RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000519057.5

COPS5-208, Transcript of COP9 signalosome subunit 5, human

TSL 4

Gene COPS5, Length 566 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
COPS5-208	ENST00000519057	TMEM18	Q96B42	140 aa		4.65	□□□□□ -1.67
COPS5-208	ENST00000519057	PCGF6	Q9BYE7	350 aa		4.65	□□□□□ -1.67
COPS5-208	ENST00000519057	LHPP	Q9H008	270 aa		4.65	□□□□□ -1.67
COPS5-208	ENST00000519057	PLEKHA2	Q9HB19	425 aa		4.65	□□□□□ -1.67
COPS5-208	ENST00000519057	THAP1	Q9NVV9	213 aa		4.65	□□□□□ -1.67
COPS5-208	ENST00000519057	OCIAD1	Q9NX40	245 aa		4.65	□□□□□ -1.67
COPS5-208	ENST00000519057	AGO1	Q9UL18	857 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
COPS5-208	ENST00000519057	LINC01553	A4QN01	128 aa		4.64	□□□□□ -1.67
COPS5-208	ENST00000519057	SLC16A5	O15375	505 aa		4.64	□□□□□ -1.67
COPS5-208	ENST00000519057	CCNT1	O60563	726 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
COPS5-208	ENST00000519057	LDB3	O75112	727 aa		4.64	□□□□□ -1.67
COPS5-208	ENST00000519057	MMP3	P08254	477 aa		4.64	□□□□□ -1.67
COPS5-208	ENST00000519057	CSF1	P09603	554 aa		4.64	□□□□□ -1.67
COPS5-208	ENST00000519057	DCTD	P32321	178 aa		4.64	□□□□□ -1.67
COPS5-208	ENST00000519057	RFC1	P35251	1148 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
COPS5-208	ENST00000519057	MTNR1A	P48039	350 aa		4.64	□□□□□ -1.67
COPS5-208	ENST00000519057	ICA1	Q05084	483 aa		4.64	□□□□□ -1.67
COPS5-208	ENST00000519057	FOXO1	Q12778	655 aa		4.64	□□□□□ -1.67
COPS5-208	ENST00000519057	CTTN	Q14247	550 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
COPS5-208	ENST00000519057	SMAD1	Q15797	465 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
COPS5-208	ENST00000519057	HLF	Q16534	295 aa		4.64	□□□□□ -1.67
COPS5-208	ENST00000519057	TMEM268	Q5VZI3	342 aa		4.64	□□□□□ -1.67
COPS5-208	ENST00000519057	MON1B	Q7L1V2	547 aa		4.64	□□□□□ -1.67
COPS5-208	ENST00000519057	SYT13	Q7L8C5	426 aa		4.64	□□□□□ -1.67
COPS5-208	ENST00000519057	MSTO1	Q9BUK6	570 aa		4.64	□□□□□ -1.67
COPS5-208	ENST00000519057	ZNF700	Q9H0M5	742 aa		4.64	□□□□□ -1.67
COPS5-208	ENST00000519057	CXorf56	Q9H5V9	222 aa		4.64	□□□□□ -1.67
COPS5-208	ENST00000519057	G6PC2	Q9NQR9	355 aa		4.64	□□□□□ -1.67
COPS5-208	ENST00000519057	GRHL1	Q9NZI5	618 aa		4.64	□□□□□ -1.67
COPS5-208	ENST00000519057	HDAC6	Q9UBN7	1215 aa		4.64	□□□□□ -1.67
COPS5-208	ENST00000519057	ZCCHC6	Q5VYS8	1495 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
COPS5-208	ENST00000519057	PLSCR5	A0PG75	271 aa		4.63	□□□□□ -1.67
COPS5-208	ENST00000519057	EYA2	O00167	538 aa		4.63	□□□□□ -1.67
COPS5-208	ENST00000519057	CAMTA2	O94983	1202 aa		4.63	□□□□□ -1.67
COPS5-208	ENST00000519057	CSTB	P04080	98 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
COPS5-208	ENST00000519057	PNPLA4	P41247	253 aa		4.63	□□□□□ -1.67
COPS5-208	ENST00000519057	MXI1	P50539	228 aa		4.63	□□□□□ -1.67
COPS5-208	ENST00000519057	PRKAA2	P54646	552 aa		4.63	□□□□□ -1.67
COPS5-208	ENST00000519057	TUBA1B	P68363	451 aa		4.63	□□□□□ -1.67
COPS5-208	ENST00000519057	ILF3	Q12906	894 aa	Known RBP eCLIP	4.63	□□□□□ -1.67
COPS5-208	ENST00000519057	THOC5	Q13769	683 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
COPS5-208	ENST00000519057	KRTAP24-1	Q3LI83	254 aa		4.63	□□□□□ -1.67
COPS5-208	ENST00000519057	SYCP2L	Q5T4T6	812 aa		4.63	□□□□□ -1.67
COPS5-208	ENST00000519057	GFI1B	Q5VTD9	330 aa		4.63	□□□□□ -1.67
COPS5-208	ENST00000519057	PALB2	Q86YC2	1186 aa		4.63	□□□□□ -1.67
COPS5-208	ENST00000519057	FSIP1	Q8NA03	581 aa		4.63	□□□□□ -1.67
COPS5-208	ENST00000519057	OR4N2	Q8NGD1	307 aa		4.63	□□□□□ -1.67
COPS5-208	ENST00000519057	SLC25A33	Q9BSK2	321 aa		4.63	□□□□□ -1.67
COPS5-208	ENST00000519057	NPFFR1	Q9GZQ6	430 aa		4.63	□□□□□ -1.67
COPS5-208	ENST00000519057	SLC45A1	Q9Y2W3	748 aa		4.63	□□□□□ -1.67
COPS5-208	ENST00000519057	CKAP5	Q14008	2032 aa		4.63	□□□□□ -1.67
COPS5-208	ENST00000519057	CYSRT1	A8MQ03	144 aa		4.62	□□□□□ -1.67
COPS5-208	ENST00000519057	ITM2A	O43736	263 aa		4.62	□□□□□ -1.67
COPS5-208	ENST00000519057	PLG	P00747	810 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
COPS5-208	ENST00000519057	GJC1	P36383	396 aa		4.62	□□□□□ -1.67
COPS5-208	ENST00000519057	DLX5	P56178	289 aa		4.62	□□□□□ -1.67
COPS5-208	ENST00000519057	POU5F1B	Q06416	359 aa		4.62	□□□□□ -1.67
COPS5-208	ENST00000519057	RPE65	Q16518	533 aa		4.62	□□□□□ -1.67
COPS5-208	ENST00000519057	KIF19	Q2TAC6	998 aa		4.62	□□□□□ -1.67
COPS5-208	ENST00000519057	ZNF718	Q3SXZ3	478 aa		4.62	□□□□□ -1.67
COPS5-208	ENST00000519057	PATL1	Q86TB9	770 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
COPS5-208	ENST00000519057	TCP11L2	Q8N4U5	519 aa		4.62	□□□□□ -1.67
COPS5-208	ENST00000519057	ZBTB8B	Q8NAP8	495 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
COPS5-208	ENST00000519057	KTI12	Q96EK9	354 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
COPS5-208	ENST00000519057	PKP4	Q99569	1192 aa		4.62	□□□□□ -1.67
COPS5-208	ENST00000519057	CLK4	Q9HAZ1	481 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
COPS5-208	ENST00000519057	NLK	Q9UBE8	527 aa		4.62	□□□□□ -1.67
COPS5-208	ENST00000519057	GRHPR	Q9UBQ7	328 aa		4.62	□□□□□ -1.67
COPS5-208	ENST00000519057	SRP68	Q9UHB9	627 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
COPS5-208	ENST00000519057	LOC102724159	A0A0B4J2E5	919 aa		4.61	□□□□□ -1.67
COPS5-208	ENST00000519057	DENND3	A2RUS2	1198 aa		4.61	□□□□□ -1.67
COPS5-208	ENST00000519057	HMX3	A6NHT5	357 aa		4.61	□□□□□ -1.67
COPS5-208	ENST00000519057		E7EVH7	732 aa		4.61	□□□□□ -1.67
COPS5-208	ENST00000519057	GRID2	O43424	1007 aa		4.61	□□□□□ -1.67
COPS5-208	ENST00000519057	METTL18	O95568	372 aa		4.61	□□□□□ -1.67
COPS5-208	ENST00000519057	TFRC	P02786	760 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
COPS5-208	ENST00000519057	SNRNP70	P08621	437 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
COPS5-208	ENST00000519057	CKMT1A	P12532	417 aa		4.61	□□□□□ -1.67
COPS5-208	ENST00000519057	VEGFA	P15692	232 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
COPS5-208	ENST00000519057	CST5	P28325	142 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
COPS5-208	ENST00000519057	C21orf33	P30042	268 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
COPS5-208	ENST00000519057	SKIV2L2	P42285	1042 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
COPS5-208	ENST00000519057	PTPN9	P43378	593 aa		4.61	□□□□□ -1.67
COPS5-208	ENST00000519057	ADORA2A-AS1	P86434	159 aa		4.61	□□□□□ -1.67
COPS5-208	ENST00000519057	PWP2	Q15269	919 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
COPS5-208	ENST00000519057	AP5B1	Q2VPB7	878 aa		4.61	□□□□□ -1.67
COPS5-208	ENST00000519057	ZNF672	Q499Z4	452 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
COPS5-208	ENST00000519057	RUNDC3A	Q59EK9	446 aa		4.61	□□□□□ -1.67
COPS5-208	ENST00000519057	GSG1L	Q6UXU4	331 aa		4.61	□□□□□ -1.67
COPS5-208	ENST00000519057	TMC8	Q8IU68	726 aa		4.61	□□□□□ -1.67
COPS5-208	ENST00000519057	LILRB1	Q8NHL6	650 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
COPS5-208	ENST00000519057	SLC39A13	Q96H72	371 aa		4.61	□□□□□ -1.67
COPS5-208	ENST00000519057	GAREM1	Q9H706	876 aa		4.61	□□□□□ -1.67
COPS5-208	ENST00000519057	MVB12B	Q9H7P6	319 aa		4.61	□□□□□ -1.67
COPS5-208	ENST00000519057	WDR6	Q9NNW5	1121 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
COPS5-208	ENST00000519057	TLR8	Q9NR97	1041 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
COPS5-208	ENST00000519057	FBXO40	Q9UH90	709 aa		4.61	□□□□□ -1.67
COPS5-208	ENST00000519057	DYTN	A2CJ06	578 aa		4.6	□□□□□ -1.67
COPS5-208	ENST00000519057	KDM4E	B2RXH2	506 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
COPS5-208	ENST00000519057	IPO5	O00410	1097 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67

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