RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550358.5

PTPRB-208, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type B, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene PTPRB, Length 6,583 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRB-208ENST00000550358 ZC4H2Q9NQZ6 224 aa8.6□□□□□ -1.03
PTPRB-208ENST00000550358 VAV3Q9UKW4 847 aa8.6□□□□□ -1.03
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PTPRB-208ENST00000550358 STX11O75558 287 aa8.6□□□□□ -1.03
PTPRB-208ENST00000550358 ME2P23368 584 aa8.6□□□□□ -1.03
PTPRB-208ENST00000550358 ATN1P54259 1190 aaPredicted RBP8.6□□□□□ -1.03
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PTPRB-208ENST00000550358 TMEM175Q9BSA9 504 aa8.6□□□□□ -1.03
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PTPRB-208ENST00000550358 MRPS33Q9Y291 106 aaKnown RBP8.6□□□□□ -1.03
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PTPRB-208ENST00000550358 EPB41L4BQ9H329 900 aa8.59□□□□□ -1.03
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PTPRB-208ENST00000550358 TRPS1Q9UHF7 1281 aa8.59□□□□□ -1.03
PTPRB-208ENST00000550358 DUSP12Q9UNI6 340 aa8.59□□□□□ -1.03
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PTPRB-208ENST00000550358 NALCNQ8IZF0 1738 aa8.59□□□□□ -1.03
PTPRB-208ENST00000550358 PTPRJQ12913 1337 aa8.59□□□□□ -1.03
PTPRB-208ENST00000550358 E9PBE3 544 aa8.59□□□□□ -1.03
PTPRB-208ENST00000550358 VAPBO95292 243 aa8.59□□□□□ -1.03
PTPRB-208ENST00000550358 GABRB2P47870 512 aa8.59□□□□□ -1.03
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