RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000514552.5

PDE4D-222, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 3

Gene PDE4D, Length 494 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-222ENST00000514552 CDY1Q9Y6F8 540 aa7.33□□□□□ -1.24
PDE4D-222ENST00000514552 ACACBO00763 2458 aa7.33□□□□□ -1.24
PDE4D-222ENST00000514552 MYH15Q9Y2K3 1946 aa7.33□□□□□ -1.24
PDE4D-222ENST00000514552 CHD8Q9HCK8 2581 aa7.32□□□□□ -1.24
PDE4D-222ENST00000514552 KMT2BQ9UMN6 2715 aaPredicted RBP7.32□□□□□ -1.24
PDE4D-222ENST00000514552 SMIM28A0A1B0GU29 152 aa7.32□□□□□ -1.24
PDE4D-222ENST00000514552 H7C4K7 107 aa7.32□□□□□ -1.24
PDE4D-222ENST00000514552 ZNF197O14709 1029 aa7.32□□□□□ -1.24
PDE4D-222ENST00000514552 NCAM2O15394 837 aa7.32□□□□□ -1.24
PDE4D-222ENST00000514552 CCL16O15467 120 aa7.32□□□□□ -1.24
PDE4D-222ENST00000514552 TSPAN6O43657 245 aa7.32□□□□□ -1.24
PDE4D-222ENST00000514552 TBC1D4O60343 1298 aa7.32□□□□□ -1.24
PDE4D-222ENST00000514552 CCT6AP40227 531 aaKnown RBP7.32□□□□□ -1.24
PDE4D-222ENST00000514552 CLCNKBP51801 687 aa7.32□□□□□ -1.24
PDE4D-222ENST00000514552 RAP2BP61225 183 aa7.32□□□□□ -1.24
PDE4D-222ENST00000514552 GPC5P78333 572 aa7.32□□□□□ -1.24
PDE4D-222ENST00000514552 ROR1Q01973 937 aa7.32□□□□□ -1.24
PDE4D-222ENST00000514552 NRN1LQ496H8 165 aa7.32□□□□□ -1.24
PDE4D-222ENST00000514552 ZNF529Q6P280 563 aa7.32□□□□□ -1.24
PDE4D-222ENST00000514552 C1orf228Q6PIY5 440 aa7.32□□□□□ -1.24
PDE4D-222ENST00000514552 MAEAQ7L5Y9 396 aa7.32□□□□□ -1.24
PDE4D-222ENST00000514552 CEP57Q86XR8 500 aa7.32□□□□□ -1.24
PDE4D-222ENST00000514552 C4orf32Q8N8J7 132 aa7.32□□□□□ -1.24
PDE4D-222ENST00000514552 NELL1Q92832 810 aa7.32□□□□□ -1.24
PDE4D-222ENST00000514552 CLDN23Q96B33 292 aa7.32□□□□□ -1.24
PDE4D-222ENST00000514552 ELSPBP1Q96BH3 223 aa7.32□□□□□ -1.24
PDE4D-222ENST00000514552 MSANTD3Q96H12 275 aa7.32□□□□□ -1.24
PDE4D-222ENST00000514552 ZSCAN31Q96LW9 406 aaPredicted RBP7.32□□□□□ -1.24
PDE4D-222ENST00000514552 TSPAN18Q96SJ8 248 aa7.32□□□□□ -1.24
PDE4D-222ENST00000514552 ACO2Q99798 780 aaKnown RBP7.32□□□□□ -1.24
PDE4D-222ENST00000514552 MYOCQ99972 504 aa7.32□□□□□ -1.24
PDE4D-222ENST00000514552 NTPCRQ9BSD7 190 aaKnown RBP7.32□□□□□ -1.24
PDE4D-222ENST00000514552 CDT1Q9H211 546 aa7.32□□□□□ -1.24
PDE4D-222ENST00000514552 PRMT8Q9NR22 394 aaPredicted RBP7.32□□□□□ -1.24
PDE4D-222ENST00000514552 DDX19AQ9NUU7 478 aaKnown RBP7.32□□□□□ -1.24
PDE4D-222ENST00000514552 CACNG4Q9UBN1 327 aa7.32□□□□□ -1.24
PDE4D-222ENST00000514552 MRPS17Q9Y2R5 130 aaKnown RBP7.32□□□□□ -1.24
PDE4D-222ENST00000514552 GDAQ9Y2T3 454 aa7.32□□□□□ -1.24
PDE4D-222ENST00000514552 MIA3Q5JRA6 1907 aa7.32□□□□□ -1.24
PDE4D-222ENST00000514552 WDR27A2RRH5 827 aa7.31□□□□□ -1.24
PDE4D-222ENST00000514552 H0YCG3 227 aa7.31□□□□□ -1.24
PDE4D-222ENST00000514552 PODXLO00592 558 aa7.31□□□□□ -1.24
PDE4D-222ENST00000514552 TRIM24O15164 1050 aa7.31□□□□□ -1.24
PDE4D-222ENST00000514552 ADAM12O43184 909 aa7.31□□□□□ -1.24
PDE4D-222ENST00000514552 KINO60870 393 aaKnown RBP7.31□□□□□ -1.24
PDE4D-222ENST00000514552 TOM1L1O75674 476 aa7.31□□□□□ -1.24
PDE4D-222ENST00000514552 DCNP07585 359 aaKnown RBP7.31□□□□□ -1.24
PDE4D-222ENST00000514552 RHOP08100 348 aa7.31□□□□□ -1.24
PDE4D-222ENST00000514552 COL4A2P08572 1712 aa7.31□□□□□ -1.24
PDE4D-222ENST00000514552 GLULP15104 373 aa7.31□□□□□ -1.24
PDE4D-222ENST00000514552 PTPN2P17706 415 aa7.31□□□□□ -1.24
PDE4D-222ENST00000514552 LPOP22079 712 aaPredicted RBP7.31□□□□□ -1.24
PDE4D-222ENST00000514552 PAX3P23760 479 aa7.31□□□□□ -1.24
PDE4D-222ENST00000514552 TKTP29401 623 aaKnown RBP7.31□□□□□ -1.24
PDE4D-222ENST00000514552 ABCD1P33897 745 aa7.31□□□□□ -1.24
PDE4D-222ENST00000514552 NPTX2P47972 431 aa7.31□□□□□ -1.24
PDE4D-222ENST00000514552 KRTAP10-2P60368 255 aa7.31□□□□□ -1.24
PDE4D-222ENST00000514552 NTHL1P78549 312 aa7.31□□□□□ -1.24
PDE4D-222ENST00000514552 UBXN2BQ14CS0 331 aa7.31□□□□□ -1.24
PDE4D-222ENST00000514552 KYAT1Q16773 422 aa7.31□□□□□ -1.24
PDE4D-222ENST00000514552 SLC44A4Q53GD3 710 aa7.31□□□□□ -1.24
PDE4D-222ENST00000514552 GLRA4Q5JXX5 417 aa7.31□□□□□ -1.24
PDE4D-222ENST00000514552 HYIQ5T013 277 aa7.31□□□□□ -1.24
PDE4D-222ENST00000514552 KRT79Q5XKE5 535 aa7.31□□□□□ -1.24
PDE4D-222ENST00000514552 ZNF280DQ6N043 979 aa7.31□□□□□ -1.24
PDE4D-222ENST00000514552 CD300LGQ6UXG3 332 aa7.31□□□□□ -1.24
PDE4D-222ENST00000514552 ZNF852Q6ZMS4 543 aa7.31□□□□□ -1.24
PDE4D-222ENST00000514552 EPM2AIP1Q7L775 607 aaPredicted RBP7.31□□□□□ -1.24
PDE4D-222ENST00000514552 SYT12Q8IV01 421 aa7.31□□□□□ -1.24
PDE4D-222ENST00000514552 MAML2Q8IZL2 1156 aaPredicted RBP7.31□□□□□ -1.24
PDE4D-222ENST00000514552 DAW1Q8N136 415 aa7.31□□□□□ -1.24
PDE4D-222ENST00000514552 DCBLD1Q8N8Z6 715 aa7.31□□□□□ -1.24
PDE4D-222ENST00000514552 SUMF1Q8NBK3 374 aa7.31□□□□□ -1.24
PDE4D-222ENST00000514552 ZBTB44Q8NCP5 570 aa7.31□□□□□ -1.24
PDE4D-222ENST00000514552 C3orf20Q8ND61 904 aa7.31□□□□□ -1.24
PDE4D-222ENST00000514552 APPL2Q8NEU8 664 aa7.31□□□□□ -1.24
PDE4D-222ENST00000514552 ITFG1Q8TB96 612 aa7.31□□□□□ -1.24
PDE4D-222ENST00000514552 DEPDC1BQ8WUY9 529 aa7.31□□□□□ -1.24
PDE4D-222ENST00000514552 DCLRE1CQ96SD1 692 aaKnown RBP7.31□□□□□ -1.24
PDE4D-222ENST00000514552 KIFC3Q9BVG8 833 aa7.31□□□□□ -1.24
PDE4D-222ENST00000514552 TRPV4Q9HBA0 871 aa7.31□□□□□ -1.24
PDE4D-222ENST00000514552 LTB4R2Q9NPC1 389 aa7.31□□□□□ -1.24
PDE4D-222ENST00000514552 KMT5AQ9NQR1 393 aa7.31□□□□□ -1.24
PDE4D-222ENST00000514552 PARPBPQ9NWS1 579 aa7.31□□□□□ -1.24
PDE4D-222ENST00000514552 CEP72Q9P209 647 aa7.31□□□□□ -1.24
PDE4D-222ENST00000514552 DNMT3BQ9UBC3 853 aaKnown RBP7.31□□□□□ -1.24
PDE4D-222ENST00000514552 KIF3AQ9Y496 699 aa7.31□□□□□ -1.24
PDE4D-222ENST00000514552 F5P12259 2224 aa7.3□□□□□ -1.24
PDE4D-222ENST00000514552 CACNA1IQ9P0X4 2223 aa7.3□□□□□ -1.24
PDE4D-222ENST00000514552 DRGXA6NNA5 263 aa7.3□□□□□ -1.24
PDE4D-222ENST00000514552 DIRC3C9JPN6 131 aa7.3□□□□□ -1.24
PDE4D-222ENST00000514552 M0QZQ0 153 aa7.3□□□□□ -1.24
PDE4D-222ENST00000514552 PRRG1O14668 218 aa7.3□□□□□ -1.24
PDE4D-222ENST00000514552 AP1G1O43747 822 aa7.3□□□□□ -1.24
PDE4D-222ENST00000514552 MYBP10242 640 aa7.3□□□□□ -1.24
PDE4D-222ENST00000514552 MTHFD1P11586 935 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
PDE4D-222ENST00000514552 CYP3A5P20815 502 aa7.3□□□□□ -1.24
PDE4D-222ENST00000514552 FCARP24071 287 aa7.3□□□□□ -1.24
PDE4D-222ENST00000514552 ELF1P32519 619 aa7.3□□□□□ -1.24
PDE4D-222ENST00000514552 PEX3P56589 373 aa7.3□□□□□ -1.24
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