RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000551253.5

CS-225, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 3

Gene CS, Length 676 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-225ENST00000551253 UTP3Q9NQZ2 479 aaKnown RBP eCLIP7.31□□□□□ -1.24
CS-225ENST00000551253 TMEM30AQ9NV96 361 aa7.31□□□□□ -1.24
CS-225ENST00000551253 ELOVL2Q9NXB9 296 aa7.31□□□□□ -1.24
CS-225ENST00000551253 FBXL12Q9NXK8 326 aa7.31□□□□□ -1.24
CS-225ENST00000551253 GGT7Q9UJ14 662 aa7.31□□□□□ -1.24
CS-225ENST00000551253 PNMA8BQ9ULN7 279 aaPredicted RBP7.31□□□□□ -1.24
CS-225ENST00000551253 ABCA4P78363 2273 aa7.31□□□□□ -1.24
CS-225ENST00000551253 ATP8B3O60423 1300 aa7.3□□□□□ -1.24
CS-225ENST00000551253 TARSL2A2RTX5 802 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
CS-225ENST00000551253 GTPBP10A4D1E9 387 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
CS-225ENST00000551253 D6RAR5 112 aa7.3□□□□□ -1.24
CS-225ENST00000551253 H3BM21 787 aa7.3□□□□□ -1.24
CS-225ENST00000551253 KCNN4O15554 427 aa7.3□□□□□ -1.24
CS-225ENST00000551253 COCHO43405 550 aa7.3□□□□□ -1.24
CS-225ENST00000551253 TIMM44O43615 452 aa7.3□□□□□ -1.24
CS-225ENST00000551253 KRT86O43790 486 aa7.3□□□□□ -1.24
CS-225ENST00000551253 TRIM21P19474 475 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
CS-225ENST00000551253 TCN2P20062 427 aa7.3□□□□□ -1.24
CS-225ENST00000551253 TBXAS1P24557 533 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
CS-225ENST00000551253 EEF1GP26641 437 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
CS-225ENST00000551253 HTR1EP28566 365 aa7.3□□□□□ -1.24
CS-225ENST00000551253 NOS2P35228 1153 aa7.3□□□□□ -1.24
CS-225ENST00000551253 MTIF2P46199 727 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
CS-225ENST00000551253 RPIAP49247 311 aa7.3□□□□□ -1.24
CS-225ENST00000551253 NDST1P52848 882 aa7.3□□□□□ -1.24
CS-225ENST00000551253 CACNA2D1P54289 1103 aa7.3□□□□□ -1.24
CS-225ENST00000551253 MFAP3P55082 362 aa7.3□□□□□ -1.24
CS-225ENST00000551253 YWHAEP62258 255 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
CS-225ENST00000551253 TYRO3Q06418 890 aa7.3□□□□□ -1.24
CS-225ENST00000551253 CUL2Q13617 745 aa7.3□□□□□ -1.24
CS-225ENST00000551253 EIF4HQ15056 248 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
CS-225ENST00000551253 MAN2A1Q16706 1144 aa7.3□□□□□ -1.24
CS-225ENST00000551253 HECTD3Q5T447 861 aa7.3□□□□□ -1.24
CS-225ENST00000551253 HIST2H2BDQ6DRA6 164 aa7.3□□□□□ -1.24
CS-225ENST00000551253 JMJD6Q6NYC1 403 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
CS-225ENST00000551253 C11orf57Q6ZUT1 292 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
CS-225ENST00000551253 PRPF39Q86UA1 669 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
CS-225ENST00000551253 CREBRFQ8IUR6 639 aa7.3□□□□□ -1.24
CS-225ENST00000551253 NUP93Q8N1F7 819 aa7.3□□□□□ -1.24
CS-225ENST00000551253 UBR7Q8N806 425 aa7.3□□□□□ -1.24
CS-225ENST00000551253 RBBP8NLQ8NC74 664 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
CS-225ENST00000551253 EHBP1Q8NDI1 1231 aa7.3□□□□□ -1.24
CS-225ENST00000551253 PTPRN2Q92932 1015 aa7.3□□□□□ -1.24
CS-225ENST00000551253 NINJ1Q92982 152 aa7.3□□□□□ -1.24
CS-225ENST00000551253 KIAA1143Q96AT1 154 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
CS-225ENST00000551253 IFT43Q96FT9 208 aa7.3□□□□□ -1.24
CS-225ENST00000551253 TWNKQ96RR1 684 aa7.3□□□□□ -1.24
CS-225ENST00000551253 NT5C1AQ9BXI3 368 aa7.3□□□□□ -1.24
CS-225ENST00000551253 B3GNT5Q9BYG0 378 aa7.3□□□□□ -1.24
CS-225ENST00000551253 KRTAP17-1Q9BYP8 105 aa7.3□□□□□ -1.24
CS-225ENST00000551253 ZNF518BQ9C0D4 1074 aa7.3□□□□□ -1.24
CS-225ENST00000551253 DNAI2Q9GZS0 605 aa7.3□□□□□ -1.24
CS-225ENST00000551253 NEUROG2Q9H2A3 272 aa7.3□□□□□ -1.24
CS-225ENST00000551253 PABPC3Q9H361 631 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
CS-225ENST00000551253 GPN2Q9H9Y4 310 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
CS-225ENST00000551253 CISHQ9NSE2 258 aa7.3□□□□□ -1.24
CS-225ENST00000551253 SLTMQ9NWH9 1034 aaKnown RBP eCLIP7.3□□□□□ -1.24
CS-225ENST00000551253 COMMD8Q9NX08 183 aa7.3□□□□□ -1.24
CS-225ENST00000551253 IL37Q9NZH6 218 aa7.3□□□□□ -1.24
CS-225ENST00000551253 ARHGAP20Q9P2F6 1191 aa7.3□□□□□ -1.24
CS-225ENST00000551253 HMGXB4Q9UGU5 601 aa7.3□□□□□ -1.24
CS-225ENST00000551253 ADAM21Q9UKJ8 722 aa7.3□□□□□ -1.24
CS-225ENST00000551253 CSNK1G3Q9Y6M4 447 aa7.3□□□□□ -1.24
CS-225ENST00000551253 FAM92AA1XBS5 289 aa7.29□□□□□ -1.24
CS-225ENST00000551253 HAX1O00165 279 aa7.29□□□□□ -1.24
CS-225ENST00000551253 CLDN5O00501 218 aa7.29□□□□□ -1.24
CS-225ENST00000551253 F9P00740 461 aa7.29□□□□□ -1.24
CS-225ENST00000551253 HEXAP06865 529 aa7.29□□□□□ -1.24
CS-225ENST00000551253 ZDHHC11BP0C7U3 371 aa7.29□□□□□ -1.24
CS-225ENST00000551253 CD58P19256 250 aa7.29□□□□□ -1.24
CS-225ENST00000551253 NUDT1P36639 197 aa7.29□□□□□ -1.24
CS-225ENST00000551253 NOP2P46087 812 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
CS-225ENST00000551253 ARSDP51689 593 aa7.29□□□□□ -1.24
CS-225ENST00000551253 MYL5Q02045 173 aa7.29□□□□□ -1.24
CS-225ENST00000551253 GCNT1Q02742 428 aa7.29□□□□□ -1.24
CS-225ENST00000551253 TLE4Q04727 773 aa7.29□□□□□ -1.24
CS-225ENST00000551253 RUNX1T1Q06455 604 aa7.29□□□□□ -1.24
CS-225ENST00000551253 ZFP36L1Q07352 338 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
CS-225ENST00000551253 IFRD2Q12894 506 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
CS-225ENST00000551253 LRMPQ12912 555 aa7.29□□□□□ -1.24
CS-225ENST00000551253 EXOC3L4Q17RC7 722 aa7.29□□□□□ -1.24
CS-225ENST00000551253 VWA3BQ502W6 1294 aa7.29□□□□□ -1.24
CS-225ENST00000551253 TCP11X2Q5H9J9 407 aa7.29□□□□□ -1.24
CS-225ENST00000551253 ATP1A1-AS1Q5TC04 95 aa7.29□□□□□ -1.24
CS-225ENST00000551253 CDKAL1Q5VV42 579 aa7.29□□□□□ -1.24
CS-225ENST00000551253 ZNF776Q68DI1 518 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
CS-225ENST00000551253 SMYD5Q6GMV2 418 aa7.29□□□□□ -1.24
CS-225ENST00000551253 C16orf46Q6P387 395 aa7.29□□□□□ -1.24
CS-225ENST00000551253 CLEC9AQ6UXN8 241 aa7.29□□□□□ -1.24
CS-225ENST00000551253 BNC2Q6ZN30 1099 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
CS-225ENST00000551253 PAQR9Q6ZVX9 377 aa7.29□□□□□ -1.24
CS-225ENST00000551253 HTR3DQ70Z44 454 aa7.29□□□□□ -1.24
CS-225ENST00000551253 ACOT1Q86TX2 421 aa7.29□□□□□ -1.24
CS-225ENST00000551253 FAM35AQ86V20 835 aa7.29□□□□□ -1.24
CS-225ENST00000551253 FUKQ8N0W3 1084 aa7.29□□□□□ -1.24
CS-225ENST00000551253 PPM1KQ8N3J5 372 aa7.29□□□□□ -1.24
CS-225ENST00000551253 SNRNP40Q96DI7 357 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
CS-225ENST00000551253 SMARCD1Q96GM5 515 aa7.29□□□□□ -1.24
CS-225ENST00000551253 FAM81BQ96LP2 452 aa7.29□□□□□ -1.24
CS-225ENST00000551253 BPIFA3Q9BQP9 254 aa7.29□□□□□ -1.24
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