RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000543658.5

DDB1-223, Transcript of damage specific DNA binding protein 1, human

TSL 4

Gene DDB1, Length 571 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
DDB1-223	ENST00000543658	NDC80	O14777	642 aa		12.08	□□□□□ -0.48
DDB1-223	ENST00000543658	TTI1	O43156	1089 aa		12.08	□□□□□ -0.48
DDB1-223	ENST00000543658	HLA-DQB2	P05538	268 aa		12.08	□□□□□ -0.48
DDB1-223	ENST00000543658	CA4	P22748	312 aa		12.08	□□□□□ -0.48
DDB1-223	ENST00000543658	FDFT1	P37268	417 aa		12.08	□□□□□ -0.48
DDB1-223	ENST00000543658	MAPK8	P45983	427 aa		12.08	□□□□□ -0.48
DDB1-223	ENST00000543658	VPS41	P49754	854 aa		12.08	□□□□□ -0.48
DDB1-223	ENST00000543658	VASP	P50552	380 aa	Predicted RBP	12.08	□□□□□ -0.48
DDB1-223	ENST00000543658	TUBB4B	P68371	445 aa		12.08	□□□□□ -0.48
DDB1-223	ENST00000543658	BASP1	P80723	227 aa	Known RBP	12.08	□□□□□ -0.48
DDB1-223	ENST00000543658	MRPS21	P82921	87 aa	Known RBP	12.08	□□□□□ -0.48
DDB1-223	ENST00000543658	MESP2	Q0VG99	397 aa		12.08	□□□□□ -0.48
DDB1-223	ENST00000543658	TRIP13	Q15645	432 aa	Predicted RBP	12.08	□□□□□ -0.48
DDB1-223	ENST00000543658	DLG2	Q15700	870 aa		12.08	□□□□□ -0.48
DDB1-223	ENST00000543658	GLE1	Q53GS7	698 aa	Known RBP	12.08	□□□□□ -0.48
DDB1-223	ENST00000543658	EGFLAM	Q63HQ2	1017 aa		12.08	□□□□□ -0.48
DDB1-223	ENST00000543658	FSTL4	Q6MZW2	842 aa		12.08	□□□□□ -0.48
DDB1-223	ENST00000543658	JAML	Q86YT9	394 aa		12.08	□□□□□ -0.48
DDB1-223	ENST00000543658	ZNF567	Q8N184	647 aa		12.08	□□□□□ -0.48
DDB1-223	ENST00000543658	ZC3H8	Q8N5P1	291 aa	Known RBP eCLIP	12.08	□□□□□ -0.48
DDB1-223	ENST00000543658	TEX26	Q8N6G2	289 aa		12.08	□□□□□ -0.48
DDB1-223	ENST00000543658	KCNV2	Q8TDN2	545 aa		12.08	□□□□□ -0.48
DDB1-223	ENST00000543658	SLCO2A1	Q92959	643 aa		12.08	□□□□□ -0.48
DDB1-223	ENST00000543658	ISG20	Q96AZ6	181 aa	Known RBP	12.08	□□□□□ -0.48
DDB1-223	ENST00000543658	RTP4	Q96DX8	246 aa		12.08	□□□□□ -0.48
DDB1-223	ENST00000543658	PSKH2	Q96QS6	385 aa		12.08	□□□□□ -0.48
DDB1-223	ENST00000543658	USP29	Q9HBJ7	922 aa		12.08	□□□□□ -0.48
DDB1-223	ENST00000543658	THAP10	Q9P2Z0	257 aa	Predicted RBP	12.08	□□□□□ -0.48
DDB1-223	ENST00000543658	SUN2	Q9UH99	717 aa		12.08	□□□□□ -0.48
DDB1-223	ENST00000543658	STARD13	Q9Y3M8	1113 aa		12.08	□□□□□ -0.48
DDB1-223	ENST00000543658	EDDM13	A0A1B0GTR0	161 aa		12.07	□□□□□ -0.48
DDB1-223	ENST00000543658	KANSL1L	A0AUZ9	987 aa		12.07	□□□□□ -0.48
DDB1-223	ENST00000543658		K7EQS6	105 aa		12.07	□□□□□ -0.48
DDB1-223	ENST00000543658		K7ERQ8	282 aa		12.07	□□□□□ -0.48
DDB1-223	ENST00000543658	ZBTB24	O43167	697 aa	Predicted RBP	12.07	□□□□□ -0.48
DDB1-223	ENST00000543658	RAD51C	O43502	376 aa		12.07	□□□□□ -0.48
DDB1-223	ENST00000543658	ATP9B	O43861	1147 aa		12.07	□□□□□ -0.48
DDB1-223	ENST00000543658	SYNCRIP	O60506	623 aa	Known RBP	12.07	□□□□□ -0.48
DDB1-223	ENST00000543658	RNF40	O75150	1001 aa		12.07	□□□□□ -0.48
DDB1-223	ENST00000543658	GCAT	O75600	419 aa		12.07	□□□□□ -0.48
DDB1-223	ENST00000543658	ANXA9	O76027	345 aa		12.07	□□□□□ -0.48
DDB1-223	ENST00000543658	PEX11B	O96011	259 aa		12.07	□□□□□ -0.48
DDB1-223	ENST00000543658	GSR	P00390	522 aa		12.07	□□□□□ -0.48
DDB1-223	ENST00000543658	MT-CO1	P00395	513 aa		12.07	□□□□□ -0.48
DDB1-223	ENST00000543658	EPHX1	P07099	455 aa		12.07	□□□□□ -0.48
DDB1-223	ENST00000543658	HNRNPL	P14866	589 aa	Known RBP eCLIP	12.07	□□□□□ -0.48	6e-6	■■■□□ 18.9
DDB1-223	ENST00000543658	NFKB1	P19838	968 aa		12.07	□□□□□ -0.48
DDB1-223	ENST00000543658	CD72	P21854	359 aa		12.07	□□□□□ -0.48
DDB1-223	ENST00000543658	CES1	P23141	567 aa		12.07	□□□□□ -0.48
DDB1-223	ENST00000543658	ADCY8	P40145	1251 aa		12.07	□□□□□ -0.48
DDB1-223	ENST00000543658	SCNN1B	P51168	640 aa		12.07	□□□□□ -0.48
DDB1-223	ENST00000543658	STARD6	P59095	220 aa		12.07	□□□□□ -0.48
DDB1-223	ENST00000543658	MAX	P61244	160 aa		12.07	□□□□□ -0.48
DDB1-223	ENST00000543658	ZXDA	P98168	799 aa		12.07	□□□□□ -0.48
DDB1-223	ENST00000543658	WASHC5	Q12768	1159 aa		12.07	□□□□□ -0.48
DDB1-223	ENST00000543658	GPS1	Q13098	491 aa		12.07	□□□□□ -0.48
DDB1-223	ENST00000543658	PTK6	Q13882	451 aa		12.07	□□□□□ -0.48
DDB1-223	ENST00000543658	STARD3	Q14849	445 aa		12.07	□□□□□ -0.48
DDB1-223	ENST00000543658	CYTH1	Q15438	398 aa		12.07	□□□□□ -0.48
DDB1-223	ENST00000543658	HSF5	Q4G112	596 aa	Predicted RBP	12.07	□□□□□ -0.48
DDB1-223	ENST00000543658	C2orf27A	Q580R0	203 aa		12.07	□□□□□ -0.48
DDB1-223	ENST00000543658	CFAP58	Q5T655	872 aa		12.07	□□□□□ -0.48
DDB1-223	ENST00000543658	IER5L	Q5T953	404 aa		12.07	□□□□□ -0.48
DDB1-223	ENST00000543658	TSEN2	Q8NCE0	465 aa	Known RBP	12.07	□□□□□ -0.48
DDB1-223	ENST00000543658	OR2AP1	Q8NGE2	309 aa		12.07	□□□□□ -0.48
DDB1-223	ENST00000543658	EXOC2	Q96KP1	924 aa		12.07	□□□□□ -0.48
DDB1-223	ENST00000543658	MRGPRX3	Q96LB0	322 aa		12.07	□□□□□ -0.48
DDB1-223	ENST00000543658	TEKT5	Q96M29	485 aa		12.07	□□□□□ -0.48
DDB1-223	ENST00000543658	NECAB3	Q96P71	396 aa	Predicted RBP	12.07	□□□□□ -0.48
DDB1-223	ENST00000543658	NELL2	Q99435	816 aa		12.07	□□□□□ -0.48
DDB1-223	ENST00000543658	MGME1	Q9BQP7	344 aa		12.07	□□□□□ -0.48
DDB1-223	ENST00000543658	TRIM51	Q9BSJ1	452 aa		12.07	□□□□□ -0.48
DDB1-223	ENST00000543658	GBA3	Q9H227	469 aa		12.07	□□□□□ -0.48
DDB1-223	ENST00000543658	TNKS2	Q9H2K2	1166 aa		12.07	□□□□□ -0.48
DDB1-223	ENST00000543658	TBC1D17	Q9HA65	648 aa		12.07	□□□□□ -0.48
DDB1-223	ENST00000543658	GLOD4	Q9HC38	313 aa		12.07	□□□□□ -0.48
DDB1-223	ENST00000543658	FBRSL1	Q9HCM7	1045 aa	Known RBP	12.07	□□□□□ -0.48
DDB1-223	ENST00000543658	LTB4R2	Q9NPC1	389 aa		12.07	□□□□□ -0.48
DDB1-223	ENST00000543658	LHX3	Q9UBR4	397 aa		12.07	□□□□□ -0.48
DDB1-223	ENST00000543658	SLCO3A1	Q9UIG8	710 aa		12.07	□□□□□ -0.48
DDB1-223	ENST00000543658	F5	P12259	2224 aa		12.07	□□□□□ -0.48
DDB1-223	ENST00000543658	KRBA1	A5PL33	1030 aa		12.06	□□□□□ -0.48
DDB1-223	ENST00000543658	EFCAB8	A8MWE9	144 aa		12.06	□□□□□ -0.48
DDB1-223	ENST00000543658	TTC34	A8MYJ7	566 aa		12.06	□□□□□ -0.48
DDB1-223	ENST00000543658		F5H423	210 aa	Predicted RBP	12.06	□□□□□ -0.48
DDB1-223	ENST00000543658	RIOK3	O14730	519 aa	Known RBP	12.06	□□□□□ -0.48
DDB1-223	ENST00000543658	PSMD3	O43242	534 aa		12.06	□□□□□ -0.48
DDB1-223	ENST00000543658	SMAD6	O43541	496 aa	Known RBP	12.06	□□□□□ -0.48
DDB1-223	ENST00000543658	HEXIM1	O94992	359 aa	Known RBP	12.06	□□□□□ -0.48
DDB1-223	ENST00000543658	KLF8	O95600	359 aa	Predicted RBP	12.06	□□□□□ -0.48
DDB1-223	ENST00000543658	CD160	O95971	181 aa		12.06	□□□□□ -0.48
DDB1-223	ENST00000543658	SERPINF2	P08697	491 aa		12.06	□□□□□ -0.48
DDB1-223	ENST00000543658	ETS1	P14921	441 aa		12.06	□□□□□ -0.48
DDB1-223	ENST00000543658	PSMB4	P28070	264 aa		12.06	□□□□□ -0.48
DDB1-223	ENST00000543658	NTSR1	P30989	418 aa		12.06	□□□□□ -0.48
DDB1-223	ENST00000543658	IL12RB1	P42701	662 aa		12.06	□□□□□ -0.48
DDB1-223	ENST00000543658	GEM	P55040	296 aa		12.06	□□□□□ -0.48
DDB1-223	ENST00000543658	AP1S1	P61966	158 aa		12.06	□□□□□ -0.48
DDB1-223	ENST00000543658	SIGLEC14	Q08ET2	396 aa		12.06	□□□□□ -0.48
DDB1-223	ENST00000543658	CALCOCO2	Q13137	446 aa		12.06	□□□□□ -0.48

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