa		14.15	□□□□□ -0.14
CS-231	ENST00000552222	OR4C6	Q8NH72	309 aa		14.15	□□□□□ -0.14
CS-231	ENST00000552222	DQX1	Q8TE96	717 aa	Known RBP	14.15	□□□□□ -0.14
CS-231	ENST00000552222	WFIKKN2	Q8TEU8	576 aa		14.15	□□□□□ -0.14
CS-231	ENST00000552222	RPL10L	Q96L21	214 aa	Known RBP	14.15	□□□□□ -0.14
CS-231	ENST00000552222	DEF6	Q9H4E7	631 aa		14.15	□□□□□ -0.14
CS-231	ENST00000552222	SUN2	Q9UH99	717 aa		14.15	□□□□□ -0.14
CS-231	ENST00000552222	ENTPD2	Q9Y5L3	495 aa		14.15	□□□□□ -0.14
CS-231	ENST00000552222	KIF26B	Q2KJY2	2108 aa		14.15	□□□□□ -0.14
CS-231	ENST00000552222	UTP20	O75691	2785 aa	Known RBP	14.15	□□□□□ -0.14
CS-231	ENST00000552222	GOLGA6L6	A8MZA4	724 aa		14.14	□□□□□ -0.15
CS-231	ENST00000552222	LAT	O43561	262 aa		14.14	□□□□□ -0.15
CS-231	ENST00000552222	AKR1B10	O60218	316 aa		14.14	□□□□□ -0.15
CS-231	ENST00000552222	IGLV3-25	P01717	112 aa		14.14	□□□□□ -0.15
CS-231	ENST00000552222	CKMT1A	P12532	417 aa		14.14	□□□□□ -0.15
CS-231	ENST00000552222	WT1	P19544	449 aa	Predicted RBP	14.14	□□□□□ -0.15
CS-231	ENST00000552222	RBMS1	P29558	406 aa	Known RBP	14.14	□□□□□ -0.15
CS-231	ENST00000552222	NOS2	P35228	1153 aa		14.14	□□□□□ -0.15
CS-231	ENST00000552222	STK19	P49842	368 aa	Predicted RBP	14.14	□□□□□ -0.15
CS-231	ENST00000552222	GSDMD	P57764	484 aa		14.14	□□□□□ -0.15
CS-231	ENST00000552222	RNASE9	P60153	205 aa	Known RBP	14.14	□□□□□ -0.15
CS-231	ENST00000552222	CDKN3	Q16667	212 aa		14.14	□□□□□ -0.15
CS-231	ENST00000552222	C4orf17	Q53FE4	359 aa		14.14	□□□□□ -0.15

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